Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q5TIM3

Protein Details
Accession A0A1Q5TIM3    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
196-219KVDGKRVKKDPKAKKPSKEEKSASBasic
359-378ESAAARKEKLQKQKAKALEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
193-215EIEKVDGKRVKKDPKAKKPSKEE
325-347KAGKKRKSIGDEKLVEAKKTKKT
387-396PKAGKKKRKS
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.833, cyto 7, cyto_mito 4.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MPSSTTLTTKVASGSPYQLDNPQVVKASTALLRHIKSAQQEKEKSATKKTLIGDNDSDDEDTPLNNEAVWLLLTTKKHVVDKNRLKPGKITIPHSLNSSPSLSICVITADPQRGFKDVVADPAFPQELSSRIEKVIGFSKLKARYQSFESRRQLFSEHDVFLADDRIITRLIPTLGKIFYKSSKRPIPIRIAEIEKVDGKRVKKDPKAKKPSKEEKSASFAAPLICAKEIERTLNCAAIHLAPSTSSAIRVGSSNFTAEQLSENIAAVVNGMAEKFINKGWRNIKAVHVKGANTMALPIWLANELWVEDADVVEEDQAAIEDGAKAGKKRKSIGDEKLVEAKKTKKTKSAEDEDEDEAESAAARKEKLQKQKAKALEDGEAVVTEAPKAGKKKRKSTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.24
3 0.25
4 0.26
5 0.28
6 0.28
7 0.29
8 0.28
9 0.26
10 0.26
11 0.24
12 0.23
13 0.2
14 0.21
15 0.2
16 0.2
17 0.23
18 0.28
19 0.28
20 0.3
21 0.32
22 0.33
23 0.38
24 0.46
25 0.49
26 0.52
27 0.55
28 0.57
29 0.62
30 0.67
31 0.63
32 0.61
33 0.6
34 0.53
35 0.56
36 0.54
37 0.54
38 0.48
39 0.5
40 0.45
41 0.4
42 0.39
43 0.34
44 0.32
45 0.24
46 0.23
47 0.17
48 0.14
49 0.12
50 0.12
51 0.11
52 0.1
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.07
58 0.07
59 0.11
60 0.12
61 0.15
62 0.19
63 0.22
64 0.27
65 0.32
66 0.4
67 0.47
68 0.58
69 0.64
70 0.7
71 0.7
72 0.66
73 0.65
74 0.64
75 0.63
76 0.57
77 0.53
78 0.5
79 0.52
80 0.51
81 0.51
82 0.44
83 0.35
84 0.33
85 0.29
86 0.21
87 0.17
88 0.19
89 0.15
90 0.14
91 0.13
92 0.12
93 0.1
94 0.13
95 0.16
96 0.17
97 0.18
98 0.21
99 0.22
100 0.23
101 0.24
102 0.21
103 0.24
104 0.2
105 0.26
106 0.25
107 0.25
108 0.23
109 0.24
110 0.24
111 0.17
112 0.18
113 0.11
114 0.12
115 0.13
116 0.15
117 0.14
118 0.14
119 0.16
120 0.15
121 0.17
122 0.2
123 0.23
124 0.22
125 0.22
126 0.29
127 0.33
128 0.35
129 0.39
130 0.35
131 0.34
132 0.39
133 0.47
134 0.46
135 0.51
136 0.54
137 0.53
138 0.51
139 0.5
140 0.45
141 0.37
142 0.37
143 0.31
144 0.26
145 0.21
146 0.2
147 0.19
148 0.18
149 0.16
150 0.1
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.09
159 0.08
160 0.09
161 0.11
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.14
166 0.19
167 0.25
168 0.28
169 0.33
170 0.38
171 0.42
172 0.46
173 0.49
174 0.52
175 0.48
176 0.48
177 0.43
178 0.4
179 0.37
180 0.33
181 0.28
182 0.23
183 0.2
184 0.2
185 0.21
186 0.19
187 0.25
188 0.31
189 0.39
190 0.43
191 0.53
192 0.61
193 0.68
194 0.79
195 0.8
196 0.81
197 0.83
198 0.86
199 0.83
200 0.81
201 0.73
202 0.66
203 0.64
204 0.58
205 0.47
206 0.37
207 0.32
208 0.23
209 0.2
210 0.16
211 0.11
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.12
216 0.12
217 0.15
218 0.15
219 0.18
220 0.18
221 0.22
222 0.21
223 0.17
224 0.17
225 0.14
226 0.15
227 0.11
228 0.1
229 0.07
230 0.08
231 0.1
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.08
253 0.07
254 0.06
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.07
264 0.15
265 0.16
266 0.24
267 0.3
268 0.37
269 0.4
270 0.42
271 0.48
272 0.49
273 0.5
274 0.49
275 0.46
276 0.39
277 0.38
278 0.38
279 0.3
280 0.21
281 0.2
282 0.13
283 0.11
284 0.1
285 0.08
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.08
311 0.1
312 0.12
313 0.19
314 0.24
315 0.28
316 0.33
317 0.41
318 0.48
319 0.55
320 0.61
321 0.64
322 0.63
323 0.62
324 0.66
325 0.6
326 0.53
327 0.5
328 0.48
329 0.47
330 0.54
331 0.55
332 0.54
333 0.59
334 0.67
335 0.72
336 0.74
337 0.72
338 0.67
339 0.67
340 0.6
341 0.55
342 0.46
343 0.36
344 0.26
345 0.18
346 0.14
347 0.11
348 0.11
349 0.13
350 0.13
351 0.19
352 0.29
353 0.37
354 0.48
355 0.57
356 0.64
357 0.7
358 0.79
359 0.8
360 0.76
361 0.73
362 0.65
363 0.59
364 0.51
365 0.44
366 0.35
367 0.27
368 0.22
369 0.18
370 0.14
371 0.1
372 0.11
373 0.11
374 0.16
375 0.23
376 0.33
377 0.42
378 0.52