FuNGI

A0A1Q5UD38

Protein Details

Accession

A0A1Q5UD38

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
159-187	CPACMSGKQHQKRNSRARRPRLHSSRIFE	Hydrophilic
486-510	QDLSYSLYSRRRRPSRRLLESLGKV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
173-177	SRARR

Subcellular Location(s)

mito 13, nucl 8, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF00665 rve
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MNLISVPKLLRDRYSVVAHPQNVFVQRRGRTVGTAYHTEEDLLILRCYVSQRSRERVQLARAPTNRRHADSLEPQAVAMDVDDPQESSGVGYASPTSELGGEARILEEDESTGVDQATEALWHARMGHLNRGDLRVVLRQTGTPYRQLTRAELLATPQCPACMSGKQHQKRNSRARRPRLHSSRIFEMIHSDIMEMPVAKDGSRYVITFTDDYSRGSWAYAMRWKHEALSKFRQFEAWVHRQFGARIKRFLTDNGREYLPIGTHLESQGVEFDTSPPYCKGQNGLAERTNRTIRERINTLLSDAKLPPSWWPELLETVVYLKLRAPASILQKKTPYEVLYGKPPKLLHLRRIGSRAWVLIPKEHRRKLGPRSSECRLLGYCEPNQYKLYEVHSGRTVFSRDVEFDERTPVAPFIEGETGNDLPDNAPPSPVFPEPILPPSGTPLTPPPSPNGPENVPPEPVDNVPSQPVDVPSPVNPIPSETQATQDLSYSLYSRRRRPSRRLLESLGKVYATGTLDTTAAKDVDPSTFNDAVSGPNQLE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.42
3	0.44
4	0.49
5	0.49
6	0.46
7	0.44
8	0.44
9	0.46
10	0.46
11	0.43
12	0.43
13	0.43
14	0.46
15	0.48
16	0.45
17	0.4
18	0.4
19	0.42
20	0.39
21	0.4
22	0.39
23	0.36
24	0.35
25	0.32
26	0.29
27	0.23
28	0.21
29	0.18
30	0.14
31	0.13
32	0.12
33	0.14
34	0.16
35	0.22
36	0.24
37	0.31
38	0.38
39	0.46
40	0.51
41	0.57
42	0.6
43	0.6
44	0.62
45	0.6
46	0.6
47	0.61
48	0.62
49	0.63
50	0.64
51	0.68
52	0.65
53	0.62
54	0.59
55	0.53
56	0.55
57	0.55
58	0.57
59	0.51
60	0.45
61	0.41
62	0.37
63	0.34
64	0.25
65	0.17
66	0.1
67	0.06
68	0.07
69	0.08
70	0.08
71	0.08
72	0.08
73	0.08
74	0.07
75	0.07
76	0.07
77	0.06
78	0.07
79	0.07
80	0.07
81	0.08
82	0.08
83	0.07
84	0.07
85	0.08
86	0.08
87	0.08
88	0.08
89	0.07
90	0.08
91	0.07
92	0.08
93	0.07
94	0.07
95	0.06
96	0.06
97	0.07
98	0.07
99	0.08
100	0.07
101	0.06
102	0.06
103	0.06
104	0.06
105	0.05
106	0.06
107	0.06
108	0.07
109	0.07
110	0.08
111	0.09
112	0.14
113	0.17
114	0.24
115	0.25
116	0.28
117	0.29
118	0.31
119	0.3
120	0.26
121	0.26
122	0.23
123	0.22
124	0.21
125	0.19
126	0.18
127	0.23
128	0.29
129	0.29
130	0.29
131	0.32
132	0.32
133	0.36
134	0.37
135	0.35
136	0.31
137	0.31
138	0.26
139	0.23
140	0.24
141	0.23
142	0.22
143	0.19
144	0.16
145	0.15
146	0.13
147	0.15
148	0.15
149	0.16
150	0.21
151	0.28
152	0.39
153	0.45
154	0.53
155	0.6
156	0.66
157	0.71
158	0.78
159	0.81
160	0.81
161	0.85
162	0.88
163	0.9
164	0.88
165	0.89
166	0.86
167	0.84
168	0.8
169	0.75
170	0.7
171	0.65
172	0.58
173	0.46
174	0.4
175	0.33
176	0.26
177	0.21
178	0.16
179	0.11
180	0.11
181	0.11
182	0.08
183	0.06
184	0.08
185	0.08
186	0.08
187	0.08
188	0.08
189	0.11
190	0.12
191	0.12
192	0.11
193	0.12
194	0.14
195	0.14
196	0.15
197	0.16
198	0.15
199	0.16
200	0.15
201	0.15
202	0.13
203	0.13
204	0.13
205	0.1
206	0.13
207	0.17
208	0.18
209	0.19
210	0.21
211	0.21
212	0.22
213	0.26
214	0.28
215	0.3
216	0.39
217	0.42
218	0.42
219	0.42
220	0.4
221	0.36
222	0.36
223	0.37
224	0.36
225	0.33
226	0.33
227	0.34
228	0.34
229	0.35
230	0.37
231	0.38
232	0.33
233	0.33
234	0.32
235	0.33
236	0.33
237	0.37
238	0.37
239	0.33
240	0.32
241	0.32
242	0.31
243	0.28
244	0.28
245	0.24
246	0.16
247	0.12
248	0.11
249	0.1
250	0.1
251	0.1
252	0.1
253	0.09
254	0.09
255	0.09
256	0.08
257	0.07
258	0.06
259	0.07
260	0.09
261	0.09
262	0.11
263	0.1
264	0.11
265	0.12
266	0.12
267	0.13
268	0.15
269	0.22
270	0.24
271	0.26
272	0.29
273	0.31
274	0.32
275	0.34
276	0.33
277	0.28
278	0.27
279	0.28
280	0.27
281	0.29
282	0.3
283	0.28
284	0.29
285	0.28
286	0.26
287	0.25
288	0.23
289	0.2
290	0.18
291	0.18
292	0.14
293	0.15
294	0.16
295	0.16
296	0.17
297	0.15
298	0.16
299	0.16
300	0.17
301	0.17
302	0.14
303	0.1
304	0.1
305	0.11
306	0.09
307	0.09
308	0.08
309	0.12
310	0.13
311	0.12
312	0.13
313	0.17
314	0.26
315	0.33
316	0.34
317	0.32
318	0.35
319	0.36
320	0.36
321	0.34
322	0.26
323	0.23
324	0.26
325	0.25
326	0.32
327	0.36
328	0.34
329	0.35
330	0.33
331	0.34
332	0.4
333	0.42
334	0.4
335	0.45
336	0.48
337	0.48
338	0.51
339	0.47
340	0.4
341	0.37
342	0.31
343	0.24
344	0.24
345	0.22
346	0.24
347	0.32
348	0.38
349	0.46
350	0.49
351	0.51
352	0.53
353	0.6
354	0.65
355	0.66
356	0.66
357	0.64
358	0.66
359	0.67
360	0.68
361	0.6
362	0.53
363	0.44
364	0.4
365	0.36
366	0.35
367	0.33
368	0.34
369	0.35
370	0.34
371	0.35
372	0.31
373	0.29
374	0.26
375	0.28
376	0.27
377	0.27
378	0.27
379	0.31
380	0.31
381	0.29
382	0.3
383	0.28
384	0.2
385	0.21
386	0.21
387	0.17
388	0.21
389	0.25
390	0.23
391	0.22
392	0.25
393	0.24
394	0.23
395	0.23
396	0.18
397	0.15
398	0.13
399	0.13
400	0.11
401	0.14
402	0.14
403	0.13
404	0.16
405	0.16
406	0.15
407	0.15
408	0.13
409	0.1
410	0.12
411	0.15
412	0.11
413	0.13
414	0.13
415	0.15
416	0.19
417	0.19
418	0.19
419	0.16
420	0.19
421	0.2
422	0.23
423	0.22
424	0.19
425	0.18
426	0.2
427	0.23
428	0.19
429	0.19
430	0.21
431	0.24
432	0.27
433	0.28
434	0.28
435	0.32
436	0.35
437	0.36
438	0.36
439	0.34
440	0.38
441	0.42
442	0.4
443	0.36
444	0.34
445	0.33
446	0.3
447	0.28
448	0.25
449	0.21
450	0.2
451	0.21
452	0.2
453	0.19
454	0.18
455	0.19
456	0.18
457	0.18
458	0.19
459	0.18
460	0.24
461	0.23
462	0.24
463	0.22
464	0.23
465	0.25
466	0.26
467	0.3
468	0.24
469	0.27
470	0.28
471	0.3
472	0.26
473	0.24
474	0.2
475	0.17
476	0.18
477	0.16
478	0.19
479	0.26
480	0.33
481	0.41
482	0.51
483	0.61
484	0.69
485	0.77
486	0.82
487	0.85
488	0.87
489	0.87
490	0.84
491	0.83
492	0.8
493	0.74
494	0.64
495	0.53
496	0.43
497	0.35
498	0.32
499	0.24
500	0.18
501	0.15
502	0.14
503	0.14
504	0.15
505	0.16
506	0.14
507	0.13
508	0.12
509	0.13
510	0.13
511	0.17
512	0.18
513	0.2
514	0.25
515	0.26
516	0.26
517	0.25
518	0.24
519	0.23
520	0.23

A0A1Q5UD38

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer