FuNGI

A0A1Q5SS68

Protein Details

Accession

A0A1Q5SS68

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
338-361	QPVISPSKPKARKKTPSPSPKAVH	Hydrophilic
490-515	LPSSPNQKTREKPPAPKHDRVSPKRE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
345-353	KPKARKKTP
411-426	KPKKGLGMIGGKKKIP
501-509	KPPAPKHDR
540-565	ADRKREELKRQLEAKSKAPAKKKRRF

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 12, mito 4, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015381 XLF_N IPR038051 XRCC4-like_N_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0006302 P:double-strand break repair
Pfam	View protein in Pfam PF09302 XLF
CDD	cd22285 HD_XLF_N

Amino Acid Sequences

MSSEWRRLCLSQENLPPLLCQYTWTRQGYELYLTDLTTIWSERLSRKEILKRADDSATTIDPSEDLDQLDLLLTKIGEALRGDGGSNTTLNSGASSDSLQLNTSTELPAPLRPLKWSILLSREPAFSTTSHLILPLLRGEASLESRQRNLLDQLKQKDWVLSKLFDRFEALGADLGTVFPGVAGLRTARKGSSRSEAAKFIKGVAPFDEQSWLAESESISSSSAIVSNLIHELAGSGNGLDLDKLHPSQEKWWSGLQRRTEAVSFQEEEPKKLSQSRTKPIESKGDVDPGEETASESDVDEFEVCPKQCPSISSIRVPNLTEFQQQEVVPRQKPQETQPVISPSKPKARKKTPSPSPKAVHTNEASATESEHEPEPEPELSPPPRRKRTSTPPPSAAPVAQDTPPTEIPNKPKKGLGMIGGKKKIPEPEPERAPLPPPEPTRVQIEDHAQSTAPATKAKKPTRLGMIGGKAKTKQAPLPETPSVQQEEPLPSSPNQKTREKPPAPKHDRVSPKRESLEPSLPAKAPSAVPAPEETEAQRADRKREELKRQLEAKSKAPAKKKRRF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.5
3	0.45
4	0.38
5	0.35
6	0.26
7	0.21
8	0.23
9	0.29
10	0.37
11	0.4
12	0.39
13	0.39
14	0.42
15	0.42
16	0.4
17	0.33
18	0.29
19	0.26
20	0.24
21	0.22
22	0.19
23	0.17
24	0.14
25	0.14
26	0.1
27	0.12
28	0.15
29	0.2
30	0.26
31	0.3
32	0.33
33	0.41
34	0.49
35	0.55
36	0.58
37	0.6
38	0.58
39	0.57
40	0.56
41	0.48
42	0.42
43	0.39
44	0.33
45	0.27
46	0.24
47	0.2
48	0.16
49	0.18
50	0.17
51	0.14
52	0.12
53	0.12
54	0.11
55	0.11
56	0.12
57	0.09
58	0.07
59	0.07
60	0.07
61	0.06
62	0.08
63	0.08
64	0.1
65	0.1
66	0.12
67	0.12
68	0.13
69	0.13
70	0.12
71	0.13
72	0.12
73	0.12
74	0.11
75	0.1
76	0.1
77	0.1
78	0.09
79	0.08
80	0.08
81	0.08
82	0.09
83	0.1
84	0.11
85	0.12
86	0.12
87	0.12
88	0.12
89	0.13
90	0.13
91	0.12
92	0.11
93	0.13
94	0.13
95	0.15
96	0.19
97	0.22
98	0.22
99	0.23
100	0.26
101	0.26
102	0.29
103	0.3
104	0.29
105	0.31
106	0.32
107	0.33
108	0.33
109	0.32
110	0.28
111	0.26
112	0.24
113	0.18
114	0.21
115	0.2
116	0.18
117	0.17
118	0.17
119	0.16
120	0.15
121	0.16
122	0.11
123	0.1
124	0.09
125	0.09
126	0.1
127	0.11
128	0.14
129	0.18
130	0.21
131	0.22
132	0.23
133	0.25
134	0.25
135	0.26
136	0.28
137	0.31
138	0.34
139	0.41
140	0.45
141	0.45
142	0.47
143	0.45
144	0.43
145	0.38
146	0.36
147	0.32
148	0.29
149	0.3
150	0.34
151	0.34
152	0.29
153	0.3
154	0.24
155	0.22
156	0.2
157	0.17
158	0.12
159	0.11
160	0.11
161	0.08
162	0.08
163	0.06
164	0.05
165	0.04
166	0.03
167	0.03
168	0.03
169	0.03
170	0.04
171	0.06
172	0.08
173	0.1
174	0.11
175	0.12
176	0.15
177	0.17
178	0.2
179	0.25
180	0.29
181	0.32
182	0.34
183	0.4
184	0.4
185	0.41
186	0.38
187	0.33
188	0.3
189	0.26
190	0.24
191	0.2
192	0.21
193	0.18
194	0.18
195	0.18
196	0.15
197	0.15
198	0.16
199	0.14
200	0.1
201	0.1
202	0.1
203	0.1
204	0.11
205	0.11
206	0.09
207	0.08
208	0.08
209	0.08
210	0.09
211	0.07
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.07
216	0.06
217	0.06
218	0.05
219	0.05
220	0.04
221	0.05
222	0.04
223	0.03
224	0.03
225	0.04
226	0.04
227	0.03
228	0.04
229	0.05
230	0.06
231	0.07
232	0.08
233	0.1
234	0.11
235	0.16
236	0.23
237	0.24
238	0.24
239	0.28
240	0.33
241	0.38
242	0.43
243	0.41
244	0.36
245	0.35
246	0.35
247	0.32
248	0.26
249	0.22
250	0.2
251	0.18
252	0.16
253	0.23
254	0.22
255	0.23
256	0.24
257	0.23
258	0.21
259	0.23
260	0.28
261	0.28
262	0.35
263	0.43
264	0.46
265	0.49
266	0.51
267	0.5
268	0.53
269	0.46
270	0.42
271	0.34
272	0.33
273	0.3
274	0.26
275	0.23
276	0.16
277	0.14
278	0.11
279	0.1
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.06
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.07
290	0.1
291	0.1
292	0.12
293	0.12
294	0.13
295	0.14
296	0.15
297	0.17
298	0.22
299	0.25
300	0.28
301	0.31
302	0.32
303	0.33
304	0.33
305	0.3
306	0.24
307	0.23
308	0.22
309	0.19
310	0.18
311	0.2
312	0.19
313	0.21
314	0.27
315	0.3
316	0.27
317	0.3
318	0.31
319	0.32
320	0.34
321	0.35
322	0.38
323	0.36
324	0.36
325	0.37
326	0.41
327	0.39
328	0.39
329	0.39
330	0.33
331	0.4
332	0.47
333	0.51
334	0.54
335	0.63
336	0.71
337	0.77
338	0.83
339	0.83
340	0.85
341	0.85
342	0.84
343	0.76
344	0.73
345	0.71
346	0.62
347	0.58
348	0.48
349	0.42
350	0.34
351	0.33
352	0.28
353	0.19
354	0.18
355	0.14
356	0.13
357	0.13
358	0.12
359	0.12
360	0.12
361	0.12
362	0.15
363	0.13
364	0.14
365	0.14
366	0.18
367	0.23
368	0.31
369	0.39
370	0.46
371	0.55
372	0.59
373	0.64
374	0.68
375	0.74
376	0.76
377	0.77
378	0.76
379	0.72
380	0.69
381	0.66
382	0.58
383	0.48
384	0.39
385	0.31
386	0.25
387	0.21
388	0.2
389	0.18
390	0.2
391	0.21
392	0.21
393	0.21
394	0.24
395	0.32
396	0.41
397	0.45
398	0.42
399	0.43
400	0.42
401	0.44
402	0.42
403	0.4
404	0.4
405	0.42
406	0.49
407	0.49
408	0.48
409	0.45
410	0.45
411	0.44
412	0.37
413	0.4
414	0.39
415	0.45
416	0.49
417	0.51
418	0.5
419	0.45
420	0.45
421	0.4
422	0.36
423	0.34
424	0.33
425	0.35
426	0.37
427	0.37
428	0.4
429	0.38
430	0.37
431	0.33
432	0.36
433	0.34
434	0.32
435	0.31
436	0.25
437	0.22
438	0.22
439	0.22
440	0.18
441	0.19
442	0.21
443	0.29
444	0.39
445	0.46
446	0.53
447	0.52
448	0.58
449	0.61
450	0.62
451	0.58
452	0.55
453	0.56
454	0.54
455	0.52
456	0.48
457	0.41
458	0.42
459	0.42
460	0.38
461	0.34
462	0.36
463	0.41
464	0.43
465	0.49
466	0.49
467	0.48
468	0.45
469	0.46
470	0.41
471	0.34
472	0.31
473	0.27
474	0.29
475	0.29
476	0.3
477	0.29
478	0.27
479	0.35
480	0.4
481	0.44
482	0.45
483	0.5
484	0.54
485	0.6
486	0.7
487	0.7
488	0.74
489	0.76
490	0.82
491	0.83
492	0.86
493	0.82
494	0.8
495	0.82
496	0.8
497	0.78
498	0.74
499	0.74
500	0.7
501	0.69
502	0.65
503	0.62
504	0.62
505	0.59
506	0.55
507	0.51
508	0.47
509	0.44
510	0.4
511	0.34
512	0.27
513	0.25
514	0.26
515	0.22
516	0.23
517	0.24
518	0.25
519	0.24
520	0.25
521	0.23
522	0.23
523	0.23
524	0.25
525	0.3
526	0.31
527	0.37
528	0.42
529	0.47
530	0.53
531	0.61
532	0.69
533	0.72
534	0.76
535	0.78
536	0.77
537	0.78
538	0.78
539	0.73
540	0.68
541	0.68
542	0.68
543	0.66
544	0.7
545	0.73

A0A1Q5SS68

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer