Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q5SSK6

Protein Details
Accession A0A1Q5SSK6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
164-183SFLPPRKDFHEKRNHARQKLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
212-224RGRPPPPGARRSQ
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022018  GIT1_C  
IPR013724  GIT_SHD  
IPR039892  Spa2/Sph1  
Gene Ontology GO:0110165  C:cellular anatomical entity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12205  GIT1_C  
PF08518  GIT_SHD  
Amino Acid Sequences MSPVSVDGSDWSGLNQYQKSDPPFSPTVSSRGNLATPPTSGGPSAPLSPSSIGPPGSGNPSPPSSVAARSSVGTLGGDGQRDGGRRGRQMEEILHQHYVTLRRFLDASMREDRLNGRSNKARDKLLRLSATQFHELSTDVYDELVRRQQAMPPPGRPPRPDVPSFLPPRKDFHEKRNHARQKLASLQHLRFRDLATDVFCELERRFPHFTGRGRPPPPGARRSQSRGPPQMGRGYPSGGPPGSPFPPRQGSLGGPPAGMNGDGPFPRAFQSNTMVPNKSTMVEDSDDMGGDDDDDARSDAFALDAVLSRRGTTTTLGDSERRLLLESQSQVSALQDKVEKLEEQLRAKDEEIARSSDADQSAISHSERQEWEDLRQDLESKVSKAEDLNSSLQLELDRVRADHDNMERELRNQLEEASQSATDSALEARYSELETKHQSLQVELLQQQQVTAEVRREASAFLMEMKTLTAQSHSNWEREEQLSTDVHRLESELNEWKNRYAKAKSQLRQLRTSSGGFADHRPDARNIMAQEHELVQPDGVVKDIHVTKFQMSIDELLRIARFEDPQQVSHQVKSVIVAVRHMIQDVDLAPPPIDGTATLRIKAKGRVAATANNMITAARNFATSSGLSPVSLLDAAASHLCTAVVELIRAVKIQASPADGLEEDDEDLSQEKFPDYFSTTASQRRQSNNSEYSVLSPPDQSHPAMQSGLTNGNGYNYGAPQGDHELQELKLYVEDQTDSMVQSIQALVASIRAEHGMDTVQTYVSAIGDIVANVVSSTENMIHDRSGDAALREASEQVIHNLDQCRDRLMRIAAEGHDVTSPEHLREITNQLPPIAFETARHAQDLVQRLELLAQGDHDDDFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.22
4 0.26
5 0.32
6 0.38
7 0.41
8 0.4
9 0.41
10 0.42
11 0.42
12 0.43
13 0.4
14 0.4
15 0.38
16 0.38
17 0.33
18 0.33
19 0.32
20 0.27
21 0.29
22 0.25
23 0.22
24 0.25
25 0.24
26 0.22
27 0.21
28 0.2
29 0.19
30 0.19
31 0.21
32 0.19
33 0.18
34 0.2
35 0.21
36 0.21
37 0.21
38 0.22
39 0.2
40 0.19
41 0.21
42 0.21
43 0.26
44 0.25
45 0.25
46 0.26
47 0.28
48 0.29
49 0.27
50 0.28
51 0.24
52 0.27
53 0.27
54 0.25
55 0.24
56 0.23
57 0.23
58 0.2
59 0.19
60 0.14
61 0.12
62 0.14
63 0.15
64 0.15
65 0.14
66 0.16
67 0.18
68 0.19
69 0.22
70 0.24
71 0.28
72 0.33
73 0.38
74 0.39
75 0.4
76 0.42
77 0.44
78 0.44
79 0.44
80 0.42
81 0.39
82 0.35
83 0.31
84 0.32
85 0.35
86 0.3
87 0.31
88 0.28
89 0.28
90 0.28
91 0.28
92 0.33
93 0.29
94 0.32
95 0.33
96 0.34
97 0.33
98 0.34
99 0.37
100 0.34
101 0.39
102 0.37
103 0.38
104 0.44
105 0.5
106 0.58
107 0.59
108 0.62
109 0.59
110 0.64
111 0.64
112 0.65
113 0.62
114 0.55
115 0.55
116 0.54
117 0.52
118 0.48
119 0.4
120 0.32
121 0.29
122 0.27
123 0.23
124 0.18
125 0.14
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.14
131 0.18
132 0.17
133 0.18
134 0.19
135 0.24
136 0.31
137 0.39
138 0.42
139 0.41
140 0.5
141 0.56
142 0.61
143 0.58
144 0.57
145 0.57
146 0.59
147 0.57
148 0.54
149 0.52
150 0.56
151 0.61
152 0.61
153 0.59
154 0.54
155 0.56
156 0.56
157 0.6
158 0.55
159 0.57
160 0.62
161 0.63
162 0.71
163 0.78
164 0.81
165 0.75
166 0.78
167 0.71
168 0.68
169 0.69
170 0.64
171 0.61
172 0.6
173 0.6
174 0.59
175 0.57
176 0.5
177 0.43
178 0.38
179 0.32
180 0.27
181 0.25
182 0.2
183 0.2
184 0.18
185 0.18
186 0.17
187 0.17
188 0.15
189 0.2
190 0.2
191 0.23
192 0.27
193 0.27
194 0.35
195 0.39
196 0.44
197 0.47
198 0.54
199 0.58
200 0.56
201 0.58
202 0.57
203 0.59
204 0.61
205 0.59
206 0.56
207 0.54
208 0.6
209 0.63
210 0.65
211 0.64
212 0.66
213 0.67
214 0.66
215 0.63
216 0.59
217 0.6
218 0.53
219 0.48
220 0.4
221 0.35
222 0.31
223 0.28
224 0.28
225 0.2
226 0.19
227 0.18
228 0.21
229 0.21
230 0.23
231 0.22
232 0.24
233 0.29
234 0.29
235 0.29
236 0.27
237 0.26
238 0.29
239 0.33
240 0.28
241 0.23
242 0.22
243 0.2
244 0.18
245 0.16
246 0.11
247 0.06
248 0.09
249 0.08
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.12
254 0.14
255 0.14
256 0.14
257 0.18
258 0.2
259 0.26
260 0.29
261 0.3
262 0.27
263 0.29
264 0.27
265 0.24
266 0.21
267 0.16
268 0.15
269 0.14
270 0.15
271 0.14
272 0.13
273 0.12
274 0.11
275 0.11
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.06
292 0.07
293 0.09
294 0.09
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.11
299 0.11
300 0.12
301 0.12
302 0.14
303 0.16
304 0.17
305 0.17
306 0.18
307 0.17
308 0.15
309 0.15
310 0.13
311 0.13
312 0.17
313 0.18
314 0.17
315 0.16
316 0.16
317 0.14
318 0.14
319 0.15
320 0.1
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.12
325 0.14
326 0.13
327 0.13
328 0.19
329 0.22
330 0.23
331 0.25
332 0.26
333 0.26
334 0.26
335 0.29
336 0.24
337 0.24
338 0.23
339 0.22
340 0.21
341 0.2
342 0.21
343 0.18
344 0.17
345 0.13
346 0.11
347 0.1
348 0.11
349 0.12
350 0.11
351 0.11
352 0.11
353 0.16
354 0.17
355 0.17
356 0.2
357 0.2
358 0.22
359 0.25
360 0.26
361 0.21
362 0.21
363 0.21
364 0.17
365 0.19
366 0.19
367 0.13
368 0.13
369 0.13
370 0.13
371 0.12
372 0.15
373 0.13
374 0.15
375 0.16
376 0.16
377 0.16
378 0.15
379 0.15
380 0.12
381 0.11
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.07
386 0.09
387 0.1
388 0.11
389 0.15
390 0.16
391 0.18
392 0.19
393 0.22
394 0.2
395 0.2
396 0.21
397 0.17
398 0.16
399 0.13
400 0.13
401 0.11
402 0.11
403 0.11
404 0.1
405 0.09
406 0.08
407 0.08
408 0.07
409 0.06
410 0.06
411 0.05
412 0.04
413 0.04
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.06
418 0.08
419 0.08
420 0.1
421 0.13
422 0.16
423 0.17
424 0.18
425 0.18
426 0.16
427 0.17
428 0.16
429 0.16
430 0.14
431 0.16
432 0.14
433 0.14
434 0.14
435 0.12
436 0.11
437 0.1
438 0.1
439 0.09
440 0.09
441 0.1
442 0.1
443 0.11
444 0.1
445 0.09
446 0.08
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.07
458 0.08
459 0.17
460 0.18
461 0.19
462 0.19
463 0.2
464 0.22
465 0.22
466 0.22
467 0.14
468 0.15
469 0.15
470 0.15
471 0.17
472 0.15
473 0.14
474 0.13
475 0.13
476 0.11
477 0.11
478 0.12
479 0.16
480 0.17
481 0.19
482 0.2
483 0.22
484 0.25
485 0.26
486 0.29
487 0.27
488 0.32
489 0.4
490 0.49
491 0.5
492 0.56
493 0.61
494 0.59
495 0.62
496 0.56
497 0.5
498 0.44
499 0.41
500 0.32
501 0.26
502 0.24
503 0.19
504 0.2
505 0.19
506 0.17
507 0.18
508 0.19
509 0.19
510 0.19
511 0.18
512 0.2
513 0.17
514 0.18
515 0.17
516 0.16
517 0.16
518 0.16
519 0.15
520 0.13
521 0.12
522 0.1
523 0.09
524 0.1
525 0.08
526 0.07
527 0.06
528 0.05
529 0.09
530 0.12
531 0.12
532 0.13
533 0.15
534 0.15
535 0.18
536 0.18
537 0.15
538 0.14
539 0.15
540 0.15
541 0.15
542 0.14
543 0.11
544 0.11
545 0.1
546 0.1
547 0.1
548 0.1
549 0.1
550 0.19
551 0.2
552 0.21
553 0.24
554 0.29
555 0.29
556 0.29
557 0.3
558 0.22
559 0.2
560 0.2
561 0.21
562 0.18
563 0.17
564 0.17
565 0.15
566 0.17
567 0.17
568 0.16
569 0.12
570 0.09
571 0.1
572 0.09
573 0.11
574 0.09
575 0.09
576 0.09
577 0.09
578 0.09
579 0.08
580 0.07
581 0.05
582 0.08
583 0.16
584 0.17
585 0.18
586 0.21
587 0.23
588 0.26
589 0.3
590 0.31
591 0.28
592 0.28
593 0.31
594 0.31
595 0.34
596 0.35
597 0.36
598 0.32
599 0.27
600 0.26
601 0.21
602 0.19
603 0.15
604 0.14
605 0.08
606 0.09
607 0.09
608 0.09
609 0.11
610 0.1
611 0.11
612 0.12
613 0.12
614 0.11
615 0.11
616 0.1
617 0.1
618 0.09
619 0.08
620 0.05
621 0.05
622 0.06
623 0.07
624 0.07
625 0.06
626 0.06
627 0.06
628 0.05
629 0.06
630 0.08
631 0.07
632 0.07
633 0.08
634 0.09
635 0.09
636 0.09
637 0.09
638 0.09
639 0.09
640 0.11
641 0.12
642 0.13
643 0.14
644 0.14
645 0.15
646 0.13
647 0.14
648 0.12
649 0.11
650 0.09
651 0.08
652 0.08
653 0.07
654 0.08
655 0.08
656 0.08
657 0.08
658 0.08
659 0.08
660 0.09
661 0.12
662 0.15
663 0.15
664 0.16
665 0.2
666 0.22
667 0.3
668 0.34
669 0.38
670 0.41
671 0.46
672 0.5
673 0.53
674 0.58
675 0.55
676 0.53
677 0.49
678 0.43
679 0.4
680 0.39
681 0.34
682 0.26
683 0.23
684 0.22
685 0.24
686 0.26
687 0.23
688 0.22
689 0.23
690 0.24
691 0.22
692 0.21
693 0.18
694 0.18
695 0.19
696 0.17
697 0.15
698 0.13
699 0.14
700 0.15
701 0.14
702 0.12
703 0.1
704 0.12
705 0.12
706 0.12
707 0.12
708 0.18
709 0.19
710 0.19
711 0.19
712 0.19
713 0.19
714 0.21
715 0.19
716 0.14
717 0.12
718 0.12
719 0.12
720 0.11
721 0.12
722 0.1
723 0.12
724 0.12
725 0.12
726 0.12
727 0.11
728 0.09
729 0.09
730 0.09
731 0.08
732 0.07
733 0.07
734 0.06
735 0.07
736 0.08
737 0.07
738 0.08
739 0.08
740 0.08
741 0.08
742 0.09
743 0.08
744 0.08
745 0.1
746 0.1
747 0.09
748 0.09
749 0.09
750 0.09
751 0.08
752 0.07
753 0.06
754 0.06
755 0.06
756 0.06
757 0.06
758 0.05
759 0.05
760 0.05
761 0.05
762 0.05
763 0.05
764 0.07
765 0.08
766 0.1
767 0.12
768 0.13
769 0.13
770 0.14
771 0.14
772 0.14
773 0.15
774 0.15
775 0.14
776 0.16
777 0.16
778 0.17
779 0.17
780 0.15
781 0.14
782 0.14
783 0.14
784 0.14
785 0.16
786 0.15
787 0.19
788 0.23
789 0.26
790 0.28
791 0.27
792 0.31
793 0.29
794 0.3
795 0.32
796 0.32
797 0.31
798 0.3
799 0.33
800 0.28
801 0.32
802 0.31
803 0.26
804 0.23
805 0.22
806 0.19
807 0.22
808 0.23
809 0.18
810 0.21
811 0.2
812 0.21
813 0.25
814 0.31
815 0.3
816 0.34
817 0.35
818 0.34
819 0.33
820 0.32
821 0.32
822 0.28
823 0.23
824 0.18
825 0.24
826 0.3
827 0.31
828 0.31
829 0.28
830 0.27
831 0.33
832 0.4
833 0.35
834 0.3
835 0.29
836 0.29
837 0.3
838 0.28
839 0.23
840 0.16
841 0.14
842 0.13
843 0.14