Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q5TQ42

Protein Details
Accession A0A1Q5TQ42    Localization Confidence Low Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
453-481DSETPLGRGERNKRKRRFRSLSPLGRGTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
460-474RGERNKRKRRFRSLS
Subcellular Location(s) mito 21, cyto 3, nucl 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006939  SNF5  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0070603  C:SWI/SNF superfamily-type complex  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF04855  SNF5  
Amino Acid Sequences MSPLRGYITSYPPRVRQYGNALLTPVYPVQTGPTPRTTKRGTTAINYAEDGYDDDDFDESDGPRRPTGLRSLRREESTGGMMAPSEKLGKEVHAPVEVQGVFREWMIKRMLRPACADQLQIQAQLPLTLVPIRIDVEVAAHQPLEPFPFPRGVNEQIVNPALPAYRRPEPLPPFRIKDTFLWNLHEALATPEEFAIGFVRDLDLPNPQATTMTISNQIRQQLEEYAGVALHPLFQSSHSIPAPSVAPQTDASRDVSMTPAATNFDTPDSRGNGATVTVTKEALVNDSLLNPDDAYRCLINLNINLQNKLYTDRFEWSLLHPPGMAEEFAQITCADLHLGGEWVSAISHAIYEAVLKLKKEVCESGGLINGFGNEIDNQAANGVEAGWRYDPETLGDKWQPQVEALSKEEIERREGDREREIRRVRRETARFSSTTGITPEVSRQSSGGYFDVDSETPLGRGERNKRKRRFRSLSPLGRGTPGGRGTPETGSGAGYGGGGGTLTDWERQSWRCSNCMVWGTAVWAVRDGPDGPRTLCHNCGFLYERDKTTPEWSRDLHRHDIPVGRFT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.55
3 0.52
4 0.54
5 0.56
6 0.55
7 0.5
8 0.45
9 0.41
10 0.38
11 0.34
12 0.26
13 0.18
14 0.14
15 0.13
16 0.15
17 0.21
18 0.25
19 0.27
20 0.35
21 0.4
22 0.42
23 0.5
24 0.52
25 0.51
26 0.54
27 0.58
28 0.52
29 0.51
30 0.57
31 0.53
32 0.51
33 0.45
34 0.39
35 0.31
36 0.27
37 0.23
38 0.18
39 0.13
40 0.11
41 0.11
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.11
46 0.1
47 0.15
48 0.21
49 0.23
50 0.23
51 0.25
52 0.26
53 0.28
54 0.38
55 0.43
56 0.46
57 0.52
58 0.6
59 0.63
60 0.64
61 0.63
62 0.55
63 0.48
64 0.41
65 0.34
66 0.26
67 0.2
68 0.17
69 0.16
70 0.14
71 0.11
72 0.1
73 0.09
74 0.11
75 0.12
76 0.14
77 0.18
78 0.21
79 0.23
80 0.23
81 0.23
82 0.22
83 0.28
84 0.26
85 0.22
86 0.18
87 0.17
88 0.15
89 0.15
90 0.21
91 0.14
92 0.19
93 0.23
94 0.26
95 0.26
96 0.35
97 0.39
98 0.36
99 0.4
100 0.4
101 0.43
102 0.42
103 0.41
104 0.34
105 0.37
106 0.35
107 0.32
108 0.27
109 0.21
110 0.2
111 0.19
112 0.16
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.09
118 0.1
119 0.11
120 0.11
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.11
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.1
130 0.1
131 0.13
132 0.13
133 0.13
134 0.14
135 0.19
136 0.19
137 0.22
138 0.27
139 0.27
140 0.3
141 0.29
142 0.29
143 0.27
144 0.28
145 0.24
146 0.19
147 0.15
148 0.12
149 0.12
150 0.13
151 0.16
152 0.2
153 0.23
154 0.25
155 0.33
156 0.39
157 0.47
158 0.52
159 0.52
160 0.51
161 0.53
162 0.53
163 0.47
164 0.44
165 0.42
166 0.41
167 0.37
168 0.37
169 0.34
170 0.33
171 0.3
172 0.27
173 0.2
174 0.15
175 0.14
176 0.1
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.05
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.1
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.13
198 0.11
199 0.12
200 0.18
201 0.18
202 0.2
203 0.22
204 0.26
205 0.22
206 0.22
207 0.22
208 0.17
209 0.18
210 0.16
211 0.14
212 0.11
213 0.1
214 0.09
215 0.08
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.1
223 0.11
224 0.15
225 0.14
226 0.15
227 0.14
228 0.15
229 0.15
230 0.12
231 0.13
232 0.09
233 0.11
234 0.11
235 0.13
236 0.13
237 0.14
238 0.14
239 0.13
240 0.13
241 0.11
242 0.11
243 0.1
244 0.09
245 0.08
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.12
255 0.13
256 0.14
257 0.13
258 0.13
259 0.11
260 0.11
261 0.11
262 0.09
263 0.09
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.1
287 0.1
288 0.13
289 0.18
290 0.19
291 0.19
292 0.19
293 0.19
294 0.17
295 0.2
296 0.17
297 0.13
298 0.13
299 0.15
300 0.16
301 0.17
302 0.17
303 0.16
304 0.24
305 0.23
306 0.22
307 0.2
308 0.18
309 0.18
310 0.17
311 0.15
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.08
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.05
322 0.04
323 0.05
324 0.04
325 0.05
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.03
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.04
339 0.05
340 0.08
341 0.1
342 0.1
343 0.13
344 0.16
345 0.18
346 0.2
347 0.2
348 0.18
349 0.2
350 0.21
351 0.19
352 0.2
353 0.18
354 0.16
355 0.15
356 0.13
357 0.1
358 0.09
359 0.08
360 0.05
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.05
368 0.05
369 0.04
370 0.04
371 0.05
372 0.06
373 0.06
374 0.07
375 0.08
376 0.09
377 0.09
378 0.11
379 0.15
380 0.14
381 0.19
382 0.21
383 0.22
384 0.23
385 0.24
386 0.22
387 0.19
388 0.22
389 0.21
390 0.22
391 0.22
392 0.22
393 0.21
394 0.22
395 0.26
396 0.23
397 0.22
398 0.22
399 0.23
400 0.29
401 0.32
402 0.34
403 0.39
404 0.44
405 0.46
406 0.53
407 0.58
408 0.58
409 0.64
410 0.67
411 0.65
412 0.68
413 0.7
414 0.69
415 0.69
416 0.66
417 0.57
418 0.52
419 0.5
420 0.41
421 0.37
422 0.3
423 0.24
424 0.2
425 0.2
426 0.21
427 0.22
428 0.22
429 0.2
430 0.18
431 0.19
432 0.19
433 0.21
434 0.18
435 0.15
436 0.14
437 0.14
438 0.17
439 0.14
440 0.14
441 0.13
442 0.12
443 0.11
444 0.12
445 0.12
446 0.13
447 0.21
448 0.31
449 0.41
450 0.51
451 0.62
452 0.71
453 0.81
454 0.88
455 0.91
456 0.9
457 0.89
458 0.9
459 0.9
460 0.9
461 0.86
462 0.8
463 0.71
464 0.64
465 0.55
466 0.45
467 0.4
468 0.32
469 0.27
470 0.24
471 0.25
472 0.26
473 0.26
474 0.26
475 0.21
476 0.19
477 0.17
478 0.16
479 0.14
480 0.11
481 0.09
482 0.07
483 0.05
484 0.05
485 0.04
486 0.03
487 0.03
488 0.05
489 0.06
490 0.09
491 0.1
492 0.12
493 0.17
494 0.2
495 0.27
496 0.34
497 0.36
498 0.36
499 0.38
500 0.38
501 0.41
502 0.42
503 0.37
504 0.3
505 0.27
506 0.27
507 0.28
508 0.27
509 0.2
510 0.17
511 0.16
512 0.16
513 0.18
514 0.16
515 0.17
516 0.19
517 0.22
518 0.22
519 0.25
520 0.3
521 0.32
522 0.37
523 0.35
524 0.34
525 0.32
526 0.36
527 0.36
528 0.36
529 0.39
530 0.38
531 0.39
532 0.4
533 0.42
534 0.39
535 0.44
536 0.49
537 0.46
538 0.47
539 0.46
540 0.52
541 0.59
542 0.63
543 0.62
544 0.57
545 0.56
546 0.55
547 0.6