FuNGI

A0A1Q5U5Z1

Protein Details

Accession

A0A1Q5U5Z1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
201-227	PACMSGKQHQKRNSRARRPRLHSTRIF	Hydrophilic
532-554	LGYSLYGRRRRPSRRLLESLGKV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
217-217	R

Subcellular Location(s)

cyto 11.5, cyto_nucl 10, nucl 7.5, mito 4, pero 2, cysk 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF00665 rve
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MLDTAGDPVEAEGIGTVKLTLRGKFNHPLVLKNVYFAPRIGMNLISVPKLLRDRYSVVAHPQNVFVQRRGRTVGTAYHAEEDLLILRCYVSQRSRERVQLARTPTDRVHADSLEPQAVDMDVDDPLELSGTQGTATTSELGGEARILEEDANTGVDQATEALWHARMGHLNRGDLRVVLRQTGTPYRQLTRAELLATPQCPACMSGKQHQKRNSRARRPRLHSTRIFEMIHSDIMEMPVAKDGSRYVITFTDDYSRGSWAYAMRWKHEALSKFRQFEAWVHRQFGARIKRFLTDNGREYLPIGTHLESQGVEFDTSPPYCKGQNGLAERTNRTIRERINTLLSDAKLPPSWWPEILETVVYLKLRAPASILQKKTPYEVIYGKPPKLLHLRRIGSRAWVLIPKEHRAKLGPRSSECRLLGYCEPNQYKLYEVHSGKTVFSRDVEFDERTPVAPLIEGETGNDLPDNAPPSPVYPEPMAPSSNAPLTPPPSYPSPDDLENVPCEPVDNMPSEPVDIPSPVNPVPGETQATQDLGYSLYGRRRRPSRRLLESLGKVYATGTLNATVIKDMDPLTFYEAVSGPNQLE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.06
2	0.06
3	0.07
4	0.07
5	0.14
6	0.17
7	0.2
8	0.25
9	0.3
10	0.36
11	0.44
12	0.46
13	0.49
14	0.47
15	0.49
16	0.48
17	0.52
18	0.46
19	0.39
20	0.41
21	0.35
22	0.35
23	0.3
24	0.29
25	0.22
26	0.24
27	0.23
28	0.19
29	0.16
30	0.2
31	0.21
32	0.19
33	0.17
34	0.16
35	0.2
36	0.24
37	0.26
38	0.24
39	0.27
40	0.3
41	0.35
42	0.4
43	0.38
44	0.41
45	0.46
46	0.46
47	0.43
48	0.41
49	0.4
50	0.42
51	0.42
52	0.39
53	0.4
54	0.4
55	0.43
56	0.45
57	0.42
58	0.37
59	0.37
60	0.37
61	0.34
62	0.35
63	0.32
64	0.3
65	0.29
66	0.26
67	0.23
68	0.18
69	0.16
70	0.14
71	0.13
72	0.11
73	0.11
74	0.12
75	0.14
76	0.2
77	0.22
78	0.29
79	0.36
80	0.43
81	0.48
82	0.53
83	0.57
84	0.57
85	0.59
86	0.57
87	0.56
88	0.57
89	0.53
90	0.51
91	0.46
92	0.46
93	0.41
94	0.37
95	0.35
96	0.28
97	0.28
98	0.28
99	0.3
100	0.26
101	0.24
102	0.2
103	0.17
104	0.16
105	0.14
106	0.1
107	0.07
108	0.05
109	0.06
110	0.06
111	0.05
112	0.05
113	0.06
114	0.05
115	0.05
116	0.05
117	0.05
118	0.05
119	0.05
120	0.06
121	0.06
122	0.07
123	0.08
124	0.07
125	0.07
126	0.07
127	0.07
128	0.07
129	0.06
130	0.06
131	0.05
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.05
136	0.06
137	0.06
138	0.07
139	0.06
140	0.06
141	0.06
142	0.06
143	0.06
144	0.06
145	0.05
146	0.04
147	0.05
148	0.06
149	0.06
150	0.07
151	0.07
152	0.08
153	0.13
154	0.15
155	0.22
156	0.23
157	0.25
158	0.27
159	0.29
160	0.28
161	0.24
162	0.23
163	0.21
164	0.2
165	0.19
166	0.18
167	0.17
168	0.21
169	0.27
170	0.27
171	0.27
172	0.3
173	0.3
174	0.34
175	0.34
176	0.33
177	0.29
178	0.28
179	0.24
180	0.21
181	0.22
182	0.21
183	0.2
184	0.18
185	0.15
186	0.13
187	0.12
188	0.13
189	0.13
190	0.15
191	0.19
192	0.27
193	0.37
194	0.44
195	0.51
196	0.58
197	0.65
198	0.7
199	0.77
200	0.79
201	0.8
202	0.84
203	0.87
204	0.89
205	0.87
206	0.88
207	0.86
208	0.83
209	0.79
210	0.74
211	0.68
212	0.63
213	0.56
214	0.45
215	0.39
216	0.31
217	0.25
218	0.19
219	0.15
220	0.1
221	0.1
222	0.1
223	0.07
224	0.06
225	0.07
226	0.07
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.1
231	0.11
232	0.11
233	0.1
234	0.12
235	0.13
236	0.13
237	0.14
238	0.15
239	0.14
240	0.15
241	0.14
242	0.14
243	0.12
244	0.12
245	0.13
246	0.1
247	0.12
248	0.16
249	0.17
250	0.18
251	0.2
252	0.2
253	0.21
254	0.25
255	0.26
256	0.29
257	0.38
258	0.41
259	0.4
260	0.4
261	0.38
262	0.35
263	0.35
264	0.36
265	0.35
266	0.32
267	0.32
268	0.33
269	0.33
270	0.33
271	0.36
272	0.37
273	0.31
274	0.32
275	0.31
276	0.32
277	0.32
278	0.35
279	0.35
280	0.31
281	0.3
282	0.3
283	0.29
284	0.27
285	0.27
286	0.23
287	0.16
288	0.12
289	0.11
290	0.09
291	0.1
292	0.1
293	0.1
294	0.09
295	0.09
296	0.09
297	0.08
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.09
302	0.09
303	0.11
304	0.11
305	0.12
306	0.13
307	0.13
308	0.14
309	0.16
310	0.22
311	0.24
312	0.28
313	0.31
314	0.33
315	0.34
316	0.35
317	0.34
318	0.29
319	0.29
320	0.3
321	0.28
322	0.3
323	0.32
324	0.3
325	0.31
326	0.29
327	0.28
328	0.26
329	0.24
330	0.21
331	0.19
332	0.19
333	0.15
334	0.15
335	0.17
336	0.17
337	0.18
338	0.16
339	0.17
340	0.17
341	0.18
342	0.18
343	0.15
344	0.11
345	0.11
346	0.12
347	0.1
348	0.09
349	0.08
350	0.13
351	0.13
352	0.13
353	0.14
354	0.17
355	0.27
356	0.34
357	0.34
358	0.33
359	0.36
360	0.37
361	0.37
362	0.35
363	0.27
364	0.24
365	0.27
366	0.26
367	0.33
368	0.37
369	0.35
370	0.35
371	0.34
372	0.35
373	0.41
374	0.43
375	0.4
376	0.45
377	0.49
378	0.49
379	0.52
380	0.48
381	0.41
382	0.38
383	0.32
384	0.25
385	0.25
386	0.22
387	0.25
388	0.28
389	0.31
390	0.36
391	0.36
392	0.35
393	0.35
394	0.4
395	0.44
396	0.49
397	0.48
398	0.46
399	0.51
400	0.52
401	0.56
402	0.5
403	0.44
404	0.36
405	0.35
406	0.35
407	0.34
408	0.34
409	0.35
410	0.36
411	0.35
412	0.35
413	0.31
414	0.29
415	0.27
416	0.28
417	0.28
418	0.28
419	0.27
420	0.3
421	0.31
422	0.29
423	0.3
424	0.27
425	0.2
426	0.2
427	0.21
428	0.18
429	0.21
430	0.25
431	0.23
432	0.22
433	0.25
434	0.24
435	0.22
436	0.23
437	0.18
438	0.14
439	0.13
440	0.13
441	0.12
442	0.13
443	0.12
444	0.11
445	0.14
446	0.14
447	0.13
448	0.13
449	0.1
450	0.09
451	0.11
452	0.14
453	0.12
454	0.13
455	0.13
456	0.15
457	0.19
458	0.19
459	0.2
460	0.18
461	0.2
462	0.23
463	0.25
464	0.24
465	0.2
466	0.22
467	0.22
468	0.22
469	0.2
470	0.18
471	0.2
472	0.23
473	0.25
474	0.23
475	0.24
476	0.25
477	0.28
478	0.3
479	0.3
480	0.3
481	0.29
482	0.3
483	0.29
484	0.3
485	0.29
486	0.26
487	0.22
488	0.19
489	0.17
490	0.16
491	0.16
492	0.15
493	0.15
494	0.15
495	0.16
496	0.17
497	0.18
498	0.18
499	0.17
500	0.16
501	0.15
502	0.16
503	0.16
504	0.2
505	0.18
506	0.2
507	0.18
508	0.19
509	0.21
510	0.23
511	0.25
512	0.21
513	0.24
514	0.23
515	0.24
516	0.21
517	0.19
518	0.16
519	0.12
520	0.13
521	0.11
522	0.14
523	0.22
524	0.28
525	0.33
526	0.42
527	0.51
528	0.6
529	0.68
530	0.75
531	0.78
532	0.81
533	0.84
534	0.82
535	0.82
536	0.79
537	0.73
538	0.64
539	0.53
540	0.43
541	0.35
542	0.33
543	0.25
544	0.2
545	0.18
546	0.17
547	0.18
548	0.18
549	0.19
550	0.14
551	0.13
552	0.12
553	0.13
554	0.12
555	0.13
556	0.14
557	0.14
558	0.18
559	0.19
560	0.18
561	0.19
562	0.19
563	0.2
564	0.2

A0A1Q5U5Z1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer