FuNGI

A0A1Q5SRM6

Protein Details

Accession

A0A1Q5SRM6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
414-442	QGPSRRRSPGGTKPKKRGYRETQNEPEQT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
417-431	SRRRSPGGTKPKKRG

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024526 DUF3807 IPR027521 Usb1
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0016829 F:lyase activity GO:1990838 F:poly(U)-specific exoribonuclease activity, producing 3' uridine cyclic phosphate ends GO:0034477 P:U6 snRNA 3'-end processing
Pfam	View protein in Pfam PF12720 DUF3807 PF09749 HVSL

Amino Acid Sequences

MSLVQYSDSESDADQPASPPAKKPRYEAKAPTTGSLVLPPLPPAFHDLYASSTRVSVKDDPSLHGGRKRVIPHVEGNWPTHVYVEWYPAKNELALLAELIARAQCPVDLSDDIDSDVAGSASTPRLHSLLHSDLGAQLPLHISLSAPVVLRTEQRASFTEALTKGIRDSHIPPFTVTPDALKWVSNYERTRWFLVLHVARPVSDGLNRLLALSNRALAVFDQPALYASSSSRDARRNRALGAHDRGLGPTGSGDYSDCFHVSLAWSLTEPGKVEEERVAGLELGDVQSMREDLQAFQVAHFPGHHQALHAPTAEPVVKDDIYADEDDLGYYPDGVKRTLTDEQIQMFRHSEIHALLRKRQLELDEAEYEDRARKLYIGEVVSAGADTTREELVRDEQNVSGEKGLHYEAHAQNQGPSRRRSPGGTKPKKRGYRETQNEPEQTLDYEDVEQNPAPAAAPKPRPTNPRAPFPGRKIISYED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.17
3	0.23
4	0.28
5	0.29
6	0.33
7	0.41
8	0.49
9	0.52
10	0.58
11	0.62
12	0.64
13	0.72
14	0.73
15	0.71
16	0.71
17	0.69
18	0.64
19	0.55
20	0.49
21	0.4
22	0.34
23	0.27
24	0.2
25	0.19
26	0.2
27	0.18
28	0.17
29	0.17
30	0.2
31	0.21
32	0.2
33	0.21
34	0.19
35	0.23
36	0.26
37	0.26
38	0.21
39	0.2
40	0.21
41	0.2
42	0.25
43	0.25
44	0.26
45	0.33
46	0.34
47	0.35
48	0.39
49	0.43
50	0.42
51	0.41
52	0.41
53	0.38
54	0.42
55	0.43
56	0.44
57	0.45
58	0.44
59	0.45
60	0.47
61	0.51
62	0.48
63	0.47
64	0.42
65	0.39
66	0.35
67	0.29
68	0.24
69	0.2
70	0.19
71	0.24
72	0.27
73	0.27
74	0.28
75	0.29
76	0.3
77	0.26
78	0.24
79	0.18
80	0.14
81	0.12
82	0.11
83	0.1
84	0.09
85	0.09
86	0.09
87	0.08
88	0.05
89	0.06
90	0.06
91	0.05
92	0.06
93	0.07
94	0.11
95	0.11
96	0.13
97	0.14
98	0.14
99	0.14
100	0.13
101	0.11
102	0.08
103	0.08
104	0.06
105	0.04
106	0.04
107	0.05
108	0.08
109	0.09
110	0.09
111	0.1
112	0.11
113	0.12
114	0.13
115	0.17
116	0.18
117	0.18
118	0.17
119	0.16
120	0.17
121	0.18
122	0.17
123	0.11
124	0.08
125	0.08
126	0.08
127	0.08
128	0.06
129	0.06
130	0.06
131	0.08
132	0.09
133	0.09
134	0.09
135	0.09
136	0.1
137	0.12
138	0.14
139	0.16
140	0.16
141	0.18
142	0.2
143	0.24
144	0.25
145	0.24
146	0.26
147	0.23
148	0.25
149	0.23
150	0.21
151	0.16
152	0.16
153	0.17
154	0.15
155	0.18
156	0.24
157	0.26
158	0.27
159	0.27
160	0.26
161	0.27
162	0.26
163	0.22
164	0.15
165	0.13
166	0.15
167	0.15
168	0.14
169	0.12
170	0.15
171	0.17
172	0.23
173	0.24
174	0.25
175	0.31
176	0.33
177	0.35
178	0.32
179	0.3
180	0.24
181	0.3
182	0.29
183	0.24
184	0.24
185	0.22
186	0.21
187	0.21
188	0.21
189	0.14
190	0.12
191	0.13
192	0.1
193	0.12
194	0.12
195	0.12
196	0.12
197	0.12
198	0.12
199	0.11
200	0.11
201	0.09
202	0.09
203	0.09
204	0.07
205	0.09
206	0.08
207	0.08
208	0.07
209	0.07
210	0.08
211	0.08
212	0.08
213	0.06
214	0.06
215	0.08
216	0.1
217	0.12
218	0.15
219	0.21
220	0.24
221	0.31
222	0.37
223	0.37
224	0.36
225	0.39
226	0.38
227	0.38
228	0.4
229	0.34
230	0.29
231	0.27
232	0.26
233	0.23
234	0.19
235	0.12
236	0.08
237	0.07
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.06
243	0.07
244	0.07
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.07
249	0.08
250	0.08
251	0.07
252	0.07
253	0.08
254	0.09
255	0.09
256	0.09
257	0.08
258	0.1
259	0.1
260	0.11
261	0.11
262	0.11
263	0.11
264	0.11
265	0.1
266	0.08
267	0.08
268	0.07
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.05
276	0.05
277	0.06
278	0.07
279	0.07
280	0.1
281	0.14
282	0.13
283	0.14
284	0.17
285	0.16
286	0.15
287	0.15
288	0.14
289	0.14
290	0.15
291	0.15
292	0.12
293	0.14
294	0.16
295	0.18
296	0.17
297	0.14
298	0.12
299	0.15
300	0.15
301	0.13
302	0.12
303	0.13
304	0.12
305	0.12
306	0.12
307	0.11
308	0.12
309	0.12
310	0.11
311	0.09
312	0.09
313	0.09
314	0.08
315	0.08
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.09
320	0.1
321	0.1
322	0.1
323	0.1
324	0.16
325	0.19
326	0.21
327	0.22
328	0.24
329	0.26
330	0.3
331	0.3
332	0.27
333	0.25
334	0.23
335	0.21
336	0.19
337	0.17
338	0.15
339	0.2
340	0.24
341	0.25
342	0.3
343	0.35
344	0.36
345	0.36
346	0.37
347	0.32
348	0.31
349	0.31
350	0.31
351	0.26
352	0.26
353	0.25
354	0.22
355	0.22
356	0.2
357	0.18
358	0.14
359	0.13
360	0.12
361	0.12
362	0.16
363	0.2
364	0.18
365	0.18
366	0.18
367	0.17
368	0.16
369	0.15
370	0.12
371	0.06
372	0.05
373	0.05
374	0.07
375	0.08
376	0.08
377	0.08
378	0.11
379	0.15
380	0.2
381	0.21
382	0.21
383	0.21
384	0.24
385	0.26
386	0.25
387	0.22
388	0.19
389	0.17
390	0.17
391	0.17
392	0.15
393	0.15
394	0.22
395	0.23
396	0.29
397	0.31
398	0.3
399	0.34
400	0.41
401	0.47
402	0.45
403	0.48
404	0.46
405	0.5
406	0.53
407	0.55
408	0.56
409	0.59
410	0.64
411	0.69
412	0.74
413	0.78
414	0.85
415	0.88
416	0.87
417	0.87
418	0.86
419	0.86
420	0.86
421	0.86
422	0.85
423	0.84
424	0.79
425	0.7
426	0.61
427	0.51
428	0.43
429	0.36
430	0.27
431	0.2
432	0.21
433	0.21
434	0.2
435	0.22
436	0.21
437	0.18
438	0.17
439	0.16
440	0.13
441	0.15
442	0.18
443	0.24
444	0.32
445	0.38
446	0.46
447	0.53
448	0.6
449	0.64
450	0.71
451	0.69
452	0.71
453	0.73
454	0.75
455	0.77
456	0.76
457	0.79
458	0.71
459	0.67

A0A1Q5SRM6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer