FuNGI

A0A2R6NKU4

Protein Details

Accession

A0A2R6NKU4

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
4-26	SASVLFHPKKKPQTAVKHESLKP	Hydrophilic
45-70	SSPTPNQPATPKRPRAPRPKPATEVD	Hydrophilic
108-129	ITTWSRPVKLNRKEARRDGRDG	Hydrophilic
192-213	KEKVSAAKKKFQKKTKQVFLVP	Hydrophilic
623-642	QAGAAKPKKRKAQPGAAVNG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
56-64	KRPRAPRPK
185-206	AGGKGKDKEKVSAAKKKFQKKT
611-634	KPSNKRKAEEGGQAGAAKPKKRKA

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MPPSASVLFHPKKKPQTAVKHESLKPSGSQDSVSAPSAPGTPLVSSPTPNQPATPKRPRAPRPKPATEVDATSAPPEGPFSEYRLLSSALNGWKYDVMKFDSRKPVDITTWSRPVKLNRKEARRDGRDGAMGAPAPQAVGPMLGPDGKPVIGMDGKVVMVDADGRPIRPGDQNGVNGASNGAGGAGGKGKDKEKVSAAKKKFQKKTKQVFLVPDAVRQLRKEERYPWVMEDGSGKEVWLGSMEEVSKAETQAMFMPAANDIFKFVPAHRWYKFQKKPNYHIPNLEEAESLMTQIQKNKDPERWLLRKRNGQGPSDATVAMFKSEREGSIVPSGSSLVHSASQSLGPGGRRLRMVDSGIDGLFGDDDEEGVDNKRRRKRQYGAEGDLDELDFEEGFADDEEKPDVEEADDEEAKELEERLKREYKTANKTREGYIDESDEEEDITQLTGAGKDMRKLMKKLEKNTAYDDSDDEKNPYASSEEEPEEEIPISPQGPAIIPPEPKPGSRSTSQAPATQPGAAGAKTPSSSIALPTPKAEPGSRATSPVPMPGHGGHSVVAKRATSPKAPKLKPNGTSRAGSPLAGASRPTSPVGSPPGLSESLPAVQSPNVAGKPSNKRKAEEGGQAGAAKPKKRKAQPGAAVNGELEDWMLVEWLKQTPNASTRDCIQYFTPYLTTEEKKQNFTKLVKEVAQLKGGVLVLRNSYRGSVGPSSPAATVVAE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.75
2	0.75
3	0.79
4	0.81
5	0.83
6	0.83
7	0.83
8	0.79
9	0.78
10	0.71
11	0.63
12	0.55
13	0.51
14	0.46
15	0.38
16	0.35
17	0.28
18	0.29
19	0.29
20	0.28
21	0.23
22	0.2
23	0.2
24	0.2
25	0.19
26	0.15
27	0.14
28	0.13
29	0.14
30	0.18
31	0.19
32	0.2
33	0.24
34	0.32
35	0.35
36	0.35
37	0.37
38	0.41
39	0.49
40	0.57
41	0.63
42	0.63
43	0.66
44	0.76
45	0.84
46	0.86
47	0.87
48	0.88
49	0.87
50	0.87
51	0.84
52	0.79
53	0.75
54	0.67
55	0.59
56	0.52
57	0.44
58	0.35
59	0.3
60	0.26
61	0.19
62	0.16
63	0.14
64	0.12
65	0.14
66	0.14
67	0.18
68	0.23
69	0.23
70	0.24
71	0.25
72	0.25
73	0.22
74	0.22
75	0.23
76	0.23
77	0.24
78	0.23
79	0.22
80	0.25
81	0.26
82	0.26
83	0.24
84	0.24
85	0.3
86	0.33
87	0.41
88	0.47
89	0.48
90	0.5
91	0.5
92	0.48
93	0.43
94	0.49
95	0.47
96	0.44
97	0.52
98	0.49
99	0.48
100	0.49
101	0.56
102	0.58
103	0.6
104	0.64
105	0.63
106	0.72
107	0.78
108	0.84
109	0.85
110	0.81
111	0.78
112	0.71
113	0.67
114	0.59
115	0.51
116	0.42
117	0.34
118	0.28
119	0.22
120	0.18
121	0.14
122	0.11
123	0.1
124	0.09
125	0.06
126	0.06
127	0.05
128	0.06
129	0.07
130	0.08
131	0.08
132	0.09
133	0.1
134	0.09
135	0.09
136	0.09
137	0.11
138	0.11
139	0.11
140	0.11
141	0.11
142	0.11
143	0.1
144	0.1
145	0.07
146	0.06
147	0.08
148	0.07
149	0.11
150	0.12
151	0.13
152	0.14
153	0.15
154	0.17
155	0.2
156	0.22
157	0.22
158	0.26
159	0.28
160	0.29
161	0.3
162	0.28
163	0.23
164	0.21
165	0.15
166	0.1
167	0.08
168	0.06
169	0.04
170	0.04
171	0.04
172	0.06
173	0.07
174	0.09
175	0.11
176	0.13
177	0.19
178	0.2
179	0.23
180	0.27
181	0.35
182	0.42
183	0.5
184	0.54
185	0.57
186	0.63
187	0.7
188	0.74
189	0.74
190	0.77
191	0.78
192	0.84
193	0.85
194	0.85
195	0.8
196	0.76
197	0.71
198	0.69
199	0.58
200	0.5
201	0.43
202	0.38
203	0.34
204	0.29
205	0.31
206	0.29
207	0.33
208	0.35
209	0.37
210	0.41
211	0.44
212	0.45
213	0.41
214	0.37
215	0.33
216	0.29
217	0.27
218	0.22
219	0.19
220	0.17
221	0.15
222	0.12
223	0.12
224	0.11
225	0.09
226	0.07
227	0.06
228	0.08
229	0.08
230	0.08
231	0.08
232	0.1
233	0.1
234	0.09
235	0.1
236	0.08
237	0.09
238	0.1
239	0.12
240	0.1
241	0.1
242	0.1
243	0.09
244	0.1
245	0.09
246	0.07
247	0.08
248	0.08
249	0.09
250	0.09
251	0.09
252	0.17
253	0.21
254	0.27
255	0.26
256	0.33
257	0.38
258	0.48
259	0.55
260	0.56
261	0.62
262	0.65
263	0.71
264	0.75
265	0.78
266	0.7
267	0.68
268	0.62
269	0.59
270	0.52
271	0.45
272	0.34
273	0.25
274	0.24
275	0.18
276	0.15
277	0.09
278	0.09
279	0.09
280	0.14
281	0.16
282	0.2
283	0.25
284	0.29
285	0.32
286	0.34
287	0.4
288	0.45
289	0.51
290	0.54
291	0.59
292	0.63
293	0.66
294	0.66
295	0.68
296	0.63
297	0.56
298	0.51
299	0.44
300	0.4
301	0.33
302	0.29
303	0.21
304	0.17
305	0.15
306	0.13
307	0.1
308	0.07
309	0.08
310	0.09
311	0.09
312	0.11
313	0.11
314	0.12
315	0.15
316	0.16
317	0.13
318	0.13
319	0.13
320	0.1
321	0.1
322	0.09
323	0.06
324	0.07
325	0.07
326	0.07
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.07
331	0.08
332	0.07
333	0.11
334	0.11
335	0.13
336	0.13
337	0.14
338	0.16
339	0.16
340	0.16
341	0.14
342	0.14
343	0.13
344	0.12
345	0.11
346	0.09
347	0.07
348	0.06
349	0.05
350	0.04
351	0.03
352	0.03
353	0.03
354	0.03
355	0.04
356	0.05
357	0.11
358	0.14
359	0.21
360	0.29
361	0.36
362	0.42
363	0.51
364	0.57
365	0.62
366	0.69
367	0.71
368	0.68
369	0.64
370	0.58
371	0.5
372	0.42
373	0.32
374	0.21
375	0.12
376	0.08
377	0.04
378	0.04
379	0.03
380	0.03
381	0.03
382	0.04
383	0.05
384	0.05
385	0.06
386	0.06
387	0.06
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.05
392	0.05
393	0.06
394	0.09
395	0.09
396	0.09
397	0.09
398	0.09
399	0.09
400	0.09
401	0.08
402	0.1
403	0.13
404	0.14
405	0.19
406	0.25
407	0.26
408	0.3
409	0.37
410	0.41
411	0.49
412	0.56
413	0.58
414	0.57
415	0.59
416	0.57
417	0.53
418	0.48
419	0.4
420	0.33
421	0.27
422	0.22
423	0.21
424	0.19
425	0.15
426	0.12
427	0.09
428	0.07
429	0.06
430	0.05
431	0.04
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.05
436	0.09
437	0.1
438	0.11
439	0.16
440	0.21
441	0.25
442	0.27
443	0.35
444	0.4
445	0.46
446	0.51
447	0.57
448	0.56
449	0.54
450	0.58
451	0.55
452	0.46
453	0.41
454	0.37
455	0.3
456	0.28
457	0.26
458	0.23
459	0.18
460	0.17
461	0.17
462	0.15
463	0.13
464	0.12
465	0.13
466	0.15
467	0.15
468	0.15
469	0.16
470	0.16
471	0.16
472	0.14
473	0.13
474	0.09
475	0.09
476	0.09
477	0.07
478	0.07
479	0.07
480	0.07
481	0.08
482	0.1
483	0.14
484	0.15
485	0.17
486	0.24
487	0.25
488	0.25
489	0.27
490	0.29
491	0.29
492	0.3
493	0.33
494	0.28
495	0.35
496	0.36
497	0.37
498	0.35
499	0.34
500	0.33
501	0.29
502	0.26
503	0.19
504	0.19
505	0.14
506	0.14
507	0.11
508	0.11
509	0.11
510	0.12
511	0.11
512	0.11
513	0.12
514	0.12
515	0.18
516	0.19
517	0.2
518	0.21
519	0.22
520	0.22
521	0.24
522	0.23
523	0.19
524	0.21
525	0.27
526	0.26
527	0.28
528	0.27
529	0.29
530	0.29
531	0.32
532	0.28
533	0.22
534	0.25
535	0.23
536	0.25
537	0.22
538	0.22
539	0.16
540	0.2
541	0.2
542	0.2
543	0.2
544	0.17
545	0.19
546	0.25
547	0.28
548	0.32
549	0.38
550	0.45
551	0.54
552	0.57
553	0.62
554	0.66
555	0.71
556	0.7
557	0.71
558	0.7
559	0.64
560	0.63
561	0.56
562	0.53
563	0.45
564	0.37
565	0.29
566	0.24
567	0.22
568	0.21
569	0.2
570	0.15
571	0.16
572	0.18
573	0.18
574	0.16
575	0.15
576	0.19
577	0.24
578	0.24
579	0.22
580	0.21
581	0.24
582	0.23
583	0.23
584	0.2
585	0.16
586	0.16
587	0.16
588	0.15
589	0.13
590	0.12
591	0.13
592	0.14
593	0.17
594	0.15
595	0.16
596	0.19
597	0.26
598	0.37
599	0.47
600	0.55
601	0.53
602	0.55
603	0.59
604	0.65
605	0.64
606	0.61
607	0.55
608	0.48
609	0.46
610	0.44
611	0.4
612	0.38
613	0.36
614	0.34
615	0.36
616	0.42
617	0.5
618	0.58
619	0.68
620	0.71
621	0.77
622	0.8
623	0.81
624	0.8
625	0.72
626	0.64
627	0.53
628	0.44
629	0.33
630	0.23
631	0.14
632	0.07
633	0.05
634	0.05
635	0.05
636	0.05
637	0.05
638	0.08
639	0.1
640	0.12
641	0.13
642	0.15
643	0.2
644	0.27
645	0.31
646	0.32
647	0.32
648	0.36
649	0.43
650	0.42
651	0.39
652	0.35
653	0.36
654	0.35
655	0.36
656	0.33
657	0.25
658	0.28
659	0.32
660	0.34
661	0.35
662	0.44
663	0.45
664	0.5
665	0.53
666	0.57
667	0.59
668	0.59
669	0.6
670	0.55
671	0.58
672	0.54
673	0.55
674	0.54
675	0.5
676	0.49
677	0.41
678	0.35
679	0.32
680	0.29
681	0.25
682	0.2
683	0.19
684	0.21
685	0.22
686	0.24
687	0.21
688	0.21
689	0.22
690	0.21
691	0.25
692	0.25
693	0.24
694	0.27
695	0.28
696	0.29
697	0.27
698	0.27

A0A2R6NKU4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer