Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A2R6NEF4

Protein Details
Accession A0A2R6NEF4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
137-160LVDDAPKPKNRKKDDTRGRGRGGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
142-180PKPKNRKKDDTRGRGRGGARGGVERARGRGRGRGRGRGF
Subcellular Location(s) nucl 8.5, mito 8, cyto_nucl 7.833, cyto 6, cyto_pero 4.833, pero 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027141  LSm4/Sm_D1/D3  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0120114  C:Sm-like protein family complex  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
Amino Acid Sequences MANAIADLSKSSGKPPMIFSLCEWGWSQVWINSFITSATDFYGRNDLDMDLWTHTDNGTAVRNFTAVNVPTHGVVALLLKDAGNEPDGVDMQMNTHLKTVKMTARNRDPASLDSLSIRGNNIRYFVLPDALPLDTLLVDDAPKPKNRKKDDTRGRGRGGARGGVERARGRGRGRGRGRGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.28
3 0.35
4 0.34
5 0.35
6 0.34
7 0.36
8 0.34
9 0.33
10 0.31
11 0.24
12 0.22
13 0.22
14 0.22
15 0.16
16 0.18
17 0.19
18 0.19
19 0.16
20 0.16
21 0.14
22 0.14
23 0.12
24 0.11
25 0.1
26 0.11
27 0.11
28 0.12
29 0.18
30 0.17
31 0.16
32 0.17
33 0.16
34 0.15
35 0.15
36 0.15
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.1
41 0.09
42 0.09
43 0.08
44 0.09
45 0.12
46 0.11
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.11
51 0.12
52 0.15
53 0.12
54 0.12
55 0.13
56 0.13
57 0.13
58 0.13
59 0.12
60 0.07
61 0.06
62 0.06
63 0.05
64 0.04
65 0.05
66 0.04
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.05
78 0.05
79 0.09
80 0.1
81 0.09
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.12
86 0.15
87 0.16
88 0.24
89 0.27
90 0.33
91 0.4
92 0.47
93 0.47
94 0.46
95 0.42
96 0.36
97 0.38
98 0.31
99 0.24
100 0.18
101 0.18
102 0.16
103 0.15
104 0.14
105 0.11
106 0.13
107 0.13
108 0.14
109 0.14
110 0.13
111 0.16
112 0.16
113 0.16
114 0.13
115 0.13
116 0.13
117 0.12
118 0.12
119 0.09
120 0.09
121 0.06
122 0.07
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.07
127 0.12
128 0.16
129 0.22
130 0.3
131 0.36
132 0.46
133 0.54
134 0.63
135 0.68
136 0.76
137 0.8
138 0.84
139 0.88
140 0.87
141 0.82
142 0.78
143 0.7
144 0.64
145 0.57
146 0.5
147 0.42
148 0.37
149 0.35
150 0.31
151 0.35
152 0.32
153 0.34
154 0.34
155 0.37
156 0.37
157 0.43
158 0.48
159 0.53
160 0.58