FuNGI

A0A2R6RZH5

Protein Details

Accession

A0A2R6RZH5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
384-405	DYMKKILKRKLKSKKLADPTLS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
388-398	KILKRKLKSKK
439-445	PPIKRRR

Subcellular Location(s)

cyto_mito 10.666, cyto 10.5, cyto_nucl 9.499, mito 8.5, mito_nucl 8.499, nucl 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR047107 DNA-dir_RNA_pol1_lsu_C IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0043229 C:intracellular organelle GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5
CDD	cd02735 RNAP_I_Rpa1_C

Amino Acid Sequences

MPPTIWKPKPLWTGKQIISTVMLNITPSNAHGLNLDAKAKVPGQLWGMGSSEDKVIFMDGELLCGVLDKSAFGATEYGLVHSVYELYGADVAGKLLGVLSRLFTKFLQHRGFTCRMDDLALTPEGNRRREQLIQQGINLGTEGAIENFPSLTTATEQDKPGALRSLLEDVLRDDQKMAGLDMTVKSKLAKLTKSIADAVMPHGLLRQFPDNHMQAMTQSGAKGSAVNAQQISCALGQQELEGRRVPVMVSGKTLPSFKPFETKAIAGGYVASRFLTGVKPQEFFFHCMAGREGLIDTAVKTSRSGYLQRCLIKHLEGIRVHYDNTVRGSDSSIYQFHYGGDGLDVTKQKHLYQFDFIAQNERSLVNKYRPGEIYGVVDPQQASDYMKKILKRKLKSKKLADPTLSLFNPSRYLGSTSEKFAEKVDEYAKALKAKEHSEPPIKRRRPTLAAKHFRQLMNVKYMRSLVDPGEAVGLLASQGVGEPSTQMTLNTFHFAGHGAANVTLGIPRLREIVMTASRKPKTPSMTMAISQGVSAEDIDAFCKKAGRLTLSQVVDKVTVKETLSVEGASRSKEFTIDLVFYPQAEYEVEYDVQPSEILSAFGTKFPLILKREIQNELKKLDQDMKTQMAEIGRGKAVRDQPGGAEDADEDGDKDTSKRKDKDDDDVSEIGDGDATSAKRERQAKEQATYEEDEDDEDAEDDIMKQYDDDEIEAAYASADEKDDTEKLRSVSESLAKQASAVEQLFMENFSYTTSFTFNDSGCTIALRFGSNMPKLLLVGIVEKTCLKTVIREIPGITDCFKSKDDKGGETVYRLTTNGSNIPGLWQFACSDADSLIDEKSIYSNDVYALLITYGVEAARAAILREVGGVFDVYKIDVDSRHLELIADYMTFDGGYKPFNRSGISTNPSPLLKASYETTASFLSDATLHGDFDDLTTPSGNIVVGRLNLTGTGVFDVVMPVEPAEKLQGLSVA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.66
2	0.71
3	0.62
4	0.53
5	0.48
6	0.4
7	0.34
8	0.26
9	0.23
10	0.16
11	0.15
12	0.15
13	0.12
14	0.12
15	0.16
16	0.14
17	0.14
18	0.14
19	0.17
20	0.21
21	0.24
22	0.25
23	0.2
24	0.21
25	0.24
26	0.24
27	0.25
28	0.21
29	0.22
30	0.22
31	0.26
32	0.27
33	0.25
34	0.25
35	0.22
36	0.22
37	0.19
38	0.19
39	0.14
40	0.13
41	0.12
42	0.12
43	0.11
44	0.1
45	0.15
46	0.12
47	0.14
48	0.13
49	0.13
50	0.12
51	0.12
52	0.12
53	0.07
54	0.07
55	0.06
56	0.07
57	0.08
58	0.08
59	0.09
60	0.09
61	0.09
62	0.13
63	0.13
64	0.13
65	0.13
66	0.13
67	0.12
68	0.11
69	0.12
70	0.07
71	0.08
72	0.07
73	0.06
74	0.07
75	0.07
76	0.07
77	0.07
78	0.07
79	0.06
80	0.06
81	0.05
82	0.05
83	0.06
84	0.06
85	0.06
86	0.08
87	0.13
88	0.14
89	0.16
90	0.16
91	0.24
92	0.29
93	0.38
94	0.43
95	0.41
96	0.44
97	0.5
98	0.56
99	0.49
100	0.46
101	0.4
102	0.33
103	0.32
104	0.29
105	0.23
106	0.2
107	0.2
108	0.17
109	0.16
110	0.22
111	0.27
112	0.3
113	0.3
114	0.29
115	0.33
116	0.39
117	0.44
118	0.47
119	0.51
120	0.49
121	0.48
122	0.49
123	0.44
124	0.38
125	0.33
126	0.22
127	0.12
128	0.1
129	0.1
130	0.07
131	0.07
132	0.07
133	0.07
134	0.07
135	0.07
136	0.07
137	0.07
138	0.07
139	0.09
140	0.12
141	0.16
142	0.2
143	0.21
144	0.22
145	0.25
146	0.25
147	0.25
148	0.26
149	0.22
150	0.19
151	0.2
152	0.23
153	0.21
154	0.2
155	0.18
156	0.16
157	0.23
158	0.23
159	0.21
160	0.17
161	0.17
162	0.19
163	0.19
164	0.17
165	0.1
166	0.1
167	0.12
168	0.13
169	0.16
170	0.14
171	0.14
172	0.14
173	0.16
174	0.22
175	0.25
176	0.26
177	0.27
178	0.34
179	0.36
180	0.39
181	0.38
182	0.32
183	0.27
184	0.26
185	0.24
186	0.2
187	0.16
188	0.13
189	0.14
190	0.14
191	0.14
192	0.16
193	0.2
194	0.19
195	0.21
196	0.28
197	0.27
198	0.28
199	0.28
200	0.25
201	0.19
202	0.2
203	0.19
204	0.13
205	0.11
206	0.1
207	0.1
208	0.1
209	0.1
210	0.08
211	0.13
212	0.14
213	0.16
214	0.17
215	0.16
216	0.17
217	0.16
218	0.17
219	0.11
220	0.11
221	0.08
222	0.08
223	0.08
224	0.09
225	0.14
226	0.14
227	0.16
228	0.16
229	0.17
230	0.16
231	0.16
232	0.16
233	0.15
234	0.18
235	0.17
236	0.19
237	0.2
238	0.21
239	0.22
240	0.24
241	0.19
242	0.2
243	0.23
244	0.21
245	0.27
246	0.26
247	0.29
248	0.31
249	0.3
250	0.27
251	0.25
252	0.24
253	0.16
254	0.16
255	0.14
256	0.1
257	0.1
258	0.08
259	0.07
260	0.07
261	0.08
262	0.09
263	0.11
264	0.18
265	0.2
266	0.21
267	0.21
268	0.27
269	0.29
270	0.3
271	0.28
272	0.24
273	0.22
274	0.23
275	0.24
276	0.19
277	0.16
278	0.13
279	0.12
280	0.09
281	0.09
282	0.07
283	0.07
284	0.09
285	0.1
286	0.09
287	0.09
288	0.11
289	0.13
290	0.16
291	0.22
292	0.23
293	0.29
294	0.34
295	0.38
296	0.37
297	0.37
298	0.36
299	0.31
300	0.31
301	0.29
302	0.3
303	0.27
304	0.3
305	0.31
306	0.3
307	0.3
308	0.28
309	0.25
310	0.2
311	0.22
312	0.19
313	0.15
314	0.15
315	0.16
316	0.15
317	0.16
318	0.16
319	0.15
320	0.15
321	0.15
322	0.15
323	0.13
324	0.13
325	0.12
326	0.09
327	0.08
328	0.07
329	0.06
330	0.1
331	0.12
332	0.12
333	0.15
334	0.16
335	0.17
336	0.22
337	0.25
338	0.24
339	0.26
340	0.27
341	0.27
342	0.29
343	0.28
344	0.28
345	0.25
346	0.23
347	0.2
348	0.19
349	0.17
350	0.18
351	0.21
352	0.2
353	0.25
354	0.26
355	0.3
356	0.3
357	0.31
358	0.29
359	0.26
360	0.24
361	0.2
362	0.2
363	0.16
364	0.16
365	0.14
366	0.12
367	0.11
368	0.09
369	0.1
370	0.11
371	0.12
372	0.15
373	0.18
374	0.22
375	0.28
376	0.36
377	0.43
378	0.48
379	0.57
380	0.64
381	0.72
382	0.78
383	0.8
384	0.81
385	0.81
386	0.8
387	0.72
388	0.64
389	0.57
390	0.53
391	0.44
392	0.37
393	0.28
394	0.23
395	0.22
396	0.19
397	0.17
398	0.12
399	0.15
400	0.15
401	0.19
402	0.2
403	0.2
404	0.22
405	0.22
406	0.21
407	0.19
408	0.19
409	0.15
410	0.16
411	0.15
412	0.14
413	0.15
414	0.17
415	0.19
416	0.19
417	0.19
418	0.18
419	0.2
420	0.21
421	0.24
422	0.25
423	0.29
424	0.35
425	0.4
426	0.45
427	0.53
428	0.55
429	0.54
430	0.55
431	0.55
432	0.54
433	0.58
434	0.61
435	0.62
436	0.66
437	0.66
438	0.65
439	0.63
440	0.56
441	0.51
442	0.44
443	0.36
444	0.36
445	0.36
446	0.32
447	0.28
448	0.28
449	0.25
450	0.22
451	0.2
452	0.12
453	0.11
454	0.11
455	0.1
456	0.09
457	0.08
458	0.07
459	0.05
460	0.05
461	0.03
462	0.03
463	0.02
464	0.02
465	0.02
466	0.02
467	0.03
468	0.03
469	0.03
470	0.03
471	0.04
472	0.04
473	0.05
474	0.06
475	0.07
476	0.08
477	0.09
478	0.09
479	0.08
480	0.09
481	0.09
482	0.09
483	0.07
484	0.07
485	0.06
486	0.06
487	0.06
488	0.06
489	0.05
490	0.04
491	0.05
492	0.05
493	0.05
494	0.05
495	0.06
496	0.06
497	0.06
498	0.07
499	0.1
500	0.16
501	0.18
502	0.21
503	0.28
504	0.29
505	0.31
506	0.33
507	0.33
508	0.32
509	0.32
510	0.33
511	0.3
512	0.31
513	0.3
514	0.29
515	0.24
516	0.2
517	0.17
518	0.13
519	0.09
520	0.07
521	0.06
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.05
526	0.05
527	0.06
528	0.06
529	0.07
530	0.07
531	0.1
532	0.12
533	0.15
534	0.17
535	0.2
536	0.27
537	0.27
538	0.28
539	0.26
540	0.24
541	0.22
542	0.2
543	0.17
544	0.12
545	0.12
546	0.12
547	0.15
548	0.14
549	0.14
550	0.14
551	0.13
552	0.12
553	0.13
554	0.14
555	0.12
556	0.12
557	0.11
558	0.11
559	0.11
560	0.11
561	0.09
562	0.1
563	0.1
564	0.1
565	0.12
566	0.11
567	0.11
568	0.11
569	0.1
570	0.09
571	0.07
572	0.08
573	0.07
574	0.08
575	0.09
576	0.09
577	0.09
578	0.08
579	0.08
580	0.07
581	0.06
582	0.06
583	0.05
584	0.06
585	0.05
586	0.07
587	0.08
588	0.08
589	0.09
590	0.08
591	0.09
592	0.09
593	0.16
594	0.16
595	0.19
596	0.22
597	0.26
598	0.3
599	0.34
600	0.39
601	0.39
602	0.4
603	0.38
604	0.37
605	0.33
606	0.31
607	0.35
608	0.31
609	0.29
610	0.29
611	0.3
612	0.29
613	0.28
614	0.28
615	0.21
616	0.2
617	0.18
618	0.16
619	0.15
620	0.15
621	0.15
622	0.19
623	0.23
624	0.25
625	0.25
626	0.23
627	0.22
628	0.24
629	0.24
630	0.19
631	0.14
632	0.1
633	0.09
634	0.09
635	0.08
636	0.07
637	0.06
638	0.07
639	0.07
640	0.08
641	0.14
642	0.21
643	0.3
644	0.34
645	0.38
646	0.47
647	0.5
648	0.58
649	0.59
650	0.56
651	0.52
652	0.48
653	0.43
654	0.34
655	0.31
656	0.21
657	0.14
658	0.1
659	0.05
660	0.08
661	0.07
662	0.09
663	0.11
664	0.12
665	0.18
666	0.25
667	0.27
668	0.33
669	0.43
670	0.47
671	0.5
672	0.53
673	0.49
674	0.46
675	0.45
676	0.37
677	0.27
678	0.21
679	0.17
680	0.14
681	0.12
682	0.09
683	0.08
684	0.07
685	0.06
686	0.06
687	0.06
688	0.07
689	0.06
690	0.06
691	0.05
692	0.06
693	0.08
694	0.08
695	0.08
696	0.07
697	0.07
698	0.07
699	0.07
700	0.07
701	0.05
702	0.04
703	0.04
704	0.04
705	0.05
706	0.05
707	0.06
708	0.08
709	0.1
710	0.12
711	0.15
712	0.17
713	0.18
714	0.19
715	0.19
716	0.18
717	0.2
718	0.24
719	0.23
720	0.23
721	0.23
722	0.21
723	0.21
724	0.2
725	0.17
726	0.16
727	0.14
728	0.12
729	0.11
730	0.11
731	0.11
732	0.11
733	0.11
734	0.07
735	0.07
736	0.07
737	0.08
738	0.08
739	0.09
740	0.1
741	0.1
742	0.12
743	0.15
744	0.14
745	0.16
746	0.15
747	0.16
748	0.14
749	0.14
750	0.12
751	0.12
752	0.13
753	0.11
754	0.11
755	0.14
756	0.21
757	0.21
758	0.23
759	0.21
760	0.21
761	0.2
762	0.19
763	0.16
764	0.1
765	0.11
766	0.12
767	0.11
768	0.12
769	0.12
770	0.13
771	0.13
772	0.15
773	0.12
774	0.14
775	0.21
776	0.3
777	0.31
778	0.32
779	0.31
780	0.34
781	0.35
782	0.33
783	0.29
784	0.22
785	0.21
786	0.23
787	0.24
788	0.24
789	0.24
790	0.32
791	0.33
792	0.33
793	0.36
794	0.39
795	0.39
796	0.36
797	0.37
798	0.3
799	0.27
800	0.25
801	0.24
802	0.19
803	0.21
804	0.22
805	0.21
806	0.19
807	0.18
808	0.21
809	0.2
810	0.19
811	0.16
812	0.14
813	0.13
814	0.14
815	0.16
816	0.13
817	0.13
818	0.11
819	0.12
820	0.12
821	0.12
822	0.11
823	0.09
824	0.09
825	0.08
826	0.1
827	0.1
828	0.1
829	0.1
830	0.1
831	0.11
832	0.12
833	0.11
834	0.1
835	0.1
836	0.08
837	0.08
838	0.07
839	0.06
840	0.06
841	0.05
842	0.05
843	0.05
844	0.05
845	0.06
846	0.07
847	0.07
848	0.08
849	0.08
850	0.08
851	0.09
852	0.09
853	0.07
854	0.08
855	0.08
856	0.07
857	0.08
858	0.08
859	0.07
860	0.08
861	0.08
862	0.09
863	0.1
864	0.14
865	0.17
866	0.19
867	0.2
868	0.2
869	0.19
870	0.18
871	0.18
872	0.15
873	0.11
874	0.09
875	0.08
876	0.08
877	0.07
878	0.08
879	0.09
880	0.09
881	0.13
882	0.15
883	0.19
884	0.22
885	0.25
886	0.26
887	0.26
888	0.31
889	0.36
890	0.39
891	0.37
892	0.37
893	0.39
894	0.38
895	0.36
896	0.31
897	0.27
898	0.23
899	0.23
900	0.22
901	0.22
902	0.24
903	0.24
904	0.25
905	0.21
906	0.21
907	0.18
908	0.16
909	0.13
910	0.11
911	0.11
912	0.12
913	0.12
914	0.12
915	0.11
916	0.12
917	0.11
918	0.11
919	0.14
920	0.11
921	0.11
922	0.12
923	0.12
924	0.12
925	0.12
926	0.12
927	0.09
928	0.09
929	0.11
930	0.12
931	0.13
932	0.13
933	0.13
934	0.13
935	0.14
936	0.13
937	0.11
938	0.11
939	0.1
940	0.09
941	0.09
942	0.1
943	0.09
944	0.09
945	0.09
946	0.07
947	0.09
948	0.09
949	0.09
950	0.12
951	0.12
952	0.12

A0A2R6RZH5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer