FuNGI

A0A2R6NK54

Protein Details

Accession

A0A2R6NK54

Localization Confidence

High

Confidence Score

26.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
268-303	SSEDEKAKNRKRKRSGDDAKRKKKRLKKEESDVELE	Basic
306-335	EDSSKKAKAKAKSRSKAKKRRKDDSESESD	Basic
338-365	DSESEEERRRRKKSKKRKVHDSDSEDSR	Basic
368-422	SDSDGASRKKKHSKSKSKKRAPSPSSDSSDPEPSRGTKSRSKSKSKRSSSPAMEY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
273-295	KAKNRKRKRSGDDAKRKKKRLKK
310-327	KKAKAKAKSRSKAKKRRK
345-355	RRRRKKSKKRK
374-414	SRKKKHSKSKSKKRAPSPSSDSSDPEPSRGTKSRSKSKSKR

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSGRKLNVLEQKIHQTALASEDKTLSQKELDALSPDVSSRTSALNFLLGAGLLKVLKNEKGKLSFRAVVKQELEVKKDLSNEESLVLSHIQASGAEGIWTKHIKVKTELHQTVIDRCLKSLTQKQLVKAVKGTVQHPTRKMYMLFHLEPSVEVTGGPWYTDKELDTEFIKLLSAACLKFIRDRSFPRSKTGEMTQRKLYPISAAPPYPTSSQVQNFLNKSRITETQLTVEHVEMLLNVLVIDGDVEKIPALGAALWESSLGDEEEASSSEDEKAKNRKRKRSGDDAKRKKKRLKKEESDVELESDEDSSKKAKAKAKSRSKAKKRRKDDSESESDTMDSESEEERRRRKKSKKRKVHDSDSEDSRSDSDSDGASRKKKHSKSKSKKRAPSPSSDSSDPEPSRGTKSRSKSKSKRSSSPAMEYSFDDSNTLGGAHVYRAVHPERMAHFGFSQAPCGRCPVFEFCKDGGPVNPSDCVYYDDWLGIAEVKVE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.33
3	0.29
4	0.31
5	0.31
6	0.23
7	0.22
8	0.24
9	0.25
10	0.27
11	0.27
12	0.23
13	0.18
14	0.19
15	0.21
16	0.22
17	0.22
18	0.22
19	0.22
20	0.22
21	0.21
22	0.19
23	0.17
24	0.15
25	0.15
26	0.13
27	0.14
28	0.14
29	0.15
30	0.16
31	0.16
32	0.15
33	0.14
34	0.13
35	0.1
36	0.09
37	0.08
38	0.08
39	0.07
40	0.08
41	0.1
42	0.13
43	0.19
44	0.24
45	0.28
46	0.33
47	0.41
48	0.45
49	0.47
50	0.52
51	0.52
52	0.49
53	0.54
54	0.5
55	0.48
56	0.46
57	0.45
58	0.47
59	0.45
60	0.46
61	0.4
62	0.39
63	0.35
64	0.37
65	0.34
66	0.28
67	0.26
68	0.23
69	0.22
70	0.2
71	0.18
72	0.16
73	0.15
74	0.12
75	0.1
76	0.09
77	0.08
78	0.08
79	0.09
80	0.08
81	0.08
82	0.09
83	0.09
84	0.09
85	0.13
86	0.14
87	0.14
88	0.18
89	0.21
90	0.24
91	0.3
92	0.37
93	0.41
94	0.51
95	0.51
96	0.49
97	0.51
98	0.49
99	0.47
100	0.46
101	0.43
102	0.32
103	0.31
104	0.31
105	0.27
106	0.32
107	0.36
108	0.38
109	0.42
110	0.44
111	0.46
112	0.52
113	0.54
114	0.5
115	0.44
116	0.38
117	0.32
118	0.32
119	0.32
120	0.32
121	0.36
122	0.39
123	0.4
124	0.41
125	0.4
126	0.4
127	0.4
128	0.34
129	0.34
130	0.35
131	0.33
132	0.31
133	0.3
134	0.27
135	0.25
136	0.24
137	0.18
138	0.11
139	0.09
140	0.08
141	0.09
142	0.09
143	0.09
144	0.07
145	0.08
146	0.1
147	0.11
148	0.11
149	0.11
150	0.11
151	0.13
152	0.13
153	0.13
154	0.12
155	0.11
156	0.1
157	0.08
158	0.08
159	0.09
160	0.11
161	0.09
162	0.12
163	0.12
164	0.13
165	0.18
166	0.23
167	0.25
168	0.28
169	0.34
170	0.4
171	0.49
172	0.49
173	0.51
174	0.5
175	0.46
176	0.45
177	0.46
178	0.48
179	0.44
180	0.47
181	0.46
182	0.45
183	0.44
184	0.41
185	0.34
186	0.27
187	0.23
188	0.22
189	0.2
190	0.18
191	0.18
192	0.18
193	0.2
194	0.18
195	0.19
196	0.17
197	0.18
198	0.19
199	0.23
200	0.24
201	0.27
202	0.27
203	0.28
204	0.3
205	0.26
206	0.26
207	0.25
208	0.25
209	0.25
210	0.26
211	0.25
212	0.24
213	0.25
214	0.25
215	0.22
216	0.2
217	0.15
218	0.12
219	0.1
220	0.06
221	0.06
222	0.04
223	0.04
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.02
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.03
238	0.03
239	0.03
240	0.03
241	0.03
242	0.03
243	0.04
244	0.04
245	0.03
246	0.04
247	0.04
248	0.03
249	0.03
250	0.04
251	0.04
252	0.05
253	0.06
254	0.05
255	0.06
256	0.08
257	0.1
258	0.11
259	0.16
260	0.26
261	0.34
262	0.43
263	0.52
264	0.6
265	0.68
266	0.78
267	0.79
268	0.8
269	0.82
270	0.84
271	0.87
272	0.88
273	0.89
274	0.88
275	0.89
276	0.87
277	0.85
278	0.85
279	0.85
280	0.85
281	0.83
282	0.84
283	0.86
284	0.81
285	0.77
286	0.66
287	0.56
288	0.44
289	0.35
290	0.25
291	0.16
292	0.11
293	0.07
294	0.07
295	0.08
296	0.1
297	0.14
298	0.21
299	0.27
300	0.35
301	0.45
302	0.55
303	0.65
304	0.71
305	0.78
306	0.82
307	0.87
308	0.9
309	0.91
310	0.91
311	0.9
312	0.91
313	0.89
314	0.87
315	0.85
316	0.82
317	0.8
318	0.74
319	0.66
320	0.55
321	0.47
322	0.37
323	0.29
324	0.2
325	0.12
326	0.08
327	0.08
328	0.12
329	0.19
330	0.24
331	0.32
332	0.41
333	0.49
334	0.58
335	0.67
336	0.74
337	0.8
338	0.86
339	0.88
340	0.9
341	0.94
342	0.93
343	0.93
344	0.92
345	0.88
346	0.84
347	0.78
348	0.71
349	0.6
350	0.5
351	0.4
352	0.32
353	0.25
354	0.19
355	0.14
356	0.12
357	0.14
358	0.19
359	0.23
360	0.28
361	0.32
362	0.4
363	0.49
364	0.57
365	0.65
366	0.71
367	0.78
368	0.84
369	0.89
370	0.93
371	0.93
372	0.94
373	0.94
374	0.93
375	0.87
376	0.86
377	0.83
378	0.8
379	0.75
380	0.68
381	0.6
382	0.53
383	0.57
384	0.47
385	0.41
386	0.35
387	0.31
388	0.37
389	0.39
390	0.41
391	0.4
392	0.49
393	0.58
394	0.64
395	0.73
396	0.76
397	0.81
398	0.86
399	0.86
400	0.87
401	0.84
402	0.85
403	0.81
404	0.79
405	0.74
406	0.66
407	0.59
408	0.51
409	0.48
410	0.39
411	0.32
412	0.24
413	0.18
414	0.15
415	0.14
416	0.12
417	0.08
418	0.07
419	0.07
420	0.07
421	0.11
422	0.12
423	0.13
424	0.18
425	0.21
426	0.23
427	0.23
428	0.29
429	0.28
430	0.33
431	0.33
432	0.3
433	0.28
434	0.27
435	0.33
436	0.28
437	0.33
438	0.32
439	0.32
440	0.3
441	0.35
442	0.33
443	0.27
444	0.31
445	0.32
446	0.34
447	0.37
448	0.42
449	0.38
450	0.44
451	0.44
452	0.42
453	0.37
454	0.35
455	0.34
456	0.3
457	0.32
458	0.26
459	0.27
460	0.25
461	0.25
462	0.23
463	0.21
464	0.2
465	0.17
466	0.16
467	0.15
468	0.15
469	0.12

A0A2R6NK54

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer