Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8YDC9

Protein Details
Accession G8YDC9    Localization Confidence High Confidence Score 18.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
115-137KAAAPEKKKRKVVKDPNAPKKPLBasic
239-269ASEAPKKSKSESKKRKSEKKDDDKTEKSDKSBasic
274-293KSEKSEKEGKESKKAKKSKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
112-135GKGKAAAPEKKKRKVVKDPNAPKK
242-293APKKSKSESKKRKSEKKDDDKTEKSDKSEKGEKSEKSEKEGKESKKAKKSKK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto 9, mito_nucl 8.5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSEIKTAKDALVASLFELSRAAQDAAAATLTFYKINNIDGSSSEAQALVSATLDRINGGQADTSDEVNGTGQGDAGKGAKQLKSGPTAAKTEAGQTIINGEVPGASQDGEAGKGKAAAPEKKKRKVVKDPNAPKKPLTIFFAYSFHMRDKIRKEREKQGLPTLSSAELNEIIKAHWNDITPEEKEGWQKKYQNELKEYQVLKEAYKNGLPTPSKAEPLPAPVPPTPEVAPPAPAPASNASEAPKKSKSESKKRKSEKKDDDKTEKSDKSEKGEKSEKSEKEGKESKKAKKSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.15
4 0.16
5 0.13
6 0.12
7 0.14
8 0.14
9 0.1
10 0.1
11 0.11
12 0.11
13 0.12
14 0.1
15 0.08
16 0.09
17 0.1
18 0.1
19 0.09
20 0.13
21 0.13
22 0.15
23 0.17
24 0.16
25 0.17
26 0.17
27 0.23
28 0.21
29 0.21
30 0.18
31 0.17
32 0.15
33 0.15
34 0.14
35 0.07
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.08
48 0.12
49 0.13
50 0.13
51 0.12
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.11
56 0.07
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.07
62 0.07
63 0.08
64 0.1
65 0.14
66 0.14
67 0.16
68 0.2
69 0.22
70 0.26
71 0.28
72 0.28
73 0.28
74 0.3
75 0.29
76 0.27
77 0.24
78 0.22
79 0.21
80 0.19
81 0.15
82 0.13
83 0.13
84 0.11
85 0.11
86 0.09
87 0.07
88 0.05
89 0.05
90 0.06
91 0.05
92 0.05
93 0.04
94 0.05
95 0.05
96 0.07
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.09
102 0.12
103 0.17
104 0.22
105 0.29
106 0.39
107 0.48
108 0.55
109 0.62
110 0.66
111 0.7
112 0.75
113 0.78
114 0.78
115 0.81
116 0.83
117 0.86
118 0.86
119 0.78
120 0.68
121 0.62
122 0.54
123 0.46
124 0.39
125 0.3
126 0.26
127 0.26
128 0.27
129 0.23
130 0.21
131 0.19
132 0.16
133 0.18
134 0.16
135 0.2
136 0.26
137 0.35
138 0.44
139 0.5
140 0.55
141 0.6
142 0.69
143 0.7
144 0.65
145 0.64
146 0.58
147 0.51
148 0.47
149 0.39
150 0.3
151 0.24
152 0.21
153 0.13
154 0.11
155 0.1
156 0.09
157 0.08
158 0.08
159 0.12
160 0.13
161 0.12
162 0.13
163 0.13
164 0.14
165 0.16
166 0.2
167 0.15
168 0.17
169 0.17
170 0.17
171 0.24
172 0.28
173 0.3
174 0.33
175 0.38
176 0.4
177 0.49
178 0.53
179 0.53
180 0.53
181 0.52
182 0.49
183 0.52
184 0.49
185 0.39
186 0.39
187 0.34
188 0.29
189 0.31
190 0.29
191 0.24
192 0.25
193 0.25
194 0.2
195 0.27
196 0.27
197 0.25
198 0.3
199 0.29
200 0.3
201 0.28
202 0.3
203 0.24
204 0.29
205 0.3
206 0.24
207 0.26
208 0.25
209 0.29
210 0.27
211 0.3
212 0.24
213 0.24
214 0.26
215 0.22
216 0.23
217 0.2
218 0.21
219 0.18
220 0.17
221 0.18
222 0.18
223 0.2
224 0.18
225 0.2
226 0.19
227 0.25
228 0.27
229 0.3
230 0.32
231 0.31
232 0.35
233 0.43
234 0.51
235 0.57
236 0.66
237 0.71
238 0.77
239 0.85
240 0.91
241 0.92
242 0.93
243 0.93
244 0.93
245 0.93
246 0.92
247 0.91
248 0.87
249 0.84
250 0.82
251 0.75
252 0.7
253 0.68
254 0.62
255 0.6
256 0.62
257 0.59
258 0.58
259 0.62
260 0.6
261 0.6
262 0.66
263 0.6
264 0.59
265 0.63
266 0.56
267 0.58
268 0.63
269 0.6
270 0.61
271 0.68
272 0.71
273 0.73