Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1U7LIG2

Protein Details
Accession A0A1U7LIG2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-53QIRGRSPVRSGRVKKKRNRWGAAEDNKALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-43RGRSPVRSGRVKKKRNR
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10.5, cyto 9.5, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032570  SF1-HH  
IPR047086  SF1-HH_sf  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF16275  SF1-HH  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MDEAPAPHVQTRAAPPPPAVAANGQIRGRSPVRSGRVKKKRNRWGAAEDNKALGLIGLPTAITSTMTTEQIEAYALHIRLEEIGQKLRIGDVTPPEKDRRSVSPPPQYDNFGRRINTRESRYRKKLEDERHRLIEKAMRTIPDFKPPADYRRPTKTQEKIYIPVNDASGGFGYAANSTREGGQGAQRRGDELEPGGGPALPGDGGQRGQGQAGGGADPERDRDGGEHPGDAERPEAGAAARAGDAQRHAARRREPDVPELYAAGCAGCAGCGNIGHRRYDCPEIRNYSANIVCRACGQAGHIMKDCPEKPDAQRRAAAQITSAADREYESLMQELGGGGGGGHSDGRLLDAGSAQSLGQTPWAQPANPWAKALPAAPHNPWGSAPPPQAMPP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.35
3 0.38
4 0.39
5 0.35
6 0.3
7 0.23
8 0.26
9 0.29
10 0.33
11 0.31
12 0.29
13 0.29
14 0.34
15 0.34
16 0.31
17 0.31
18 0.34
19 0.41
20 0.51
21 0.59
22 0.64
23 0.73
24 0.8
25 0.84
26 0.87
27 0.89
28 0.9
29 0.88
30 0.85
31 0.84
32 0.84
33 0.83
34 0.8
35 0.71
36 0.61
37 0.53
38 0.45
39 0.34
40 0.23
41 0.15
42 0.08
43 0.06
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.05
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.09
52 0.11
53 0.13
54 0.13
55 0.13
56 0.13
57 0.13
58 0.13
59 0.1
60 0.09
61 0.14
62 0.14
63 0.14
64 0.13
65 0.13
66 0.13
67 0.14
68 0.16
69 0.14
70 0.17
71 0.18
72 0.18
73 0.18
74 0.18
75 0.18
76 0.15
77 0.16
78 0.2
79 0.24
80 0.26
81 0.3
82 0.34
83 0.35
84 0.37
85 0.37
86 0.36
87 0.39
88 0.46
89 0.51
90 0.57
91 0.58
92 0.61
93 0.6
94 0.58
95 0.55
96 0.5
97 0.47
98 0.42
99 0.4
100 0.38
101 0.4
102 0.44
103 0.46
104 0.47
105 0.51
106 0.56
107 0.65
108 0.71
109 0.73
110 0.68
111 0.7
112 0.73
113 0.74
114 0.76
115 0.75
116 0.73
117 0.72
118 0.69
119 0.6
120 0.54
121 0.48
122 0.38
123 0.35
124 0.31
125 0.26
126 0.27
127 0.33
128 0.32
129 0.35
130 0.35
131 0.29
132 0.35
133 0.36
134 0.41
135 0.43
136 0.47
137 0.44
138 0.51
139 0.55
140 0.53
141 0.59
142 0.6
143 0.59
144 0.62
145 0.61
146 0.55
147 0.55
148 0.53
149 0.46
150 0.4
151 0.32
152 0.24
153 0.2
154 0.17
155 0.12
156 0.09
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.13
170 0.19
171 0.2
172 0.22
173 0.22
174 0.22
175 0.23
176 0.22
177 0.17
178 0.11
179 0.11
180 0.08
181 0.09
182 0.08
183 0.07
184 0.06
185 0.05
186 0.05
187 0.03
188 0.03
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.06
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.08
210 0.1
211 0.16
212 0.16
213 0.15
214 0.15
215 0.16
216 0.16
217 0.15
218 0.13
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.05
224 0.07
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.09
232 0.11
233 0.15
234 0.2
235 0.24
236 0.29
237 0.35
238 0.4
239 0.44
240 0.46
241 0.45
242 0.46
243 0.46
244 0.42
245 0.37
246 0.31
247 0.27
248 0.2
249 0.18
250 0.11
251 0.06
252 0.05
253 0.04
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.04
258 0.05
259 0.08
260 0.14
261 0.16
262 0.19
263 0.2
264 0.23
265 0.27
266 0.34
267 0.37
268 0.34
269 0.4
270 0.43
271 0.45
272 0.45
273 0.42
274 0.4
275 0.38
276 0.37
277 0.34
278 0.28
279 0.26
280 0.23
281 0.24
282 0.18
283 0.15
284 0.15
285 0.18
286 0.21
287 0.24
288 0.24
289 0.23
290 0.25
291 0.32
292 0.31
293 0.27
294 0.26
295 0.28
296 0.34
297 0.44
298 0.48
299 0.45
300 0.48
301 0.47
302 0.52
303 0.49
304 0.42
305 0.32
306 0.31
307 0.28
308 0.26
309 0.24
310 0.18
311 0.15
312 0.16
313 0.16
314 0.13
315 0.12
316 0.11
317 0.11
318 0.11
319 0.11
320 0.1
321 0.09
322 0.06
323 0.06
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.07
337 0.08
338 0.09
339 0.09
340 0.1
341 0.08
342 0.09
343 0.1
344 0.09
345 0.12
346 0.13
347 0.13
348 0.2
349 0.22
350 0.21
351 0.21
352 0.31
353 0.36
354 0.36
355 0.37
356 0.3
357 0.3
358 0.32
359 0.34
360 0.3
361 0.29
362 0.33
363 0.34
364 0.41
365 0.4
366 0.38
367 0.37
368 0.34
369 0.31
370 0.33
371 0.34
372 0.3