FuNGI

A0A1U7LSW5

Protein Details

Accession

A0A1U7LSW5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
403-425	EAEAESKRRKKQEREAQRNVNST	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1
Gene Ontology	GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MEEAPAKRPRLDTSIMTDHSANAAIADESNKNFPESDIALDTEYSHKPSSINGGIPGLFLVQRAREANERVFQIPENLDEKPVTNTPETHEIVLVDIPAKIPNDILEECNSQSRENIEDEAPVNSLTEPLYPFIFTRLSNYSSFSQDSNQQPLNTNSQDIIRGLDALDQLLTNPCAKMVYASDDLADASSDEDDNTDQTSSSEEESDSSSESDQEASPGPLVREHCLLDDDGSDDEKPKNGESNGAPKTKNEIVEIKPTSRPDIQLAEDAKLQRLGFIQQIVGDHVVVEGCVAGDYKVLDEDTPLFLESRKVIGVVCLVVAVNSETKIYDTFGRVQAPLYSIRFASVEEITELGLEVGMSIFYTLVNSKFILTRALQGIKGSDASNIHDEEVGEAEQEFSDDEAEAESKRRKKQEREAQRNVNSTVTTHQSQLPINNGPYTPLQRPSNYEDMLRSTPGRPSRPNNGQQERGRGRTRGQRNRGQGNRSHQSSRDNIYNNQQSQHQPLCNSLQNIPADFYQRPLHYSQQAPPISFTSYQYPQPSFHSLPQYQQPPMSGYSRPNQFQMQGNMHLNPAFLRSQIGMSQQIPAPPMNTGQHPNAQVQEILDRLKSAGHDQQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.47
3	0.46
4	0.42
5	0.36
6	0.33
7	0.3
8	0.21
9	0.12
10	0.12
11	0.1
12	0.1
13	0.13
14	0.14
15	0.15
16	0.19
17	0.2
18	0.2
19	0.2
20	0.2
21	0.22
22	0.21
23	0.22
24	0.21
25	0.21
26	0.21
27	0.2
28	0.21
29	0.21
30	0.21
31	0.21
32	0.19
33	0.19
34	0.19
35	0.21
36	0.27
37	0.27
38	0.27
39	0.26
40	0.27
41	0.27
42	0.26
43	0.25
44	0.18
45	0.13
46	0.12
47	0.12
48	0.11
49	0.15
50	0.17
51	0.2
52	0.24
53	0.29
54	0.33
55	0.36
56	0.38
57	0.36
58	0.36
59	0.33
60	0.32
61	0.29
62	0.28
63	0.26
64	0.23
65	0.23
66	0.22
67	0.23
68	0.22
69	0.24
70	0.23
71	0.23
72	0.23
73	0.26
74	0.33
75	0.33
76	0.3
77	0.28
78	0.24
79	0.23
80	0.22
81	0.18
82	0.11
83	0.09
84	0.09
85	0.11
86	0.11
87	0.1
88	0.1
89	0.11
90	0.15
91	0.16
92	0.18
93	0.19
94	0.2
95	0.22
96	0.27
97	0.27
98	0.22
99	0.23
100	0.23
101	0.22
102	0.22
103	0.23
104	0.18
105	0.2
106	0.2
107	0.2
108	0.18
109	0.15
110	0.14
111	0.11
112	0.11
113	0.09
114	0.1
115	0.1
116	0.1
117	0.11
118	0.11
119	0.11
120	0.13
121	0.15
122	0.13
123	0.17
124	0.19
125	0.22
126	0.22
127	0.25
128	0.25
129	0.26
130	0.27
131	0.24
132	0.22
133	0.26
134	0.3
135	0.32
136	0.33
137	0.31
138	0.34
139	0.36
140	0.4
141	0.34
142	0.31
143	0.26
144	0.24
145	0.24
146	0.2
147	0.19
148	0.12
149	0.11
150	0.11
151	0.12
152	0.11
153	0.09
154	0.09
155	0.07
156	0.08
157	0.1
158	0.1
159	0.09
160	0.09
161	0.08
162	0.09
163	0.09
164	0.1
165	0.09
166	0.14
167	0.15
168	0.15
169	0.15
170	0.15
171	0.15
172	0.13
173	0.12
174	0.06
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.05
179	0.06
180	0.06
181	0.06
182	0.07
183	0.07
184	0.06
185	0.07
186	0.08
187	0.09
188	0.09
189	0.1
190	0.09
191	0.09
192	0.11
193	0.11
194	0.11
195	0.1
196	0.09
197	0.09
198	0.1
199	0.1
200	0.09
201	0.09
202	0.09
203	0.09
204	0.1
205	0.11
206	0.11
207	0.12
208	0.14
209	0.14
210	0.15
211	0.15
212	0.15
213	0.15
214	0.15
215	0.12
216	0.11
217	0.11
218	0.09
219	0.1
220	0.09
221	0.1
222	0.1
223	0.11
224	0.12
225	0.12
226	0.15
227	0.14
228	0.18
229	0.19
230	0.28
231	0.31
232	0.34
233	0.34
234	0.3
235	0.36
236	0.35
237	0.34
238	0.27
239	0.27
240	0.25
241	0.34
242	0.35
243	0.32
244	0.32
245	0.32
246	0.33
247	0.29
248	0.28
249	0.22
250	0.23
251	0.22
252	0.24
253	0.24
254	0.21
255	0.22
256	0.21
257	0.19
258	0.19
259	0.17
260	0.13
261	0.12
262	0.12
263	0.11
264	0.11
265	0.11
266	0.09
267	0.1
268	0.1
269	0.09
270	0.08
271	0.06
272	0.06
273	0.05
274	0.04
275	0.04
276	0.03
277	0.02
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.03
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.05
288	0.06
289	0.06
290	0.06
291	0.07
292	0.06
293	0.07
294	0.08
295	0.08
296	0.08
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.06
303	0.05
304	0.05
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.05
312	0.04
313	0.05
314	0.06
315	0.07
316	0.08
317	0.09
318	0.12
319	0.14
320	0.16
321	0.15
322	0.15
323	0.15
324	0.15
325	0.16
326	0.14
327	0.13
328	0.11
329	0.12
330	0.12
331	0.11
332	0.12
333	0.09
334	0.08
335	0.08
336	0.08
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.04
341	0.04
342	0.03
343	0.03
344	0.02
345	0.02
346	0.02
347	0.02
348	0.02
349	0.02
350	0.03
351	0.04
352	0.05
353	0.06
354	0.07
355	0.08
356	0.09
357	0.09
358	0.12
359	0.11
360	0.14
361	0.17
362	0.18
363	0.18
364	0.17
365	0.17
366	0.15
367	0.16
368	0.13
369	0.11
370	0.1
371	0.12
372	0.14
373	0.14
374	0.13
375	0.13
376	0.12
377	0.11
378	0.11
379	0.09
380	0.07
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.05
386	0.04
387	0.05
388	0.04
389	0.05
390	0.05
391	0.06
392	0.06
393	0.1
394	0.17
395	0.23
396	0.29
397	0.38
398	0.46
399	0.55
400	0.65
401	0.72
402	0.77
403	0.82
404	0.85
405	0.86
406	0.84
407	0.79
408	0.69
409	0.6
410	0.49
411	0.39
412	0.33
413	0.27
414	0.22
415	0.2
416	0.21
417	0.21
418	0.23
419	0.24
420	0.25
421	0.24
422	0.24
423	0.24
424	0.22
425	0.21
426	0.23
427	0.25
428	0.24
429	0.27
430	0.29
431	0.29
432	0.34
433	0.38
434	0.41
435	0.38
436	0.36
437	0.31
438	0.33
439	0.33
440	0.3
441	0.26
442	0.21
443	0.26
444	0.32
445	0.36
446	0.37
447	0.42
448	0.5
449	0.57
450	0.65
451	0.69
452	0.69
453	0.72
454	0.7
455	0.75
456	0.7
457	0.68
458	0.63
459	0.55
460	0.54
461	0.55
462	0.62
463	0.62
464	0.65
465	0.66
466	0.7
467	0.79
468	0.79
469	0.75
470	0.72
471	0.7
472	0.7
473	0.67
474	0.62
475	0.54
476	0.53
477	0.52
478	0.5
479	0.48
480	0.44
481	0.42
482	0.48
483	0.54
484	0.5
485	0.46
486	0.47
487	0.42
488	0.46
489	0.49
490	0.43
491	0.35
492	0.37
493	0.4
494	0.4
495	0.4
496	0.34
497	0.34
498	0.32
499	0.32
500	0.31
501	0.27
502	0.26
503	0.23
504	0.25
505	0.25
506	0.24
507	0.26
508	0.28
509	0.32
510	0.34
511	0.38
512	0.4
513	0.44
514	0.45
515	0.43
516	0.42
517	0.38
518	0.36
519	0.33
520	0.3
521	0.27
522	0.28
523	0.32
524	0.35
525	0.36
526	0.34
527	0.37
528	0.43
529	0.39
530	0.42
531	0.46
532	0.42
533	0.45
534	0.51
535	0.52
536	0.47
537	0.45
538	0.41
539	0.34
540	0.36
541	0.35
542	0.3
543	0.29
544	0.35
545	0.41
546	0.41
547	0.42
548	0.42
549	0.42
550	0.46
551	0.49
552	0.46
553	0.45
554	0.47
555	0.44
556	0.43
557	0.39
558	0.32
559	0.25
560	0.23
561	0.17
562	0.14
563	0.15
564	0.14
565	0.16
566	0.18
567	0.21
568	0.23
569	0.22
570	0.26
571	0.26
572	0.27
573	0.26
574	0.25
575	0.22
576	0.19
577	0.23
578	0.22
579	0.26
580	0.29
581	0.31
582	0.37
583	0.38
584	0.4
585	0.38
586	0.37
587	0.33
588	0.29
589	0.28
590	0.25
591	0.24
592	0.21
593	0.19
594	0.18
595	0.19
596	0.19

A0A1U7LSW5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer