Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1U7LVP3

Protein Details
Accession A0A1U7LVP3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
320-345LHGRSVLKRRRTAKDRQHVEKRIKVIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
328-331RRRT
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007133  RNA_pol_II-assoc_Paf1  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF03985  Paf1  
Amino Acid Sequences MPAPTSSSSAQSSSIGDYIARFRFQNQLPAPPFAPKLIDIPTPLSRYTDTTYISDLVKRVPTSIDLDPELGMPLNLAALPGLFEGDESALYPLQNSQLDPKDQALLKDSDHISSVQRNPAGVSFLRRTEYISSEARASIKPPITIESQQNIRAIKAAAERQEKLRDPHAQLDAIEQSFAEFDCNSFVHPNPRKAHLTAVELIDVFPDVEIFDNTYMLMKFQGCPDSNLPEPTPDNPRFVTALFRPTQSAVGDEWLSYFLADERSSTNLKRKIAEGNTQDVSTTFVHVRDYETNLNTEALSTDIILALPTEEGKFARYTNLHGRSVLKRRRTAKDRQHVEKRIKVIELLMRPMTEDEQAEKMTSISRLDPLGTLRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.17
3 0.15
4 0.15
5 0.2
6 0.22
7 0.22
8 0.2
9 0.22
10 0.3
11 0.32
12 0.41
13 0.38
14 0.44
15 0.46
16 0.5
17 0.49
18 0.45
19 0.44
20 0.35
21 0.34
22 0.25
23 0.25
24 0.24
25 0.26
26 0.23
27 0.27
28 0.31
29 0.31
30 0.31
31 0.3
32 0.28
33 0.29
34 0.31
35 0.29
36 0.27
37 0.25
38 0.27
39 0.27
40 0.27
41 0.25
42 0.22
43 0.22
44 0.24
45 0.22
46 0.21
47 0.2
48 0.22
49 0.24
50 0.26
51 0.26
52 0.22
53 0.23
54 0.22
55 0.21
56 0.19
57 0.14
58 0.11
59 0.07
60 0.06
61 0.05
62 0.05
63 0.05
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.05
69 0.04
70 0.04
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.11
81 0.12
82 0.12
83 0.17
84 0.21
85 0.23
86 0.24
87 0.24
88 0.26
89 0.26
90 0.26
91 0.24
92 0.22
93 0.2
94 0.25
95 0.24
96 0.2
97 0.2
98 0.2
99 0.18
100 0.22
101 0.25
102 0.24
103 0.24
104 0.23
105 0.23
106 0.23
107 0.24
108 0.19
109 0.2
110 0.18
111 0.2
112 0.21
113 0.2
114 0.22
115 0.21
116 0.23
117 0.22
118 0.21
119 0.2
120 0.2
121 0.21
122 0.2
123 0.18
124 0.17
125 0.19
126 0.19
127 0.19
128 0.18
129 0.2
130 0.22
131 0.25
132 0.27
133 0.25
134 0.26
135 0.28
136 0.29
137 0.27
138 0.23
139 0.22
140 0.18
141 0.17
142 0.18
143 0.18
144 0.22
145 0.25
146 0.26
147 0.28
148 0.34
149 0.34
150 0.32
151 0.35
152 0.35
153 0.33
154 0.38
155 0.36
156 0.31
157 0.29
158 0.28
159 0.25
160 0.19
161 0.16
162 0.1
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.06
167 0.04
168 0.04
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.08
173 0.09
174 0.18
175 0.23
176 0.3
177 0.31
178 0.36
179 0.38
180 0.37
181 0.41
182 0.34
183 0.32
184 0.27
185 0.25
186 0.21
187 0.18
188 0.17
189 0.13
190 0.1
191 0.07
192 0.04
193 0.03
194 0.03
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.09
208 0.15
209 0.15
210 0.18
211 0.2
212 0.23
213 0.23
214 0.25
215 0.24
216 0.21
217 0.22
218 0.21
219 0.28
220 0.25
221 0.26
222 0.25
223 0.26
224 0.24
225 0.23
226 0.25
227 0.19
228 0.24
229 0.22
230 0.22
231 0.22
232 0.22
233 0.24
234 0.19
235 0.19
236 0.12
237 0.14
238 0.13
239 0.12
240 0.11
241 0.1
242 0.1
243 0.08
244 0.07
245 0.06
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.09
250 0.13
251 0.15
252 0.18
253 0.26
254 0.29
255 0.31
256 0.32
257 0.33
258 0.39
259 0.41
260 0.47
261 0.42
262 0.42
263 0.41
264 0.4
265 0.37
266 0.29
267 0.27
268 0.19
269 0.18
270 0.13
271 0.12
272 0.14
273 0.14
274 0.18
275 0.18
276 0.23
277 0.25
278 0.25
279 0.26
280 0.26
281 0.26
282 0.22
283 0.19
284 0.14
285 0.1
286 0.09
287 0.07
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.06
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.09
300 0.11
301 0.11
302 0.17
303 0.17
304 0.23
305 0.32
306 0.38
307 0.38
308 0.39
309 0.44
310 0.47
311 0.57
312 0.59
313 0.58
314 0.6
315 0.66
316 0.75
317 0.76
318 0.78
319 0.79
320 0.81
321 0.82
322 0.84
323 0.87
324 0.85
325 0.88
326 0.84
327 0.79
328 0.73
329 0.64
330 0.55
331 0.49
332 0.48
333 0.43
334 0.41
335 0.37
336 0.32
337 0.31
338 0.32
339 0.29
340 0.24
341 0.21
342 0.19
343 0.21
344 0.22
345 0.21
346 0.2
347 0.19
348 0.19
349 0.19
350 0.18
351 0.17
352 0.18
353 0.19
354 0.19
355 0.21