Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1U7LJQ6

Protein Details
Accession A0A1U7LJQ6    Localization Confidence Low Confidence Score 8.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
204-223HQGHSRDRDKREQERRELRLBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14, nucl 13.5, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR005378  Vps35  
IPR042491  Vps35_C  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0030906  C:retromer, cargo-selective complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
Pfam View protein in Pfam  
PF03635  Vps35  
Amino Acid Sequences MAAALVAQSSQQQQAGDEQARLLEEALAVVRNHALHMRRCLDAARLMDALKNASSMLAELRSSALGPKQYYQVYMAAFDSLRYLAAYLLEAHQSGKHHLADLYELVQYAGNIVPRLYLMITVGTVYMGVEGAPVREIMKDLLEMSRGVQHPIRGLFLRHYLSGQSRDYLPSGEEESASGNLRDSISFVLTNFIEMNKLWVRLQHQGHSRDRDKREQERRELRLLVGTNLVRLSQLCAADLELYSGTILPAILEQVVQCRDVLAQEYLMEVITQVFADDLHLRTLDQFLSATAKLNTHSNIRQIVSALIDRLASYAARESENEDPEERRLKEEGAANRLASKIQRIRVSNAKNNSSTDQVVESNPDETDPPTKFRGIPQDVPLFEVFWEQIVNLVKARPDIPLQDVSALLLSLANLSLNCYPDKLEYVDKIFSFARDKMIDYADSPDLYAPTTVNAYLALLLAPLSSYQSLLTLFAIPFYLPLLHAQPYSTRRAIAAAVSHALLNTDIILSSVQDVQDVLELLKVIIVESAPAQSSLVRKSQNEDEVEEQGWIARIIHLCKSEDIDIQFSILEALSKACIEGGDRIKYTTPSLVTQTILLAHQCYSQEHLENDWPNKLTAMFKFLHQLISMLYSRMALADLCLRLFVNAGQIADSCGAEDTAYEYFAQAFTIYEDSISESRTQYQALMIISGGLYNTKSFGNENYENLITKAALHGAKLLKKPDQARAVYSASHLWWSEDEKGYRDGKRVLDCLQKSLKIADACMDTASSVELFVEILNRYGYHFDRANDAVTVKYLNGLIELVQTNLTSLDTVDKRHAGTSTSAICEYEGHPAEWIQNFFYRTIKHMESRIEDEPEKWAGVKIPAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.28
3 0.28
4 0.26
5 0.24
6 0.23
7 0.24
8 0.23
9 0.19
10 0.12
11 0.09
12 0.1
13 0.1
14 0.12
15 0.11
16 0.12
17 0.13
18 0.13
19 0.14
20 0.19
21 0.24
22 0.27
23 0.36
24 0.38
25 0.37
26 0.38
27 0.39
28 0.38
29 0.38
30 0.34
31 0.29
32 0.27
33 0.26
34 0.27
35 0.27
36 0.25
37 0.19
38 0.17
39 0.13
40 0.12
41 0.12
42 0.1
43 0.12
44 0.11
45 0.11
46 0.11
47 0.12
48 0.12
49 0.13
50 0.15
51 0.16
52 0.19
53 0.22
54 0.24
55 0.28
56 0.29
57 0.3
58 0.3
59 0.3
60 0.25
61 0.25
62 0.23
63 0.19
64 0.18
65 0.16
66 0.16
67 0.12
68 0.11
69 0.1
70 0.09
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.11
77 0.11
78 0.12
79 0.14
80 0.16
81 0.18
82 0.22
83 0.21
84 0.22
85 0.22
86 0.22
87 0.22
88 0.22
89 0.2
90 0.16
91 0.15
92 0.13
93 0.13
94 0.12
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.1
102 0.12
103 0.1
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.05
114 0.04
115 0.04
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.09
124 0.09
125 0.1
126 0.1
127 0.11
128 0.12
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.18
133 0.18
134 0.21
135 0.21
136 0.22
137 0.25
138 0.26
139 0.28
140 0.23
141 0.24
142 0.24
143 0.28
144 0.28
145 0.25
146 0.24
147 0.25
148 0.28
149 0.31
150 0.29
151 0.25
152 0.24
153 0.26
154 0.26
155 0.23
156 0.19
157 0.16
158 0.18
159 0.16
160 0.15
161 0.13
162 0.14
163 0.15
164 0.16
165 0.13
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.12
174 0.11
175 0.13
176 0.12
177 0.13
178 0.13
179 0.11
180 0.11
181 0.1
182 0.16
183 0.15
184 0.17
185 0.16
186 0.19
187 0.22
188 0.3
189 0.33
190 0.35
191 0.4
192 0.46
193 0.53
194 0.59
195 0.62
196 0.63
197 0.66
198 0.69
199 0.7
200 0.73
201 0.77
202 0.76
203 0.8
204 0.8
205 0.79
206 0.75
207 0.68
208 0.58
209 0.53
210 0.46
211 0.36
212 0.32
213 0.27
214 0.22
215 0.2
216 0.2
217 0.14
218 0.13
219 0.14
220 0.12
221 0.12
222 0.12
223 0.12
224 0.12
225 0.13
226 0.12
227 0.11
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.08
242 0.09
243 0.1
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.13
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.07
256 0.05
257 0.05
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.03
263 0.05
264 0.07
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.1
270 0.11
271 0.1
272 0.08
273 0.07
274 0.07
275 0.1
276 0.1
277 0.12
278 0.11
279 0.12
280 0.12
281 0.15
282 0.16
283 0.18
284 0.19
285 0.21
286 0.24
287 0.24
288 0.24
289 0.22
290 0.21
291 0.18
292 0.16
293 0.13
294 0.1
295 0.09
296 0.09
297 0.08
298 0.08
299 0.06
300 0.06
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.1
305 0.13
306 0.17
307 0.19
308 0.2
309 0.19
310 0.19
311 0.22
312 0.29
313 0.26
314 0.23
315 0.23
316 0.22
317 0.24
318 0.29
319 0.3
320 0.28
321 0.28
322 0.26
323 0.26
324 0.25
325 0.23
326 0.17
327 0.2
328 0.2
329 0.24
330 0.29
331 0.3
332 0.35
333 0.42
334 0.49
335 0.48
336 0.49
337 0.49
338 0.45
339 0.45
340 0.42
341 0.37
342 0.3
343 0.24
344 0.2
345 0.17
346 0.15
347 0.15
348 0.14
349 0.12
350 0.11
351 0.11
352 0.09
353 0.09
354 0.14
355 0.13
356 0.15
357 0.16
358 0.18
359 0.18
360 0.21
361 0.3
362 0.3
363 0.33
364 0.34
365 0.37
366 0.36
367 0.38
368 0.34
369 0.25
370 0.19
371 0.17
372 0.12
373 0.07
374 0.07
375 0.05
376 0.08
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.1
381 0.1
382 0.11
383 0.12
384 0.1
385 0.1
386 0.11
387 0.13
388 0.14
389 0.14
390 0.14
391 0.13
392 0.12
393 0.1
394 0.09
395 0.06
396 0.04
397 0.04
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.05
403 0.06
404 0.07
405 0.07
406 0.08
407 0.08
408 0.09
409 0.11
410 0.11
411 0.12
412 0.12
413 0.14
414 0.16
415 0.15
416 0.17
417 0.15
418 0.15
419 0.16
420 0.15
421 0.16
422 0.15
423 0.16
424 0.15
425 0.16
426 0.15
427 0.13
428 0.15
429 0.13
430 0.12
431 0.11
432 0.1
433 0.09
434 0.09
435 0.08
436 0.05
437 0.05
438 0.06
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.04
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.05
456 0.05
457 0.06
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.06
462 0.07
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.04
468 0.06
469 0.07
470 0.08
471 0.08
472 0.09
473 0.13
474 0.16
475 0.21
476 0.2
477 0.19
478 0.18
479 0.19
480 0.19
481 0.15
482 0.13
483 0.1
484 0.1
485 0.1
486 0.09
487 0.08
488 0.08
489 0.06
490 0.05
491 0.04
492 0.04
493 0.03
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.05
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.06
504 0.07
505 0.06
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.06
510 0.05
511 0.05
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.07
521 0.09
522 0.11
523 0.15
524 0.18
525 0.18
526 0.22
527 0.27
528 0.31
529 0.3
530 0.3
531 0.28
532 0.28
533 0.28
534 0.23
535 0.18
536 0.13
537 0.12
538 0.1
539 0.07
540 0.07
541 0.09
542 0.11
543 0.14
544 0.16
545 0.17
546 0.17
547 0.19
548 0.19
549 0.2
550 0.19
551 0.18
552 0.16
553 0.15
554 0.14
555 0.11
556 0.1
557 0.07
558 0.06
559 0.04
560 0.05
561 0.05
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.05
566 0.06
567 0.12
568 0.16
569 0.19
570 0.19
571 0.21
572 0.22
573 0.23
574 0.24
575 0.21
576 0.18
577 0.16
578 0.19
579 0.19
580 0.19
581 0.18
582 0.17
583 0.14
584 0.13
585 0.12
586 0.09
587 0.08
588 0.1
589 0.11
590 0.11
591 0.14
592 0.15
593 0.18
594 0.17
595 0.19
596 0.23
597 0.27
598 0.28
599 0.28
600 0.27
601 0.24
602 0.24
603 0.23
604 0.21
605 0.17
606 0.2
607 0.17
608 0.17
609 0.21
610 0.21
611 0.21
612 0.18
613 0.17
614 0.13
615 0.17
616 0.16
617 0.13
618 0.12
619 0.11
620 0.11
621 0.1
622 0.1
623 0.06
624 0.06
625 0.1
626 0.1
627 0.1
628 0.11
629 0.1
630 0.1
631 0.11
632 0.1
633 0.1
634 0.11
635 0.11
636 0.11
637 0.11
638 0.12
639 0.13
640 0.12
641 0.08
642 0.07
643 0.07
644 0.06
645 0.06
646 0.07
647 0.07
648 0.08
649 0.07
650 0.07
651 0.08
652 0.08
653 0.08
654 0.06
655 0.06
656 0.07
657 0.08
658 0.08
659 0.07
660 0.08
661 0.11
662 0.11
663 0.12
664 0.13
665 0.13
666 0.15
667 0.16
668 0.17
669 0.14
670 0.14
671 0.16
672 0.14
673 0.13
674 0.11
675 0.1
676 0.09
677 0.09
678 0.08
679 0.06
680 0.06
681 0.06
682 0.07
683 0.07
684 0.08
685 0.1
686 0.13
687 0.2
688 0.22
689 0.24
690 0.27
691 0.28
692 0.27
693 0.26
694 0.24
695 0.16
696 0.14
697 0.13
698 0.14
699 0.13
700 0.12
701 0.17
702 0.22
703 0.28
704 0.32
705 0.35
706 0.35
707 0.41
708 0.45
709 0.49
710 0.52
711 0.48
712 0.47
713 0.48
714 0.45
715 0.39
716 0.37
717 0.31
718 0.23
719 0.23
720 0.2
721 0.16
722 0.16
723 0.19
724 0.23
725 0.27
726 0.28
727 0.28
728 0.33
729 0.37
730 0.38
731 0.4
732 0.39
733 0.39
734 0.43
735 0.43
736 0.43
737 0.47
738 0.46
739 0.48
740 0.49
741 0.45
742 0.41
743 0.4
744 0.4
745 0.31
746 0.31
747 0.28
748 0.24
749 0.22
750 0.21
751 0.2
752 0.14
753 0.13
754 0.13
755 0.09
756 0.07
757 0.06
758 0.05
759 0.05
760 0.06
761 0.08
762 0.08
763 0.09
764 0.1
765 0.1
766 0.11
767 0.16
768 0.17
769 0.2
770 0.23
771 0.23
772 0.28
773 0.29
774 0.3
775 0.27
776 0.26
777 0.21
778 0.19
779 0.19
780 0.13
781 0.14
782 0.13
783 0.11
784 0.11
785 0.11
786 0.1
787 0.13
788 0.13
789 0.12
790 0.12
791 0.12
792 0.12
793 0.12
794 0.12
795 0.08
796 0.08
797 0.15
798 0.16
799 0.19
800 0.23
801 0.25
802 0.26
803 0.28
804 0.29
805 0.23
806 0.25
807 0.29
808 0.28
809 0.29
810 0.28
811 0.26
812 0.26
813 0.25
814 0.23
815 0.26
816 0.24
817 0.21
818 0.21
819 0.22
820 0.27
821 0.29
822 0.29
823 0.23
824 0.26
825 0.27
826 0.27
827 0.31
828 0.28
829 0.27
830 0.33
831 0.35
832 0.35
833 0.39
834 0.45
835 0.46
836 0.5
837 0.52
838 0.51
839 0.47
840 0.43
841 0.42
842 0.38
843 0.33
844 0.28
845 0.24
846 0.21