Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1U7LPB6

Protein Details
Accession A0A1U7LPB6    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-51KAALEERKRIEQKKKEIEEERQLSHydrophilic
161-217KMLREAKEGKERRKKHRHRNEDDRDRRRHRSRSYDDNRTRKRSRSRDDKPTRRTERSBasic
312-339RTSPPPGRRSRSPYHRPNRPSPIRRSNSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
159-225KMKMLREAKEGKERRKKHRHRNEDDRDRRRHRSRSYDDNRTRKRSRSRDDKPTRRTERSTERRATIR
238-246RRDSRNERR
312-335RTSPPPGRRSRSPYHRPNRPSPIR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, mito_nucl 13, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR022209  CWC25  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
PF12542  CWC25  
Amino Acid Sequences MGGGDLNMKKSWHPLLLVNQAKVWEKEKAALEERKRIEQKKKEIEEERQLSELQRLQEAAGGKKRVERVDWMYAVPGGTGGGGGTTEEMEDYLLGKKRIDQLIKDDDAEKSSKVYKHFIASQNANTIRDTQKKIREDPLLAIKKQEQAAYEELMKNPLKMKMLREAKEGKERRKKHRHRNEDDRDRRRHRSRSYDDNRTRKRSRSRDDKPTRRTERSTERRATIRHHHDSHEQLRFHRRDSRNERRSSRERGSRCRSPFPQYDKSTSNGYFHRQSSSRSSGRRSLSPLNCPFKRRAISRSPYRKDIYFEKNRTSPPPGRRSRSPYHRPNRPSPIRRSNSEERANKLAEMQANASELEMTREKRLKELEEQEKKDQKRDFETRKINGRYGGTAHFMKGVQRQVYDGKKSLGERIQRGKAGYSRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.38
3 0.48
4 0.52
5 0.48
6 0.44
7 0.44
8 0.46
9 0.43
10 0.38
11 0.33
12 0.29
13 0.34
14 0.38
15 0.41
16 0.45
17 0.51
18 0.54
19 0.58
20 0.6
21 0.64
22 0.67
23 0.69
24 0.71
25 0.72
26 0.77
27 0.79
28 0.82
29 0.82
30 0.81
31 0.81
32 0.81
33 0.77
34 0.68
35 0.59
36 0.53
37 0.45
38 0.43
39 0.38
40 0.29
41 0.25
42 0.23
43 0.21
44 0.23
45 0.25
46 0.26
47 0.29
48 0.3
49 0.29
50 0.34
51 0.39
52 0.39
53 0.38
54 0.39
55 0.38
56 0.44
57 0.45
58 0.4
59 0.36
60 0.34
61 0.31
62 0.23
63 0.17
64 0.08
65 0.06
66 0.06
67 0.04
68 0.03
69 0.03
70 0.03
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.06
79 0.1
80 0.14
81 0.15
82 0.15
83 0.19
84 0.26
85 0.33
86 0.36
87 0.33
88 0.37
89 0.44
90 0.45
91 0.43
92 0.37
93 0.31
94 0.3
95 0.29
96 0.22
97 0.17
98 0.21
99 0.23
100 0.24
101 0.28
102 0.27
103 0.31
104 0.38
105 0.42
106 0.43
107 0.44
108 0.43
109 0.47
110 0.46
111 0.43
112 0.36
113 0.34
114 0.33
115 0.36
116 0.4
117 0.39
118 0.46
119 0.5
120 0.53
121 0.56
122 0.54
123 0.49
124 0.48
125 0.51
126 0.48
127 0.43
128 0.42
129 0.38
130 0.37
131 0.37
132 0.34
133 0.24
134 0.22
135 0.24
136 0.23
137 0.24
138 0.21
139 0.2
140 0.24
141 0.23
142 0.2
143 0.21
144 0.22
145 0.22
146 0.23
147 0.25
148 0.3
149 0.38
150 0.38
151 0.41
152 0.44
153 0.44
154 0.52
155 0.56
156 0.56
157 0.58
158 0.65
159 0.7
160 0.76
161 0.82
162 0.83
163 0.88
164 0.89
165 0.89
166 0.92
167 0.92
168 0.92
169 0.92
170 0.9
171 0.89
172 0.85
173 0.85
174 0.82
175 0.8
176 0.75
177 0.76
178 0.73
179 0.74
180 0.75
181 0.77
182 0.77
183 0.79
184 0.79
185 0.77
186 0.75
187 0.71
188 0.74
189 0.73
190 0.73
191 0.73
192 0.74
193 0.77
194 0.84
195 0.86
196 0.83
197 0.84
198 0.82
199 0.77
200 0.72
201 0.67
202 0.67
203 0.66
204 0.67
205 0.61
206 0.56
207 0.55
208 0.54
209 0.53
210 0.51
211 0.51
212 0.5
213 0.48
214 0.47
215 0.48
216 0.53
217 0.54
218 0.51
219 0.43
220 0.39
221 0.46
222 0.45
223 0.43
224 0.47
225 0.44
226 0.47
227 0.56
228 0.65
229 0.64
230 0.71
231 0.73
232 0.71
233 0.74
234 0.72
235 0.7
236 0.67
237 0.64
238 0.67
239 0.7
240 0.7
241 0.68
242 0.68
243 0.64
244 0.62
245 0.64
246 0.62
247 0.64
248 0.59
249 0.59
250 0.53
251 0.51
252 0.49
253 0.42
254 0.37
255 0.3
256 0.31
257 0.31
258 0.3
259 0.33
260 0.29
261 0.31
262 0.35
263 0.4
264 0.41
265 0.4
266 0.44
267 0.46
268 0.48
269 0.48
270 0.46
271 0.48
272 0.47
273 0.53
274 0.57
275 0.59
276 0.59
277 0.58
278 0.56
279 0.54
280 0.56
281 0.51
282 0.49
283 0.51
284 0.57
285 0.64
286 0.72
287 0.69
288 0.7
289 0.69
290 0.64
291 0.58
292 0.57
293 0.57
294 0.56
295 0.56
296 0.55
297 0.57
298 0.58
299 0.58
300 0.58
301 0.56
302 0.55
303 0.61
304 0.64
305 0.65
306 0.7
307 0.74
308 0.76
309 0.78
310 0.79
311 0.79
312 0.81
313 0.84
314 0.83
315 0.84
316 0.85
317 0.85
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320 0.84
321 0.8
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323 0.76
324 0.75
325 0.73
326 0.74
327 0.69
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339 0.2
340 0.18
341 0.14
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343 0.14
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348 0.29
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355 0.61
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357 0.71
358 0.75
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360 0.72
361 0.67
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363 0.62
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365 0.66
366 0.67
367 0.74
368 0.74
369 0.79
370 0.78
371 0.72
372 0.67
373 0.61
374 0.53
375 0.47
376 0.43
377 0.38
378 0.34
379 0.31
380 0.28
381 0.26
382 0.27
383 0.3
384 0.34
385 0.33
386 0.32
387 0.35
388 0.4
389 0.48
390 0.49
391 0.47
392 0.42
393 0.44
394 0.45
395 0.49
396 0.48
397 0.49
398 0.51
399 0.57
400 0.61
401 0.6
402 0.6
403 0.58