Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1U7LTB5

Protein Details
Accession A0A1U7LTB5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
124-144KTEFSKHKYVKRKEEKFLRTFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
402-413KGKALRKSKATK
Subcellular Location(s) cyto 14, nucl 9, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MASAIIQADKYILLRLPSTNTKLLVLKDHSTVNLGKFGVFHADDIIGKPYGHTYEICADKKLKIVRKHQLTYSVDEVNNNQATIDDTARQTLTMDDIEALKTGDLQGRQIIDTVIQGHMAYDEKTEFSKHKYVKRKEEKFLRTFTPLKPTSWNIAQHFFEKDMAKILELKVETLSFILTAANIRPGGKYLVVDDAAGLITTAILERLGGSGTVLSLHDNEHPNFDIIKYLDFREDTLTRLLYNLDFLEAFYPNERSSLEATGDPATMKSRQREAYYRKQRAYTRLSECRHIYDEQNFDALIIATSFDPICLLSRLTPQVSGSRVIVVYSPHKETLIHTSHWMQAQHTILAPTVSEIRARKFQAILGRIHPEMMATSGGGYVLTGIRVLPVDSVVAKGKVDFKGKALRKSKATKDLNGEKRKIEMNEYVGGEPDSKKLKVDTTADQI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.18
3 0.24
4 0.3
5 0.35
6 0.36
7 0.35
8 0.37
9 0.38
10 0.38
11 0.39
12 0.37
13 0.35
14 0.34
15 0.35
16 0.32
17 0.32
18 0.33
19 0.27
20 0.27
21 0.25
22 0.22
23 0.2
24 0.21
25 0.23
26 0.2
27 0.18
28 0.15
29 0.16
30 0.17
31 0.18
32 0.2
33 0.15
34 0.14
35 0.15
36 0.16
37 0.16
38 0.17
39 0.16
40 0.17
41 0.23
42 0.31
43 0.32
44 0.33
45 0.34
46 0.34
47 0.4
48 0.45
49 0.46
50 0.47
51 0.56
52 0.62
53 0.7
54 0.73
55 0.7
56 0.71
57 0.66
58 0.62
59 0.57
60 0.52
61 0.43
62 0.4
63 0.37
64 0.35
65 0.33
66 0.27
67 0.22
68 0.16
69 0.18
70 0.19
71 0.19
72 0.15
73 0.15
74 0.17
75 0.17
76 0.17
77 0.15
78 0.13
79 0.13
80 0.11
81 0.1
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.11
91 0.11
92 0.12
93 0.14
94 0.15
95 0.15
96 0.15
97 0.14
98 0.11
99 0.12
100 0.12
101 0.1
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.13
113 0.14
114 0.18
115 0.26
116 0.31
117 0.39
118 0.49
119 0.57
120 0.66
121 0.75
122 0.78
123 0.8
124 0.84
125 0.84
126 0.79
127 0.75
128 0.67
129 0.63
130 0.59
131 0.52
132 0.51
133 0.43
134 0.4
135 0.39
136 0.38
137 0.37
138 0.38
139 0.42
140 0.35
141 0.38
142 0.37
143 0.35
144 0.34
145 0.3
146 0.28
147 0.23
148 0.2
149 0.19
150 0.18
151 0.16
152 0.17
153 0.16
154 0.16
155 0.15
156 0.16
157 0.12
158 0.12
159 0.11
160 0.09
161 0.09
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.09
177 0.11
178 0.11
179 0.1
180 0.09
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.02
190 0.02
191 0.02
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.06
204 0.09
205 0.12
206 0.13
207 0.14
208 0.15
209 0.15
210 0.15
211 0.14
212 0.12
213 0.1
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.12
218 0.12
219 0.12
220 0.14
221 0.14
222 0.14
223 0.14
224 0.14
225 0.12
226 0.13
227 0.13
228 0.09
229 0.09
230 0.07
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.11
244 0.12
245 0.12
246 0.11
247 0.13
248 0.13
249 0.13
250 0.11
251 0.1
252 0.11
253 0.14
254 0.17
255 0.19
256 0.23
257 0.26
258 0.3
259 0.38
260 0.44
261 0.51
262 0.59
263 0.64
264 0.61
265 0.65
266 0.65
267 0.64
268 0.63
269 0.61
270 0.58
271 0.6
272 0.59
273 0.58
274 0.55
275 0.51
276 0.47
277 0.41
278 0.36
279 0.33
280 0.34
281 0.29
282 0.28
283 0.24
284 0.2
285 0.19
286 0.15
287 0.09
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.09
300 0.13
301 0.16
302 0.17
303 0.18
304 0.17
305 0.2
306 0.21
307 0.22
308 0.18
309 0.17
310 0.16
311 0.15
312 0.15
313 0.14
314 0.18
315 0.2
316 0.22
317 0.2
318 0.21
319 0.21
320 0.22
321 0.28
322 0.27
323 0.25
324 0.25
325 0.27
326 0.3
327 0.33
328 0.32
329 0.24
330 0.25
331 0.26
332 0.24
333 0.22
334 0.2
335 0.16
336 0.16
337 0.15
338 0.11
339 0.12
340 0.11
341 0.14
342 0.16
343 0.2
344 0.26
345 0.28
346 0.3
347 0.28
348 0.31
349 0.35
350 0.37
351 0.37
352 0.35
353 0.37
354 0.34
355 0.34
356 0.3
357 0.22
358 0.18
359 0.16
360 0.12
361 0.07
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.06
367 0.06
368 0.05
369 0.06
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.08
378 0.08
379 0.11
380 0.13
381 0.14
382 0.13
383 0.15
384 0.2
385 0.25
386 0.3
387 0.29
388 0.31
389 0.4
390 0.47
391 0.55
392 0.57
393 0.58
394 0.62
395 0.7
396 0.75
397 0.75
398 0.75
399 0.72
400 0.74
401 0.78
402 0.79
403 0.8
404 0.74
405 0.65
406 0.63
407 0.63
408 0.55
409 0.5
410 0.46
411 0.41
412 0.43
413 0.44
414 0.4
415 0.35
416 0.33
417 0.3
418 0.25
419 0.26
420 0.26
421 0.23
422 0.25
423 0.27
424 0.3
425 0.35
426 0.39