Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1U7LJM3

Protein Details
Accession A0A1U7LJM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
442-466NKGGGNKRTDNKRADNKRAGKKLEMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
427-463KKRADNKGGDNKGGGNKGGGNKRTDNKRADNKRAGKK
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_pero 8.5, nucl 8, pero 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR041177  GEN1_C  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
IPR001044  XPG/Rad2_eukaryotes  
IPR006085  XPG_DNA_repair_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004519  F:endonuclease activity  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF18380  GEN1_C  
PF00867  XPG_I  
PF00752  XPG_N  
CDD cd09870  PIN_YEN1  
Amino Acid Sequences MGIPGLWDVHEPSRKRVAFTKLAEDHRAQYGRPLRVAIDASIWSFQIKASKGGQNPALRTLYYRLSRLLLLGIHPLFVFDGPLRPEIKRNHKVSHNPPFQIAQMKKLINLFGFALWNAPGEAEAECAMLQSNGVVDLVMTEDVDCIMFGGTKVIRNWSSEASTKSPTHVDLYENMNDIDRMGMVLVALMHGGDYLPAGIANCGIKTAVEAARAGFGRRLKDPDFRHFLGESLRTNKDGHFSTKHPGIKIPDAFPDCKVMNYYLAPVVTSTTNYKQIDWNEKPKLEGLVCYCQDVLGWVGTGKLIQSLSPSYLIWKLGTQTINENIGRGNNLYPLSKKHTQALIENISCTRRHFSADYILEFRISFIPDKVFPVKLVALEECESEIESENQVNLPRKFDPSLPMKLWLPESIVRNGASKVVEQYEMSKKRADNKGGDNKGGGNKGGGNKRTDNKRADNKRAGKKLEMSIDQRGAMDKFLIKIGANEXXXXQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.49
3 0.53
4 0.53
5 0.55
6 0.57
7 0.61
8 0.58
9 0.62
10 0.64
11 0.59
12 0.54
13 0.53
14 0.5
15 0.4
16 0.41
17 0.44
18 0.44
19 0.43
20 0.41
21 0.34
22 0.37
23 0.39
24 0.3
25 0.25
26 0.21
27 0.21
28 0.2
29 0.19
30 0.15
31 0.13
32 0.13
33 0.17
34 0.17
35 0.2
36 0.25
37 0.31
38 0.34
39 0.4
40 0.46
41 0.46
42 0.46
43 0.48
44 0.44
45 0.37
46 0.37
47 0.35
48 0.36
49 0.33
50 0.33
51 0.29
52 0.29
53 0.29
54 0.27
55 0.26
56 0.18
57 0.16
58 0.21
59 0.19
60 0.17
61 0.17
62 0.16
63 0.15
64 0.13
65 0.14
66 0.08
67 0.12
68 0.14
69 0.18
70 0.2
71 0.2
72 0.28
73 0.35
74 0.45
75 0.5
76 0.54
77 0.58
78 0.64
79 0.73
80 0.76
81 0.78
82 0.76
83 0.68
84 0.64
85 0.59
86 0.53
87 0.53
88 0.43
89 0.38
90 0.36
91 0.35
92 0.35
93 0.35
94 0.35
95 0.25
96 0.26
97 0.21
98 0.15
99 0.15
100 0.13
101 0.12
102 0.1
103 0.1
104 0.09
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.05
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.03
123 0.04
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.05
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.07
137 0.08
138 0.11
139 0.12
140 0.17
141 0.18
142 0.2
143 0.22
144 0.21
145 0.23
146 0.24
147 0.27
148 0.26
149 0.3
150 0.28
151 0.28
152 0.27
153 0.25
154 0.24
155 0.21
156 0.19
157 0.18
158 0.22
159 0.22
160 0.21
161 0.2
162 0.18
163 0.16
164 0.15
165 0.11
166 0.07
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.03
171 0.04
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.02
180 0.02
181 0.02
182 0.02
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.08
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.12
199 0.13
200 0.13
201 0.13
202 0.14
203 0.16
204 0.17
205 0.22
206 0.22
207 0.3
208 0.33
209 0.37
210 0.42
211 0.4
212 0.41
213 0.36
214 0.34
215 0.3
216 0.28
217 0.23
218 0.21
219 0.21
220 0.2
221 0.21
222 0.2
223 0.21
224 0.2
225 0.22
226 0.2
227 0.21
228 0.24
229 0.3
230 0.32
231 0.28
232 0.3
233 0.29
234 0.31
235 0.31
236 0.29
237 0.27
238 0.28
239 0.28
240 0.25
241 0.26
242 0.2
243 0.19
244 0.18
245 0.14
246 0.13
247 0.13
248 0.13
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.08
256 0.1
257 0.11
258 0.19
259 0.19
260 0.2
261 0.23
262 0.27
263 0.36
264 0.37
265 0.44
266 0.42
267 0.42
268 0.41
269 0.39
270 0.37
271 0.28
272 0.26
273 0.22
274 0.24
275 0.24
276 0.24
277 0.22
278 0.19
279 0.18
280 0.16
281 0.13
282 0.06
283 0.06
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.07
293 0.08
294 0.09
295 0.1
296 0.1
297 0.11
298 0.12
299 0.13
300 0.12
301 0.12
302 0.12
303 0.16
304 0.17
305 0.16
306 0.17
307 0.19
308 0.23
309 0.22
310 0.22
311 0.17
312 0.17
313 0.17
314 0.15
315 0.13
316 0.12
317 0.13
318 0.15
319 0.16
320 0.19
321 0.26
322 0.3
323 0.31
324 0.33
325 0.36
326 0.37
327 0.39
328 0.42
329 0.41
330 0.36
331 0.36
332 0.32
333 0.3
334 0.29
335 0.27
336 0.23
337 0.17
338 0.2
339 0.21
340 0.22
341 0.29
342 0.32
343 0.33
344 0.32
345 0.31
346 0.28
347 0.26
348 0.25
349 0.17
350 0.16
351 0.14
352 0.13
353 0.16
354 0.16
355 0.21
356 0.22
357 0.21
358 0.2
359 0.22
360 0.21
361 0.2
362 0.21
363 0.17
364 0.17
365 0.17
366 0.17
367 0.14
368 0.13
369 0.12
370 0.11
371 0.12
372 0.1
373 0.11
374 0.11
375 0.11
376 0.13
377 0.17
378 0.24
379 0.23
380 0.26
381 0.27
382 0.31
383 0.32
384 0.33
385 0.35
386 0.34
387 0.41
388 0.38
389 0.4
390 0.38
391 0.38
392 0.38
393 0.32
394 0.3
395 0.27
396 0.29
397 0.28
398 0.29
399 0.27
400 0.27
401 0.26
402 0.26
403 0.22
404 0.19
405 0.2
406 0.2
407 0.2
408 0.19
409 0.24
410 0.31
411 0.36
412 0.36
413 0.38
414 0.38
415 0.46
416 0.55
417 0.56
418 0.53
419 0.58
420 0.67
421 0.67
422 0.67
423 0.58
424 0.54
425 0.54
426 0.48
427 0.38
428 0.29
429 0.29
430 0.35
431 0.42
432 0.42
433 0.41
434 0.46
435 0.54
436 0.62
437 0.66
438 0.66
439 0.68
440 0.74
441 0.79
442 0.82
443 0.84
444 0.84
445 0.87
446 0.88
447 0.83
448 0.79
449 0.75
450 0.72
451 0.7
452 0.67
453 0.62
454 0.61
455 0.58
456 0.52
457 0.46
458 0.42
459 0.34
460 0.28
461 0.26
462 0.2
463 0.19
464 0.2
465 0.21
466 0.17