Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1U7LIR7

Protein Details
Accession A0A1U7LIR7    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-108TEKNLLKHSKQIPKDKQSFEHydrophilic
344-367QRATKDPPSKKIKIKKQGSQSTLPHydrophilic
420-447VTRGKGFRTEKGKKKKGSYKGGKIDMESBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
232-233KK
354-354K
422-441RGKGFRTEKGKKKKGSYKGG
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MRSVPDDLLPLIWHFLDSNDYKKAAKAFAKQVGRDLQSDIALESSLVDIYNRYLESKNNDESAGSSKESSSSDESTSESEEKAKEQTATEKNLLKHSKQIPKDKQSFEHGNTLPAGKDLNGSSGLNTIKPRSVSSAEPSSSESQLTSSSSESDSEKEAAPAKTEKRVSNRRDGKETSAFDKVSGKKRVRDESSSSSTESTGSDSSNSESESESEEPAPAKTIKSVSKRTDAKKKTTFDKASSKKRVRDESNSSSSESSGSDSSDSESESESEEPAPAKTIKSVSKRTDAKQKTTFDTASGKKRVRDESSSSSSENSDSDSSDSESKSEASEKTHFMSSSSAPNQRATKDPPSKKIKIKKQGSQSTLPSTLPTPIEDGRLNVPFSRVKKDEITFADESLRDNRFKAPEDSYGAKASRDLIVTRGKGFRTEKGKKKKGSYKGGKIDMESRSFKFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.17
4 0.19
5 0.23
6 0.25
7 0.27
8 0.27
9 0.3
10 0.33
11 0.34
12 0.38
13 0.41
14 0.46
15 0.54
16 0.6
17 0.58
18 0.61
19 0.61
20 0.56
21 0.5
22 0.44
23 0.37
24 0.31
25 0.3
26 0.24
27 0.17
28 0.14
29 0.12
30 0.1
31 0.08
32 0.07
33 0.06
34 0.06
35 0.06
36 0.08
37 0.11
38 0.11
39 0.14
40 0.15
41 0.2
42 0.26
43 0.32
44 0.34
45 0.33
46 0.33
47 0.3
48 0.31
49 0.31
50 0.28
51 0.23
52 0.2
53 0.18
54 0.21
55 0.21
56 0.23
57 0.22
58 0.21
59 0.22
60 0.22
61 0.23
62 0.22
63 0.25
64 0.22
65 0.18
66 0.19
67 0.19
68 0.2
69 0.21
70 0.22
71 0.2
72 0.2
73 0.29
74 0.31
75 0.36
76 0.39
77 0.42
78 0.42
79 0.49
80 0.53
81 0.45
82 0.48
83 0.51
84 0.55
85 0.58
86 0.67
87 0.68
88 0.73
89 0.81
90 0.76
91 0.71
92 0.71
93 0.7
94 0.63
95 0.62
96 0.52
97 0.45
98 0.42
99 0.38
100 0.3
101 0.23
102 0.2
103 0.11
104 0.13
105 0.11
106 0.12
107 0.13
108 0.13
109 0.12
110 0.16
111 0.16
112 0.16
113 0.18
114 0.18
115 0.18
116 0.19
117 0.2
118 0.21
119 0.23
120 0.23
121 0.27
122 0.31
123 0.29
124 0.29
125 0.32
126 0.3
127 0.27
128 0.25
129 0.2
130 0.14
131 0.14
132 0.14
133 0.12
134 0.1
135 0.11
136 0.11
137 0.12
138 0.12
139 0.13
140 0.14
141 0.14
142 0.14
143 0.14
144 0.18
145 0.17
146 0.19
147 0.22
148 0.22
149 0.28
150 0.32
151 0.35
152 0.4
153 0.49
154 0.51
155 0.57
156 0.65
157 0.62
158 0.64
159 0.62
160 0.59
161 0.57
162 0.55
163 0.47
164 0.42
165 0.38
166 0.32
167 0.37
168 0.36
169 0.37
170 0.43
171 0.43
172 0.44
173 0.51
174 0.58
175 0.56
176 0.55
177 0.53
178 0.52
179 0.54
180 0.5
181 0.44
182 0.37
183 0.32
184 0.27
185 0.21
186 0.16
187 0.11
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.09
195 0.08
196 0.09
197 0.12
198 0.12
199 0.12
200 0.11
201 0.12
202 0.12
203 0.11
204 0.13
205 0.1
206 0.09
207 0.1
208 0.13
209 0.19
210 0.25
211 0.32
212 0.33
213 0.41
214 0.47
215 0.52
216 0.59
217 0.57
218 0.6
219 0.61
220 0.62
221 0.59
222 0.61
223 0.59
224 0.54
225 0.6
226 0.59
227 0.62
228 0.68
229 0.69
230 0.66
231 0.69
232 0.71
233 0.67
234 0.66
235 0.65
236 0.62
237 0.62
238 0.57
239 0.52
240 0.44
241 0.38
242 0.3
243 0.22
244 0.16
245 0.1
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.08
259 0.09
260 0.09
261 0.08
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.1
266 0.13
267 0.19
268 0.25
269 0.32
270 0.33
271 0.41
272 0.46
273 0.48
274 0.55
275 0.54
276 0.56
277 0.57
278 0.58
279 0.53
280 0.53
281 0.49
282 0.41
283 0.43
284 0.41
285 0.41
286 0.45
287 0.44
288 0.43
289 0.48
290 0.52
291 0.5
292 0.5
293 0.48
294 0.48
295 0.51
296 0.5
297 0.45
298 0.4
299 0.35
300 0.3
301 0.24
302 0.19
303 0.14
304 0.12
305 0.13
306 0.13
307 0.14
308 0.16
309 0.16
310 0.14
311 0.14
312 0.14
313 0.14
314 0.16
315 0.15
316 0.17
317 0.2
318 0.22
319 0.24
320 0.26
321 0.25
322 0.22
323 0.24
324 0.21
325 0.26
326 0.3
327 0.33
328 0.32
329 0.36
330 0.38
331 0.37
332 0.41
333 0.39
334 0.44
335 0.49
336 0.55
337 0.6
338 0.66
339 0.71
340 0.76
341 0.8
342 0.79
343 0.8
344 0.82
345 0.81
346 0.82
347 0.84
348 0.8
349 0.77
350 0.71
351 0.67
352 0.6
353 0.53
354 0.43
355 0.35
356 0.33
357 0.26
358 0.22
359 0.2
360 0.18
361 0.22
362 0.21
363 0.22
364 0.23
365 0.25
366 0.26
367 0.22
368 0.25
369 0.27
370 0.29
371 0.36
372 0.33
373 0.35
374 0.4
375 0.41
376 0.45
377 0.43
378 0.47
379 0.39
380 0.38
381 0.38
382 0.32
383 0.32
384 0.3
385 0.3
386 0.24
387 0.25
388 0.3
389 0.3
390 0.34
391 0.36
392 0.35
393 0.37
394 0.42
395 0.45
396 0.42
397 0.43
398 0.39
399 0.35
400 0.31
401 0.28
402 0.25
403 0.23
404 0.21
405 0.21
406 0.28
407 0.3
408 0.34
409 0.36
410 0.34
411 0.39
412 0.42
413 0.46
414 0.48
415 0.56
416 0.62
417 0.69
418 0.77
419 0.78
420 0.85
421 0.87
422 0.87
423 0.88
424 0.88
425 0.88
426 0.88
427 0.88
428 0.8
429 0.74
430 0.71
431 0.66
432 0.61
433 0.56