FuNGI

A0A1U7LHU8

Protein Details

Accession

A0A1U7LHU8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
407-428	GQWRCEKCDKSYPKPNHRYIMT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 12, cyto_nucl 9.833, cyto_mito 8.833, nucl 6.5, mito 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR047192 Euk_RPA1_DBD_C IPR012340 NA-bd_OB-fold IPR004365 NA-bd_OB_tRNA IPR013955 Rep_factor-A_C IPR031657 REPA_OB_2 IPR004591 Rfa1
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0046872 F:metal ion binding GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair GO:0006260 P:DNA replication
Pfam	View protein in Pfam PF08646 Rep_fac-A_C PF16900 REPA_OB_2 PF01336 tRNA_anti-codon
CDD	cd04474 RPA1_DBD_A cd04475 RPA1_DBD_B cd04476 RPA1_DBD_C

Amino Acid Sequences

MKERRILIVLNLEVLEDLGIQEKIGDPVVLEAAVGGQGQQQQQQAQQPVHQPRQVAPISNTNFYGNNKPAPQNQLQQTMKLAPSSTGGHAAAIYPIEGLSPYQNKWTIKARVTFKSEIKHWHNQRGEGKLFSVHLLDESGEIKATGFNDQCDSFYEVLQEGQVYFISKCRVNIAKKQFSNIQNEYELSFERDTEIEKCEDQSSVPQERYNFVELGNVSQIEKDNTIDVIGVVKEVHDLSEITSKTTQKPISKRDLTIVDSSQYSIRLTLWGKQAQNFSTDEGNVIAVKGVKVSDFNGRSLSMYSSSTMSVNPDIDEAHSLKGWYDGSGKSENFSTHANIGGSLSAASGRKEDRKTLAQLKDEGIGMSEQPDYFTTKATIVFIKQDNISYPACPAEACNKKVIEDSDGQWRCEKCDKSYPKPNHRYIMTISVNDHTGQAWFSTFDDVGKQIMGKTADELFQLKEENEQAYLDVINGATCTTFNFRCRAKQDNFQGQAWAYLVVLGATTINFTQASKELIELINAYGI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.15
3	0.07
4	0.07
5	0.07
6	0.07
7	0.07
8	0.08
9	0.09
10	0.1
11	0.11
12	0.1
13	0.08
14	0.1
15	0.11
16	0.1
17	0.08
18	0.07
19	0.06
20	0.07
21	0.07
22	0.05
23	0.07
24	0.12
25	0.13
26	0.18
27	0.2
28	0.22
29	0.27
30	0.34
31	0.37
32	0.36
33	0.39
34	0.45
35	0.52
36	0.57
37	0.55
38	0.49
39	0.46
40	0.53
41	0.5
42	0.46
43	0.4
44	0.42
45	0.43
46	0.44
47	0.43
48	0.36
49	0.36
50	0.35
51	0.39
52	0.33
53	0.36
54	0.38
55	0.41
56	0.44
57	0.49
58	0.51
59	0.52
60	0.53
61	0.57
62	0.54
63	0.51
64	0.49
65	0.47
66	0.42
67	0.34
68	0.29
69	0.2
70	0.22
71	0.23
72	0.21
73	0.2
74	0.18
75	0.17
76	0.17
77	0.16
78	0.14
79	0.11
80	0.1
81	0.06
82	0.06
83	0.06
84	0.06
85	0.06
86	0.11
87	0.14
88	0.15
89	0.2
90	0.25
91	0.26
92	0.3
93	0.38
94	0.4
95	0.43
96	0.5
97	0.51
98	0.53
99	0.59
100	0.6
101	0.56
102	0.55
103	0.53
104	0.55
105	0.56
106	0.59
107	0.59
108	0.63
109	0.62
110	0.64
111	0.66
112	0.64
113	0.59
114	0.5
115	0.45
116	0.37
117	0.34
118	0.27
119	0.22
120	0.14
121	0.12
122	0.11
123	0.1
124	0.09
125	0.09
126	0.08
127	0.07
128	0.07
129	0.07
130	0.08
131	0.09
132	0.12
133	0.12
134	0.13
135	0.16
136	0.16
137	0.16
138	0.18
139	0.21
140	0.17
141	0.16
142	0.17
143	0.14
144	0.14
145	0.14
146	0.11
147	0.07
148	0.07
149	0.07
150	0.07
151	0.07
152	0.1
153	0.13
154	0.14
155	0.14
156	0.19
157	0.26
158	0.29
159	0.38
160	0.46
161	0.53
162	0.52
163	0.55
164	0.58
165	0.56
166	0.59
167	0.53
168	0.46
169	0.37
170	0.37
171	0.34
172	0.27
173	0.23
174	0.17
175	0.15
176	0.12
177	0.11
178	0.11
179	0.12
180	0.13
181	0.14
182	0.13
183	0.13
184	0.14
185	0.14
186	0.14
187	0.13
188	0.16
189	0.19
190	0.22
191	0.23
192	0.23
193	0.23
194	0.25
195	0.27
196	0.25
197	0.19
198	0.15
199	0.17
200	0.15
201	0.16
202	0.15
203	0.13
204	0.1
205	0.11
206	0.12
207	0.1
208	0.1
209	0.09
210	0.08
211	0.08
212	0.08
213	0.07
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.06
226	0.12
227	0.12
228	0.13
229	0.16
230	0.18
231	0.19
232	0.24
233	0.28
234	0.28
235	0.35
236	0.4
237	0.46
238	0.48
239	0.47
240	0.45
241	0.44
242	0.41
243	0.36
244	0.31
245	0.22
246	0.19
247	0.19
248	0.16
249	0.13
250	0.1
251	0.08
252	0.07
253	0.1
254	0.1
255	0.14
256	0.19
257	0.23
258	0.23
259	0.26
260	0.29
261	0.26
262	0.27
263	0.23
264	0.2
265	0.16
266	0.16
267	0.13
268	0.1
269	0.1
270	0.08
271	0.07
272	0.06
273	0.05
274	0.05
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.06
279	0.07
280	0.14
281	0.15
282	0.16
283	0.17
284	0.17
285	0.17
286	0.18
287	0.17
288	0.11
289	0.11
290	0.11
291	0.11
292	0.11
293	0.11
294	0.1
295	0.11
296	0.1
297	0.1
298	0.09
299	0.09
300	0.08
301	0.08
302	0.11
303	0.1
304	0.09
305	0.09
306	0.09
307	0.09
308	0.11
309	0.1
310	0.09
311	0.11
312	0.11
313	0.14
314	0.18
315	0.18
316	0.17
317	0.18
318	0.18
319	0.17
320	0.17
321	0.16
322	0.12
323	0.14
324	0.13
325	0.12
326	0.12
327	0.1
328	0.09
329	0.07
330	0.06
331	0.06
332	0.07
333	0.07
334	0.09
335	0.12
336	0.18
337	0.2
338	0.24
339	0.27
340	0.31
341	0.38
342	0.45
343	0.48
344	0.45
345	0.45
346	0.43
347	0.4
348	0.35
349	0.28
350	0.2
351	0.14
352	0.11
353	0.1
354	0.1
355	0.08
356	0.08
357	0.09
358	0.12
359	0.12
360	0.13
361	0.13
362	0.13
363	0.14
364	0.15
365	0.15
366	0.13
367	0.18
368	0.19
369	0.2
370	0.19
371	0.2
372	0.2
373	0.22
374	0.22
375	0.17
376	0.16
377	0.15
378	0.14
379	0.13
380	0.13
381	0.19
382	0.26
383	0.27
384	0.31
385	0.31
386	0.32
387	0.35
388	0.35
389	0.3
390	0.26
391	0.26
392	0.32
393	0.34
394	0.34
395	0.36
396	0.35
397	0.35
398	0.4
399	0.41
400	0.36
401	0.45
402	0.52
403	0.57
404	0.67
405	0.73
406	0.76
407	0.82
408	0.83
409	0.8
410	0.73
411	0.68
412	0.61
413	0.6
414	0.52
415	0.45
416	0.39
417	0.33
418	0.33
419	0.29
420	0.25
421	0.16
422	0.13
423	0.12
424	0.1
425	0.09
426	0.09
427	0.09
428	0.12
429	0.12
430	0.12
431	0.13
432	0.13
433	0.13
434	0.13
435	0.12
436	0.1
437	0.15
438	0.16
439	0.14
440	0.16
441	0.17
442	0.18
443	0.19
444	0.2
445	0.16
446	0.16
447	0.18
448	0.15
449	0.17
450	0.18
451	0.18
452	0.18
453	0.17
454	0.15
455	0.15
456	0.15
457	0.11
458	0.1
459	0.08
460	0.07
461	0.07
462	0.07
463	0.06
464	0.06
465	0.08
466	0.13
467	0.17
468	0.2
469	0.27
470	0.3
471	0.39
472	0.44
473	0.51
474	0.51
475	0.57
476	0.65
477	0.69
478	0.7
479	0.63
480	0.61
481	0.52
482	0.48
483	0.39
484	0.29
485	0.18
486	0.14
487	0.12
488	0.08
489	0.08
490	0.06
491	0.06
492	0.05
493	0.07
494	0.06
495	0.08
496	0.08
497	0.09
498	0.12
499	0.13
500	0.16
501	0.15
502	0.16
503	0.18
504	0.18
505	0.19
506	0.17

A0A1U7LHU8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer