Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1U7LJ67

Protein Details
Accession A0A1U7LJ67    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-133DGVAPRAKMNQQRSRRFRTARESKEKEEDTHydrophilic
410-429FENRRRQEARRDENQKRRKLBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPAMFRFLSKKYPKIITPVIEESSKDDEDGVQIPIDTSGPNPNGKEFDNLYLDMNGIVHPCSHPENKPPPETEEDMMLEVFKYTDRVIAMVRPRKLLMIAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRTARESKEKEEDTKRLIAELEASGKPVHESLKNQKKAWDSNAITPGTPFMDILSASLRYWVQKKQNNDPGWKNLKIIISDAGVPGEGEHKIMEFVRSQRTSRDHNPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFFQDASSKGCRICSQMGHFASECSAENRANAAAIAAEKKAGEVSVLKPFIWLHVDILREYLAVELDPEIPDVKFDLERAIDDWVFLCFFVGNDFLPHLPSLDIREGAIDMLTGIWKANFKNLDGYLTTDGTVNLDKAQIILDAVAVKEARIFENRRRQEARRDENQKRRKLEVEESQRKIEEMMMNQPNSMPAGQATVTRGAFKNPTMQPPDLSLLTPLGTGRIDHAQSNSDIVANRKNMRMANLANKSAAASLKAQLLGNVATESDGASETTEDKAEDMEDVSISPSGKKRKADELIADNGEVSDDVRLWEEGFKDRYYEQKLHKDYSDNEFRREFVKSYVEGLCWVLLYYYQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFERIDEYEINFDLGTPFRPFEQLMGVLPAASKAHLPENFQKLMTEEDSEILDFYPENFPIDMNGKKFAWQGVALLPFIDEIRLLKALERPYHSLTEEERLRNAVGHDVLFVSDGSKLYDELAMNLYSKRKLEKPFKITSKLSKGLAGYVMPDESFIPNSTIQNPLLSVDLEDIVNNRVLCVKYKIPKSKYVHKSMLLKGVQMNPPVLTSSELWEVKTGKNSTFRDNDDNRGSNRRGRGGYRGGRNGNNSKTNSPASSGYNQGPSTYGQSPSAYGSFNQSPFGPGSSTQTFSHLPQSNMFGQSSWNSYQAAPGPAYSHNAYSGASNAYPPQPSTQLRFDSGEGGYPSSSSQYPLPSKHTRFNQDGPPSGDDYDPYGIGNQYRHI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.53
3 0.58
4 0.63
5 0.57
6 0.56
7 0.55
8 0.51
9 0.46
10 0.44
11 0.4
12 0.39
13 0.34
14 0.27
15 0.22
16 0.2
17 0.21
18 0.22
19 0.19
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.13
24 0.13
25 0.1
26 0.1
27 0.17
28 0.19
29 0.24
30 0.25
31 0.27
32 0.3
33 0.31
34 0.35
35 0.3
36 0.33
37 0.33
38 0.32
39 0.31
40 0.28
41 0.26
42 0.21
43 0.19
44 0.14
45 0.11
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.13
50 0.18
51 0.24
52 0.27
53 0.36
54 0.46
55 0.52
56 0.58
57 0.58
58 0.58
59 0.59
60 0.59
61 0.51
62 0.44
63 0.38
64 0.33
65 0.3
66 0.24
67 0.18
68 0.14
69 0.13
70 0.09
71 0.09
72 0.08
73 0.11
74 0.11
75 0.12
76 0.13
77 0.2
78 0.29
79 0.36
80 0.38
81 0.38
82 0.38
83 0.38
84 0.38
85 0.34
86 0.27
87 0.25
88 0.23
89 0.21
90 0.22
91 0.2
92 0.2
93 0.18
94 0.15
95 0.1
96 0.13
97 0.19
98 0.26
99 0.36
100 0.45
101 0.55
102 0.66
103 0.74
104 0.8
105 0.84
106 0.82
107 0.8
108 0.81
109 0.82
110 0.82
111 0.84
112 0.81
113 0.77
114 0.8
115 0.76
116 0.73
117 0.71
118 0.66
119 0.6
120 0.58
121 0.52
122 0.44
123 0.4
124 0.32
125 0.27
126 0.23
127 0.23
128 0.18
129 0.19
130 0.18
131 0.17
132 0.18
133 0.16
134 0.18
135 0.17
136 0.24
137 0.34
138 0.45
139 0.51
140 0.52
141 0.56
142 0.59
143 0.61
144 0.6
145 0.59
146 0.52
147 0.53
148 0.58
149 0.54
150 0.46
151 0.4
152 0.36
153 0.26
154 0.23
155 0.16
156 0.09
157 0.1
158 0.09
159 0.1
160 0.11
161 0.11
162 0.1
163 0.13
164 0.13
165 0.16
166 0.2
167 0.26
168 0.33
169 0.38
170 0.45
171 0.54
172 0.62
173 0.65
174 0.7
175 0.68
176 0.69
177 0.7
178 0.65
179 0.56
180 0.51
181 0.47
182 0.4
183 0.36
184 0.28
185 0.22
186 0.21
187 0.2
188 0.15
189 0.12
190 0.11
191 0.1
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.09
198 0.1
199 0.11
200 0.13
201 0.16
202 0.25
203 0.28
204 0.29
205 0.34
206 0.38
207 0.44
208 0.5
209 0.58
210 0.57
211 0.64
212 0.69
213 0.7
214 0.74
215 0.67
216 0.59
217 0.48
218 0.41
219 0.33
220 0.29
221 0.21
222 0.14
223 0.12
224 0.11
225 0.1
226 0.08
227 0.06
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.04
233 0.05
234 0.07
235 0.08
236 0.11
237 0.13
238 0.14
239 0.18
240 0.2
241 0.24
242 0.25
243 0.26
244 0.24
245 0.26
246 0.25
247 0.21
248 0.21
249 0.17
250 0.17
251 0.18
252 0.18
253 0.16
254 0.18
255 0.19
256 0.2
257 0.24
258 0.26
259 0.29
260 0.36
261 0.36
262 0.37
263 0.36
264 0.31
265 0.28
266 0.24
267 0.2
268 0.13
269 0.15
270 0.12
271 0.13
272 0.14
273 0.13
274 0.12
275 0.11
276 0.09
277 0.07
278 0.08
279 0.09
280 0.07
281 0.08
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.11
289 0.17
290 0.19
291 0.18
292 0.19
293 0.19
294 0.2
295 0.2
296 0.18
297 0.12
298 0.15
299 0.16
300 0.15
301 0.16
302 0.14
303 0.12
304 0.11
305 0.09
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.08
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.09
318 0.08
319 0.08
320 0.1
321 0.09
322 0.1
323 0.11
324 0.13
325 0.11
326 0.11
327 0.11
328 0.09
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.07
344 0.08
345 0.11
346 0.12
347 0.12
348 0.11
349 0.11
350 0.11
351 0.1
352 0.09
353 0.06
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.06
361 0.07
362 0.12
363 0.13
364 0.13
365 0.18
366 0.18
367 0.19
368 0.18
369 0.21
370 0.18
371 0.17
372 0.17
373 0.13
374 0.12
375 0.11
376 0.11
377 0.09
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.06
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.05
391 0.05
392 0.07
393 0.07
394 0.08
395 0.13
396 0.17
397 0.24
398 0.34
399 0.37
400 0.43
401 0.48
402 0.49
403 0.55
404 0.62
405 0.61
406 0.61
407 0.68
408 0.7
409 0.76
410 0.82
411 0.79
412 0.73
413 0.69
414 0.64
415 0.59
416 0.57
417 0.55
418 0.58
419 0.59
420 0.58
421 0.56
422 0.51
423 0.46
424 0.39
425 0.33
426 0.24
427 0.16
428 0.22
429 0.24
430 0.24
431 0.24
432 0.24
433 0.21
434 0.19
435 0.17
436 0.09
437 0.05
438 0.06
439 0.07
440 0.08
441 0.09
442 0.11
443 0.11
444 0.13
445 0.13
446 0.13
447 0.14
448 0.14
449 0.21
450 0.2
451 0.25
452 0.28
453 0.28
454 0.27
455 0.28
456 0.3
457 0.22
458 0.2
459 0.15
460 0.11
461 0.1
462 0.1
463 0.07
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.07
468 0.09
469 0.1
470 0.1
471 0.11
472 0.12
473 0.12
474 0.13
475 0.11
476 0.09
477 0.1
478 0.1
479 0.14
480 0.16
481 0.18
482 0.18
483 0.2
484 0.2
485 0.22
486 0.24
487 0.22
488 0.27
489 0.29
490 0.28
491 0.26
492 0.25
493 0.23
494 0.2
495 0.18
496 0.1
497 0.08
498 0.09
499 0.1
500 0.11
501 0.1
502 0.1
503 0.1
504 0.09
505 0.08
506 0.07
507 0.06
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.05
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.06
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.04
527 0.05
528 0.05
529 0.06
530 0.06
531 0.07
532 0.12
533 0.18
534 0.22
535 0.25
536 0.28
537 0.35
538 0.39
539 0.4
540 0.41
541 0.39
542 0.39
543 0.36
544 0.33
545 0.24
546 0.2
547 0.17
548 0.12
549 0.08
550 0.04
551 0.03
552 0.04
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.07
557 0.08
558 0.11
559 0.14
560 0.13
561 0.14
562 0.15
563 0.21
564 0.24
565 0.29
566 0.32
567 0.39
568 0.42
569 0.43
570 0.44
571 0.42
572 0.4
573 0.41
574 0.46
575 0.38
576 0.38
577 0.36
578 0.35
579 0.33
580 0.32
581 0.26
582 0.18
583 0.2
584 0.18
585 0.21
586 0.21
587 0.19
588 0.18
589 0.17
590 0.14
591 0.1
592 0.1
593 0.06
594 0.05
595 0.06
596 0.07
597 0.08
598 0.09
599 0.09
600 0.1
601 0.1
602 0.15
603 0.17
604 0.17
605 0.2
606 0.2
607 0.25
608 0.28
609 0.3
610 0.28
611 0.24
612 0.24
613 0.2
614 0.2
615 0.17
616 0.14
617 0.12
618 0.1
619 0.12
620 0.12
621 0.12
622 0.12
623 0.11
624 0.1
625 0.11
626 0.12
627 0.1
628 0.09
629 0.09
630 0.08
631 0.08
632 0.1
633 0.09
634 0.09
635 0.09
636 0.11
637 0.11
638 0.11
639 0.12
640 0.11
641 0.11
642 0.12
643 0.11
644 0.1
645 0.1
646 0.1
647 0.07
648 0.07
649 0.07
650 0.06
651 0.12
652 0.14
653 0.18
654 0.24
655 0.3
656 0.31
657 0.31
658 0.3
659 0.25
660 0.27
661 0.24
662 0.18
663 0.13
664 0.13
665 0.13
666 0.13
667 0.12
668 0.09
669 0.08
670 0.06
671 0.07
672 0.09
673 0.08
674 0.1
675 0.1
676 0.09
677 0.11
678 0.16
679 0.17
680 0.16
681 0.19
682 0.18
683 0.2
684 0.21
685 0.2
686 0.18
687 0.15
688 0.15
689 0.16
690 0.17
691 0.15
692 0.14
693 0.13
694 0.11
695 0.11
696 0.09
697 0.06
698 0.05
699 0.07
700 0.08
701 0.08
702 0.1
703 0.14
704 0.19
705 0.24
706 0.27
707 0.29
708 0.31
709 0.34
710 0.33
711 0.31
712 0.27
713 0.31
714 0.33
715 0.3
716 0.28
717 0.27
718 0.26
719 0.25
720 0.24
721 0.2
722 0.15
723 0.14
724 0.14
725 0.12
726 0.12
727 0.11
728 0.1
729 0.07
730 0.07
731 0.07
732 0.08
733 0.08
734 0.08
735 0.08
736 0.12
737 0.11
738 0.11
739 0.13
740 0.12
741 0.13
742 0.15
743 0.17
744 0.16
745 0.18
746 0.21
747 0.25
748 0.34
749 0.44
750 0.52
751 0.57
752 0.64
753 0.69
754 0.72
755 0.71
756 0.7
757 0.69
758 0.63
759 0.56
760 0.5
761 0.43
762 0.38
763 0.35
764 0.26
765 0.18
766 0.15
767 0.14
768 0.11
769 0.11
770 0.1
771 0.1
772 0.11
773 0.11
774 0.12
775 0.14
776 0.16
777 0.17
778 0.19
779 0.18
780 0.18
781 0.17
782 0.15
783 0.14
784 0.13
785 0.12
786 0.09
787 0.1
788 0.09
789 0.09
790 0.09
791 0.09
792 0.12
793 0.11
794 0.1
795 0.14
796 0.14
797 0.17
798 0.22
799 0.28
800 0.33
801 0.43
802 0.53
803 0.53
804 0.62
805 0.66
806 0.71
807 0.73
808 0.75
809 0.71
810 0.68
811 0.71
812 0.66
813 0.68
814 0.58
815 0.51
816 0.46
817 0.47
818 0.44
819 0.38
820 0.35
821 0.26
822 0.26
823 0.25
824 0.21
825 0.17
826 0.14
827 0.15
828 0.21
829 0.21
830 0.21
831 0.23
832 0.25
833 0.25
834 0.32
835 0.31
836 0.28
837 0.37
838 0.39
839 0.43
840 0.47
841 0.49
842 0.51
843 0.53
844 0.56
845 0.55
846 0.57
847 0.53
848 0.55
849 0.54
850 0.51
851 0.53
852 0.52
853 0.49
854 0.47
855 0.52
856 0.54
857 0.59
858 0.61
859 0.64
860 0.62
861 0.62
862 0.67
863 0.67
864 0.64
865 0.64
866 0.59
867 0.53
868 0.52
869 0.52
870 0.45
871 0.4
872 0.36
873 0.33
874 0.33
875 0.35
876 0.33
877 0.35
878 0.33
879 0.3
880 0.29
881 0.25
882 0.27
883 0.26
884 0.25
885 0.21
886 0.22
887 0.23
888 0.24
889 0.24
890 0.2
891 0.17
892 0.22
893 0.25
894 0.25
895 0.26
896 0.23
897 0.24
898 0.24
899 0.25
900 0.2
901 0.15
902 0.22
903 0.23
904 0.26
905 0.25
906 0.28
907 0.28
908 0.28
909 0.37
910 0.35
911 0.33
912 0.33
913 0.37
914 0.37
915 0.38
916 0.37
917 0.27
918 0.25
919 0.26
920 0.28
921 0.25
922 0.23
923 0.21
924 0.21
925 0.25
926 0.27
927 0.27
928 0.23
929 0.22
930 0.23
931 0.23
932 0.28
933 0.25
934 0.22
935 0.2
936 0.2
937 0.19
938 0.18
939 0.18
940 0.17
941 0.15
942 0.16
943 0.17
944 0.2
945 0.22
946 0.23
947 0.25
948 0.29
949 0.32
950 0.37
951 0.41
952 0.42
953 0.43
954 0.45
955 0.41
956 0.38
957 0.35
958 0.34
959 0.28
960 0.25
961 0.22
962 0.19
963 0.19
964 0.18
965 0.18
966 0.15
967 0.16
968 0.23
969 0.29
970 0.33
971 0.41
972 0.47
973 0.52
974 0.59
975 0.66
976 0.66
977 0.67
978 0.7
979 0.72
980 0.69
981 0.71
982 0.67
983 0.61
984 0.56
985 0.5
986 0.44
987 0.35
988 0.31
989 0.26
990 0.21
991 0.18
992 0.17
993 0.18
994 0.2