Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8Y4Z0

Protein Details
Accession G8Y4Z0    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
230-259KQSAAKASKNEKKNDKKKPKKTVSTSGSNHHydrophilic
264-295DDQDNKTKPGKGNKKGTRNKKNDIKENASPQDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
164-251RSNAREKKKNGASTKKDKKSVSKSDGKKQGSQSKKKKASESSKSETTAPAKKPQEKAKKKSSSEGAKQSAAKASKNEKKNDKKKPKKT
268-285NKTKPGKGNKKGTRNKKN
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 12.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MRQDKHTETHTMKSNEPNSEKLKLTVRLLPAALTWEQFTSQLDKYTDIRSKGGVTNEYYVQGFYPKSPYELPTFSRAYLLFKNSSLMREFIEQVKDKPFIEEKTGNQMAPQLEKALYSKMPTPESKLSKPGNKAIEKDHIFKEFLACLEEGTPFDLLEISHRIRSNAREKKKNGASTKKDKKSVSKSDGKKQGSQSKKKKASESSKSETTAPAKKPQEKAKKKSSSEGAKQSAAKASKNEKKNDKKKPKKTVSTSGSNHPSKPDDQDNKTKPGKGNKKGTRNKKNDIKENASPQDQKPKVLLQPKNKKDADTPGESHSKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.59
3 0.58
4 0.58
5 0.53
6 0.55
7 0.52
8 0.47
9 0.48
10 0.44
11 0.45
12 0.44
13 0.42
14 0.4
15 0.39
16 0.35
17 0.28
18 0.27
19 0.24
20 0.19
21 0.17
22 0.14
23 0.14
24 0.15
25 0.16
26 0.17
27 0.17
28 0.21
29 0.21
30 0.24
31 0.25
32 0.33
33 0.37
34 0.34
35 0.34
36 0.3
37 0.33
38 0.34
39 0.36
40 0.32
41 0.29
42 0.3
43 0.3
44 0.3
45 0.26
46 0.22
47 0.18
48 0.17
49 0.15
50 0.13
51 0.17
52 0.16
53 0.19
54 0.21
55 0.23
56 0.26
57 0.29
58 0.3
59 0.31
60 0.32
61 0.29
62 0.3
63 0.27
64 0.27
65 0.27
66 0.28
67 0.24
68 0.23
69 0.26
70 0.24
71 0.26
72 0.23
73 0.2
74 0.17
75 0.18
76 0.2
77 0.2
78 0.25
79 0.24
80 0.25
81 0.28
82 0.29
83 0.27
84 0.29
85 0.29
86 0.25
87 0.3
88 0.32
89 0.28
90 0.36
91 0.37
92 0.33
93 0.29
94 0.31
95 0.26
96 0.24
97 0.23
98 0.15
99 0.13
100 0.14
101 0.15
102 0.14
103 0.13
104 0.13
105 0.17
106 0.18
107 0.22
108 0.22
109 0.27
110 0.32
111 0.37
112 0.38
113 0.41
114 0.43
115 0.45
116 0.48
117 0.48
118 0.48
119 0.46
120 0.46
121 0.42
122 0.46
123 0.43
124 0.43
125 0.39
126 0.33
127 0.31
128 0.29
129 0.27
130 0.19
131 0.16
132 0.14
133 0.11
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.05
144 0.06
145 0.1
146 0.1
147 0.13
148 0.13
149 0.14
150 0.16
151 0.22
152 0.31
153 0.37
154 0.44
155 0.5
156 0.52
157 0.6
158 0.65
159 0.68
160 0.66
161 0.67
162 0.67
163 0.69
164 0.78
165 0.75
166 0.74
167 0.69
168 0.69
169 0.69
170 0.7
171 0.67
172 0.66
173 0.65
174 0.68
175 0.74
176 0.68
177 0.64
178 0.62
179 0.64
180 0.64
181 0.69
182 0.7
183 0.71
184 0.78
185 0.77
186 0.76
187 0.76
188 0.77
189 0.76
190 0.74
191 0.7
192 0.65
193 0.62
194 0.56
195 0.5
196 0.45
197 0.42
198 0.37
199 0.4
200 0.42
201 0.47
202 0.53
203 0.6
204 0.66
205 0.69
206 0.74
207 0.76
208 0.79
209 0.75
210 0.76
211 0.75
212 0.73
213 0.71
214 0.72
215 0.65
216 0.59
217 0.57
218 0.51
219 0.49
220 0.42
221 0.36
222 0.33
223 0.39
224 0.43
225 0.49
226 0.56
227 0.6
228 0.69
229 0.77
230 0.82
231 0.84
232 0.87
233 0.9
234 0.93
235 0.93
236 0.93
237 0.91
238 0.9
239 0.86
240 0.84
241 0.77
242 0.75
243 0.73
244 0.66
245 0.58
246 0.51
247 0.48
248 0.41
249 0.43
250 0.45
251 0.44
252 0.48
253 0.58
254 0.59
255 0.64
256 0.66
257 0.66
258 0.62
259 0.64
260 0.68
261 0.67
262 0.73
263 0.74
264 0.81
265 0.85
266 0.9
267 0.9
268 0.88
269 0.89
270 0.88
271 0.88
272 0.87
273 0.86
274 0.83
275 0.8
276 0.81
277 0.76
278 0.74
279 0.69
280 0.63
281 0.65
282 0.58
283 0.53
284 0.47
285 0.47
286 0.48
287 0.53
288 0.58
289 0.58
290 0.67
291 0.72
292 0.78
293 0.73
294 0.69
295 0.65
296 0.67
297 0.63
298 0.59
299 0.55
300 0.51