Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q2YC45

Protein Details
Accession A0A1Q2YC45    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
188-207NQHQRQYQHHQNRNHNQNQNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044641  Lsm7/SmG-like  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0043229  C:intracellular organelle  
GO:0032991  C:protein-containing complex  
GO:0043170  P:macromolecule metabolic process  
GO:0006807  P:nitrogen compound metabolic process  
GO:0044238  P:primary metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
Amino Acid Sequences MVVRRRFANAYGWQVIDHMVEEHFSEKCCKGEDLSSWKIKKSDCNLIDLDEEEYRDLNVKLGQVMNKEYRKESKRHHINSPGLSVPERAKLKDLSHQNGVADSVSIPVSNVSNIDNSMNSDSNISDLDNESANNGAWLNEEASGYYDGPTGLLNSVNEGQRRAMSGSEAQAEAISQQQAPEQYQKQHNQHQRQYQHHQNRNHNQNQNQNQNQNRQQKKNTYAPKRGPIIDLEPVLNKEVSVRISGGREIIGTLAGYDQLMNLVVENAIVKTPDHISYSEKDEEIKLDKVVVIGRLLLALEPMDGYEVVTNPNVQFDFVI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.33
3 0.25
4 0.19
5 0.13
6 0.09
7 0.1
8 0.1
9 0.12
10 0.12
11 0.13
12 0.17
13 0.18
14 0.2
15 0.22
16 0.23
17 0.23
18 0.27
19 0.33
20 0.37
21 0.43
22 0.5
23 0.49
24 0.51
25 0.52
26 0.5
27 0.51
28 0.5
29 0.53
30 0.45
31 0.48
32 0.46
33 0.44
34 0.43
35 0.35
36 0.31
37 0.21
38 0.2
39 0.15
40 0.15
41 0.13
42 0.14
43 0.13
44 0.12
45 0.12
46 0.13
47 0.15
48 0.17
49 0.2
50 0.2
51 0.25
52 0.31
53 0.34
54 0.36
55 0.37
56 0.44
57 0.47
58 0.52
59 0.55
60 0.58
61 0.64
62 0.67
63 0.72
64 0.72
65 0.73
66 0.7
67 0.65
68 0.56
69 0.47
70 0.42
71 0.36
72 0.28
73 0.29
74 0.27
75 0.23
76 0.24
77 0.26
78 0.28
79 0.33
80 0.39
81 0.36
82 0.38
83 0.38
84 0.35
85 0.32
86 0.31
87 0.23
88 0.16
89 0.11
90 0.08
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.06
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.12
105 0.12
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.11
110 0.11
111 0.09
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.06
129 0.08
130 0.09
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.05
139 0.06
140 0.05
141 0.07
142 0.09
143 0.11
144 0.12
145 0.12
146 0.12
147 0.12
148 0.13
149 0.12
150 0.1
151 0.09
152 0.1
153 0.1
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.09
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.07
165 0.08
166 0.1
167 0.15
168 0.16
169 0.21
170 0.28
171 0.35
172 0.4
173 0.48
174 0.56
175 0.6
176 0.64
177 0.67
178 0.68
179 0.68
180 0.71
181 0.72
182 0.74
183 0.72
184 0.74
185 0.76
186 0.78
187 0.8
188 0.81
189 0.77
190 0.73
191 0.75
192 0.75
193 0.74
194 0.7
195 0.68
196 0.65
197 0.66
198 0.7
199 0.7
200 0.7
201 0.67
202 0.69
203 0.7
204 0.71
205 0.72
206 0.73
207 0.73
208 0.74
209 0.73
210 0.74
211 0.7
212 0.64
213 0.56
214 0.49
215 0.44
216 0.38
217 0.32
218 0.26
219 0.23
220 0.22
221 0.22
222 0.19
223 0.14
224 0.12
225 0.13
226 0.13
227 0.12
228 0.12
229 0.13
230 0.15
231 0.16
232 0.15
233 0.13
234 0.12
235 0.11
236 0.1
237 0.08
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.07
257 0.09
258 0.11
259 0.13
260 0.15
261 0.16
262 0.19
263 0.22
264 0.28
265 0.29
266 0.27
267 0.26
268 0.25
269 0.28
270 0.28
271 0.27
272 0.21
273 0.19
274 0.19
275 0.2
276 0.21
277 0.18
278 0.15
279 0.13
280 0.13
281 0.12
282 0.12
283 0.1
284 0.08
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.06
291 0.07
292 0.08
293 0.09
294 0.11
295 0.12
296 0.14
297 0.13
298 0.18
299 0.17