Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q2YJU8

Protein Details
Accession A0A1Q2YJU8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
55-78DVDTESKKEKAKKTRFSKEAKVIYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
62-69KEKAKKTR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, cyto 4.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013929  RNA_pol_II_AP1_C  
IPR039913  RPAP1/Rba50  
Gene Ontology GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08620  RPAP1_C  
Amino Acid Sequences MLMRRSVQKYGPPPAAGQQPQQQPQHMSNTSLKSALKTPLMTPHSCSLDSEAADDVDTESKKEKAKKTRFSKEAKVIYLDQKRKVRQSSPPDSDGEWEDFEEVAEDTNPRPAVASGVDAADDDTAIRIEDAVRLKQTHNEELADPSSSSSGVHFPQPTQPYEELDINDPKFNDKLHEKYFPDLPRNPKQLEWMKSDSVDDIPAVISYDSLESVRFDFKADLITSENIGKYTNENQGLYNHAKNPELPGYTIPELAHYLRSTFPGQVCIACRTLGRLLYKLGTLQYQVHEVGDNEEINETGTEGMFEIECWKLIIKLKIVNLLQIYASDKEKNLSVKNYAIDALWLWKQGNGDEKIKKYASQDEQAQEQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.55
3 0.5
4 0.48
5 0.48
6 0.51
7 0.57
8 0.59
9 0.58
10 0.53
11 0.54
12 0.58
13 0.51
14 0.48
15 0.47
16 0.47
17 0.44
18 0.43
19 0.39
20 0.33
21 0.35
22 0.35
23 0.32
24 0.29
25 0.3
26 0.35
27 0.4
28 0.39
29 0.38
30 0.4
31 0.39
32 0.38
33 0.37
34 0.32
35 0.31
36 0.3
37 0.27
38 0.22
39 0.18
40 0.17
41 0.17
42 0.13
43 0.14
44 0.13
45 0.14
46 0.15
47 0.19
48 0.25
49 0.33
50 0.41
51 0.47
52 0.58
53 0.67
54 0.75
55 0.82
56 0.84
57 0.84
58 0.85
59 0.83
60 0.8
61 0.72
62 0.66
63 0.59
64 0.6
65 0.62
66 0.58
67 0.57
68 0.57
69 0.61
70 0.64
71 0.66
72 0.63
73 0.63
74 0.67
75 0.69
76 0.68
77 0.65
78 0.59
79 0.54
80 0.5
81 0.43
82 0.35
83 0.25
84 0.19
85 0.17
86 0.14
87 0.13
88 0.12
89 0.09
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.11
95 0.11
96 0.1
97 0.11
98 0.11
99 0.12
100 0.11
101 0.12
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.06
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.09
117 0.11
118 0.12
119 0.14
120 0.16
121 0.17
122 0.22
123 0.26
124 0.26
125 0.25
126 0.25
127 0.24
128 0.25
129 0.25
130 0.2
131 0.16
132 0.13
133 0.11
134 0.1
135 0.09
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.12
140 0.12
141 0.13
142 0.19
143 0.22
144 0.22
145 0.24
146 0.24
147 0.23
148 0.25
149 0.26
150 0.2
151 0.21
152 0.24
153 0.2
154 0.21
155 0.19
156 0.18
157 0.17
158 0.16
159 0.17
160 0.17
161 0.21
162 0.24
163 0.3
164 0.3
165 0.31
166 0.37
167 0.37
168 0.38
169 0.38
170 0.41
171 0.43
172 0.47
173 0.46
174 0.4
175 0.45
176 0.47
177 0.46
178 0.44
179 0.4
180 0.36
181 0.35
182 0.35
183 0.28
184 0.2
185 0.17
186 0.11
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.12
206 0.11
207 0.12
208 0.12
209 0.13
210 0.13
211 0.14
212 0.14
213 0.11
214 0.11
215 0.1
216 0.11
217 0.15
218 0.2
219 0.21
220 0.21
221 0.22
222 0.22
223 0.27
224 0.28
225 0.26
226 0.24
227 0.24
228 0.24
229 0.23
230 0.26
231 0.25
232 0.22
233 0.21
234 0.19
235 0.22
236 0.22
237 0.23
238 0.19
239 0.16
240 0.17
241 0.17
242 0.18
243 0.13
244 0.14
245 0.13
246 0.16
247 0.17
248 0.18
249 0.18
250 0.19
251 0.19
252 0.2
253 0.22
254 0.22
255 0.21
256 0.19
257 0.18
258 0.18
259 0.2
260 0.22
261 0.22
262 0.2
263 0.21
264 0.22
265 0.22
266 0.21
267 0.19
268 0.16
269 0.15
270 0.16
271 0.15
272 0.17
273 0.17
274 0.16
275 0.16
276 0.15
277 0.16
278 0.16
279 0.14
280 0.12
281 0.12
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.09
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.09
297 0.09
298 0.12
299 0.18
300 0.22
301 0.24
302 0.28
303 0.3
304 0.38
305 0.37
306 0.38
307 0.33
308 0.3
309 0.26
310 0.22
311 0.23
312 0.18
313 0.21
314 0.19
315 0.19
316 0.2
317 0.24
318 0.28
319 0.3
320 0.32
321 0.33
322 0.35
323 0.36
324 0.36
325 0.33
326 0.27
327 0.23
328 0.19
329 0.2
330 0.17
331 0.18
332 0.17
333 0.18
334 0.19
335 0.21
336 0.29
337 0.29
338 0.36
339 0.41
340 0.44
341 0.49
342 0.5
343 0.5
344 0.46
345 0.51
346 0.5
347 0.51
348 0.55