Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q2YDP6

Protein Details
Accession A0A1Q2YDP6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
419-439DLIPSKNHSSSRKIRKKRRIAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
429-439SRKIRKKRRIA
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.833, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018247  EF_Hand_1_Ca_BS  
IPR039577  Rad18  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0006301  P:postreplication repair  
GO:0006513  P:protein monoubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF13920  zf-C3HC4_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00018  EF_HAND_1  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
Amino Acid Sequences MPNTFQGLLSFPEFSGNDLDSTSRSELIFQFHTILNNLSIQLCCPICQDVPTQPYLLPTCGHTFCYSCIKHWFQCNPSCPICRSIIGETKPILNHSVKNIIVALIDDISLTAKELHLKDYKSYKQKLESWEKEKNEEFSIDKANDFPWLKKIASNWGRAVVDTEDGVPRCSATDGDELDDDDDDEEDEDGYGRGPRRDRALHSDSDDWEDYDNGLNDMHGRIVDNEAEEISGEEEEGDDFNNDAYRRRSHNDRRGHDHGRETGYIDAYDSDDGFVVDDDEEKEEEDNDDDNGSEDDEYGNTSDVEIVDEDKLASGDEDVILHGKVAEPLYLSEDESDGGLINPRRSRALPVQSDDDDETGAEEEIEVHDDDSDGDGDGDVDEDDLLKTARSGRKKAILDDEDEDEDDNGGAGDNLSSDDLIPSKNHSSSRKIRKKRRIA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.2
4 0.18
5 0.17
6 0.18
7 0.14
8 0.19
9 0.19
10 0.18
11 0.17
12 0.19
13 0.21
14 0.25
15 0.26
16 0.23
17 0.24
18 0.23
19 0.25
20 0.23
21 0.23
22 0.19
23 0.18
24 0.18
25 0.17
26 0.16
27 0.15
28 0.18
29 0.17
30 0.16
31 0.17
32 0.19
33 0.18
34 0.2
35 0.23
36 0.25
37 0.29
38 0.3
39 0.3
40 0.27
41 0.31
42 0.31
43 0.29
44 0.22
45 0.21
46 0.25
47 0.25
48 0.27
49 0.24
50 0.23
51 0.24
52 0.33
53 0.31
54 0.29
55 0.36
56 0.4
57 0.43
58 0.5
59 0.55
60 0.52
61 0.6
62 0.61
63 0.6
64 0.59
65 0.59
66 0.52
67 0.48
68 0.44
69 0.38
70 0.37
71 0.36
72 0.39
73 0.37
74 0.39
75 0.35
76 0.36
77 0.35
78 0.32
79 0.31
80 0.26
81 0.26
82 0.26
83 0.31
84 0.27
85 0.28
86 0.26
87 0.22
88 0.19
89 0.17
90 0.14
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.11
101 0.12
102 0.17
103 0.21
104 0.23
105 0.27
106 0.35
107 0.43
108 0.47
109 0.52
110 0.52
111 0.54
112 0.58
113 0.63
114 0.65
115 0.66
116 0.65
117 0.68
118 0.65
119 0.63
120 0.6
121 0.53
122 0.44
123 0.37
124 0.31
125 0.26
126 0.29
127 0.24
128 0.22
129 0.2
130 0.19
131 0.23
132 0.23
133 0.21
134 0.2
135 0.22
136 0.23
137 0.24
138 0.25
139 0.29
140 0.34
141 0.37
142 0.34
143 0.35
144 0.35
145 0.33
146 0.33
147 0.24
148 0.18
149 0.14
150 0.14
151 0.12
152 0.12
153 0.13
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.09
159 0.09
160 0.12
161 0.12
162 0.13
163 0.13
164 0.13
165 0.13
166 0.12
167 0.1
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.07
179 0.08
180 0.12
181 0.13
182 0.15
183 0.21
184 0.24
185 0.27
186 0.33
187 0.36
188 0.35
189 0.36
190 0.37
191 0.32
192 0.33
193 0.29
194 0.21
195 0.17
196 0.15
197 0.12
198 0.11
199 0.1
200 0.07
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.07
229 0.07
230 0.09
231 0.12
232 0.16
233 0.19
234 0.23
235 0.33
236 0.42
237 0.5
238 0.58
239 0.6
240 0.65
241 0.69
242 0.71
243 0.64
244 0.58
245 0.53
246 0.47
247 0.42
248 0.35
249 0.29
250 0.24
251 0.2
252 0.16
253 0.12
254 0.1
255 0.09
256 0.08
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.04
264 0.05
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.06
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.06
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.06
300 0.06
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.07
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.09
316 0.12
317 0.13
318 0.13
319 0.11
320 0.11
321 0.11
322 0.1
323 0.1
324 0.06
325 0.06
326 0.11
327 0.13
328 0.18
329 0.2
330 0.22
331 0.25
332 0.26
333 0.32
334 0.36
335 0.43
336 0.44
337 0.46
338 0.5
339 0.48
340 0.5
341 0.44
342 0.36
343 0.26
344 0.2
345 0.16
346 0.12
347 0.11
348 0.07
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.09
353 0.08
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.08
358 0.09
359 0.09
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.07
375 0.15
376 0.22
377 0.29
378 0.34
379 0.41
380 0.5
381 0.54
382 0.58
383 0.61
384 0.57
385 0.54
386 0.53
387 0.49
388 0.42
389 0.39
390 0.34
391 0.24
392 0.21
393 0.16
394 0.12
395 0.08
396 0.06
397 0.06
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.06
402 0.06
403 0.07
404 0.07
405 0.08
406 0.09
407 0.11
408 0.12
409 0.17
410 0.21
411 0.26
412 0.32
413 0.36
414 0.44
415 0.53
416 0.64
417 0.7
418 0.75
419 0.82