FuNGI

A0A1Q2YGR6

Protein Details

Accession

A0A1Q2YGR6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
183-210	SANGNGSNKKKSKKSKKKSPSNATANGN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
190-201	NKKKSKKSKKKS

Subcellular Location(s)

cyto 10.5, cyto_nucl 10, nucl 8.5, extr 4, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006630 La_HTH IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF05383 La
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA
CDD	cd07323 LAM

Amino Acid Sequences

MSAALSYAHAAAKKEPFDPAPAAETAAVASAAAAVPIAADNGTEHGRDTPATARSRSATGTSIPAEISPDNNNINSSSSAVSKEDTPSSLSSTPTPTPTPTPAPAALAPAPLPSKNAWGKIESTVPTSVDLKSIIDHNNNTSTPSSSFSSSTITNSNIKWVPFKGANIVISDSSSNSSANHNSANGNGSNKKKSKKSKKKSPSNATANGNSASIASTTPSSSSSSANGSSASTNNNVPNDRKHQTQNSAPKRSSRPSNSSEKQVNSDSVPADINSTSDSDDLAKVSAATDDRSQVKNSTAYSKGVNGGRRYNNNGNGTGNGNNTSKYNNSGPTNPRYNKNYYNNFYPQQNFQYYQDFSNGYAYNPNYQNMRYQQNYNYHRSNNSSSNGNYHRNNNNINNNNNNNNNYNNYNHNRNFNYRTKYTNNSANAPAMNWITPESRLTAVNSLALQLDYYFDISNLLKDMYLRKHMNSQGWINLDFITGFYRVRALSCGDLSVIRESLDHAGQFEWGVVESDQNSPEESSTTKEAAKTEEGETKPESTEAGAVSTEAAELANPIANIKIRALTEPLNWVLPDSDRDGCGLDEAVPAIIHKREEPKNAETGAEAESAPAESFEQQASTSIPESIEQQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.32
3	0.32
4	0.34
5	0.36
6	0.32
7	0.29
8	0.27
9	0.27
10	0.22
11	0.21
12	0.16
13	0.14
14	0.11
15	0.07
16	0.06
17	0.06
18	0.05
19	0.05
20	0.05
21	0.04
22	0.04
23	0.04
24	0.05
25	0.04
26	0.04
27	0.05
28	0.08
29	0.1
30	0.1
31	0.11
32	0.12
33	0.14
34	0.14
35	0.16
36	0.19
37	0.25
38	0.29
39	0.3
40	0.31
41	0.33
42	0.35
43	0.34
44	0.31
45	0.26
46	0.24
47	0.27
48	0.25
49	0.23
50	0.21
51	0.19
52	0.2
53	0.18
54	0.19
55	0.18
56	0.2
57	0.21
58	0.22
59	0.23
60	0.21
61	0.23
62	0.21
63	0.19
64	0.17
65	0.16
66	0.18
67	0.17
68	0.18
69	0.17
70	0.2
71	0.2
72	0.2
73	0.21
74	0.2
75	0.24
76	0.25
77	0.24
78	0.23
79	0.26
80	0.27
81	0.28
82	0.29
83	0.27
84	0.29
85	0.32
86	0.35
87	0.33
88	0.35
89	0.32
90	0.33
91	0.31
92	0.31
93	0.27
94	0.23
95	0.21
96	0.19
97	0.2
98	0.17
99	0.19
100	0.15
101	0.23
102	0.25
103	0.3
104	0.29
105	0.3
106	0.31
107	0.32
108	0.36
109	0.3
110	0.29
111	0.25
112	0.24
113	0.24
114	0.23
115	0.21
116	0.17
117	0.16
118	0.13
119	0.13
120	0.16
121	0.18
122	0.21
123	0.22
124	0.24
125	0.28
126	0.28
127	0.29
128	0.27
129	0.25
130	0.21
131	0.23
132	0.22
133	0.19
134	0.2
135	0.19
136	0.2
137	0.19
138	0.2
139	0.19
140	0.2
141	0.21
142	0.2
143	0.25
144	0.25
145	0.25
146	0.26
147	0.25
148	0.27
149	0.26
150	0.27
151	0.26
152	0.26
153	0.27
154	0.25
155	0.25
156	0.2
157	0.18
158	0.18
159	0.14
160	0.12
161	0.11
162	0.1
163	0.1
164	0.13
165	0.14
166	0.15
167	0.16
168	0.16
169	0.15
170	0.16
171	0.19
172	0.17
173	0.19
174	0.24
175	0.27
176	0.35
177	0.4
178	0.46
179	0.52
180	0.61
181	0.68
182	0.74
183	0.8
184	0.83
185	0.88
186	0.93
187	0.95
188	0.94
189	0.93
190	0.9
191	0.86
192	0.8
193	0.71
194	0.62
195	0.51
196	0.41
197	0.31
198	0.22
199	0.15
200	0.11
201	0.08
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.08
207	0.1
208	0.11
209	0.12
210	0.12
211	0.14
212	0.14
213	0.14
214	0.13
215	0.12
216	0.12
217	0.12
218	0.12
219	0.12
220	0.14
221	0.16
222	0.18
223	0.2
224	0.21
225	0.25
226	0.3
227	0.31
228	0.33
229	0.37
230	0.4
231	0.43
232	0.5
233	0.55
234	0.58
235	0.62
236	0.59
237	0.6
238	0.6
239	0.6
240	0.61
241	0.57
242	0.54
243	0.52
244	0.61
245	0.57
246	0.58
247	0.58
248	0.5
249	0.47
250	0.41
251	0.37
252	0.28
253	0.28
254	0.21
255	0.17
256	0.15
257	0.12
258	0.11
259	0.1
260	0.09
261	0.08
262	0.08
263	0.08
264	0.07
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.06
271	0.05
272	0.06
273	0.07
274	0.06
275	0.07
276	0.08
277	0.11
278	0.14
279	0.16
280	0.16
281	0.16
282	0.18
283	0.19
284	0.19
285	0.21
286	0.19
287	0.19
288	0.19
289	0.19
290	0.21
291	0.22
292	0.25
293	0.23
294	0.28
295	0.31
296	0.33
297	0.38
298	0.39
299	0.42
300	0.4
301	0.39
302	0.33
303	0.3
304	0.3
305	0.24
306	0.2
307	0.16
308	0.14
309	0.14
310	0.13
311	0.14
312	0.12
313	0.14
314	0.15
315	0.17
316	0.18
317	0.24
318	0.28
319	0.32
320	0.41
321	0.4
322	0.43
323	0.44
324	0.47
325	0.5
326	0.55
327	0.57
328	0.52
329	0.56
330	0.55
331	0.52
332	0.51
333	0.44
334	0.38
335	0.34
336	0.33
337	0.29
338	0.26
339	0.29
340	0.26
341	0.25
342	0.24
343	0.21
344	0.18
345	0.21
346	0.19
347	0.14
348	0.17
349	0.17
350	0.21
351	0.21
352	0.22
353	0.19
354	0.19
355	0.24
356	0.24
357	0.3
358	0.26
359	0.28
360	0.33
361	0.41
362	0.46
363	0.47
364	0.47
365	0.43
366	0.44
367	0.45
368	0.44
369	0.39
370	0.36
371	0.34
372	0.3
373	0.35
374	0.37
375	0.39
376	0.36
377	0.39
378	0.42
379	0.42
380	0.48
381	0.47
382	0.52
383	0.52
384	0.54
385	0.54
386	0.54
387	0.54
388	0.52
389	0.48
390	0.41
391	0.37
392	0.36
393	0.31
394	0.29
395	0.32
396	0.32
397	0.38
398	0.39
399	0.43
400	0.44
401	0.47
402	0.52
403	0.52
404	0.54
405	0.48
406	0.52
407	0.5
408	0.52
409	0.51
410	0.51
411	0.46
412	0.43
413	0.43
414	0.39
415	0.34
416	0.29
417	0.26
418	0.19
419	0.16
420	0.13
421	0.13
422	0.12
423	0.12
424	0.13
425	0.12
426	0.13
427	0.14
428	0.15
429	0.15
430	0.14
431	0.15
432	0.14
433	0.13
434	0.12
435	0.11
436	0.09
437	0.07
438	0.08
439	0.06
440	0.08
441	0.07
442	0.06
443	0.09
444	0.09
445	0.1
446	0.1
447	0.09
448	0.08
449	0.1
450	0.15
451	0.17
452	0.25
453	0.27
454	0.27
455	0.35
456	0.4
457	0.43
458	0.43
459	0.42
460	0.38
461	0.39
462	0.38
463	0.31
464	0.27
465	0.22
466	0.17
467	0.15
468	0.12
469	0.1
470	0.09
471	0.08
472	0.1
473	0.1
474	0.11
475	0.12
476	0.12
477	0.14
478	0.14
479	0.15
480	0.14
481	0.14
482	0.15
483	0.16
484	0.14
485	0.11
486	0.11
487	0.12
488	0.14
489	0.15
490	0.13
491	0.12
492	0.12
493	0.12
494	0.12
495	0.11
496	0.08
497	0.07
498	0.08
499	0.07
500	0.09
501	0.1
502	0.12
503	0.13
504	0.13
505	0.14
506	0.13
507	0.13
508	0.13
509	0.13
510	0.14
511	0.17
512	0.18
513	0.19
514	0.2
515	0.21
516	0.24
517	0.26
518	0.25
519	0.25
520	0.32
521	0.31
522	0.32
523	0.33
524	0.31
525	0.28
526	0.26
527	0.23
528	0.15
529	0.17
530	0.13
531	0.12
532	0.1
533	0.1
534	0.1
535	0.09
536	0.08
537	0.06
538	0.06
539	0.04
540	0.05
541	0.06
542	0.07
543	0.07
544	0.07
545	0.09
546	0.11
547	0.13
548	0.14
549	0.17
550	0.16
551	0.18
552	0.21
553	0.22
554	0.23
555	0.27
556	0.27
557	0.25
558	0.24
559	0.23
560	0.21
561	0.2
562	0.21
563	0.2
564	0.2
565	0.19
566	0.2
567	0.2
568	0.18
569	0.18
570	0.16
571	0.12
572	0.11
573	0.11
574	0.11
575	0.09
576	0.1
577	0.12
578	0.13
579	0.14
580	0.18
581	0.26
582	0.32
583	0.41
584	0.47
585	0.48
586	0.52
587	0.51
588	0.48
589	0.4
590	0.35
591	0.29
592	0.24
593	0.19
594	0.13
595	0.13
596	0.13
597	0.12
598	0.1
599	0.1
600	0.09
601	0.11
602	0.11
603	0.12
604	0.11
605	0.13
606	0.13
607	0.15
608	0.15
609	0.15
610	0.15

A0A1Q2YGR6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer