Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q2YLA8

Protein Details
Accession A0A1Q2YLA8    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-70AKAELKPKRAPAKRQRATKQQQQQQHydrophilic
116-140TPVAEEKKTRKKRAAKDPNAPKKPLBasic
243-267SNEIAEPPKKKKSKKSKKSKKVDAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-61LKPKRAPAKRQR
122-138KKTRKKRAAKDPNAPKK
249-264PPKKKKSKKSKKSKKV
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 9.833, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MVRGTYTHAYIAVVDCAQQHAGEAASLVTAASFTAAAANTAAGTAAKAELKPKRAPAKRQRATKQQQQQQQQALTEPVAEAEPGQQPELETEMLSDPIVELDEPAADTPASTAEDTPVAEEKKTRKKRAAKDPNAPKKPLTSYILFYNHLRSSVAEKNTELSQVDIAKEIARQWKEMSESDKNYWKGIYEKDKVKYDQEMVKYNATKDSPKAEKRSIIDIVDDDGPGNNPGTEVLSALPPDVSNEIAEPPKKKKSKKSKKSKKVDAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.13
4 0.13
5 0.12
6 0.11
7 0.09
8 0.1
9 0.09
10 0.08
11 0.06
12 0.06
13 0.06
14 0.05
15 0.04
16 0.04
17 0.03
18 0.04
19 0.04
20 0.04
21 0.06
22 0.06
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.06
27 0.06
28 0.07
29 0.04
30 0.05
31 0.05
32 0.06
33 0.08
34 0.08
35 0.16
36 0.21
37 0.27
38 0.31
39 0.38
40 0.47
41 0.54
42 0.64
43 0.68
44 0.75
45 0.77
46 0.83
47 0.83
48 0.84
49 0.85
50 0.84
51 0.83
52 0.8
53 0.8
54 0.78
55 0.77
56 0.72
57 0.66
58 0.57
59 0.49
60 0.42
61 0.34
62 0.25
63 0.18
64 0.12
65 0.09
66 0.08
67 0.07
68 0.07
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.12
75 0.14
76 0.11
77 0.08
78 0.08
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.08
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.04
87 0.04
88 0.03
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.05
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.13
108 0.2
109 0.3
110 0.39
111 0.43
112 0.49
113 0.58
114 0.67
115 0.76
116 0.8
117 0.78
118 0.79
119 0.84
120 0.86
121 0.82
122 0.74
123 0.63
124 0.55
125 0.49
126 0.43
127 0.36
128 0.27
129 0.24
130 0.28
131 0.3
132 0.28
133 0.26
134 0.26
135 0.23
136 0.21
137 0.19
138 0.15
139 0.18
140 0.22
141 0.24
142 0.21
143 0.21
144 0.22
145 0.22
146 0.23
147 0.17
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.12
157 0.17
158 0.17
159 0.18
160 0.18
161 0.2
162 0.23
163 0.25
164 0.29
165 0.29
166 0.32
167 0.35
168 0.41
169 0.39
170 0.37
171 0.35
172 0.3
173 0.27
174 0.3
175 0.35
176 0.34
177 0.4
178 0.45
179 0.5
180 0.51
181 0.5
182 0.47
183 0.44
184 0.43
185 0.41
186 0.41
187 0.39
188 0.43
189 0.41
190 0.38
191 0.38
192 0.34
193 0.33
194 0.29
195 0.35
196 0.38
197 0.43
198 0.49
199 0.48
200 0.53
201 0.53
202 0.56
203 0.51
204 0.43
205 0.38
206 0.32
207 0.3
208 0.24
209 0.21
210 0.15
211 0.12
212 0.13
213 0.12
214 0.12
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.09
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.1
231 0.11
232 0.14
233 0.2
234 0.25
235 0.28
236 0.34
237 0.43
238 0.52
239 0.6
240 0.67
241 0.73
242 0.8
243 0.85
244 0.9
245 0.91
246 0.94
247 0.96