Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8YNJ5

Protein Details
Accession G8YNJ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-35DDYSRDRSRSPVRYRSRSPSQRRGTDEGHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-68RSPSQRRGTDEGHEKKEKNERKGYSNSRGRYATDRRSDSNRRGYKR
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd21605  RRM1_HRB1_GBP2  
cd21607  RRM3_HRB1_GBP2  
Amino Acid Sequences MEEMDIDDYSRDRSRSPVRYRSRSPSQRRGTDEGHEKKEKNERKGYSNSRGRYATDRRSDSNRRGYKRGGYRGRDFIARRDFNYSRTPDDYRSKSERNYDNSIFIGNIPFSCTSKDIQELFKDDFQLIKADIVTSRGRSRGMATVEFSNKEDVTKAISKFDHYEFLGREIFVRQDYPPPSDKRKDDSPQAESFSRGYNERNSRSTTSTRDQSLIPKPGTEIFVGNLPFSINWQALKDLMRVTGEVVRADVRTDNWGKSRGFGTVVFNTEEEAAKAVEYFQGYEIEGRRLDTRPGRKSNYADDESDAQQALPSNTDFTDNVVGEGERSNTIFASNLPWATNEDDLYELFETIGKVSRAELQLNEKGKPSGNAVIQFEQEENADVAIANLDNYNYGGRDLKITFARKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.46
3 0.55
4 0.61
5 0.67
6 0.75
7 0.82
8 0.83
9 0.84
10 0.85
11 0.85
12 0.86
13 0.85
14 0.84
15 0.83
16 0.81
17 0.74
18 0.72
19 0.72
20 0.7
21 0.69
22 0.69
23 0.63
24 0.63
25 0.7
26 0.7
27 0.68
28 0.69
29 0.66
30 0.66
31 0.75
32 0.77
33 0.77
34 0.77
35 0.71
36 0.68
37 0.65
38 0.6
39 0.59
40 0.59
41 0.58
42 0.58
43 0.6
44 0.58
45 0.65
46 0.7
47 0.7
48 0.72
49 0.71
50 0.68
51 0.68
52 0.69
53 0.69
54 0.7
55 0.72
56 0.71
57 0.69
58 0.7
59 0.71
60 0.68
61 0.66
62 0.58
63 0.56
64 0.57
65 0.52
66 0.48
67 0.49
68 0.48
69 0.44
70 0.51
71 0.46
72 0.41
73 0.43
74 0.44
75 0.42
76 0.5
77 0.5
78 0.5
79 0.54
80 0.53
81 0.53
82 0.59
83 0.6
84 0.57
85 0.61
86 0.55
87 0.5
88 0.45
89 0.41
90 0.33
91 0.26
92 0.21
93 0.13
94 0.11
95 0.11
96 0.12
97 0.12
98 0.14
99 0.15
100 0.14
101 0.16
102 0.2
103 0.2
104 0.22
105 0.25
106 0.26
107 0.28
108 0.28
109 0.27
110 0.23
111 0.21
112 0.19
113 0.17
114 0.14
115 0.12
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.12
120 0.13
121 0.15
122 0.16
123 0.17
124 0.18
125 0.18
126 0.2
127 0.22
128 0.23
129 0.22
130 0.22
131 0.25
132 0.27
133 0.27
134 0.26
135 0.22
136 0.19
137 0.18
138 0.16
139 0.12
140 0.15
141 0.19
142 0.19
143 0.21
144 0.21
145 0.23
146 0.25
147 0.26
148 0.24
149 0.19
150 0.22
151 0.19
152 0.21
153 0.2
154 0.17
155 0.17
156 0.14
157 0.15
158 0.12
159 0.13
160 0.1
161 0.16
162 0.18
163 0.21
164 0.26
165 0.3
166 0.36
167 0.41
168 0.43
169 0.42
170 0.48
171 0.48
172 0.51
173 0.51
174 0.5
175 0.46
176 0.47
177 0.42
178 0.35
179 0.32
180 0.26
181 0.21
182 0.17
183 0.16
184 0.2
185 0.26
186 0.28
187 0.3
188 0.32
189 0.33
190 0.36
191 0.37
192 0.35
193 0.33
194 0.34
195 0.32
196 0.3
197 0.29
198 0.31
199 0.34
200 0.34
201 0.3
202 0.26
203 0.26
204 0.26
205 0.26
206 0.21
207 0.15
208 0.1
209 0.13
210 0.13
211 0.12
212 0.1
213 0.09
214 0.08
215 0.09
216 0.1
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.12
223 0.12
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.11
229 0.13
230 0.13
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.12
236 0.11
237 0.09
238 0.14
239 0.16
240 0.18
241 0.2
242 0.24
243 0.24
244 0.25
245 0.25
246 0.2
247 0.2
248 0.19
249 0.21
250 0.2
251 0.21
252 0.2
253 0.19
254 0.19
255 0.18
256 0.16
257 0.12
258 0.1
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.12
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.15
274 0.17
275 0.18
276 0.23
277 0.28
278 0.36
279 0.43
280 0.5
281 0.54
282 0.57
283 0.6
284 0.62
285 0.63
286 0.57
287 0.49
288 0.44
289 0.42
290 0.37
291 0.35
292 0.27
293 0.18
294 0.16
295 0.17
296 0.15
297 0.13
298 0.12
299 0.12
300 0.12
301 0.14
302 0.13
303 0.14
304 0.18
305 0.16
306 0.16
307 0.16
308 0.15
309 0.14
310 0.15
311 0.14
312 0.1
313 0.1
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.09
319 0.12
320 0.14
321 0.14
322 0.14
323 0.15
324 0.17
325 0.19
326 0.2
327 0.16
328 0.14
329 0.14
330 0.14
331 0.16
332 0.14
333 0.12
334 0.1
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.15
339 0.13
340 0.13
341 0.14
342 0.2
343 0.22
344 0.24
345 0.26
346 0.29
347 0.36
348 0.39
349 0.39
350 0.35
351 0.35
352 0.35
353 0.33
354 0.31
355 0.3
356 0.32
357 0.35
358 0.38
359 0.38
360 0.37
361 0.36
362 0.32
363 0.26
364 0.22
365 0.18
366 0.14
367 0.11
368 0.1
369 0.09
370 0.08
371 0.09
372 0.08
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.08
377 0.09
378 0.1
379 0.09
380 0.11
381 0.14
382 0.14
383 0.19
384 0.2
385 0.25
386 0.31