Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q2YJM0

Protein Details
Accession A0A1Q2YJM0    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
170-192EKFNALLKKPTKRRKNNDVDLEAHydrophilic
422-449RFKALNKKLTKLSQKKKAGKKDGVSIEGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
164-166KRR
173-184NALLKKPTKRRK
427-442NKKLTKLSQKKKAGKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MASEDLVAAKLEESSHDGVLDQSVDDQQETGKNAAAEVEEEEEEEGQEDAGNLKKEASMAEAEVEAKQEDGETKETADKEEKPDEQAQEEEQEQPLDAGDGDIEEDILKLNKFKKTEGKSASPGQKRSRDDDFQDDESRNQAAASNNVGGIDGNEEIEDEKTRKRREFEEKFNALLKKPTKRRKNNDVDLEAMQDEAISHLKNMMKDAAYMDIDCVNNKKPAANKLKLLPQVRDTLLKSNLYDSILDNNLLEAVRIWLEPLPDASLPSFEIQKTLLNELVKLPIKTIHLRESGLGKVMIFYQKSKKVDPALKRIAEKLIGDWTRPVMGRSDNYRAREIPTANFDIEKFKAKTKLQTGGTDSAQNSRKSLYQESADRRKRAAAPEARTSVYTIAPQTSINALHAQRASGLSTGIGQSLSRDERFKALNKKLTKLSQKKKAGKKDGVSIEGRGLNI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.15
4 0.15
5 0.15
6 0.16
7 0.15
8 0.1
9 0.1
10 0.11
11 0.12
12 0.12
13 0.12
14 0.12
15 0.16
16 0.18
17 0.18
18 0.19
19 0.18
20 0.18
21 0.19
22 0.17
23 0.14
24 0.13
25 0.15
26 0.12
27 0.12
28 0.13
29 0.12
30 0.11
31 0.11
32 0.09
33 0.06
34 0.07
35 0.06
36 0.08
37 0.12
38 0.14
39 0.13
40 0.14
41 0.15
42 0.15
43 0.15
44 0.16
45 0.13
46 0.12
47 0.13
48 0.13
49 0.14
50 0.13
51 0.14
52 0.11
53 0.1
54 0.09
55 0.08
56 0.1
57 0.12
58 0.14
59 0.14
60 0.16
61 0.2
62 0.21
63 0.24
64 0.26
65 0.27
66 0.3
67 0.36
68 0.36
69 0.37
70 0.42
71 0.4
72 0.38
73 0.36
74 0.32
75 0.29
76 0.28
77 0.25
78 0.2
79 0.18
80 0.16
81 0.14
82 0.12
83 0.09
84 0.08
85 0.06
86 0.05
87 0.04
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.07
95 0.07
96 0.11
97 0.16
98 0.2
99 0.22
100 0.27
101 0.35
102 0.4
103 0.5
104 0.53
105 0.54
106 0.55
107 0.62
108 0.67
109 0.64
110 0.65
111 0.63
112 0.65
113 0.62
114 0.62
115 0.61
116 0.57
117 0.54
118 0.55
119 0.52
120 0.48
121 0.49
122 0.45
123 0.38
124 0.34
125 0.31
126 0.22
127 0.17
128 0.16
129 0.13
130 0.14
131 0.16
132 0.15
133 0.14
134 0.14
135 0.14
136 0.11
137 0.09
138 0.09
139 0.06
140 0.06
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.07
145 0.09
146 0.09
147 0.14
148 0.21
149 0.27
150 0.31
151 0.34
152 0.41
153 0.51
154 0.58
155 0.63
156 0.66
157 0.63
158 0.6
159 0.62
160 0.56
161 0.46
162 0.44
163 0.4
164 0.39
165 0.47
166 0.55
167 0.6
168 0.69
169 0.78
170 0.82
171 0.86
172 0.86
173 0.85
174 0.77
175 0.7
176 0.59
177 0.52
178 0.4
179 0.29
180 0.2
181 0.11
182 0.08
183 0.06
184 0.07
185 0.05
186 0.05
187 0.08
188 0.1
189 0.11
190 0.12
191 0.13
192 0.12
193 0.12
194 0.13
195 0.12
196 0.11
197 0.11
198 0.1
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.12
203 0.12
204 0.14
205 0.14
206 0.16
207 0.16
208 0.26
209 0.34
210 0.35
211 0.36
212 0.37
213 0.43
214 0.47
215 0.46
216 0.39
217 0.32
218 0.33
219 0.32
220 0.32
221 0.26
222 0.25
223 0.25
224 0.25
225 0.22
226 0.19
227 0.2
228 0.17
229 0.16
230 0.12
231 0.13
232 0.12
233 0.12
234 0.11
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.1
256 0.08
257 0.09
258 0.09
259 0.12
260 0.13
261 0.14
262 0.16
263 0.14
264 0.15
265 0.15
266 0.2
267 0.2
268 0.18
269 0.17
270 0.17
271 0.2
272 0.24
273 0.26
274 0.26
275 0.25
276 0.26
277 0.27
278 0.26
279 0.24
280 0.22
281 0.19
282 0.13
283 0.12
284 0.13
285 0.15
286 0.14
287 0.16
288 0.21
289 0.28
290 0.31
291 0.32
292 0.35
293 0.4
294 0.47
295 0.51
296 0.54
297 0.55
298 0.56
299 0.56
300 0.53
301 0.48
302 0.42
303 0.36
304 0.27
305 0.27
306 0.24
307 0.23
308 0.22
309 0.21
310 0.21
311 0.21
312 0.2
313 0.14
314 0.17
315 0.2
316 0.25
317 0.33
318 0.35
319 0.38
320 0.41
321 0.39
322 0.39
323 0.41
324 0.38
325 0.32
326 0.33
327 0.32
328 0.3
329 0.29
330 0.27
331 0.25
332 0.25
333 0.29
334 0.25
335 0.27
336 0.34
337 0.36
338 0.44
339 0.46
340 0.52
341 0.49
342 0.52
343 0.53
344 0.49
345 0.48
346 0.45
347 0.39
348 0.38
349 0.4
350 0.35
351 0.31
352 0.28
353 0.3
354 0.3
355 0.34
356 0.31
357 0.31
358 0.39
359 0.48
360 0.57
361 0.61
362 0.59
363 0.56
364 0.58
365 0.57
366 0.55
367 0.56
368 0.54
369 0.52
370 0.58
371 0.6
372 0.55
373 0.5
374 0.46
375 0.37
376 0.3
377 0.26
378 0.2
379 0.18
380 0.17
381 0.17
382 0.17
383 0.18
384 0.17
385 0.16
386 0.2
387 0.19
388 0.23
389 0.24
390 0.23
391 0.22
392 0.22
393 0.22
394 0.16
395 0.16
396 0.11
397 0.12
398 0.12
399 0.11
400 0.1
401 0.09
402 0.1
403 0.15
404 0.2
405 0.21
406 0.23
407 0.24
408 0.28
409 0.33
410 0.4
411 0.45
412 0.5
413 0.56
414 0.59
415 0.64
416 0.67
417 0.72
418 0.75
419 0.75
420 0.76
421 0.78
422 0.83
423 0.87
424 0.89
425 0.91
426 0.9
427 0.89
428 0.85
429 0.84
430 0.81
431 0.77
432 0.7
433 0.6
434 0.56