FuNGI

A0A1Q2YL40

Protein Details

Accession

A0A1Q2YL40

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
84-114	SDTDSVSHQKPKKGRRKKKNNSDAKAKTVKA	Hydrophilic
581-610	EDCWQKWKDQFTSRSKKRRKGVRQFEGYNE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
93-110	KPKKGRRKKKNNSDAKAK
595-600	SKKRRK

Subcellular Location(s)

nucl 25, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007224 TIF_Rrn11
Gene Ontology	GO:0001164 F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding GO:0001181 F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity
Pfam	View protein in Pfam PF04090 RNA_pol_I_TF

Amino Acid Sequences

MDTPFEIPYCILEDAPENRHTRILRPYVEQLIHTDVEHPVHSNPYNRFSVLRNEVQEDTLEYWISDPENEQETGEKGQNSGSESDTDSVSHQKPKKGRRKKKNNSDAKAKTVKAHIRLAHDAQISSADSALNYEFNSREVQHIKQQMYLSLQQKSRSTLPPETETKDIKMALISLSGYECPPPPVYFNSSRPDCERVSFIKYLSRVIDTLFYISLYKGNWKQCYRLFSILVRTFDSDINQIWTLGVHMLCELNMSEFKKYFHVEWMKFNKESAAPELSPKVLNDMAFLQNPALVPLLYKGENDPDLIRILQRTVIQKRPMYDIILKFLRLLMRTSRNQHPLIGAYPEQTYVPGGILLPEKKLRQSKSHEKIQKEEEARSSNSQHQDRCRPNASPNENFDSAEKCAASNTGTENEKSDTDTDPDTDPDTDPDTDTDMGIDTGTASNIKDPHITISAHKTPIIIKNNDFDPRSDGHTPHQQIFRKSLKRHSTPLHKQGTRVRTPTFTLSYLWILVRSGRLNVVQRALEPLLLVVPTSTDARVELANLASRVLDLAGAAQEISLSDEYEWERISLVEGKLSEIEDCWQKWKDQFTSRSKKRRKGVRQFEGYNEVGVSLAKLKKWVNDCLMKNKGDQKSKFGSKLAKPEESYESAKSDGYITANEDDKTDETEQEVKEDFELDADADEEEEIRKEMERLLGYSAIVDEEESEVTKKEIKNEEFGKEDFVVEDDDEEEVQREMERLMGYAEEHNNGDDDNDDDDDNNFKLENEQFYNEYNKWHDIDSDSE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.27
3	0.32
4	0.31
5	0.32
6	0.38
7	0.39
8	0.39
9	0.44
10	0.48
11	0.46
12	0.48
13	0.53
14	0.55
15	0.55
16	0.5
17	0.44
18	0.41
19	0.37
20	0.32
21	0.28
22	0.22
23	0.23
24	0.22
25	0.21
26	0.17
27	0.23
28	0.26
29	0.31
30	0.34
31	0.38
32	0.4
33	0.39
34	0.4
35	0.37
36	0.43
37	0.43
38	0.45
39	0.42
40	0.43
41	0.43
42	0.42
43	0.39
44	0.33
45	0.28
46	0.23
47	0.19
48	0.15
49	0.14
50	0.15
51	0.15
52	0.12
53	0.11
54	0.14
55	0.17
56	0.17
57	0.17
58	0.18
59	0.19
60	0.23
61	0.25
62	0.22
63	0.19
64	0.2
65	0.22
66	0.23
67	0.22
68	0.2
69	0.18
70	0.2
71	0.2
72	0.19
73	0.17
74	0.17
75	0.22
76	0.24
77	0.32
78	0.35
79	0.41
80	0.49
81	0.59
82	0.69
83	0.73
84	0.8
85	0.83
86	0.89
87	0.93
88	0.96
89	0.96
90	0.96
91	0.93
92	0.93
93	0.88
94	0.85
95	0.82
96	0.73
97	0.66
98	0.64
99	0.63
100	0.57
101	0.59
102	0.54
103	0.52
104	0.56
105	0.54
106	0.51
107	0.46
108	0.4
109	0.33
110	0.31
111	0.25
112	0.19
113	0.17
114	0.11
115	0.09
116	0.1
117	0.1
118	0.09
119	0.08
120	0.11
121	0.1
122	0.12
123	0.15
124	0.14
125	0.2
126	0.23
127	0.25
128	0.31
129	0.38
130	0.38
131	0.4
132	0.4
133	0.36
134	0.38
135	0.42
136	0.39
137	0.38
138	0.4
139	0.39
140	0.41
141	0.42
142	0.42
143	0.42
144	0.44
145	0.43
146	0.45
147	0.47
148	0.5
149	0.49
150	0.49
151	0.45
152	0.4
153	0.37
154	0.32
155	0.27
156	0.22
157	0.19
158	0.14
159	0.13
160	0.11
161	0.08
162	0.09
163	0.09
164	0.09
165	0.1
166	0.1
167	0.12
168	0.14
169	0.14
170	0.16
171	0.19
172	0.26
173	0.31
174	0.35
175	0.41
176	0.41
177	0.43
178	0.44
179	0.45
180	0.39
181	0.35
182	0.35
183	0.3
184	0.33
185	0.32
186	0.29
187	0.3
188	0.29
189	0.3
190	0.27
191	0.25
192	0.2
193	0.19
194	0.2
195	0.16
196	0.16
197	0.13
198	0.12
199	0.11
200	0.11
201	0.12
202	0.1
203	0.16
204	0.2
205	0.27
206	0.34
207	0.35
208	0.41
209	0.44
210	0.49
211	0.48
212	0.46
213	0.42
214	0.37
215	0.45
216	0.44
217	0.41
218	0.37
219	0.33
220	0.3
221	0.28
222	0.27
223	0.19
224	0.15
225	0.17
226	0.16
227	0.14
228	0.12
229	0.11
230	0.1
231	0.11
232	0.1
233	0.06
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.07
239	0.06
240	0.1
241	0.11
242	0.13
243	0.14
244	0.15
245	0.18
246	0.2
247	0.19
248	0.24
249	0.32
250	0.32
251	0.4
252	0.47
253	0.49
254	0.47
255	0.46
256	0.4
257	0.33
258	0.33
259	0.28
260	0.24
261	0.2
262	0.22
263	0.23
264	0.22
265	0.2
266	0.18
267	0.18
268	0.15
269	0.14
270	0.13
271	0.15
272	0.16
273	0.15
274	0.16
275	0.12
276	0.12
277	0.12
278	0.11
279	0.09
280	0.06
281	0.06
282	0.07
283	0.09
284	0.09
285	0.09
286	0.09
287	0.11
288	0.12
289	0.13
290	0.12
291	0.11
292	0.11
293	0.11
294	0.12
295	0.1
296	0.1
297	0.11
298	0.14
299	0.2
300	0.24
301	0.3
302	0.35
303	0.36
304	0.37
305	0.4
306	0.38
307	0.34
308	0.35
309	0.3
310	0.3
311	0.29
312	0.27
313	0.22
314	0.23
315	0.21
316	0.16
317	0.17
318	0.17
319	0.23
320	0.27
321	0.32
322	0.38
323	0.41
324	0.41
325	0.4
326	0.36
327	0.3
328	0.28
329	0.25
330	0.18
331	0.14
332	0.14
333	0.13
334	0.12
335	0.1
336	0.09
337	0.07
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.06
342	0.08
343	0.09
344	0.1
345	0.13
346	0.13
347	0.18
348	0.24
349	0.26
350	0.31
351	0.39
352	0.48
353	0.52
354	0.61
355	0.63
356	0.59
357	0.61
358	0.59
359	0.57
360	0.49
361	0.44
362	0.38
363	0.36
364	0.35
365	0.33
366	0.31
367	0.29
368	0.34
369	0.35
370	0.34
371	0.36
372	0.43
373	0.45
374	0.48
375	0.46
376	0.41
377	0.42
378	0.48
379	0.49
380	0.44
381	0.43
382	0.43
383	0.4
384	0.39
385	0.34
386	0.27
387	0.22
388	0.18
389	0.15
390	0.1
391	0.09
392	0.1
393	0.09
394	0.08
395	0.09
396	0.11
397	0.12
398	0.12
399	0.14
400	0.15
401	0.14
402	0.14
403	0.14
404	0.12
405	0.12
406	0.13
407	0.13
408	0.12
409	0.13
410	0.13
411	0.12
412	0.11
413	0.11
414	0.13
415	0.12
416	0.11
417	0.11
418	0.12
419	0.11
420	0.11
421	0.09
422	0.07
423	0.07
424	0.06
425	0.06
426	0.04
427	0.04
428	0.04
429	0.05
430	0.04
431	0.06
432	0.07
433	0.08
434	0.09
435	0.09
436	0.11
437	0.14
438	0.14
439	0.14
440	0.21
441	0.24
442	0.24
443	0.24
444	0.22
445	0.22
446	0.3
447	0.35
448	0.3
449	0.27
450	0.29
451	0.32
452	0.36
453	0.34
454	0.27
455	0.23
456	0.22
457	0.26
458	0.26
459	0.24
460	0.24
461	0.32
462	0.33
463	0.34
464	0.4
465	0.39
466	0.38
467	0.44
468	0.49
469	0.49
470	0.5
471	0.55
472	0.57
473	0.58
474	0.62
475	0.63
476	0.65
477	0.65
478	0.72
479	0.72
480	0.64
481	0.64
482	0.65
483	0.66
484	0.61
485	0.56
486	0.49
487	0.41
488	0.43
489	0.42
490	0.37
491	0.29
492	0.24
493	0.23
494	0.21
495	0.2
496	0.18
497	0.13
498	0.11
499	0.11
500	0.12
501	0.11
502	0.11
503	0.11
504	0.15
505	0.18
506	0.2
507	0.22
508	0.2
509	0.19
510	0.22
511	0.21
512	0.18
513	0.14
514	0.12
515	0.09
516	0.09
517	0.09
518	0.04
519	0.04
520	0.05
521	0.06
522	0.06
523	0.06
524	0.06
525	0.08
526	0.08
527	0.08
528	0.08
529	0.08
530	0.1
531	0.1
532	0.1
533	0.09
534	0.09
535	0.08
536	0.07
537	0.06
538	0.04
539	0.04
540	0.04
541	0.04
542	0.04
543	0.04
544	0.04
545	0.04
546	0.06
547	0.06
548	0.06
549	0.06
550	0.08
551	0.09
552	0.11
553	0.11
554	0.09
555	0.09
556	0.08
557	0.11
558	0.14
559	0.13
560	0.15
561	0.14
562	0.15
563	0.16
564	0.16
565	0.14
566	0.1
567	0.12
568	0.14
569	0.15
570	0.19
571	0.2
572	0.22
573	0.25
574	0.32
575	0.36
576	0.41
577	0.5
578	0.56
579	0.66
580	0.73
581	0.8
582	0.83
583	0.85
584	0.85
585	0.87
586	0.87
587	0.87
588	0.89
589	0.88
590	0.88
591	0.82
592	0.78
593	0.73
594	0.62
595	0.51
596	0.4
597	0.29
598	0.2
599	0.16
600	0.12
601	0.12
602	0.13
603	0.13
604	0.18
605	0.19
606	0.25
607	0.29
608	0.35
609	0.37
610	0.44
611	0.48
612	0.53
613	0.58
614	0.53
615	0.54
616	0.57
617	0.57
618	0.58
619	0.56
620	0.54
621	0.57
622	0.62
623	0.61
624	0.57
625	0.58
626	0.54
627	0.62
628	0.61
629	0.58
630	0.52
631	0.53
632	0.53
633	0.49
634	0.47
635	0.39
636	0.34
637	0.29
638	0.28
639	0.25
640	0.2
641	0.17
642	0.15
643	0.14
644	0.15
645	0.17
646	0.19
647	0.19
648	0.18
649	0.19
650	0.18
651	0.22
652	0.2
653	0.18
654	0.18
655	0.24
656	0.23
657	0.24
658	0.24
659	0.2
660	0.19
661	0.2
662	0.17
663	0.11
664	0.12
665	0.09
666	0.08
667	0.08
668	0.07
669	0.06
670	0.06
671	0.06
672	0.07
673	0.07
674	0.07
675	0.08
676	0.09
677	0.09
678	0.12
679	0.17
680	0.18
681	0.18
682	0.21
683	0.21
684	0.2
685	0.2
686	0.18
687	0.13
688	0.11
689	0.1
690	0.07
691	0.07
692	0.08
693	0.09
694	0.1
695	0.1
696	0.11
697	0.17
698	0.18
699	0.25
700	0.34
701	0.36
702	0.44
703	0.48
704	0.51
705	0.5
706	0.49
707	0.45
708	0.36
709	0.34
710	0.25
711	0.22
712	0.19
713	0.15
714	0.15
715	0.11
716	0.11
717	0.11
718	0.11
719	0.11
720	0.09
721	0.09
722	0.09
723	0.09
724	0.08
725	0.11
726	0.11
727	0.1
728	0.11
729	0.12
730	0.13
731	0.18
732	0.2
733	0.2
734	0.2
735	0.2
736	0.19
737	0.19
738	0.17
739	0.13
740	0.12
741	0.12
742	0.13
743	0.13
744	0.13
745	0.14
746	0.17
747	0.16
748	0.15
749	0.13
750	0.11
751	0.16
752	0.2
753	0.25
754	0.26
755	0.29
756	0.31
757	0.33
758	0.4
759	0.36
760	0.38
761	0.36
762	0.36
763	0.34
764	0.33
765	0.33

A0A1Q2YL40

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer