Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q2YHQ0

Protein Details
Accession A0A1Q2YHQ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-45AKPALKFKPKVVSRKTKEERENAGKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-77KPALKFKPKVVSRKTKEERENAGKINTPGVNKIVEKNNRRLAKKPGPGAAGGRTNK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12, mito 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MSKRLDSITRPSAPSGTPTGAKPALKFKPKVVSRKTKEERENAGKINTPGVNKIVEKNNRRLAKKPGPGAAGGRTNKKLTGTQLVISGPLSEGAISLGGSTTYNSSSGSSGKNPMNPLLDRLKSKSQAKALKNSKIKSENGERSLKIFDDSDSDIDDNAIDMGKKSLLGDDLVDGDGDVNLEKIDTDLFPVRAERNEHREYGEEAKIDKTIKTEFHSERSVIPSETPSRDPTADVTPVSGDSSKSRAIINEDDANLHMNNFQEQLESKQMEEDYNILSKNLKSLDLENNMFFLQVPCSLPVFEGGLDGQIGKIRIHKSGKMTMKIGKVKFEVLRGGSSDFRQDVILVDKEKGSCYHVGNVKDKITAIPKIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.37
3 0.32
4 0.29
5 0.28
6 0.33
7 0.35
8 0.36
9 0.34
10 0.39
11 0.45
12 0.51
13 0.53
14 0.52
15 0.57
16 0.63
17 0.7
18 0.71
19 0.73
20 0.72
21 0.8
22 0.83
23 0.82
24 0.83
25 0.82
26 0.81
27 0.79
28 0.78
29 0.71
30 0.66
31 0.61
32 0.53
33 0.51
34 0.44
35 0.37
36 0.32
37 0.3
38 0.31
39 0.27
40 0.33
41 0.36
42 0.42
43 0.47
44 0.53
45 0.6
46 0.64
47 0.66
48 0.66
49 0.67
50 0.68
51 0.69
52 0.66
53 0.63
54 0.57
55 0.56
56 0.53
57 0.48
58 0.46
59 0.42
60 0.42
61 0.4
62 0.39
63 0.38
64 0.38
65 0.35
66 0.31
67 0.36
68 0.32
69 0.3
70 0.31
71 0.3
72 0.28
73 0.24
74 0.2
75 0.12
76 0.1
77 0.09
78 0.06
79 0.06
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.05
87 0.05
88 0.06
89 0.07
90 0.07
91 0.08
92 0.09
93 0.1
94 0.12
95 0.14
96 0.15
97 0.2
98 0.22
99 0.25
100 0.25
101 0.27
102 0.29
103 0.27
104 0.29
105 0.31
106 0.32
107 0.31
108 0.34
109 0.37
110 0.4
111 0.43
112 0.44
113 0.46
114 0.51
115 0.53
116 0.58
117 0.59
118 0.62
119 0.65
120 0.61
121 0.6
122 0.57
123 0.54
124 0.5
125 0.53
126 0.51
127 0.5
128 0.52
129 0.45
130 0.42
131 0.41
132 0.35
133 0.27
134 0.2
135 0.14
136 0.13
137 0.14
138 0.13
139 0.13
140 0.12
141 0.11
142 0.11
143 0.1
144 0.07
145 0.05
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.05
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.1
179 0.12
180 0.17
181 0.18
182 0.24
183 0.26
184 0.27
185 0.27
186 0.27
187 0.28
188 0.29
189 0.27
190 0.2
191 0.19
192 0.19
193 0.2
194 0.19
195 0.16
196 0.13
197 0.14
198 0.15
199 0.17
200 0.24
201 0.23
202 0.27
203 0.29
204 0.28
205 0.27
206 0.29
207 0.28
208 0.2
209 0.19
210 0.19
211 0.21
212 0.23
213 0.23
214 0.21
215 0.22
216 0.22
217 0.22
218 0.21
219 0.21
220 0.2
221 0.18
222 0.16
223 0.14
224 0.14
225 0.14
226 0.13
227 0.1
228 0.1
229 0.13
230 0.13
231 0.14
232 0.14
233 0.14
234 0.18
235 0.2
236 0.22
237 0.23
238 0.22
239 0.22
240 0.22
241 0.22
242 0.18
243 0.15
244 0.13
245 0.1
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.11
251 0.14
252 0.19
253 0.19
254 0.18
255 0.19
256 0.2
257 0.19
258 0.19
259 0.17
260 0.13
261 0.14
262 0.15
263 0.12
264 0.14
265 0.13
266 0.17
267 0.16
268 0.16
269 0.15
270 0.19
271 0.26
272 0.3
273 0.32
274 0.29
275 0.29
276 0.27
277 0.26
278 0.22
279 0.15
280 0.11
281 0.11
282 0.12
283 0.12
284 0.13
285 0.13
286 0.13
287 0.14
288 0.13
289 0.11
290 0.1
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.07
296 0.09
297 0.1
298 0.1
299 0.15
300 0.17
301 0.24
302 0.29
303 0.33
304 0.37
305 0.45
306 0.52
307 0.52
308 0.54
309 0.53
310 0.58
311 0.61
312 0.57
313 0.54
314 0.48
315 0.49
316 0.47
317 0.44
318 0.41
319 0.35
320 0.35
321 0.31
322 0.33
323 0.29
324 0.28
325 0.3
326 0.24
327 0.23
328 0.21
329 0.19
330 0.18
331 0.21
332 0.24
333 0.21
334 0.22
335 0.24
336 0.25
337 0.26
338 0.25
339 0.24
340 0.24
341 0.26
342 0.32
343 0.36
344 0.42
345 0.46
346 0.49
347 0.48
348 0.44
349 0.42
350 0.39
351 0.39