Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q2YE55

Protein Details
Accession A0A1Q2YE55    Localization Confidence Low Confidence Score 8.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-163VSLQKIKDNKEKIKNNKQLPYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 12, cyto 10.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005937  26S_Psome_P45-like  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR041569  AAA_lid_3  
IPR003959  ATPase_AAA_core  
IPR003960  ATPase_AAA_CS  
IPR007834  DSS1_SEM1  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR032501  Prot_ATP_ID_OB_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008540  C:proteasome regulatory particle, base subcomplex  
GO:0008541  C:proteasome regulatory particle, lid subcomplex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0036402  F:proteasome-activating activity  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
GO:0070682  P:proteasome regulatory particle assembly  
GO:0043161  P:proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00004  AAA  
PF17862  AAA_lid_3  
PF05160  DSS1_SEM1  
PF16450  Prot_ATP_ID_OB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00674  AAA  
CDD cd13768  DSS1_Sem1  
Amino Acid Sequences MSAEDAKKQDTAVAEQQKQDEFIKKLEDDDEFEDFPEDDWEEPQNTDGKHDLWEESWEDHDDYKDNFIQRLRYSPPKETSPSAIPQLHKMATLEDLENNQDLQIDQEILSSSTTDIKNRTKLLDNEIKIFRSEFLRLQHDKTVSLQKIKDNKEKIKNNKQLPYLVGNVVELLDIDAEENATNEGANIDLDSTRVGKSAVIKTSTRQTVFLPLIGLVEPEKLKPGDLIGVNKDSYLILDTLPAEYDSRVKAMEVDEKPTESYADIGGLDKQVEELVEAVVLPMQQAEKFKNLGIKPPKGALMYGPPGTGKTLLARACAAQSNATFLKLAAPQLVQMFIGDGAKLVRDAFELAKEKAPTIIFIDELDAIGTKRFDSDKSGDREVQRTMLELLNQLDGFGSDDRVKVLAATNRVDVLDPALLRSGRLDRKIEFLLPSEESRAQILQIHARKMTVDSSVNWKELARSTDEFNGAQLKAVTVEAGMIALRNGQSSVKHEDFVEGIGEVQARKTKSVSFYA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.44
3 0.48
4 0.46
5 0.46
6 0.44
7 0.43
8 0.36
9 0.35
10 0.37
11 0.34
12 0.36
13 0.36
14 0.34
15 0.3
16 0.31
17 0.32
18 0.26
19 0.26
20 0.26
21 0.22
22 0.21
23 0.19
24 0.16
25 0.12
26 0.14
27 0.16
28 0.16
29 0.17
30 0.18
31 0.2
32 0.19
33 0.22
34 0.23
35 0.2
36 0.22
37 0.24
38 0.23
39 0.2
40 0.23
41 0.22
42 0.21
43 0.23
44 0.22
45 0.22
46 0.21
47 0.22
48 0.21
49 0.2
50 0.24
51 0.26
52 0.25
53 0.27
54 0.29
55 0.33
56 0.32
57 0.37
58 0.38
59 0.44
60 0.48
61 0.53
62 0.55
63 0.56
64 0.58
65 0.55
66 0.55
67 0.5
68 0.49
69 0.47
70 0.47
71 0.42
72 0.42
73 0.44
74 0.39
75 0.34
76 0.31
77 0.25
78 0.22
79 0.23
80 0.2
81 0.16
82 0.17
83 0.18
84 0.18
85 0.17
86 0.14
87 0.12
88 0.11
89 0.1
90 0.1
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.1
95 0.1
96 0.11
97 0.09
98 0.09
99 0.14
100 0.15
101 0.17
102 0.22
103 0.27
104 0.32
105 0.34
106 0.38
107 0.39
108 0.41
109 0.47
110 0.5
111 0.46
112 0.47
113 0.48
114 0.45
115 0.39
116 0.36
117 0.29
118 0.23
119 0.24
120 0.21
121 0.23
122 0.31
123 0.33
124 0.35
125 0.39
126 0.37
127 0.35
128 0.36
129 0.4
130 0.35
131 0.38
132 0.38
133 0.39
134 0.47
135 0.53
136 0.58
137 0.57
138 0.63
139 0.67
140 0.74
141 0.78
142 0.8
143 0.82
144 0.81
145 0.79
146 0.74
147 0.67
148 0.6
149 0.54
150 0.45
151 0.37
152 0.29
153 0.22
154 0.19
155 0.16
156 0.12
157 0.08
158 0.05
159 0.04
160 0.03
161 0.04
162 0.03
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.13
184 0.18
185 0.2
186 0.22
187 0.23
188 0.24
189 0.31
190 0.35
191 0.3
192 0.26
193 0.24
194 0.27
195 0.27
196 0.26
197 0.19
198 0.15
199 0.15
200 0.13
201 0.13
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.11
212 0.12
213 0.14
214 0.14
215 0.16
216 0.16
217 0.16
218 0.16
219 0.12
220 0.1
221 0.09
222 0.07
223 0.05
224 0.06
225 0.07
226 0.06
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.08
232 0.07
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.09
238 0.17
239 0.16
240 0.19
241 0.19
242 0.2
243 0.2
244 0.19
245 0.18
246 0.09
247 0.09
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.04
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.04
270 0.05
271 0.07
272 0.09
273 0.11
274 0.12
275 0.13
276 0.19
277 0.19
278 0.27
279 0.33
280 0.34
281 0.34
282 0.34
283 0.35
284 0.29
285 0.29
286 0.22
287 0.19
288 0.19
289 0.18
290 0.17
291 0.15
292 0.15
293 0.16
294 0.15
295 0.1
296 0.08
297 0.13
298 0.13
299 0.14
300 0.14
301 0.14
302 0.14
303 0.16
304 0.15
305 0.12
306 0.11
307 0.15
308 0.15
309 0.15
310 0.13
311 0.12
312 0.14
313 0.14
314 0.14
315 0.11
316 0.11
317 0.12
318 0.12
319 0.13
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.07
324 0.07
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.07
334 0.07
335 0.13
336 0.16
337 0.17
338 0.21
339 0.21
340 0.21
341 0.23
342 0.22
343 0.18
344 0.17
345 0.16
346 0.13
347 0.12
348 0.14
349 0.1
350 0.1
351 0.09
352 0.07
353 0.06
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.08
358 0.09
359 0.1
360 0.16
361 0.2
362 0.27
363 0.32
364 0.37
365 0.4
366 0.41
367 0.43
368 0.39
369 0.38
370 0.3
371 0.26
372 0.24
373 0.21
374 0.19
375 0.18
376 0.17
377 0.16
378 0.16
379 0.14
380 0.12
381 0.1
382 0.12
383 0.1
384 0.11
385 0.1
386 0.1
387 0.11
388 0.12
389 0.11
390 0.1
391 0.15
392 0.17
393 0.2
394 0.21
395 0.22
396 0.22
397 0.23
398 0.22
399 0.17
400 0.15
401 0.14
402 0.12
403 0.12
404 0.15
405 0.14
406 0.14
407 0.17
408 0.22
409 0.25
410 0.31
411 0.33
412 0.31
413 0.37
414 0.39
415 0.39
416 0.33
417 0.3
418 0.29
419 0.28
420 0.28
421 0.27
422 0.26
423 0.24
424 0.24
425 0.22
426 0.18
427 0.2
428 0.21
429 0.26
430 0.3
431 0.32
432 0.31
433 0.31
434 0.31
435 0.29
436 0.28
437 0.24
438 0.21
439 0.2
440 0.29
441 0.32
442 0.32
443 0.31
444 0.29
445 0.27
446 0.3
447 0.31
448 0.27
449 0.26
450 0.29
451 0.34
452 0.36
453 0.33
454 0.29
455 0.31
456 0.25
457 0.25
458 0.22
459 0.17
460 0.15
461 0.15
462 0.14
463 0.08
464 0.08
465 0.06
466 0.07
467 0.06
468 0.05
469 0.05
470 0.07
471 0.08
472 0.08
473 0.1
474 0.11
475 0.14
476 0.19
477 0.28
478 0.27
479 0.28
480 0.28
481 0.29
482 0.28
483 0.26
484 0.22
485 0.13
486 0.12
487 0.12
488 0.13
489 0.11
490 0.14
491 0.18
492 0.19
493 0.21
494 0.22
495 0.26