Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q2YE52

Protein Details
Accession A0A1Q2YE52    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
495-514NVLIPRSKKHPNKKMPVPTIHydrophilic
983-1007DQILKFMTKRLVKNKKYNDSKDAKVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 9.333, cyto_mito 4.166, plas 4, mito 3.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031120  HIR1-like  
IPR011494  HIRA-like_C  
IPR019015  HIRA_B_motif  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF07569  Hira  
PF09453  HIRA_B  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MHVVKFPWVKHAEGPRSFEIYSVSVSPDGSRLATGGLDGKVKLWSIDTLKKYEEADKLNGGSSFSSNIIDKSECRPLCSMSRHAGAITCVRFCPNGRFLASGSDDKLVLIWEKDEEKTRIMAMHRNEIANSGDSNFLFANGDDSGINDADLEHWTVRKRLVAHDNDVQDMAWAPDGSILVTVGLDRSIVVWNGMTFEKIKRFDIHQSHVKGVVFDPAGKYFATCSDDRSMRIFRYRKGVSVEGADMEFVVENIIRDPFAKSPLTTYFRRCSWSPDGLYIAAPNGTNEGVNANVVIKRGSWESELSLIGHRLPCEVCSFSPRLYDVEFGNNNSSNKRNGGHNKSSSRSETVIITAGQDRTLALWSSSCATPLCVATEISAKSITDIAWNPNGLNVFLCGLDGVVLSLFFDERELGHVVPWEENNRALIRYGKDRDMFFPESVEQLKLEEFAESRGIIGNIKPVKPDRLQSLMGGSSMGGNAELNPSSNDESRKVMNVLIPRSKKHPNKKMPVPTILPKTTSNTHNGTSNTRASTSSQTKVNLLSSKTQNITITKSGKKRVAPTLISVSSTNANTSASSASNAFSSGTAAAASADATATTLKNLNIEKRSKLSRIISLPYPPLPKHGLSTLTSSIRPKIVNDETEQESLEKAIDYIAETDNNNSGLQDKRGKFSSVNKKSYSSNTLSKSANGGRKSYPSVYGDSSSVWNKRRKVAYPDWIKDSLVSPITIYGDTSMSFYNVFVERKQLPEPLVGEQVVEVRYENDHVYKYLDHNDDTEMENNWNEFDAVSHIVAKSTNCESESVEEWELFVNERITCLGESSLEGLSYWCFCTENGRVLLISLTGRQLCGSIELGSNVVKLQCKDSYIMCVCANGMIYSWKFFKCHDSLISGKSIVEGVSLAPVLNTHSMTSESKKKIEISAKITNLYMRSNGCPLIVINDEKRNCIYSFDPLLESWVEVLDSWYVDVLPACKLESEMEVLGETDQILKFMTKRLVKNKKYNDSKDAKVTMETNGTKETKDTKTIPDIKNVKQNTTASNETSKDSTSAICSNAKGEATLESIYEDWKSVNKCVAECINRKLEKC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.54
3 0.56
4 0.53
5 0.47
6 0.4
7 0.31
8 0.28
9 0.23
10 0.21
11 0.18
12 0.18
13 0.18
14 0.17
15 0.16
16 0.14
17 0.13
18 0.11
19 0.11
20 0.11
21 0.11
22 0.13
23 0.14
24 0.15
25 0.15
26 0.16
27 0.17
28 0.17
29 0.17
30 0.15
31 0.18
32 0.23
33 0.32
34 0.34
35 0.36
36 0.38
37 0.4
38 0.41
39 0.42
40 0.42
41 0.39
42 0.39
43 0.39
44 0.39
45 0.38
46 0.36
47 0.31
48 0.26
49 0.22
50 0.2
51 0.16
52 0.17
53 0.16
54 0.16
55 0.18
56 0.19
57 0.2
58 0.23
59 0.32
60 0.3
61 0.33
62 0.35
63 0.36
64 0.42
65 0.46
66 0.46
67 0.42
68 0.45
69 0.42
70 0.41
71 0.38
72 0.33
73 0.34
74 0.31
75 0.27
76 0.24
77 0.25
78 0.27
79 0.28
80 0.33
81 0.3
82 0.33
83 0.33
84 0.35
85 0.33
86 0.38
87 0.4
88 0.34
89 0.31
90 0.27
91 0.25
92 0.23
93 0.23
94 0.17
95 0.15
96 0.12
97 0.11
98 0.13
99 0.16
100 0.19
101 0.25
102 0.26
103 0.26
104 0.26
105 0.27
106 0.28
107 0.28
108 0.33
109 0.3
110 0.37
111 0.38
112 0.38
113 0.37
114 0.35
115 0.34
116 0.29
117 0.26
118 0.18
119 0.18
120 0.16
121 0.18
122 0.16
123 0.14
124 0.13
125 0.12
126 0.13
127 0.1
128 0.11
129 0.09
130 0.1
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.1
138 0.11
139 0.1
140 0.12
141 0.15
142 0.17
143 0.19
144 0.22
145 0.23
146 0.29
147 0.38
148 0.41
149 0.45
150 0.5
151 0.5
152 0.47
153 0.45
154 0.36
155 0.27
156 0.22
157 0.16
158 0.11
159 0.09
160 0.08
161 0.09
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.04
173 0.05
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.15
184 0.22
185 0.24
186 0.27
187 0.28
188 0.32
189 0.4
190 0.46
191 0.49
192 0.5
193 0.51
194 0.51
195 0.51
196 0.48
197 0.39
198 0.32
199 0.3
200 0.23
201 0.21
202 0.21
203 0.18
204 0.19
205 0.17
206 0.17
207 0.12
208 0.15
209 0.18
210 0.16
211 0.19
212 0.25
213 0.27
214 0.29
215 0.33
216 0.32
217 0.32
218 0.41
219 0.41
220 0.37
221 0.45
222 0.45
223 0.44
224 0.46
225 0.45
226 0.38
227 0.37
228 0.34
229 0.26
230 0.24
231 0.2
232 0.14
233 0.12
234 0.09
235 0.06
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.07
241 0.06
242 0.07
243 0.1
244 0.11
245 0.15
246 0.16
247 0.15
248 0.19
249 0.26
250 0.31
251 0.32
252 0.36
253 0.37
254 0.38
255 0.42
256 0.39
257 0.39
258 0.41
259 0.45
260 0.4
261 0.38
262 0.38
263 0.34
264 0.34
265 0.27
266 0.2
267 0.14
268 0.12
269 0.1
270 0.09
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.1
284 0.11
285 0.12
286 0.13
287 0.13
288 0.13
289 0.15
290 0.16
291 0.15
292 0.15
293 0.14
294 0.14
295 0.15
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.15
301 0.16
302 0.15
303 0.18
304 0.2
305 0.19
306 0.21
307 0.21
308 0.2
309 0.19
310 0.2
311 0.16
312 0.22
313 0.22
314 0.21
315 0.24
316 0.26
317 0.26
318 0.27
319 0.28
320 0.23
321 0.24
322 0.25
323 0.3
324 0.36
325 0.44
326 0.5
327 0.56
328 0.59
329 0.6
330 0.62
331 0.56
332 0.5
333 0.42
334 0.35
335 0.28
336 0.23
337 0.21
338 0.17
339 0.16
340 0.15
341 0.14
342 0.12
343 0.11
344 0.1
345 0.09
346 0.1
347 0.09
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.1
352 0.1
353 0.11
354 0.09
355 0.1
356 0.11
357 0.11
358 0.12
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.14
363 0.13
364 0.13
365 0.13
366 0.11
367 0.11
368 0.12
369 0.11
370 0.11
371 0.12
372 0.14
373 0.15
374 0.16
375 0.15
376 0.16
377 0.16
378 0.13
379 0.11
380 0.09
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.04
388 0.04
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.04
397 0.04
398 0.07
399 0.08
400 0.08
401 0.09
402 0.11
403 0.11
404 0.12
405 0.14
406 0.13
407 0.12
408 0.13
409 0.14
410 0.13
411 0.13
412 0.13
413 0.16
414 0.16
415 0.23
416 0.25
417 0.27
418 0.3
419 0.3
420 0.32
421 0.35
422 0.35
423 0.28
424 0.26
425 0.22
426 0.21
427 0.21
428 0.19
429 0.12
430 0.1
431 0.1
432 0.09
433 0.09
434 0.08
435 0.07
436 0.07
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.13
445 0.15
446 0.16
447 0.18
448 0.18
449 0.23
450 0.25
451 0.27
452 0.25
453 0.27
454 0.27
455 0.25
456 0.26
457 0.21
458 0.19
459 0.17
460 0.12
461 0.08
462 0.07
463 0.06
464 0.04
465 0.03
466 0.04
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.06
471 0.07
472 0.09
473 0.12
474 0.13
475 0.14
476 0.16
477 0.16
478 0.17
479 0.16
480 0.15
481 0.16
482 0.18
483 0.21
484 0.27
485 0.28
486 0.28
487 0.32
488 0.4
489 0.46
490 0.53
491 0.59
492 0.62
493 0.69
494 0.77
495 0.81
496 0.77
497 0.73
498 0.66
499 0.62
500 0.58
501 0.5
502 0.43
503 0.35
504 0.33
505 0.32
506 0.3
507 0.29
508 0.25
509 0.24
510 0.26
511 0.26
512 0.26
513 0.26
514 0.26
515 0.22
516 0.21
517 0.21
518 0.19
519 0.24
520 0.25
521 0.24
522 0.24
523 0.24
524 0.24
525 0.24
526 0.25
527 0.22
528 0.19
529 0.22
530 0.21
531 0.24
532 0.23
533 0.24
534 0.23
535 0.21
536 0.23
537 0.22
538 0.26
539 0.28
540 0.32
541 0.35
542 0.38
543 0.39
544 0.41
545 0.43
546 0.44
547 0.39
548 0.38
549 0.38
550 0.35
551 0.33
552 0.28
553 0.23
554 0.18
555 0.17
556 0.15
557 0.09
558 0.09
559 0.08
560 0.08
561 0.09
562 0.07
563 0.08
564 0.08
565 0.08
566 0.08
567 0.08
568 0.07
569 0.06
570 0.06
571 0.06
572 0.05
573 0.05
574 0.05
575 0.04
576 0.04
577 0.04
578 0.03
579 0.03
580 0.03
581 0.03
582 0.04
583 0.04
584 0.05
585 0.06
586 0.06
587 0.1
588 0.12
589 0.16
590 0.22
591 0.24
592 0.26
593 0.28
594 0.32
595 0.31
596 0.35
597 0.33
598 0.32
599 0.33
600 0.34
601 0.32
602 0.31
603 0.31
604 0.29
605 0.3
606 0.24
607 0.25
608 0.24
609 0.23
610 0.22
611 0.22
612 0.21
613 0.19
614 0.23
615 0.23
616 0.22
617 0.23
618 0.22
619 0.22
620 0.21
621 0.2
622 0.17
623 0.21
624 0.23
625 0.23
626 0.24
627 0.27
628 0.27
629 0.27
630 0.27
631 0.2
632 0.16
633 0.14
634 0.13
635 0.08
636 0.05
637 0.05
638 0.05
639 0.05
640 0.07
641 0.07
642 0.08
643 0.09
644 0.1
645 0.11
646 0.11
647 0.11
648 0.09
649 0.11
650 0.11
651 0.15
652 0.22
653 0.22
654 0.24
655 0.27
656 0.28
657 0.29
658 0.37
659 0.45
660 0.46
661 0.51
662 0.5
663 0.5
664 0.51
665 0.53
666 0.49
667 0.43
668 0.4
669 0.38
670 0.4
671 0.39
672 0.36
673 0.36
674 0.36
675 0.37
676 0.32
677 0.31
678 0.28
679 0.31
680 0.34
681 0.32
682 0.3
683 0.26
684 0.27
685 0.26
686 0.25
687 0.23
688 0.2
689 0.21
690 0.21
691 0.24
692 0.28
693 0.32
694 0.34
695 0.4
696 0.45
697 0.47
698 0.52
699 0.55
700 0.59
701 0.63
702 0.64
703 0.62
704 0.58
705 0.52
706 0.44
707 0.36
708 0.3
709 0.21
710 0.17
711 0.12
712 0.12
713 0.13
714 0.12
715 0.11
716 0.08
717 0.08
718 0.08
719 0.09
720 0.08
721 0.08
722 0.08
723 0.08
724 0.09
725 0.12
726 0.13
727 0.12
728 0.17
729 0.18
730 0.2
731 0.22
732 0.22
733 0.2
734 0.23
735 0.24
736 0.22
737 0.23
738 0.2
739 0.18
740 0.15
741 0.16
742 0.13
743 0.12
744 0.09
745 0.08
746 0.09
747 0.1
748 0.11
749 0.11
750 0.11
751 0.12
752 0.14
753 0.15
754 0.17
755 0.22
756 0.23
757 0.22
758 0.22
759 0.23
760 0.23
761 0.23
762 0.22
763 0.16
764 0.15
765 0.15
766 0.14
767 0.13
768 0.12
769 0.1
770 0.08
771 0.07
772 0.08
773 0.09
774 0.1
775 0.11
776 0.1
777 0.11
778 0.12
779 0.12
780 0.13
781 0.14
782 0.15
783 0.15
784 0.16
785 0.16
786 0.18
787 0.21
788 0.21
789 0.2
790 0.18
791 0.17
792 0.17
793 0.16
794 0.14
795 0.12
796 0.1
797 0.1
798 0.1
799 0.11
800 0.11
801 0.11
802 0.11
803 0.1
804 0.08
805 0.09
806 0.1
807 0.1
808 0.08
809 0.08
810 0.08
811 0.08
812 0.09
813 0.09
814 0.08
815 0.08
816 0.08
817 0.14
818 0.17
819 0.22
820 0.22
821 0.23
822 0.22
823 0.22
824 0.22
825 0.17
826 0.15
827 0.1
828 0.12
829 0.11
830 0.11
831 0.11
832 0.11
833 0.1
834 0.12
835 0.12
836 0.1
837 0.11
838 0.11
839 0.12
840 0.12
841 0.12
842 0.1
843 0.11
844 0.13
845 0.13
846 0.17
847 0.18
848 0.19
849 0.21
850 0.21
851 0.27
852 0.26
853 0.29
854 0.25
855 0.23
856 0.22
857 0.21
858 0.21
859 0.12
860 0.11
861 0.12
862 0.12
863 0.15
864 0.18
865 0.18
866 0.18
867 0.2
868 0.26
869 0.25
870 0.29
871 0.29
872 0.31
873 0.33
874 0.35
875 0.37
876 0.3
877 0.26
878 0.22
879 0.2
880 0.14
881 0.11
882 0.09
883 0.06
884 0.07
885 0.07
886 0.07
887 0.06
888 0.06
889 0.08
890 0.1
891 0.1
892 0.09
893 0.1
894 0.14
895 0.17
896 0.22
897 0.3
898 0.32
899 0.33
900 0.36
901 0.37
902 0.42
903 0.47
904 0.49
905 0.47
906 0.52
907 0.52
908 0.5
909 0.49
910 0.44
911 0.38
912 0.33
913 0.29
914 0.23
915 0.23
916 0.25
917 0.25
918 0.22
919 0.21
920 0.19
921 0.19
922 0.2
923 0.21
924 0.23
925 0.31
926 0.32
927 0.33
928 0.35
929 0.34
930 0.31
931 0.3
932 0.27
933 0.26
934 0.29
935 0.29
936 0.29
937 0.26
938 0.28
939 0.24
940 0.22
941 0.15
942 0.12
943 0.1
944 0.08
945 0.09
946 0.08
947 0.08
948 0.07
949 0.07
950 0.07
951 0.07
952 0.08
953 0.08
954 0.09
955 0.1
956 0.1
957 0.1
958 0.11
959 0.12
960 0.13
961 0.15
962 0.14
963 0.13
964 0.13
965 0.13
966 0.13
967 0.11
968 0.1
969 0.1
970 0.09
971 0.09
972 0.1
973 0.11
974 0.12
975 0.17
976 0.25
977 0.29
978 0.38
979 0.49
980 0.59
981 0.67
982 0.76
983 0.81
984 0.84
985 0.88
986 0.87
987 0.86
988 0.82
989 0.79
990 0.77
991 0.7
992 0.61
993 0.54
994 0.48
995 0.41
996 0.43
997 0.38
998 0.32
999 0.35
1000 0.34
1001 0.31
1002 0.33
1003 0.37
1004 0.32
1005 0.38
1006 0.39
1007 0.39
1008 0.48
1009 0.58
1010 0.56
1011 0.59
1012 0.62
1013 0.61
1014 0.67
1015 0.64
1016 0.57
1017 0.55
1018 0.55
1019 0.5
1020 0.5
1021 0.48
1022 0.42
1023 0.46
1024 0.43
1025 0.39
1026 0.38
1027 0.34
1028 0.28
1029 0.25
1030 0.23
1031 0.22
1032 0.23
1033 0.23
1034 0.25
1035 0.24
1036 0.24
1037 0.26
1038 0.25
1039 0.21
1040 0.19
1041 0.17
1042 0.17
1043 0.17
1044 0.15
1045 0.14
1046 0.14
1047 0.15
1048 0.14
1049 0.13
1050 0.11
1051 0.17
1052 0.2
1053 0.21
1054 0.27
1055 0.29
1056 0.29
1057 0.35
1058 0.43
1059 0.46
1060 0.49
1061 0.53
1062 0.57