FuNGI

A0A1Q2YC24

Protein Details

Accession

A0A1Q2YC24

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
102-123	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAKD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, mito_nucl 10.5, mito 7.5, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSKKYPKIISSVIDEEGPEVDGIEHPINYSDPNPNGELDNLYLDMNAIVHPCSHPENKPPPETEEEMMLEIFSYTSRVLNIARPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAKDAQIAHEEKQRELAEMEARGEIIDEAIKGKKGWDSNSITPGTPFMDILAMSLKYWVAYKLSTDPGWATLQVIISDASVPGEGEHKIMNFIRSQRSDPEYDPNVSHCIHGLDADLIFLSLATHEPHFRVLREDVFANDQLQRQLSTRDRLHMDEATKEKLKNRKQPFIWLHINVLREYLQVELNVPRLPFKYDFERAIDDWVFMCFFAGNDFLPHLPSLDVRDSSLDTLVGIWKGLLPGLKHYITCDGNLNLDRVEKLLAELAKREDGIFKAKHEQDVRREANFKRRKVEREQQSIVNNQLLKTVSKGKDNAPLNPSQNMTLTNLSSGAISGGLKMTNNDIVKNISTISKANTTNQSVADVLRQNMVNNVKESSEPAEKEEPIDVSEANDKKRKVDSTEMENSSTADTEDKDDDIEDEDIRLWEPGYKSRYYQQKFRTTNEKEIFQIRRSMAKSYVEGISWVLLYYYQGCPSWNWYYPYHYAPFAADFTDLNEFKIEFEQGTPFQPFEQLMSVLPAASNHNLPQIFRSLMSEPDSEIIDFYPEDFEIDMNGEKQSWRGIALLPFIDEKRLLRVVRQQYHQLTNDEIERNSHKHEVLFVGKKSHYYKKFSKLYNPEKKKEEVAFHFEKTHLAGIAKPHEMYQPGEIFKFPFQSTNDEYKDLSTADFIMVEFQMPPKVIGKSMILTGYRPHNPVLTQEDKEKIMYFRNYNNRYQNRNENHSTGIDYSKHTGPGLPSMYNLRAGGYKFFLNMYTQEIAHQQQTAAFNQGANNFNDMYQNNYDTYANPAENYNSYGGRGGRGGYGGRGGHGGYGGYGGRGNRGGYGGRGGYNDGRGGYNGGRGGYNGGRGGYNGGRGGYMNYNNNRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.6
3	0.62
4	0.62
5	0.57
6	0.55
7	0.51
8	0.44
9	0.35
10	0.33
11	0.27
12	0.23
13	0.2
14	0.13
15	0.09
16	0.09
17	0.09
18	0.13
19	0.14
20	0.13
21	0.13
22	0.14
23	0.15
24	0.16
25	0.18
26	0.22
27	0.22
28	0.26
29	0.27
30	0.27
31	0.28
32	0.27
33	0.26
34	0.2
35	0.2
36	0.17
37	0.15
38	0.14
39	0.13
40	0.12
41	0.1
42	0.09
43	0.08
44	0.08
45	0.09
46	0.1
47	0.13
48	0.18
49	0.24
50	0.27
51	0.36
52	0.46
53	0.52
54	0.58
55	0.58
56	0.58
57	0.59
58	0.59
59	0.51
60	0.44
61	0.38
62	0.33
63	0.3
64	0.24
65	0.17
66	0.13
67	0.11
68	0.07
69	0.07
70	0.07
71	0.08
72	0.08
73	0.1
74	0.12
75	0.19
76	0.3
77	0.38
78	0.42
79	0.43
80	0.45
81	0.46
82	0.46
83	0.42
84	0.34
85	0.3
86	0.26
87	0.24
88	0.24
89	0.21
90	0.2
91	0.18
92	0.15
93	0.1
94	0.13
95	0.19
96	0.26
97	0.36
98	0.45
99	0.55
100	0.66
101	0.74
102	0.8
103	0.84
104	0.82
105	0.78
106	0.79
107	0.78
108	0.76
109	0.76
110	0.69
111	0.61
112	0.64
113	0.6
114	0.53
115	0.5
116	0.42
117	0.34
118	0.39
119	0.37
120	0.29
121	0.26
122	0.27
123	0.25
124	0.25
125	0.26
126	0.19
127	0.18
128	0.16
129	0.16
130	0.12
131	0.09
132	0.08
133	0.07
134	0.09
135	0.11
136	0.12
137	0.12
138	0.14
139	0.18
140	0.21
141	0.24
142	0.3
143	0.36
144	0.4
145	0.46
146	0.46
147	0.42
148	0.38
149	0.36
150	0.29
151	0.22
152	0.17
153	0.11
154	0.1
155	0.1
156	0.1
157	0.12
158	0.1
159	0.1
160	0.11
161	0.1
162	0.09
163	0.1
164	0.11
165	0.09
166	0.1
167	0.12
168	0.16
169	0.21
170	0.2
171	0.21
172	0.2
173	0.21
174	0.22
175	0.2
176	0.16
177	0.13
178	0.14
179	0.13
180	0.13
181	0.1
182	0.09
183	0.09
184	0.08
185	0.07
186	0.06
187	0.06
188	0.06
189	0.08
190	0.08
191	0.08
192	0.09
193	0.09
194	0.13
195	0.14
196	0.16
197	0.18
198	0.22
199	0.29
200	0.31
201	0.34
202	0.36
203	0.39
204	0.41
205	0.39
206	0.43
207	0.39
208	0.38
209	0.37
210	0.33
211	0.32
212	0.29
213	0.27
214	0.19
215	0.16
216	0.14
217	0.13
218	0.12
219	0.1
220	0.09
221	0.09
222	0.08
223	0.06
224	0.06
225	0.05
226	0.04
227	0.04
228	0.05
229	0.06
230	0.07
231	0.09
232	0.1
233	0.15
234	0.17
235	0.17
236	0.2
237	0.22
238	0.23
239	0.24
240	0.24
241	0.21
242	0.23
243	0.23
244	0.2
245	0.2
246	0.2
247	0.19
248	0.2
249	0.19
250	0.17
251	0.23
252	0.26
253	0.31
254	0.31
255	0.35
256	0.36
257	0.37
258	0.4
259	0.37
260	0.34
261	0.32
262	0.33
263	0.33
264	0.34
265	0.34
266	0.36
267	0.42
268	0.49
269	0.53
270	0.59
271	0.63
272	0.62
273	0.7
274	0.7
275	0.68
276	0.66
277	0.58
278	0.54
279	0.47
280	0.47
281	0.36
282	0.32
283	0.24
284	0.17
285	0.16
286	0.13
287	0.11
288	0.09
289	0.11
290	0.11
291	0.13
292	0.15
293	0.14
294	0.15
295	0.15
296	0.19
297	0.19
298	0.21
299	0.26
300	0.28
301	0.3
302	0.31
303	0.33
304	0.3
305	0.32
306	0.29
307	0.22
308	0.18
309	0.17
310	0.14
311	0.1
312	0.1
313	0.06
314	0.05
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.07
320	0.07
321	0.08
322	0.08
323	0.08
324	0.07
325	0.08
326	0.11
327	0.13
328	0.13
329	0.13
330	0.14
331	0.14
332	0.14
333	0.14
334	0.1
335	0.07
336	0.08
337	0.09
338	0.07
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.07
344	0.08
345	0.07
346	0.1
347	0.15
348	0.16
349	0.15
350	0.16
351	0.21
352	0.2
353	0.21
354	0.2
355	0.17
356	0.19
357	0.2
358	0.19
359	0.14
360	0.14
361	0.13
362	0.11
363	0.11
364	0.08
365	0.07
366	0.1
367	0.1
368	0.1
369	0.12
370	0.13
371	0.13
372	0.13
373	0.13
374	0.12
375	0.12
376	0.18
377	0.17
378	0.18
379	0.25
380	0.26
381	0.31
382	0.35
383	0.38
384	0.39
385	0.48
386	0.48
387	0.43
388	0.47
389	0.44
390	0.5
391	0.53
392	0.5
393	0.48
394	0.52
395	0.55
396	0.59
397	0.66
398	0.65
399	0.66
400	0.66
401	0.62
402	0.59
403	0.55
404	0.48
405	0.42
406	0.32
407	0.23
408	0.23
409	0.19
410	0.16
411	0.16
412	0.23
413	0.21
414	0.24
415	0.26
416	0.25
417	0.32
418	0.34
419	0.36
420	0.31
421	0.34
422	0.32
423	0.32
424	0.31
425	0.24
426	0.23
427	0.19
428	0.18
429	0.15
430	0.13
431	0.11
432	0.11
433	0.1
434	0.09
435	0.08
436	0.05
437	0.05
438	0.04
439	0.04
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.06
445	0.1
446	0.11
447	0.11
448	0.11
449	0.12
450	0.12
451	0.13
452	0.12
453	0.09
454	0.09
455	0.1
456	0.11
457	0.15
458	0.15
459	0.18
460	0.21
461	0.22
462	0.23
463	0.22
464	0.21
465	0.16
466	0.16
467	0.16
468	0.14
469	0.12
470	0.13
471	0.13
472	0.12
473	0.15
474	0.18
475	0.16
476	0.15
477	0.16
478	0.14
479	0.14
480	0.15
481	0.15
482	0.15
483	0.14
484	0.17
485	0.18
486	0.18
487	0.19
488	0.18
489	0.15
490	0.12
491	0.13
492	0.09
493	0.08
494	0.14
495	0.15
496	0.18
497	0.22
498	0.21
499	0.23
500	0.27
501	0.28
502	0.26
503	0.32
504	0.33
505	0.36
506	0.43
507	0.42
508	0.4
509	0.38
510	0.34
511	0.26
512	0.22
513	0.15
514	0.08
515	0.07
516	0.08
517	0.08
518	0.08
519	0.08
520	0.08
521	0.08
522	0.09
523	0.09
524	0.07
525	0.07
526	0.07
527	0.07
528	0.07
529	0.07
530	0.05
531	0.08
532	0.09
533	0.14
534	0.17
535	0.18
536	0.19
537	0.25
538	0.35
539	0.35
540	0.42
541	0.46
542	0.53
543	0.55
544	0.58
545	0.62
546	0.57
547	0.64
548	0.58
549	0.52
550	0.43
551	0.46
552	0.46
553	0.37
554	0.38
555	0.29
556	0.32
557	0.32
558	0.32
559	0.29
560	0.27
561	0.27
562	0.24
563	0.24
564	0.17
565	0.16
566	0.14
567	0.11
568	0.09
569	0.08
570	0.05
571	0.04
572	0.05
573	0.07
574	0.07
575	0.08
576	0.09
577	0.09
578	0.1
579	0.15
580	0.19
581	0.2
582	0.23
583	0.23
584	0.28
585	0.3
586	0.33
587	0.3
588	0.26
589	0.23
590	0.2
591	0.2
592	0.16
593	0.13
594	0.1
595	0.08
596	0.1
597	0.15
598	0.14
599	0.13
600	0.13
601	0.13
602	0.13
603	0.14
604	0.13
605	0.07
606	0.08
607	0.1
608	0.11
609	0.13
610	0.13
611	0.12
612	0.12
613	0.13
614	0.12
615	0.11
616	0.11
617	0.1
618	0.09
619	0.1
620	0.1
621	0.09
622	0.09
623	0.08
624	0.09
625	0.1
626	0.1
627	0.09
628	0.14
629	0.14
630	0.14
631	0.15
632	0.16
633	0.16
634	0.15
635	0.18
636	0.14
637	0.17
638	0.2
639	0.18
640	0.16
641	0.16
642	0.16
643	0.13
644	0.12
645	0.1
646	0.08
647	0.07
648	0.07
649	0.07
650	0.06
651	0.07
652	0.07
653	0.07
654	0.06
655	0.08
656	0.08
657	0.07
658	0.08
659	0.08
660	0.08
661	0.08
662	0.1
663	0.09
664	0.09
665	0.09
666	0.11
667	0.13
668	0.15
669	0.14
670	0.14
671	0.15
672	0.14
673	0.15
674	0.13
675	0.12
676	0.14
677	0.19
678	0.19
679	0.2
680	0.29
681	0.38
682	0.43
683	0.46
684	0.49
685	0.49
686	0.55
687	0.55
688	0.47
689	0.39
690	0.35
691	0.36
692	0.31
693	0.26
694	0.23
695	0.24
696	0.25
697	0.27
698	0.28
699	0.25
700	0.23
701	0.25
702	0.26
703	0.3
704	0.33
705	0.3
706	0.33
707	0.32
708	0.37
709	0.4
710	0.45
711	0.44
712	0.46
713	0.52
714	0.57
715	0.65
716	0.64
717	0.68
718	0.7
719	0.74
720	0.78
721	0.79
722	0.76
723	0.72
724	0.71
725	0.68
726	0.62
727	0.59
728	0.53
729	0.53
730	0.5
731	0.47
732	0.46
733	0.4
734	0.35
735	0.29
736	0.25
737	0.18
738	0.15
739	0.15
740	0.18
741	0.22
742	0.23
743	0.21
744	0.21
745	0.22
746	0.23
747	0.23
748	0.23
749	0.23
750	0.23
751	0.23
752	0.23
753	0.23
754	0.22
755	0.25
756	0.2
757	0.2
758	0.21
759	0.27
760	0.32
761	0.38
762	0.39
763	0.36
764	0.36
765	0.32
766	0.32
767	0.26
768	0.2
769	0.13
770	0.11
771	0.1
772	0.1
773	0.08
774	0.09
775	0.08
776	0.08
777	0.08
778	0.08
779	0.1
780	0.1
781	0.12
782	0.13
783	0.15
784	0.15
785	0.17
786	0.18
787	0.17
788	0.19
789	0.21
790	0.18
791	0.18
792	0.21
793	0.26
794	0.28
795	0.28
796	0.27
797	0.26
798	0.26
799	0.3
800	0.35
801	0.33
802	0.32
803	0.35
804	0.37
805	0.36
806	0.37
807	0.34
808	0.29
809	0.3
810	0.34
811	0.34
812	0.39
813	0.49
814	0.52
815	0.58
816	0.66
817	0.67
818	0.67
819	0.7
820	0.71
821	0.68
822	0.72
823	0.69
824	0.61
825	0.57
826	0.51
827	0.47
828	0.39
829	0.35
830	0.29
831	0.26
832	0.28
833	0.27
834	0.27
835	0.25
836	0.25
837	0.22
838	0.28
839	0.28
840	0.24
841	0.24
842	0.27
843	0.28
844	0.28
845	0.26
846	0.2
847	0.2
848	0.21
849	0.22
850	0.2
851	0.2
852	0.18
853	0.18
854	0.18
855	0.17
856	0.17
857	0.19
858	0.18
859	0.18
860	0.18
861	0.21
862	0.22
863	0.22
864	0.22
865	0.17
866	0.2
867	0.22
868	0.23
869	0.23
870	0.21
871	0.2
872	0.23
873	0.28
874	0.27
875	0.26
876	0.27
877	0.23
878	0.23
879	0.27
880	0.24
881	0.25
882	0.24
883	0.25
884	0.23
885	0.25
886	0.25
887	0.21
888	0.27
889	0.25
890	0.22
891	0.21
892	0.22
893	0.23
894	0.24
895	0.26
896	0.23
897	0.18
898	0.19
899	0.22
900	0.21
901	0.2
902	0.2
903	0.18
904	0.16
905	0.18
906	0.18
907	0.15
908	0.2
909	0.18
910	0.18
911	0.18
912	0.16
913	0.15
914	0.14
915	0.13
916	0.08
917	0.1
918	0.09
919	0.09
920	0.12
921	0.11
922	0.14
923	0.16
924	0.16
925	0.15
926	0.17
927	0.18
928	0.17
929	0.22
930	0.21
931	0.21
932	0.21
933	0.24
934	0.25
935	0.26
936	0.26
937	0.22
938	0.21
939	0.2
940	0.23
941	0.21
942	0.22
943	0.21
944	0.2
945	0.19
946	0.19
947	0.23
948	0.21
949	0.24
950	0.21
951	0.2
952	0.19
953	0.19
954	0.24
955	0.21
956	0.22
957	0.2
958	0.19
959	0.19
960	0.19
961	0.23
962	0.24
963	0.29
964	0.34

A0A1Q2YC24

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer