FuNGI

A0A1Q2YCH3

Protein Details

Accession

A0A1Q2YCH3

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
134-153	KLNILRQQQKQQQQKRNFSA	Hydrophilic
443-463	HWTCWEETKRTSRRDRSPQRS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021605 CFIA_Pcf11_C IPR045154 PCF11-like
Gene Ontology	GO:0005849 C:mRNA cleavage factor complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000993 F:RNA polymerase II complex binding GO:0006379 P:mRNA cleavage GO:0006378 P:mRNA polyadenylation GO:0006369 P:termination of RNA polymerase II transcription
Pfam	View protein in Pfam PF11526 CFIA_Pcf11

Amino Acid Sequences

MQVDQVVQDVEASNGPDRVTAASNPGINYVSSLNSSNSNSNSNSNSNASTPNSTPMNMNMAVNLKPNLIKETDDLLALVSSRLNSVPSDEKGQQRHKLLNQLKSILSSNSAIPKSQLDEVAKQLQSIREDEILKLNILRQQQKQQQQKRNFSASQLQTLLNLSKDNNQTSGPPPNSAASAQALFNMMSSVIGKSPPASGSNAQTTNNSNNNTNMTNPLGLKDISFLQNMLKKTSSQQTQSSPAGPKVDFKFIRPTKEAIIEDFVLTQSVVSNHNPTAKEISLLYDFKPNQCAKCPKRFAASPEGDFLMRKHTEWHDRVEQRLTMGGSGLGGVVNRSWYLTESAWVDFDDYRESDETKKDARLALASTSVSVTADKNDAIRDYRDRDEPIDLSDAPNHTVTIPESSSNEVVCGICREKLVGTFDEDSGDWIWKNAVEQKGKVWHWTCWEETKRTSRRDRSPQRS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.15
3	0.14
4	0.15
5	0.16
6	0.18
7	0.17
8	0.2
9	0.22
10	0.25
11	0.24
12	0.26
13	0.24
14	0.21
15	0.21
16	0.18
17	0.15
18	0.15
19	0.17
20	0.16
21	0.19
22	0.22
23	0.25
24	0.26
25	0.29
26	0.29
27	0.31
28	0.34
29	0.33
30	0.34
31	0.32
32	0.31
33	0.29
34	0.31
35	0.3
36	0.3
37	0.29
38	0.31
39	0.3
40	0.29
41	0.28
42	0.26
43	0.28
44	0.24
45	0.23
46	0.2
47	0.21
48	0.22
49	0.23
50	0.22
51	0.18
52	0.19
53	0.21
54	0.21
55	0.2
56	0.2
57	0.19
58	0.22
59	0.21
60	0.19
61	0.18
62	0.15
63	0.14
64	0.12
65	0.1
66	0.07
67	0.07
68	0.08
69	0.08
70	0.09
71	0.09
72	0.13
73	0.18
74	0.19
75	0.25
76	0.29
77	0.35
78	0.42
79	0.5
80	0.52
81	0.52
82	0.57
83	0.56
84	0.62
85	0.62
86	0.62
87	0.59
88	0.55
89	0.51
90	0.46
91	0.44
92	0.34
93	0.29
94	0.22
95	0.2
96	0.24
97	0.24
98	0.21
99	0.21
100	0.22
101	0.22
102	0.23
103	0.25
104	0.21
105	0.23
106	0.27
107	0.33
108	0.31
109	0.29
110	0.29
111	0.28
112	0.27
113	0.26
114	0.24
115	0.21
116	0.22
117	0.23
118	0.25
119	0.23
120	0.21
121	0.2
122	0.19
123	0.19
124	0.24
125	0.29
126	0.29
127	0.37
128	0.45
129	0.54
130	0.62
131	0.68
132	0.73
133	0.77
134	0.82
135	0.79
136	0.78
137	0.7
138	0.63
139	0.63
140	0.55
141	0.49
142	0.41
143	0.35
144	0.28
145	0.28
146	0.26
147	0.17
148	0.16
149	0.12
150	0.17
151	0.2
152	0.21
153	0.21
154	0.2
155	0.22
156	0.24
157	0.32
158	0.27
159	0.24
160	0.24
161	0.24
162	0.24
163	0.22
164	0.2
165	0.13
166	0.12
167	0.11
168	0.11
169	0.11
170	0.09
171	0.09
172	0.08
173	0.06
174	0.05
175	0.06
176	0.06
177	0.05
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.07
182	0.08
183	0.09
184	0.11
185	0.13
186	0.15
187	0.2
188	0.21
189	0.21
190	0.21
191	0.22
192	0.25
193	0.28
194	0.27
195	0.23
196	0.23
197	0.25
198	0.24
199	0.22
200	0.19
201	0.15
202	0.15
203	0.14
204	0.13
205	0.12
206	0.12
207	0.11
208	0.1
209	0.11
210	0.11
211	0.11
212	0.1
213	0.11
214	0.15
215	0.16
216	0.17
217	0.16
218	0.15
219	0.18
220	0.24
221	0.25
222	0.24
223	0.27
224	0.28
225	0.33
226	0.33
227	0.34
228	0.3
229	0.27
230	0.27
231	0.24
232	0.25
233	0.23
234	0.3
235	0.26
236	0.27
237	0.36
238	0.36
239	0.41
240	0.38
241	0.37
242	0.31
243	0.37
244	0.35
245	0.26
246	0.26
247	0.21
248	0.19
249	0.17
250	0.15
251	0.09
252	0.09
253	0.07
254	0.05
255	0.06
256	0.08
257	0.09
258	0.11
259	0.12
260	0.17
261	0.17
262	0.18
263	0.21
264	0.19
265	0.19
266	0.17
267	0.18
268	0.17
269	0.17
270	0.17
271	0.21
272	0.21
273	0.21
274	0.28
275	0.28
276	0.27
277	0.34
278	0.43
279	0.42
280	0.52
281	0.57
282	0.53
283	0.57
284	0.58
285	0.55
286	0.55
287	0.53
288	0.44
289	0.4
290	0.38
291	0.32
292	0.3
293	0.25
294	0.22
295	0.18
296	0.16
297	0.19
298	0.23
299	0.33
300	0.34
301	0.4
302	0.43
303	0.45
304	0.48
305	0.47
306	0.42
307	0.33
308	0.34
309	0.28
310	0.18
311	0.16
312	0.13
313	0.09
314	0.08
315	0.07
316	0.05
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.06
324	0.07
325	0.1
326	0.1
327	0.12
328	0.13
329	0.14
330	0.14
331	0.14
332	0.14
333	0.12
334	0.12
335	0.13
336	0.12
337	0.14
338	0.14
339	0.16
340	0.17
341	0.2
342	0.23
343	0.24
344	0.26
345	0.26
346	0.26
347	0.26
348	0.26
349	0.24
350	0.22
351	0.21
352	0.19
353	0.17
354	0.15
355	0.14
356	0.12
357	0.11
358	0.1
359	0.09
360	0.11
361	0.11
362	0.12
363	0.13
364	0.15
365	0.17
366	0.21
367	0.25
368	0.28
369	0.32
370	0.35
371	0.36
372	0.36
373	0.38
374	0.35
375	0.32
376	0.3
377	0.27
378	0.24
379	0.25
380	0.24
381	0.22
382	0.21
383	0.19
384	0.15
385	0.16
386	0.16
387	0.16
388	0.16
389	0.16
390	0.17
391	0.2
392	0.22
393	0.2
394	0.19
395	0.16
396	0.15
397	0.15
398	0.18
399	0.16
400	0.17
401	0.17
402	0.18
403	0.18
404	0.22
405	0.25
406	0.22
407	0.25
408	0.26
409	0.26
410	0.26
411	0.25
412	0.22
413	0.2
414	0.2
415	0.15
416	0.13
417	0.14
418	0.13
419	0.16
420	0.21
421	0.28
422	0.31
423	0.32
424	0.39
425	0.47
426	0.48
427	0.54
428	0.49
429	0.46
430	0.48
431	0.52
432	0.5
433	0.51
434	0.57
435	0.54
436	0.59
437	0.65
438	0.66
439	0.7
440	0.77
441	0.76
442	0.8
443	0.85

A0A1Q2YCH3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer