FuNGI

A0A1Q2YJC4

Protein Details

Accession

A0A1Q2YJC4

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
253-285	EEQGRGKKRNRRGGDRRRRKRRGGNRNRRNGVS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
257-284	RGKKRNRRGGDRRRRKRRGGNRNRRNGV

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027075 CPSF2 IPR025069 Cpsf2_C IPR036866 RibonucZ/Hydroxyglut_hydro
Gene Ontology	GO:0005847 C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0006379 P:mRNA cleavage GO:0006378 P:mRNA polyadenylation
Pfam	View protein in Pfam PF13299 CPSF100_C

Amino Acid Sequences

MILTEKPNLNSKLNQFYKIWRQGVDATESDPKEGSHIVLEIPDVRLASVKEELLRGKDLAAYLKKITERKELEMKLEKEEMEKRRIEEMLEAGVKVETDTEDEEDEEDADAEKVLANLDQNIKADEGALNGNMLAKKDSQSAVGVEITANIIKTAEIKFQLDDSKRLKMDEILMLPRDFDVRNMKHKNRVFPFVNNRYNVDDYGVVVKHEDFQIYDDDRFPILGPESTNTKENGNDNKGSGDESGGSGMESDEEQGRGKKRNRRGGDRRRRKRRGGNRNRRNGVSDGTGKRGKEENALYQPAVYSLESTVDPVVREKTTSRITVRCGISFIDLGGNHDLRSLKFTAKQIKPRKVIILPGVSGNADDLMLELSEDTKQSILSGNGNSTNVDVEYIKSKMNDKINLGDVITSYELLLDEKLASSLHWQTLNDGYSVSSVGGVVEKLKDWEFKLTELGSTASSTMAVSSTKIGDVKLAQLRRALATKKHRVELMGDGRLVVDEELVVGKASEGNLSIEGGLGGLFYEVKELIERMLATI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.49
3	0.53
4	0.59
5	0.62
6	0.59
7	0.49
8	0.49
9	0.5
10	0.52
11	0.48
12	0.38
13	0.33
14	0.37
15	0.36
16	0.33
17	0.29
18	0.25
19	0.22
20	0.22
21	0.2
22	0.14
23	0.14
24	0.13
25	0.13
26	0.15
27	0.14
28	0.14
29	0.14
30	0.12
31	0.12
32	0.14
33	0.14
34	0.16
35	0.17
36	0.17
37	0.17
38	0.21
39	0.23
40	0.24
41	0.26
42	0.23
43	0.21
44	0.22
45	0.21
46	0.26
47	0.27
48	0.27
49	0.26
50	0.3
51	0.34
52	0.37
53	0.4
54	0.42
55	0.43
56	0.46
57	0.54
58	0.52
59	0.55
60	0.6
61	0.57
62	0.52
63	0.51
64	0.45
65	0.4
66	0.47
67	0.44
68	0.42
69	0.43
70	0.4
71	0.42
72	0.42
73	0.38
74	0.33
75	0.29
76	0.28
77	0.26
78	0.23
79	0.19
80	0.18
81	0.17
82	0.14
83	0.12
84	0.07
85	0.08
86	0.09
87	0.1
88	0.1
89	0.11
90	0.12
91	0.11
92	0.11
93	0.1
94	0.08
95	0.08
96	0.07
97	0.07
98	0.06
99	0.06
100	0.06
101	0.06
102	0.07
103	0.06
104	0.1
105	0.13
106	0.15
107	0.15
108	0.16
109	0.16
110	0.15
111	0.16
112	0.13
113	0.11
114	0.1
115	0.09
116	0.08
117	0.08
118	0.11
119	0.11
120	0.11
121	0.11
122	0.11
123	0.13
124	0.16
125	0.17
126	0.15
127	0.16
128	0.16
129	0.16
130	0.15
131	0.14
132	0.1
133	0.1
134	0.1
135	0.09
136	0.08
137	0.06
138	0.06
139	0.06
140	0.08
141	0.09
142	0.12
143	0.13
144	0.14
145	0.14
146	0.16
147	0.24
148	0.23
149	0.29
150	0.29
151	0.33
152	0.33
153	0.33
154	0.32
155	0.27
156	0.28
157	0.25
158	0.25
159	0.22
160	0.24
161	0.23
162	0.22
163	0.2
164	0.19
165	0.14
166	0.15
167	0.21
168	0.23
169	0.33
170	0.41
171	0.45
172	0.52
173	0.56
174	0.62
175	0.57
176	0.62
177	0.55
178	0.55
179	0.62
180	0.62
181	0.65
182	0.57
183	0.54
184	0.5
185	0.48
186	0.4
187	0.31
188	0.22
189	0.16
190	0.18
191	0.16
192	0.12
193	0.11
194	0.11
195	0.11
196	0.11
197	0.11
198	0.07
199	0.08
200	0.12
201	0.14
202	0.15
203	0.14
204	0.14
205	0.14
206	0.14
207	0.13
208	0.1
209	0.09
210	0.09
211	0.09
212	0.09
213	0.13
214	0.14
215	0.16
216	0.15
217	0.15
218	0.16
219	0.2
220	0.26
221	0.27
222	0.26
223	0.25
224	0.25
225	0.24
226	0.23
227	0.18
228	0.12
229	0.08
230	0.07
231	0.07
232	0.06
233	0.06
234	0.05
235	0.05
236	0.04
237	0.04
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.06
242	0.1
243	0.13
244	0.2
245	0.27
246	0.35
247	0.43
248	0.53
249	0.58
250	0.66
251	0.74
252	0.78
253	0.83
254	0.86
255	0.88
256	0.89
257	0.91
258	0.89
259	0.89
260	0.88
261	0.88
262	0.89
263	0.89
264	0.88
265	0.9
266	0.85
267	0.76
268	0.68
269	0.59
270	0.49
271	0.42
272	0.39
273	0.3
274	0.32
275	0.33
276	0.29
277	0.3
278	0.3
279	0.27
280	0.25
281	0.25
282	0.27
283	0.29
284	0.3
285	0.28
286	0.25
287	0.24
288	0.19
289	0.18
290	0.11
291	0.07
292	0.06
293	0.07
294	0.07
295	0.08
296	0.08
297	0.08
298	0.08
299	0.09
300	0.11
301	0.1
302	0.11
303	0.11
304	0.16
305	0.19
306	0.23
307	0.25
308	0.26
309	0.29
310	0.36
311	0.36
312	0.31
313	0.29
314	0.25
315	0.23
316	0.2
317	0.17
318	0.12
319	0.11
320	0.12
321	0.14
322	0.14
323	0.12
324	0.14
325	0.15
326	0.12
327	0.16
328	0.15
329	0.15
330	0.19
331	0.24
332	0.33
333	0.38
334	0.48
335	0.54
336	0.62
337	0.64
338	0.63
339	0.64
340	0.55
341	0.54
342	0.5
343	0.44
344	0.35
345	0.31
346	0.29
347	0.23
348	0.2
349	0.16
350	0.1
351	0.06
352	0.05
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.05
360	0.05
361	0.06
362	0.05
363	0.05
364	0.06
365	0.09
366	0.09
367	0.12
368	0.13
369	0.15
370	0.17
371	0.17
372	0.17
373	0.15
374	0.14
375	0.11
376	0.11
377	0.09
378	0.08
379	0.11
380	0.12
381	0.13
382	0.14
383	0.17
384	0.22
385	0.29
386	0.32
387	0.31
388	0.34
389	0.36
390	0.35
391	0.32
392	0.26
393	0.2
394	0.18
395	0.16
396	0.12
397	0.09
398	0.08
399	0.08
400	0.08
401	0.08
402	0.06
403	0.06
404	0.06
405	0.07
406	0.06
407	0.06
408	0.1
409	0.13
410	0.15
411	0.17
412	0.17
413	0.19
414	0.24
415	0.25
416	0.21
417	0.18
418	0.16
419	0.14
420	0.14
421	0.12
422	0.07
423	0.06
424	0.06
425	0.07
426	0.06
427	0.07
428	0.08
429	0.08
430	0.11
431	0.13
432	0.15
433	0.16
434	0.24
435	0.24
436	0.24
437	0.27
438	0.25
439	0.24
440	0.22
441	0.22
442	0.15
443	0.14
444	0.13
445	0.1
446	0.09
447	0.09
448	0.08
449	0.08
450	0.07
451	0.07
452	0.09
453	0.1
454	0.12
455	0.12
456	0.12
457	0.14
458	0.15
459	0.21
460	0.27
461	0.29
462	0.29
463	0.31
464	0.33
465	0.34
466	0.39
467	0.37
468	0.38
469	0.46
470	0.55
471	0.59
472	0.61
473	0.59
474	0.54
475	0.53
476	0.54
477	0.52
478	0.46
479	0.4
480	0.36
481	0.34
482	0.32
483	0.29
484	0.19
485	0.1
486	0.05
487	0.06
488	0.07
489	0.07
490	0.07
491	0.06
492	0.06
493	0.08
494	0.08
495	0.09
496	0.09
497	0.1
498	0.11
499	0.12
500	0.11
501	0.1
502	0.09
503	0.08
504	0.07
505	0.05
506	0.04
507	0.04
508	0.04
509	0.04
510	0.06
511	0.06
512	0.07
513	0.09
514	0.1
515	0.1
516	0.13

A0A1Q2YJC4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer