Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177ELM3

Protein Details
Accession A0A177ELM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
221-245IHEKYKKEEEKAKKKTEKARIQALKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
226-239KKEEEKAKKKTEKA
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 5.5, cyto_mito 5.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001487  Bromodomain  
IPR036427  Bromodomain-like_sf  
IPR018359  Bromodomain_CS  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR038718  SNF2-like_sf  
IPR000330  SNF2_N  
Gene Ontology GO:0016514  C:SWI/SNF complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0140658  F:ATP-dependent chromatin remodeler activity  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0070577  F:lysine-acetylated histone binding  
GO:0031492  F:nucleosomal DNA binding  
GO:0000182  F:rDNA binding  
GO:0061629  F:RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding  
GO:0035973  P:aggrephagy  
GO:0006261  P:DNA-templated DNA replication  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
GO:1900189  P:positive regulation of cell adhesion involved in single-species biofilm formation  
GO:2000219  P:positive regulation of invasive growth in response to glucose limitation  
GO:0031496  P:positive regulation of mating type switching  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0042148  P:strand invasion  
Pfam View protein in Pfam  
PF00439  Bromodomain  
PF00271  Helicase_C  
PF00176  SNF2-rel_dom  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00633  BROMODOMAIN_1  
PS50014  BROMODOMAIN_2  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd04369  Bromodomain  
cd18793  SF2_C_SNF  
Amino Acid Sequences MKGDEREWSSFLNARRGLFISGVSGIFTTSAEDKTLKVGFEAAARMHPTHLPLGFDVETLKLERARLQSLKKEQAVARILQAYARENNLSLAQMLPDPRAYLSSHRGSPSAFLALLQIKKIDLLQEQNILRKNVYRGIKEIASPEILRSARSSVAHKVENLYDLRALSELETRHLAAGEAKKAAWWLNTMTLVQQTALKMVQKQKDQTANQQRIFIAVNAIHEKYKKEEEKAKKKTEKARIQALKSNDEQEYLKLIKQEKNTRLTHILQKTDEYIAVLKKRIKLQQGSEVDDATVLDYFEAAHKQKEHVKEQPRSVAYGQLREYQLKGVEWMVSLYNNKLNGILADEMGLGKTVQAIVFICYLLEKKEANMPFLVIVPLSTFSNWTSEFSRWAPSIKVLSYKGDPLYRKDLKKETLSTKFDVLLTTFEYIIKDKSFLSKIQWLYTIVDEGHRMKNTGSKLCTVMNSCYKSKYRLLLTGTPLQNSLPELWSLLNFVLPKIFFSGGSFDEWFSAPVAHVGEKIELNEEEELLIIKRLHKVLRPFLLRRLKKDVEAGLPNKVETVIKCRMSGLQRSLYTEVRDAAVCKAEGAKRLNNTIMQLRKICNHPFVFERVEETINPSKVNNELLYRVSGKFELLRRMLHKLLATGHKVLMFFQMTQIMTIMEDMLVMEGFKYLRLDGAVKSEERAALISTFNDPTSGYSVFLLSTRAGGLGLNLQIADTVIIFDSDWNPHADQQAQDRAHRIGQTKEVRIFRLVTAESIEEYILEKANHKLHVDEKIIQAGRFDNRTTHEEREALLRNIFEASGEGDDSCAVTSDADLNKILARSDAEMLKLSEIDASKALGSSELYSGPKLSLLDNNLNEVTPTTEYPSKRKSSATLSRSQKISSATRQYKEVLETIAKSTEKGRKRAELFMELPDAEMYPDYYDLIYEPISISEIRENLELYESFEDFATDVRKMCANAMTYNAEGSFVYRDAEHFLHILNSYTNE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.38
3 0.38
4 0.36
5 0.31
6 0.28
7 0.21
8 0.2
9 0.19
10 0.15
11 0.13
12 0.12
13 0.11
14 0.1
15 0.1
16 0.11
17 0.12
18 0.13
19 0.14
20 0.15
21 0.19
22 0.22
23 0.19
24 0.17
25 0.18
26 0.17
27 0.2
28 0.22
29 0.18
30 0.2
31 0.23
32 0.23
33 0.24
34 0.24
35 0.24
36 0.26
37 0.27
38 0.24
39 0.22
40 0.27
41 0.25
42 0.23
43 0.22
44 0.17
45 0.17
46 0.17
47 0.19
48 0.15
49 0.17
50 0.22
51 0.26
52 0.32
53 0.37
54 0.43
55 0.5
56 0.58
57 0.65
58 0.61
59 0.64
60 0.59
61 0.6
62 0.58
63 0.5
64 0.45
65 0.38
66 0.36
67 0.31
68 0.31
69 0.27
70 0.26
71 0.28
72 0.24
73 0.22
74 0.24
75 0.23
76 0.21
77 0.17
78 0.15
79 0.13
80 0.14
81 0.15
82 0.15
83 0.15
84 0.15
85 0.15
86 0.16
87 0.17
88 0.2
89 0.26
90 0.3
91 0.34
92 0.35
93 0.35
94 0.34
95 0.34
96 0.31
97 0.26
98 0.2
99 0.16
100 0.18
101 0.22
102 0.23
103 0.22
104 0.2
105 0.17
106 0.18
107 0.18
108 0.18
109 0.16
110 0.2
111 0.22
112 0.29
113 0.31
114 0.36
115 0.4
116 0.38
117 0.36
118 0.35
119 0.35
120 0.36
121 0.41
122 0.38
123 0.36
124 0.4
125 0.41
126 0.38
127 0.37
128 0.32
129 0.29
130 0.27
131 0.24
132 0.26
133 0.24
134 0.23
135 0.22
136 0.22
137 0.22
138 0.24
139 0.27
140 0.27
141 0.33
142 0.34
143 0.34
144 0.34
145 0.32
146 0.34
147 0.32
148 0.26
149 0.22
150 0.2
151 0.19
152 0.16
153 0.15
154 0.12
155 0.15
156 0.14
157 0.15
158 0.16
159 0.16
160 0.16
161 0.16
162 0.15
163 0.17
164 0.21
165 0.22
166 0.21
167 0.21
168 0.2
169 0.22
170 0.23
171 0.18
172 0.16
173 0.15
174 0.17
175 0.19
176 0.19
177 0.19
178 0.18
179 0.17
180 0.16
181 0.16
182 0.13
183 0.13
184 0.15
185 0.16
186 0.2
187 0.27
188 0.33
189 0.37
190 0.41
191 0.46
192 0.54
193 0.55
194 0.6
195 0.63
196 0.66
197 0.62
198 0.61
199 0.54
200 0.47
201 0.45
202 0.34
203 0.27
204 0.18
205 0.2
206 0.2
207 0.21
208 0.21
209 0.21
210 0.23
211 0.24
212 0.32
213 0.33
214 0.36
215 0.45
216 0.54
217 0.64
218 0.72
219 0.78
220 0.77
221 0.8
222 0.84
223 0.85
224 0.84
225 0.79
226 0.8
227 0.77
228 0.74
229 0.72
230 0.67
231 0.61
232 0.53
233 0.5
234 0.4
235 0.34
236 0.3
237 0.25
238 0.26
239 0.22
240 0.21
241 0.22
242 0.26
243 0.29
244 0.37
245 0.46
246 0.47
247 0.54
248 0.54
249 0.54
250 0.55
251 0.54
252 0.55
253 0.51
254 0.49
255 0.42
256 0.42
257 0.39
258 0.34
259 0.3
260 0.22
261 0.19
262 0.19
263 0.2
264 0.24
265 0.25
266 0.28
267 0.34
268 0.39
269 0.44
270 0.45
271 0.47
272 0.52
273 0.53
274 0.54
275 0.49
276 0.43
277 0.36
278 0.3
279 0.25
280 0.15
281 0.11
282 0.06
283 0.05
284 0.04
285 0.05
286 0.06
287 0.1
288 0.1
289 0.13
290 0.14
291 0.17
292 0.24
293 0.3
294 0.35
295 0.39
296 0.48
297 0.52
298 0.56
299 0.61
300 0.56
301 0.52
302 0.47
303 0.46
304 0.38
305 0.37
306 0.34
307 0.32
308 0.33
309 0.31
310 0.31
311 0.25
312 0.24
313 0.19
314 0.18
315 0.14
316 0.12
317 0.11
318 0.11
319 0.1
320 0.1
321 0.11
322 0.11
323 0.13
324 0.13
325 0.13
326 0.13
327 0.12
328 0.1
329 0.12
330 0.11
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.05
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.05
344 0.06
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.1
352 0.09
353 0.09
354 0.16
355 0.17
356 0.18
357 0.18
358 0.17
359 0.15
360 0.16
361 0.15
362 0.08
363 0.07
364 0.06
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.07
369 0.07
370 0.1
371 0.1
372 0.12
373 0.13
374 0.14
375 0.17
376 0.17
377 0.19
378 0.17
379 0.18
380 0.17
381 0.17
382 0.19
383 0.17
384 0.2
385 0.18
386 0.2
387 0.2
388 0.22
389 0.22
390 0.24
391 0.25
392 0.25
393 0.33
394 0.37
395 0.38
396 0.41
397 0.44
398 0.43
399 0.47
400 0.49
401 0.48
402 0.5
403 0.51
404 0.47
405 0.43
406 0.4
407 0.35
408 0.29
409 0.22
410 0.14
411 0.12
412 0.11
413 0.1
414 0.09
415 0.1
416 0.1
417 0.11
418 0.1
419 0.09
420 0.09
421 0.13
422 0.14
423 0.14
424 0.17
425 0.22
426 0.23
427 0.24
428 0.25
429 0.22
430 0.22
431 0.21
432 0.18
433 0.12
434 0.12
435 0.12
436 0.13
437 0.15
438 0.14
439 0.15
440 0.14
441 0.18
442 0.21
443 0.24
444 0.22
445 0.21
446 0.22
447 0.23
448 0.24
449 0.22
450 0.22
451 0.24
452 0.26
453 0.25
454 0.28
455 0.28
456 0.3
457 0.31
458 0.32
459 0.28
460 0.29
461 0.33
462 0.33
463 0.35
464 0.39
465 0.37
466 0.32
467 0.3
468 0.25
469 0.22
470 0.18
471 0.15
472 0.08
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.08
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.09
486 0.09
487 0.07
488 0.08
489 0.1
490 0.09
491 0.11
492 0.11
493 0.1
494 0.1
495 0.1
496 0.1
497 0.08
498 0.08
499 0.06
500 0.06
501 0.07
502 0.06
503 0.07
504 0.07
505 0.08
506 0.08
507 0.08
508 0.08
509 0.08
510 0.09
511 0.08
512 0.08
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.05
517 0.07
518 0.06
519 0.07
520 0.1
521 0.12
522 0.14
523 0.17
524 0.22
525 0.26
526 0.33
527 0.37
528 0.37
529 0.44
530 0.52
531 0.51
532 0.51
533 0.54
534 0.48
535 0.44
536 0.46
537 0.4
538 0.35
539 0.39
540 0.35
541 0.31
542 0.29
543 0.27
544 0.24
545 0.21
546 0.17
547 0.12
548 0.17
549 0.19
550 0.2
551 0.2
552 0.21
553 0.25
554 0.27
555 0.31
556 0.29
557 0.29
558 0.29
559 0.32
560 0.34
561 0.32
562 0.29
563 0.25
564 0.21
565 0.16
566 0.16
567 0.14
568 0.12
569 0.12
570 0.1
571 0.1
572 0.13
573 0.13
574 0.18
575 0.21
576 0.23
577 0.23
578 0.26
579 0.27
580 0.25
581 0.25
582 0.26
583 0.26
584 0.26
585 0.27
586 0.26
587 0.28
588 0.32
589 0.33
590 0.33
591 0.3
592 0.29
593 0.29
594 0.31
595 0.3
596 0.25
597 0.25
598 0.2
599 0.2
600 0.18
601 0.22
602 0.24
603 0.22
604 0.23
605 0.2
606 0.19
607 0.19
608 0.22
609 0.17
610 0.13
611 0.14
612 0.15
613 0.17
614 0.18
615 0.17
616 0.16
617 0.15
618 0.14
619 0.17
620 0.19
621 0.23
622 0.22
623 0.25
624 0.26
625 0.31
626 0.31
627 0.29
628 0.26
629 0.22
630 0.25
631 0.27
632 0.27
633 0.24
634 0.24
635 0.23
636 0.22
637 0.21
638 0.2
639 0.16
640 0.13
641 0.13
642 0.16
643 0.14
644 0.14
645 0.14
646 0.1
647 0.09
648 0.09
649 0.08
650 0.04
651 0.04
652 0.04
653 0.04
654 0.03
655 0.03
656 0.03
657 0.04
658 0.04
659 0.05
660 0.05
661 0.05
662 0.06
663 0.07
664 0.09
665 0.09
666 0.13
667 0.15
668 0.15
669 0.16
670 0.16
671 0.15
672 0.14
673 0.14
674 0.1
675 0.09
676 0.1
677 0.1
678 0.11
679 0.12
680 0.11
681 0.11
682 0.1
683 0.11
684 0.13
685 0.13
686 0.11
687 0.11
688 0.11
689 0.11
690 0.11
691 0.11
692 0.08
693 0.08
694 0.07
695 0.07
696 0.07
697 0.06
698 0.06
699 0.08
700 0.08
701 0.07
702 0.07
703 0.07
704 0.07
705 0.07
706 0.06
707 0.04
708 0.04
709 0.04
710 0.04
711 0.04
712 0.05
713 0.07
714 0.08
715 0.09
716 0.11
717 0.12
718 0.14
719 0.16
720 0.18
721 0.18
722 0.23
723 0.3
724 0.3
725 0.31
726 0.32
727 0.32
728 0.32
729 0.34
730 0.32
731 0.26
732 0.34
733 0.39
734 0.41
735 0.46
736 0.46
737 0.44
738 0.43
739 0.42
740 0.33
741 0.32
742 0.27
743 0.2
744 0.19
745 0.18
746 0.16
747 0.15
748 0.14
749 0.09
750 0.09
751 0.1
752 0.1
753 0.1
754 0.11
755 0.16
756 0.2
757 0.23
758 0.22
759 0.24
760 0.25
761 0.32
762 0.35
763 0.33
764 0.31
765 0.36
766 0.37
767 0.34
768 0.32
769 0.28
770 0.28
771 0.27
772 0.26
773 0.22
774 0.25
775 0.3
776 0.34
777 0.34
778 0.34
779 0.32
780 0.32
781 0.36
782 0.37
783 0.34
784 0.31
785 0.26
786 0.23
787 0.23
788 0.22
789 0.15
790 0.1
791 0.1
792 0.09
793 0.09
794 0.08
795 0.08
796 0.08
797 0.08
798 0.07
799 0.07
800 0.06
801 0.05
802 0.06
803 0.11
804 0.12
805 0.13
806 0.14
807 0.14
808 0.15
809 0.16
810 0.16
811 0.12
812 0.12
813 0.13
814 0.16
815 0.17
816 0.16
817 0.18
818 0.18
819 0.18
820 0.16
821 0.14
822 0.14
823 0.13
824 0.14
825 0.12
826 0.12
827 0.12
828 0.12
829 0.12
830 0.09
831 0.1
832 0.1
833 0.11
834 0.13
835 0.14
836 0.14
837 0.15
838 0.14
839 0.15
840 0.14
841 0.14
842 0.16
843 0.21
844 0.28
845 0.28
846 0.32
847 0.3
848 0.29
849 0.28
850 0.23
851 0.21
852 0.15
853 0.15
854 0.17
855 0.22
856 0.25
857 0.32
858 0.4
859 0.42
860 0.43
861 0.45
862 0.45
863 0.49
864 0.57
865 0.56
866 0.57
867 0.6
868 0.63
869 0.62
870 0.58
871 0.52
872 0.47
873 0.48
874 0.47
875 0.51
876 0.52
877 0.53
878 0.55
879 0.54
880 0.51
881 0.47
882 0.4
883 0.34
884 0.29
885 0.29
886 0.28
887 0.32
888 0.28
889 0.26
890 0.32
891 0.36
892 0.4
893 0.46
894 0.5
895 0.54
896 0.58
897 0.65
898 0.64
899 0.63
900 0.58
901 0.54
902 0.51
903 0.42
904 0.38
905 0.3
906 0.25
907 0.17
908 0.15
909 0.12
910 0.09
911 0.1
912 0.1
913 0.09
914 0.09
915 0.09
916 0.11
917 0.1
918 0.09
919 0.09
920 0.09
921 0.11
922 0.11
923 0.12
924 0.15
925 0.16
926 0.17
927 0.18
928 0.18
929 0.17
930 0.21
931 0.19
932 0.18
933 0.2
934 0.19
935 0.18
936 0.17
937 0.17
938 0.13
939 0.16
940 0.15
941 0.13
942 0.14
943 0.15
944 0.18
945 0.19
946 0.21
947 0.24
948 0.24
949 0.24
950 0.28
951 0.3
952 0.27
953 0.28
954 0.25
955 0.21
956 0.18
957 0.18
958 0.16
959 0.13
960 0.13
961 0.12
962 0.13
963 0.18
964 0.18
965 0.18
966 0.16
967 0.16
968 0.18
969 0.18
970 0.19