Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177EC85

Protein Details
Accession A0A177EC85    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
302-323LAGAQVQKRQRQRQREKINVVDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
Gene Ontology GO:1990342  C:heterochromatin island  
GO:1990477  C:MTREC complex  
GO:0016604  C:nuclear body  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0033621  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, meiosis-specific transcripts  
GO:1902802  P:regulation of siRNA-dependent facultative heterochromatin formation  
GO:1902801  P:regulation of siRNA-independent facultative heterochromatin formation  
GO:0043144  P:sno(s)RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MKSSLLSEQLSVPSLDDIERAVNASEDNAEEVDSFVESNDNKNLVRHTCIIPPAFAYAPLSETKTPVRCTYPFQLDRFQELALKCLERDESVLVSAHTSAGKTLIAEYAIHLSILKKQRVIYTSPIKALSNQKYRELNEKFGDVGLMTGDVTLNPDSTCLVMTTEILRNMIYRGTEVLRETHFVVFDEVHYMRDRERGVVWEETIILLPSTTRFIFLSATIPNAEEFARWIVSIHKQPCHVIYTEKRPTPLEHYIYSNLPESPSYLRPNSTSLVDISDRVSLVVDKDGEFQSKGFKKLQSSLAGAQVQKRQRQRQREKINVVDILRILQSTNNIPTIVFSFRRKECEDYGLTALREFDFNTEEEKELVDTIFTNALNSLRDEDRSLPQITSIIDMLKRGIGIHHSGLLPIIKEIIEILFQENLLKVLFATETFSIGLNMPAKSVVFTSIKKFDGLGTRFVTSGEYIQMSGRAGRRGRDTIGNVILALESSAKIEEKEIRNVLHGPSNSLDSAFRLSYNTILNLLRLDGMDEEYIIKHSFLQFRQELKGRKLVDSIKGLLALYSTTSKKIAEIDQTRANLIKISKLFALKMQIVQAPLLLHPDGIPGAFLTPGRIVVIQAPALLADTTTPAAIEYPDVSGPVNYQQVVVTEVREKSPTPKNLKAIFEDGTEKEIPTSCIIKVSKSKIESGSKTMHKHTQEYFRTVKKRKLLPAPEPEPLSFYTPKDLGSSNAVGDNLIRIEERISETETNEEEKTLLNLLSLQAATSAQITMLNDHKKKTELIMIEEYKSKKKILHALSYITDNEVLMKGKVASEISSGDELLLTEMLFNNELSALSPGRICSLLSCIVFDEKTDRLSLTPESETAYKILQTTAQRLSSEFKRLDSTFTESEYLEKFSPNLMDVVYTWTEGHSFGDICKTTDVFEGSIIRCFRRLEEVLKEMSRASKVIGNVEMENKFSAAISLVKRDIVFANSLYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.12
4 0.11
5 0.11
6 0.12
7 0.12
8 0.11
9 0.11
10 0.11
11 0.12
12 0.12
13 0.11
14 0.12
15 0.11
16 0.11
17 0.1
18 0.11
19 0.1
20 0.09
21 0.08
22 0.07
23 0.11
24 0.11
25 0.15
26 0.19
27 0.21
28 0.22
29 0.25
30 0.31
31 0.3
32 0.34
33 0.35
34 0.34
35 0.37
36 0.42
37 0.41
38 0.36
39 0.34
40 0.32
41 0.28
42 0.26
43 0.23
44 0.17
45 0.18
46 0.19
47 0.22
48 0.19
49 0.22
50 0.28
51 0.32
52 0.35
53 0.37
54 0.41
55 0.39
56 0.45
57 0.51
58 0.55
59 0.55
60 0.55
61 0.59
62 0.56
63 0.59
64 0.54
65 0.46
66 0.4
67 0.34
68 0.34
69 0.29
70 0.27
71 0.21
72 0.23
73 0.23
74 0.18
75 0.21
76 0.2
77 0.17
78 0.18
79 0.18
80 0.16
81 0.15
82 0.15
83 0.14
84 0.12
85 0.11
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.11
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.12
100 0.19
101 0.28
102 0.29
103 0.29
104 0.31
105 0.37
106 0.4
107 0.43
108 0.44
109 0.46
110 0.47
111 0.48
112 0.48
113 0.43
114 0.45
115 0.51
116 0.51
117 0.51
118 0.5
119 0.53
120 0.57
121 0.59
122 0.64
123 0.58
124 0.56
125 0.49
126 0.47
127 0.41
128 0.35
129 0.32
130 0.22
131 0.17
132 0.1
133 0.08
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.09
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.12
151 0.16
152 0.16
153 0.16
154 0.16
155 0.16
156 0.16
157 0.17
158 0.13
159 0.11
160 0.12
161 0.14
162 0.16
163 0.16
164 0.19
165 0.18
166 0.2
167 0.21
168 0.2
169 0.19
170 0.17
171 0.18
172 0.15
173 0.14
174 0.17
175 0.16
176 0.16
177 0.17
178 0.17
179 0.16
180 0.21
181 0.22
182 0.18
183 0.2
184 0.21
185 0.24
186 0.25
187 0.24
188 0.2
189 0.19
190 0.18
191 0.16
192 0.13
193 0.09
194 0.07
195 0.06
196 0.07
197 0.1
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.11
202 0.12
203 0.13
204 0.15
205 0.12
206 0.14
207 0.13
208 0.13
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.1
218 0.12
219 0.18
220 0.26
221 0.29
222 0.31
223 0.32
224 0.34
225 0.36
226 0.35
227 0.31
228 0.3
229 0.32
230 0.39
231 0.46
232 0.46
233 0.46
234 0.45
235 0.47
236 0.47
237 0.48
238 0.42
239 0.36
240 0.38
241 0.38
242 0.37
243 0.36
244 0.3
245 0.22
246 0.19
247 0.17
248 0.15
249 0.17
250 0.2
251 0.23
252 0.24
253 0.25
254 0.25
255 0.28
256 0.28
257 0.25
258 0.21
259 0.17
260 0.19
261 0.18
262 0.17
263 0.15
264 0.15
265 0.13
266 0.12
267 0.12
268 0.09
269 0.09
270 0.11
271 0.1
272 0.1
273 0.13
274 0.14
275 0.15
276 0.15
277 0.14
278 0.21
279 0.24
280 0.27
281 0.28
282 0.3
283 0.32
284 0.37
285 0.42
286 0.37
287 0.37
288 0.36
289 0.38
290 0.38
291 0.35
292 0.34
293 0.35
294 0.36
295 0.39
296 0.46
297 0.5
298 0.56
299 0.66
300 0.73
301 0.77
302 0.82
303 0.86
304 0.84
305 0.79
306 0.76
307 0.69
308 0.59
309 0.5
310 0.39
311 0.3
312 0.23
313 0.18
314 0.13
315 0.09
316 0.1
317 0.11
318 0.13
319 0.13
320 0.13
321 0.12
322 0.13
323 0.14
324 0.16
325 0.17
326 0.18
327 0.23
328 0.25
329 0.31
330 0.33
331 0.35
332 0.33
333 0.36
334 0.35
335 0.31
336 0.33
337 0.3
338 0.27
339 0.24
340 0.22
341 0.16
342 0.15
343 0.12
344 0.1
345 0.09
346 0.09
347 0.12
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.12
352 0.11
353 0.1
354 0.09
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.11
366 0.1
367 0.11
368 0.12
369 0.14
370 0.16
371 0.19
372 0.2
373 0.17
374 0.16
375 0.17
376 0.16
377 0.14
378 0.12
379 0.1
380 0.09
381 0.09
382 0.1
383 0.08
384 0.08
385 0.07
386 0.07
387 0.08
388 0.09
389 0.1
390 0.12
391 0.11
392 0.11
393 0.12
394 0.12
395 0.1
396 0.08
397 0.08
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.05
412 0.04
413 0.05
414 0.05
415 0.04
416 0.06
417 0.06
418 0.07
419 0.07
420 0.08
421 0.08
422 0.08
423 0.1
424 0.1
425 0.1
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.08
430 0.08
431 0.1
432 0.1
433 0.11
434 0.15
435 0.19
436 0.19
437 0.19
438 0.19
439 0.18
440 0.24
441 0.24
442 0.25
443 0.22
444 0.23
445 0.22
446 0.22
447 0.21
448 0.13
449 0.12
450 0.09
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.08
455 0.07
456 0.1
457 0.11
458 0.15
459 0.15
460 0.17
461 0.21
462 0.22
463 0.23
464 0.25
465 0.25
466 0.23
467 0.23
468 0.21
469 0.18
470 0.16
471 0.14
472 0.09
473 0.08
474 0.05
475 0.03
476 0.04
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.06
481 0.12
482 0.14
483 0.18
484 0.19
485 0.19
486 0.2
487 0.22
488 0.21
489 0.2
490 0.18
491 0.16
492 0.15
493 0.16
494 0.14
495 0.14
496 0.13
497 0.09
498 0.11
499 0.09
500 0.09
501 0.08
502 0.08
503 0.1
504 0.11
505 0.1
506 0.1
507 0.1
508 0.1
509 0.1
510 0.1
511 0.08
512 0.07
513 0.07
514 0.05
515 0.06
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.06
524 0.09
525 0.13
526 0.14
527 0.2
528 0.22
529 0.24
530 0.27
531 0.33
532 0.34
533 0.33
534 0.39
535 0.34
536 0.32
537 0.34
538 0.33
539 0.32
540 0.3
541 0.29
542 0.23
543 0.22
544 0.21
545 0.16
546 0.14
547 0.09
548 0.07
549 0.09
550 0.09
551 0.09
552 0.1
553 0.1
554 0.11
555 0.13
556 0.14
557 0.2
558 0.22
559 0.26
560 0.29
561 0.3
562 0.3
563 0.28
564 0.26
565 0.2
566 0.17
567 0.18
568 0.14
569 0.15
570 0.17
571 0.17
572 0.18
573 0.17
574 0.2
575 0.16
576 0.17
577 0.17
578 0.16
579 0.16
580 0.16
581 0.15
582 0.11
583 0.11
584 0.12
585 0.09
586 0.08
587 0.07
588 0.08
589 0.07
590 0.06
591 0.06
592 0.04
593 0.04
594 0.05
595 0.05
596 0.06
597 0.06
598 0.06
599 0.07
600 0.07
601 0.07
602 0.08
603 0.1
604 0.09
605 0.08
606 0.08
607 0.07
608 0.08
609 0.07
610 0.05
611 0.04
612 0.05
613 0.05
614 0.05
615 0.05
616 0.04
617 0.05
618 0.05
619 0.06
620 0.05
621 0.06
622 0.06
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.08
627 0.1
628 0.11
629 0.1
630 0.1
631 0.1
632 0.11
633 0.13
634 0.13
635 0.11
636 0.14
637 0.15
638 0.15
639 0.16
640 0.17
641 0.2
642 0.29
643 0.36
644 0.4
645 0.45
646 0.52
647 0.57
648 0.59
649 0.55
650 0.5
651 0.43
652 0.36
653 0.34
654 0.27
655 0.25
656 0.23
657 0.19
658 0.17
659 0.17
660 0.16
661 0.15
662 0.16
663 0.12
664 0.19
665 0.19
666 0.22
667 0.28
668 0.32
669 0.35
670 0.35
671 0.39
672 0.39
673 0.46
674 0.44
675 0.43
676 0.45
677 0.45
678 0.47
679 0.47
680 0.47
681 0.43
682 0.45
683 0.46
684 0.48
685 0.47
686 0.49
687 0.51
688 0.52
689 0.59
690 0.61
691 0.62
692 0.6
693 0.63
694 0.65
695 0.7
696 0.7
697 0.69
698 0.74
699 0.71
700 0.67
701 0.63
702 0.54
703 0.47
704 0.39
705 0.36
706 0.28
707 0.24
708 0.23
709 0.21
710 0.22
711 0.22
712 0.21
713 0.18
714 0.2
715 0.2
716 0.16
717 0.17
718 0.16
719 0.14
720 0.14
721 0.13
722 0.09
723 0.08
724 0.07
725 0.06
726 0.07
727 0.09
728 0.12
729 0.12
730 0.16
731 0.17
732 0.18
733 0.21
734 0.21
735 0.22
736 0.2
737 0.18
738 0.15
739 0.14
740 0.14
741 0.13
742 0.11
743 0.08
744 0.09
745 0.09
746 0.1
747 0.1
748 0.08
749 0.07
750 0.07
751 0.08
752 0.08
753 0.07
754 0.05
755 0.07
756 0.08
757 0.1
758 0.17
759 0.25
760 0.27
761 0.28
762 0.3
763 0.31
764 0.32
765 0.32
766 0.32
767 0.26
768 0.3
769 0.37
770 0.37
771 0.37
772 0.41
773 0.41
774 0.4
775 0.39
776 0.35
777 0.3
778 0.34
779 0.42
780 0.43
781 0.5
782 0.48
783 0.5
784 0.5
785 0.49
786 0.43
787 0.35
788 0.28
789 0.19
790 0.16
791 0.14
792 0.13
793 0.11
794 0.11
795 0.11
796 0.11
797 0.13
798 0.12
799 0.12
800 0.12
801 0.13
802 0.14
803 0.14
804 0.14
805 0.12
806 0.11
807 0.1
808 0.09
809 0.09
810 0.06
811 0.06
812 0.07
813 0.08
814 0.08
815 0.08
816 0.08
817 0.08
818 0.08
819 0.08
820 0.1
821 0.1
822 0.1
823 0.11
824 0.11
825 0.12
826 0.13
827 0.12
828 0.11
829 0.14
830 0.18
831 0.17
832 0.18
833 0.17
834 0.2
835 0.19
836 0.19
837 0.19
838 0.15
839 0.17
840 0.17
841 0.16
842 0.14
843 0.18
844 0.19
845 0.2
846 0.2
847 0.19
848 0.21
849 0.21
850 0.22
851 0.2
852 0.19
853 0.16
854 0.15
855 0.15
856 0.18
857 0.2
858 0.25
859 0.29
860 0.31
861 0.3
862 0.31
863 0.36
864 0.36
865 0.41
866 0.36
867 0.33
868 0.36
869 0.36
870 0.39
871 0.36
872 0.38
873 0.32
874 0.33
875 0.33
876 0.26
877 0.29
878 0.27
879 0.27
880 0.2
881 0.19
882 0.17
883 0.18
884 0.2
885 0.18
886 0.17
887 0.13
888 0.13
889 0.13
890 0.18
891 0.16
892 0.16
893 0.15
894 0.14
895 0.15
896 0.14
897 0.15
898 0.12
899 0.11
900 0.11
901 0.19
902 0.19
903 0.2
904 0.22
905 0.21
906 0.21
907 0.24
908 0.25
909 0.18
910 0.19
911 0.24
912 0.22
913 0.28
914 0.29
915 0.27
916 0.28
917 0.29
918 0.28
919 0.31
920 0.34
921 0.34
922 0.39
923 0.43
924 0.46
925 0.46
926 0.44
927 0.38
928 0.38
929 0.34
930 0.27
931 0.24
932 0.22
933 0.23
934 0.27
935 0.28
936 0.27
937 0.27
938 0.33
939 0.32
940 0.29
941 0.28
942 0.24
943 0.2
944 0.17
945 0.15
946 0.11
947 0.16
948 0.17
949 0.22
950 0.23
951 0.25
952 0.25
953 0.27
954 0.27
955 0.24
956 0.24