Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177EGD3

Protein Details
Accession A0A177EGD3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-95RVFDKRAKKAGKRKPRDYIRRRINRLFKRTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-98KRAKKAGKRKPRDYIRRRINRLFKRTEKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR013949  Utp6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF08640  U3_assoc_6  
Amino Acid Sequences MSDQIRQEMEYMVAELQYYTKQKLFAPKEVTSIVKKRRDFEDIIQHTEASLFSFLKYIEYEILLERVFDKRAKKAGKRKPRDYIRRRINRLFKRTEKKFPMEETLHLTHLGYFLAIADKEMACKLALNLPRKIAGSSKIWIRCAEALRECEEIEASRTLLQRALRLVTPQKEVIQAFISIEESFPDEDSEQLISLLKNQLSQAATAP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.1
3 0.1
4 0.14
5 0.16
6 0.18
7 0.19
8 0.21
9 0.25
10 0.35
11 0.4
12 0.43
13 0.47
14 0.46
15 0.47
16 0.48
17 0.48
18 0.45
19 0.48
20 0.49
21 0.5
22 0.52
23 0.52
24 0.54
25 0.56
26 0.53
27 0.52
28 0.54
29 0.49
30 0.52
31 0.49
32 0.43
33 0.37
34 0.34
35 0.26
36 0.16
37 0.14
38 0.09
39 0.08
40 0.09
41 0.09
42 0.1
43 0.11
44 0.1
45 0.09
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.11
50 0.1
51 0.09
52 0.09
53 0.1
54 0.12
55 0.15
56 0.17
57 0.2
58 0.28
59 0.36
60 0.44
61 0.53
62 0.61
63 0.69
64 0.76
65 0.79
66 0.82
67 0.85
68 0.87
69 0.85
70 0.85
71 0.85
72 0.85
73 0.84
74 0.83
75 0.82
76 0.8
77 0.79
78 0.77
79 0.76
80 0.75
81 0.74
82 0.75
83 0.71
84 0.66
85 0.61
86 0.55
87 0.53
88 0.44
89 0.4
90 0.36
91 0.32
92 0.28
93 0.24
94 0.22
95 0.15
96 0.14
97 0.12
98 0.06
99 0.04
100 0.04
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.05
105 0.05
106 0.06
107 0.06
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.07
112 0.11
113 0.17
114 0.21
115 0.23
116 0.23
117 0.25
118 0.25
119 0.26
120 0.22
121 0.2
122 0.19
123 0.2
124 0.26
125 0.27
126 0.28
127 0.28
128 0.28
129 0.29
130 0.28
131 0.31
132 0.28
133 0.27
134 0.29
135 0.29
136 0.27
137 0.22
138 0.21
139 0.16
140 0.15
141 0.13
142 0.11
143 0.14
144 0.15
145 0.15
146 0.18
147 0.18
148 0.18
149 0.19
150 0.21
151 0.18
152 0.23
153 0.29
154 0.3
155 0.33
156 0.32
157 0.32
158 0.34
159 0.33
160 0.31
161 0.25
162 0.22
163 0.19
164 0.17
165 0.17
166 0.12
167 0.12
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.12
173 0.11
174 0.11
175 0.12
176 0.13
177 0.11
178 0.11
179 0.12
180 0.1
181 0.13
182 0.18
183 0.17
184 0.18
185 0.19
186 0.23
187 0.23