Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177ECA2

Protein Details
Accession A0A177ECA2    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-37ESKQRKASGLGDKRKQQRNKFDRTLKIKDFVHydrophilic
327-354AAPKAAPKKKEERKEERKEEKKESRPFVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-12K
18-21DKRK
324-350RPKAAPKAAPKKKEERKEERKEEKKES
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
Amino Acid Sequences MQKSKEESKQRKASGLGDKRKQQRNKFDRTLKIKDFVLVKGSLYKILLTSGKSVCGRVVDVTEKEVRLSEFTNDRENEVTFESTVPAEDIVRIDHLVDALRRTKRDMVVAEMVSGTTGYGKLVSEDAEQLNFADFVFFSDSSISYTISIKKLFVKKILKLDLKHKDSDKEVSFSDESTEVKKEAKVTPQRAQTHDFLTDTEIGKKKTGRQREFQPFFQTKEKEPREKERNRYDNKPGEWDQFKANEEMFGVKSEFDESMYTTVLDKNSEEYKKHSEEAEKLARKMTSGNSSSYHVNEERGHHTDKTEDQKYGSVSIEAEEKEDRPKAAPKAAPKKKEERKEERKEEKKESRPFVVNHYNHGVSVDFSTHVFETSRDKPSTKKSSNKLFKVLPVTTEKNESKQKVSSSNSSAASSASSSSSREPSSSHSPKPSTQSRTVVTAVPIQLEKDTPQTTPQPTPQTPAQVTPQTTPQTTAQPLAGVKKLNPNAKSFDPSTAQRNAFFVALSKNGRKKICGPDDEEIDKSTWGHGDSFLKTMNNHRSSHQGGKKYNNN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.7
3 0.7
4 0.68
5 0.74
6 0.77
7 0.83
8 0.85
9 0.84
10 0.85
11 0.85
12 0.87
13 0.88
14 0.88
15 0.88
16 0.87
17 0.87
18 0.81
19 0.76
20 0.66
21 0.61
22 0.54
23 0.46
24 0.42
25 0.33
26 0.28
27 0.29
28 0.29
29 0.26
30 0.23
31 0.22
32 0.18
33 0.21
34 0.22
35 0.18
36 0.23
37 0.22
38 0.27
39 0.28
40 0.28
41 0.25
42 0.25
43 0.24
44 0.2
45 0.23
46 0.23
47 0.23
48 0.27
49 0.29
50 0.28
51 0.27
52 0.27
53 0.24
54 0.21
55 0.22
56 0.23
57 0.24
58 0.27
59 0.34
60 0.33
61 0.34
62 0.33
63 0.32
64 0.29
65 0.26
66 0.25
67 0.18
68 0.17
69 0.16
70 0.14
71 0.14
72 0.12
73 0.1
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.09
82 0.1
83 0.11
84 0.12
85 0.15
86 0.21
87 0.26
88 0.26
89 0.3
90 0.36
91 0.36
92 0.41
93 0.39
94 0.37
95 0.39
96 0.38
97 0.35
98 0.29
99 0.26
100 0.19
101 0.17
102 0.11
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.09
111 0.09
112 0.12
113 0.13
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.12
118 0.11
119 0.09
120 0.07
121 0.06
122 0.07
123 0.11
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.13
130 0.12
131 0.1
132 0.12
133 0.16
134 0.18
135 0.18
136 0.18
137 0.25
138 0.31
139 0.33
140 0.39
141 0.42
142 0.45
143 0.53
144 0.6
145 0.58
146 0.55
147 0.62
148 0.63
149 0.61
150 0.6
151 0.54
152 0.49
153 0.47
154 0.51
155 0.43
156 0.36
157 0.32
158 0.32
159 0.3
160 0.26
161 0.25
162 0.19
163 0.17
164 0.17
165 0.18
166 0.13
167 0.15
168 0.16
169 0.18
170 0.2
171 0.29
172 0.35
173 0.4
174 0.46
175 0.53
176 0.57
177 0.57
178 0.57
179 0.5
180 0.44
181 0.4
182 0.33
183 0.25
184 0.22
185 0.22
186 0.19
187 0.23
188 0.23
189 0.23
190 0.25
191 0.27
192 0.32
193 0.37
194 0.47
195 0.46
196 0.49
197 0.58
198 0.67
199 0.7
200 0.65
201 0.66
202 0.58
203 0.56
204 0.57
205 0.49
206 0.42
207 0.48
208 0.52
209 0.51
210 0.53
211 0.6
212 0.63
213 0.69
214 0.73
215 0.74
216 0.77
217 0.74
218 0.76
219 0.75
220 0.72
221 0.65
222 0.63
223 0.55
224 0.51
225 0.47
226 0.42
227 0.36
228 0.31
229 0.3
230 0.25
231 0.22
232 0.16
233 0.15
234 0.15
235 0.12
236 0.11
237 0.1
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.1
254 0.15
255 0.17
256 0.18
257 0.2
258 0.25
259 0.27
260 0.28
261 0.27
262 0.25
263 0.26
264 0.32
265 0.37
266 0.33
267 0.32
268 0.33
269 0.31
270 0.28
271 0.27
272 0.23
273 0.2
274 0.2
275 0.21
276 0.21
277 0.23
278 0.23
279 0.22
280 0.23
281 0.16
282 0.17
283 0.18
284 0.2
285 0.22
286 0.24
287 0.26
288 0.23
289 0.23
290 0.23
291 0.26
292 0.3
293 0.28
294 0.26
295 0.24
296 0.26
297 0.26
298 0.26
299 0.21
300 0.14
301 0.11
302 0.11
303 0.13
304 0.11
305 0.12
306 0.1
307 0.11
308 0.14
309 0.15
310 0.15
311 0.14
312 0.2
313 0.21
314 0.27
315 0.3
316 0.36
317 0.46
318 0.54
319 0.58
320 0.58
321 0.66
322 0.68
323 0.74
324 0.74
325 0.74
326 0.78
327 0.82
328 0.87
329 0.87
330 0.88
331 0.86
332 0.86
333 0.85
334 0.83
335 0.81
336 0.75
337 0.7
338 0.66
339 0.6
340 0.59
341 0.59
342 0.5
343 0.45
344 0.45
345 0.39
346 0.33
347 0.33
348 0.25
349 0.15
350 0.15
351 0.12
352 0.08
353 0.08
354 0.1
355 0.09
356 0.1
357 0.09
358 0.09
359 0.15
360 0.19
361 0.26
362 0.26
363 0.27
364 0.31
365 0.4
366 0.5
367 0.52
368 0.56
369 0.57
370 0.67
371 0.76
372 0.76
373 0.72
374 0.64
375 0.61
376 0.59
377 0.51
378 0.44
379 0.41
380 0.4
381 0.36
382 0.41
383 0.37
384 0.37
385 0.44
386 0.43
387 0.4
388 0.41
389 0.43
390 0.43
391 0.46
392 0.45
393 0.43
394 0.45
395 0.43
396 0.39
397 0.36
398 0.28
399 0.25
400 0.19
401 0.15
402 0.11
403 0.11
404 0.11
405 0.14
406 0.17
407 0.17
408 0.17
409 0.18
410 0.22
411 0.32
412 0.37
413 0.4
414 0.44
415 0.46
416 0.5
417 0.57
418 0.59
419 0.56
420 0.56
421 0.57
422 0.51
423 0.52
424 0.5
425 0.44
426 0.37
427 0.35
428 0.28
429 0.24
430 0.23
431 0.19
432 0.18
433 0.17
434 0.17
435 0.18
436 0.19
437 0.17
438 0.22
439 0.27
440 0.31
441 0.35
442 0.41
443 0.44
444 0.43
445 0.48
446 0.47
447 0.49
448 0.46
449 0.44
450 0.44
451 0.41
452 0.42
453 0.39
454 0.43
455 0.38
456 0.37
457 0.37
458 0.33
459 0.33
460 0.33
461 0.33
462 0.26
463 0.25
464 0.26
465 0.27
466 0.28
467 0.24
468 0.24
469 0.32
470 0.38
471 0.43
472 0.44
473 0.43
474 0.46
475 0.48
476 0.52
477 0.44
478 0.43
479 0.4
480 0.41
481 0.43
482 0.45
483 0.43
484 0.38
485 0.38
486 0.34
487 0.3
488 0.26
489 0.23
490 0.19
491 0.23
492 0.27
493 0.34
494 0.39
495 0.46
496 0.48
497 0.5
498 0.54
499 0.59
500 0.63
501 0.61
502 0.61
503 0.6
504 0.65
505 0.64
506 0.58
507 0.49
508 0.4
509 0.34
510 0.28
511 0.23
512 0.18
513 0.16
514 0.16
515 0.18
516 0.22
517 0.23
518 0.25
519 0.27
520 0.27
521 0.27
522 0.36
523 0.42
524 0.42
525 0.42
526 0.42
527 0.47
528 0.52
529 0.6
530 0.59
531 0.58
532 0.59