Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R018

Protein Details
Accession C4R018    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
590-612IEDPTNRPKNGPKKQKIDDNLVIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045243  Rna14-like  
IPR008847  Suf  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0032991  C:protein-containing complex  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
KEGG ppa:PAS_chr2-1_0232  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05843  Suf  
Amino Acid Sequences MADNTKKRRLSNDVIGQLQDDLKQSPLNVNTWDTLIDKVIAKDKHEQVIQVFEDCLVYFSYLGYFWNRYATYLLERLEFDKTKEIFNRCLPKVANVELWRSYIRYVRRTNSIITGGEEARRLIIKSFEISLENIGMDYNSDVLYDDYIEFLNEWQPINPNERNHRNDLLRGLYRSLIKSPVKDLERYWTDYTNFENEANPNKQISRKLVNEISGEYMNTRIKLSDLVNKIKGIPKADRYLMNNEFDFSKVGSLSLVIAWSEWERTNPFNLEKNVVKKRVNLSFQKSLQLYPFIPKLWYNYFTYLMDQQQDPSTEATNGESNQAQQAQELIVTVKQAISLNPTSFILSTLLSDLLQSDGKDVDTIKKVYLDLIEALQKYYNTDQVEDSIVNRSITEAYILLMNMLKSSKDGRSEIRKVFSQARKFENLTYHCYVQNAYLEYYTFNDVKVAKKIFDLAFKKFNDNISFLNYYLNFVISIKDFSQAKVVYETFIKSNQDSLDREKLFKVYQSFMQFESQFGDPISLRNLEKRLSNQFGLDSLYLAMINRLSPFCSPSNLLELEPPFNSVKQIDEKQGSLDSILSTPVSASTSIEDPTNRPKNGPKKQKIDDNLVIKDDIYNLLRILPKKTFFKDVPILNEKLVEVLTSLNL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.61
3 0.54
4 0.47
5 0.39
6 0.31
7 0.23
8 0.18
9 0.17
10 0.18
11 0.18
12 0.23
13 0.25
14 0.26
15 0.26
16 0.28
17 0.27
18 0.26
19 0.27
20 0.22
21 0.2
22 0.18
23 0.18
24 0.17
25 0.19
26 0.26
27 0.26
28 0.28
29 0.36
30 0.4
31 0.44
32 0.43
33 0.43
34 0.38
35 0.43
36 0.41
37 0.33
38 0.28
39 0.22
40 0.21
41 0.19
42 0.18
43 0.11
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.08
49 0.1
50 0.13
51 0.14
52 0.14
53 0.2
54 0.2
55 0.2
56 0.22
57 0.23
58 0.24
59 0.27
60 0.27
61 0.23
62 0.24
63 0.25
64 0.31
65 0.29
66 0.26
67 0.31
68 0.31
69 0.35
70 0.41
71 0.44
72 0.43
73 0.5
74 0.57
75 0.5
76 0.56
77 0.5
78 0.49
79 0.5
80 0.47
81 0.47
82 0.4
83 0.43
84 0.37
85 0.39
86 0.34
87 0.3
88 0.29
89 0.27
90 0.31
91 0.35
92 0.41
93 0.43
94 0.49
95 0.51
96 0.51
97 0.5
98 0.47
99 0.39
100 0.35
101 0.34
102 0.28
103 0.27
104 0.25
105 0.2
106 0.17
107 0.18
108 0.16
109 0.14
110 0.15
111 0.15
112 0.16
113 0.18
114 0.17
115 0.17
116 0.17
117 0.17
118 0.15
119 0.13
120 0.11
121 0.1
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.1
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.15
143 0.17
144 0.24
145 0.28
146 0.32
147 0.4
148 0.48
149 0.53
150 0.54
151 0.59
152 0.55
153 0.53
154 0.51
155 0.48
156 0.43
157 0.39
158 0.35
159 0.31
160 0.31
161 0.3
162 0.27
163 0.29
164 0.27
165 0.28
166 0.3
167 0.35
168 0.35
169 0.35
170 0.34
171 0.35
172 0.36
173 0.4
174 0.38
175 0.35
176 0.33
177 0.33
178 0.35
179 0.29
180 0.27
181 0.22
182 0.22
183 0.2
184 0.26
185 0.27
186 0.26
187 0.23
188 0.24
189 0.28
190 0.3
191 0.33
192 0.34
193 0.34
194 0.39
195 0.4
196 0.41
197 0.39
198 0.35
199 0.32
200 0.25
201 0.22
202 0.16
203 0.17
204 0.15
205 0.15
206 0.14
207 0.11
208 0.11
209 0.15
210 0.16
211 0.2
212 0.25
213 0.29
214 0.31
215 0.31
216 0.32
217 0.34
218 0.34
219 0.31
220 0.3
221 0.3
222 0.32
223 0.35
224 0.37
225 0.35
226 0.4
227 0.39
228 0.37
229 0.32
230 0.29
231 0.26
232 0.23
233 0.2
234 0.13
235 0.1
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.05
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.1
251 0.11
252 0.14
253 0.16
254 0.18
255 0.22
256 0.23
257 0.26
258 0.28
259 0.35
260 0.4
261 0.43
262 0.42
263 0.41
264 0.45
265 0.48
266 0.51
267 0.49
268 0.49
269 0.51
270 0.5
271 0.5
272 0.45
273 0.39
274 0.34
275 0.3
276 0.24
277 0.19
278 0.2
279 0.15
280 0.16
281 0.15
282 0.18
283 0.19
284 0.2
285 0.2
286 0.2
287 0.22
288 0.21
289 0.22
290 0.21
291 0.18
292 0.18
293 0.15
294 0.14
295 0.14
296 0.14
297 0.14
298 0.12
299 0.12
300 0.1
301 0.11
302 0.11
303 0.11
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.09
308 0.1
309 0.11
310 0.1
311 0.08
312 0.08
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.04
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.1
325 0.11
326 0.11
327 0.12
328 0.12
329 0.12
330 0.11
331 0.12
332 0.09
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.08
348 0.1
349 0.13
350 0.14
351 0.13
352 0.14
353 0.14
354 0.14
355 0.14
356 0.11
357 0.09
358 0.09
359 0.12
360 0.11
361 0.11
362 0.11
363 0.11
364 0.12
365 0.12
366 0.16
367 0.13
368 0.14
369 0.14
370 0.14
371 0.16
372 0.14
373 0.14
374 0.13
375 0.13
376 0.12
377 0.12
378 0.11
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.07
383 0.06
384 0.07
385 0.07
386 0.06
387 0.07
388 0.06
389 0.06
390 0.07
391 0.06
392 0.07
393 0.1
394 0.12
395 0.15
396 0.17
397 0.23
398 0.32
399 0.38
400 0.41
401 0.42
402 0.41
403 0.41
404 0.48
405 0.5
406 0.49
407 0.47
408 0.48
409 0.49
410 0.49
411 0.49
412 0.47
413 0.43
414 0.42
415 0.4
416 0.37
417 0.33
418 0.32
419 0.29
420 0.23
421 0.23
422 0.18
423 0.16
424 0.14
425 0.14
426 0.14
427 0.15
428 0.16
429 0.13
430 0.11
431 0.13
432 0.14
433 0.17
434 0.22
435 0.22
436 0.2
437 0.2
438 0.25
439 0.24
440 0.32
441 0.33
442 0.31
443 0.37
444 0.38
445 0.41
446 0.39
447 0.42
448 0.36
449 0.34
450 0.31
451 0.29
452 0.29
453 0.25
454 0.27
455 0.22
456 0.21
457 0.19
458 0.18
459 0.12
460 0.11
461 0.12
462 0.1
463 0.12
464 0.11
465 0.15
466 0.15
467 0.16
468 0.22
469 0.21
470 0.21
471 0.23
472 0.22
473 0.19
474 0.2
475 0.21
476 0.17
477 0.19
478 0.2
479 0.17
480 0.2
481 0.2
482 0.23
483 0.25
484 0.29
485 0.35
486 0.35
487 0.36
488 0.34
489 0.35
490 0.32
491 0.34
492 0.31
493 0.25
494 0.29
495 0.32
496 0.32
497 0.31
498 0.35
499 0.31
500 0.28
501 0.28
502 0.23
503 0.18
504 0.17
505 0.17
506 0.12
507 0.13
508 0.16
509 0.16
510 0.17
511 0.21
512 0.23
513 0.23
514 0.27
515 0.31
516 0.37
517 0.39
518 0.39
519 0.36
520 0.34
521 0.33
522 0.32
523 0.26
524 0.18
525 0.13
526 0.12
527 0.11
528 0.1
529 0.1
530 0.07
531 0.08
532 0.1
533 0.1
534 0.11
535 0.12
536 0.16
537 0.17
538 0.2
539 0.22
540 0.22
541 0.27
542 0.26
543 0.26
544 0.26
545 0.27
546 0.27
547 0.24
548 0.25
549 0.22
550 0.21
551 0.22
552 0.18
553 0.2
554 0.25
555 0.29
556 0.33
557 0.34
558 0.35
559 0.35
560 0.36
561 0.32
562 0.25
563 0.22
564 0.16
565 0.13
566 0.14
567 0.11
568 0.1
569 0.09
570 0.09
571 0.1
572 0.09
573 0.09
574 0.11
575 0.12
576 0.13
577 0.15
578 0.16
579 0.19
580 0.29
581 0.37
582 0.36
583 0.38
584 0.47
585 0.55
586 0.65
587 0.72
588 0.72
589 0.73
590 0.8
591 0.86
592 0.83
593 0.82
594 0.8
595 0.76
596 0.7
597 0.62
598 0.54
599 0.44
600 0.38
601 0.3
602 0.26
603 0.2
604 0.17
605 0.15
606 0.19
607 0.24
608 0.26
609 0.3
610 0.33
611 0.38
612 0.44
613 0.48
614 0.52
615 0.49
616 0.55
617 0.57
618 0.56
619 0.59
620 0.57
621 0.55
622 0.48
623 0.48
624 0.39
625 0.32
626 0.27
627 0.18
628 0.12