Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177EBV3

Protein Details
Accession A0A177EBV3    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
90-112DFKGKEKEKKVIRKKLVKKYHSFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
93-107GKEKEKKVIRKKLVK
Subcellular Location(s) cyto 24.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002143  Ribosomal_L1  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:0015934  C:large ribosomal subunit  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MGSKMFGAEEVVPVIEKIVEGTKPKNVEGGETIELRIGIKGYDAAREARFRGEVTLPFLKRKEEKILVLADIALSKILDGTDIPFVLIDDFKGKEKEKKVIRKKLVKKYHSFISIASVYKVFEPSLFTGNKKPVYMIKNINEIKNYYEDVKRKVQLNLKADLLFGFAIGTTKMPLEQVAQNFAAAMTALLGLVKKGMQNIRSVHIKTTQGKPVRYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.08
3 0.07
4 0.07
5 0.1
6 0.13
7 0.16
8 0.19
9 0.25
10 0.27
11 0.27
12 0.3
13 0.27
14 0.27
15 0.26
16 0.29
17 0.26
18 0.24
19 0.24
20 0.2
21 0.2
22 0.17
23 0.15
24 0.1
25 0.07
26 0.07
27 0.1
28 0.1
29 0.12
30 0.14
31 0.16
32 0.19
33 0.21
34 0.22
35 0.21
36 0.21
37 0.19
38 0.21
39 0.21
40 0.2
41 0.24
42 0.31
43 0.3
44 0.33
45 0.33
46 0.35
47 0.35
48 0.38
49 0.4
50 0.36
51 0.37
52 0.37
53 0.37
54 0.32
55 0.29
56 0.25
57 0.16
58 0.12
59 0.1
60 0.06
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.05
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.07
74 0.06
75 0.05
76 0.06
77 0.07
78 0.09
79 0.12
80 0.14
81 0.2
82 0.23
83 0.31
84 0.37
85 0.47
86 0.56
87 0.63
88 0.7
89 0.74
90 0.8
91 0.83
92 0.85
93 0.81
94 0.75
95 0.69
96 0.66
97 0.58
98 0.49
99 0.39
100 0.33
101 0.29
102 0.24
103 0.21
104 0.16
105 0.13
106 0.13
107 0.14
108 0.09
109 0.07
110 0.09
111 0.1
112 0.14
113 0.14
114 0.15
115 0.19
116 0.24
117 0.25
118 0.23
119 0.23
120 0.25
121 0.27
122 0.31
123 0.35
124 0.33
125 0.41
126 0.43
127 0.43
128 0.39
129 0.36
130 0.32
131 0.28
132 0.26
133 0.2
134 0.24
135 0.26
136 0.29
137 0.35
138 0.37
139 0.38
140 0.43
141 0.47
142 0.49
143 0.49
144 0.47
145 0.43
146 0.39
147 0.36
148 0.3
149 0.24
150 0.15
151 0.11
152 0.08
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.07
162 0.1
163 0.14
164 0.16
165 0.2
166 0.2
167 0.19
168 0.19
169 0.18
170 0.15
171 0.1
172 0.08
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.07
181 0.07
182 0.13
183 0.18
184 0.2
185 0.26
186 0.29
187 0.34
188 0.41
189 0.41
190 0.39
191 0.41
192 0.47
193 0.47
194 0.51
195 0.55
196 0.54