Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177EDY3

Protein Details
Accession A0A177EDY3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
74-99APQPAPKSRPEKRPHPKEHPENGNTNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-90KSRPEKRPHPK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 10.833, mito 7.5, cyto_mito 5.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045154  PCF11-like  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000993  F:RNA polymerase II complex binding  
GO:0006379  P:mRNA cleavage  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
GO:0006369  P:termination of RNA polymerase II transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MTRIAREYTDLITRSTLATKYSIRALQAVAETNDHHAKEILQAINGAILSQHPEKKEALKLLLTALQGHPAYAAPQPAPKSRPEKRPHPKEHPENGNTNPENANGNPENAKKKKSLPKEGFFPFPPEFLLFKMVDKQAYAESYRYYTKSAHEERTESTEPLLTRDYLTTPRLPLAVKTLYASSAQCKVCGMRFASIELFSVHDEHHQRRSQIDKKLSGAMWRPWLLEASQWAAAQKKAAPVSLKSMHHGKIENVPVKGDRSQRCTICKDPFEIIWSDEEECWSFKDALVVKTSPTRQICHRRCAT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.23
4 0.18
5 0.21
6 0.22
7 0.24
8 0.29
9 0.29
10 0.27
11 0.28
12 0.27
13 0.25
14 0.25
15 0.26
16 0.22
17 0.21
18 0.2
19 0.24
20 0.28
21 0.25
22 0.23
23 0.2
24 0.19
25 0.22
26 0.28
27 0.24
28 0.2
29 0.2
30 0.19
31 0.2
32 0.19
33 0.14
34 0.08
35 0.07
36 0.11
37 0.15
38 0.19
39 0.19
40 0.21
41 0.23
42 0.28
43 0.33
44 0.33
45 0.31
46 0.29
47 0.29
48 0.29
49 0.3
50 0.26
51 0.23
52 0.18
53 0.2
54 0.19
55 0.18
56 0.16
57 0.13
58 0.14
59 0.13
60 0.15
61 0.11
62 0.15
63 0.19
64 0.23
65 0.25
66 0.3
67 0.38
68 0.44
69 0.53
70 0.57
71 0.65
72 0.71
73 0.8
74 0.83
75 0.84
76 0.86
77 0.86
78 0.88
79 0.87
80 0.8
81 0.74
82 0.68
83 0.67
84 0.57
85 0.49
86 0.4
87 0.31
88 0.3
89 0.24
90 0.27
91 0.18
92 0.2
93 0.21
94 0.24
95 0.32
96 0.33
97 0.36
98 0.32
99 0.4
100 0.48
101 0.53
102 0.61
103 0.6
104 0.62
105 0.67
106 0.67
107 0.62
108 0.54
109 0.5
110 0.4
111 0.32
112 0.28
113 0.22
114 0.2
115 0.16
116 0.19
117 0.13
118 0.13
119 0.17
120 0.17
121 0.15
122 0.14
123 0.15
124 0.12
125 0.13
126 0.14
127 0.11
128 0.11
129 0.12
130 0.14
131 0.14
132 0.14
133 0.14
134 0.15
135 0.23
136 0.26
137 0.29
138 0.29
139 0.3
140 0.29
141 0.35
142 0.34
143 0.26
144 0.22
145 0.2
146 0.19
147 0.19
148 0.19
149 0.12
150 0.11
151 0.11
152 0.13
153 0.13
154 0.15
155 0.15
156 0.14
157 0.14
158 0.15
159 0.15
160 0.13
161 0.15
162 0.14
163 0.13
164 0.13
165 0.13
166 0.13
167 0.14
168 0.14
169 0.11
170 0.17
171 0.17
172 0.16
173 0.17
174 0.17
175 0.18
176 0.21
177 0.2
178 0.16
179 0.16
180 0.18
181 0.19
182 0.18
183 0.17
184 0.13
185 0.13
186 0.1
187 0.11
188 0.09
189 0.13
190 0.18
191 0.2
192 0.27
193 0.29
194 0.3
195 0.33
196 0.42
197 0.44
198 0.48
199 0.52
200 0.49
201 0.48
202 0.52
203 0.49
204 0.44
205 0.42
206 0.37
207 0.36
208 0.33
209 0.32
210 0.27
211 0.28
212 0.23
213 0.2
214 0.18
215 0.15
216 0.16
217 0.16
218 0.16
219 0.17
220 0.17
221 0.17
222 0.17
223 0.2
224 0.19
225 0.21
226 0.23
227 0.23
228 0.3
229 0.35
230 0.35
231 0.33
232 0.38
233 0.37
234 0.38
235 0.39
236 0.33
237 0.34
238 0.42
239 0.43
240 0.38
241 0.38
242 0.36
243 0.37
244 0.41
245 0.41
246 0.39
247 0.41
248 0.48
249 0.51
250 0.55
251 0.58
252 0.6
253 0.6
254 0.58
255 0.54
256 0.5
257 0.46
258 0.44
259 0.39
260 0.33
261 0.26
262 0.25
263 0.23
264 0.2
265 0.21
266 0.19
267 0.18
268 0.18
269 0.19
270 0.18
271 0.16
272 0.23
273 0.25
274 0.26
275 0.3
276 0.29
277 0.28
278 0.35
279 0.38
280 0.39
281 0.39
282 0.39
283 0.45
284 0.56
285 0.61