FuNGI

A0A177EEP5

Protein Details

Accession

A0A177EEP5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
116-142	QAQLLAKIRSRKKSRPAEQRVVKKVYD	Hydrophilic
162-181	KTGFKFFHRAHRLKKHDALK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
124-131	RSRKKSRP

Subcellular Location(s)

mito 13, cyto 11, nucl 1, pero 1, cysk 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007080 RNA_pol_Rpb1_1 IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR044893 RNA_pol_Rpb1_clamp_domain IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000785 C:chromatin GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0001056 F:RNA polymerase III activity GO:0006386 P:termination of RNA polymerase III transcription GO:0006384 P:transcription initiation at RNA polymerase III promoter GO:0042797 P:tRNA transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF04997 RNA_pol_Rpb1_1 PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5

Amino Acid Sequences

MFKEYVPREIAKIKFELMQGGETKRVSVVDVASRELYTNEGKVPAPGGPLDLKLGPSTKDGLCGTCEMRMAECPGHFGHIDLALPVFHPGLLKNIHKVLQSVCKQCSSILLSEEVQAQLLAKIRSRKKSRPAEQRVVKKVYDEAKKTVECLQCAAVNGIVRKTGFKFFHRAHRLKKHDALKEAERQTYTPATEDNPDLAPWIDNAPDEYLSPLRALEIFKRITQGSRELLGMACAPESLLIRCLPVAPGTIRPSVISIDASSNEDDLTIKLSEIAYTSQLIKDEVAKGAALHALVENWDLLQSQCAQLISSDSRPDAAKIRSLVQRLKGKHGRFRGNLSGKRVEFSGRTVISPDPNLSVEEVGIPQEMARTLTVPVPVTAANLAQLRTLAKTGCTSYPGANYIVRGERRLFLRSGNAIALEEGDVLERHMQDGDVVLFNRQPSLHRLSIMAHKARVLPGRTLRFNECVCSPYNADFDGDEMNIHLAQTTEARVEALELMGVKNNLVVPRNGQPLVAATQDFITGTFILTGKDTFFTREEMGQMLAYALPQHARLQIKPTVLRPRVLFTGKSLVSAAMNLSVSVEIRTRSYTREGASSLKEGLFVMKKGEILAGQADKRVIGGEEGSVFHHELREGGPGVVVKALDAIARLCSRYMGEKGFSIGLDDVLARPELEAAFTAAVDRCEIEAFGEKEDRITATLARAREDAGMLCVQQLPRSNAPVIMQACGSKGSLINVSQMIACVGQQLIESRRIALDFGDRSLPHFAVASPIHASRGFVRSSFCAGLRPTEFFFHAVSGREGLVDTAVKTAETGYMQRRLMKVLEGVYVAYDGTVRRGEQIVQMQFGDDGLDPAVLQSGSILSDMPAALEWAVSGEAPPSAWVGALHGAVKEATNGQGPDAPFGTDIWEKVNDIIGHRLFRQNNDTLVHATNDYMFQRLPSTENLENSGDVRARFMAKILYQTMRSQIEYGTAVGALAAQSIGEPGTQMTLKTFHLAGTSGTSITLGVPRLKEIINAAVNISTPLIKVWVTGEESGVIERIQPMSVEDLATYVSIGEASVVFSMPTELVEKHRLVQEVKAIGAVKKDSFFIWEVQVDKTTPTEIDKLLKTHLRGVPSVSRVISTSDGVIAKGLGLQEILGIEGVDSTTTQTNNIHEIYKTLGIEAARGAIVREIQYTIKQHGISVDPRHIGLLADVMCLTGEMCGMTRFGLQRMGGSSVLTLASFEQTGEHLFAAGYHGYEDAIEGVSECIITGQRIPIGTGSFKVCYNLEEHRPI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.35
3	0.35
4	0.29
5	0.31
6	0.3
7	0.31
8	0.34
9	0.29
10	0.29
11	0.26
12	0.24
13	0.21
14	0.19
15	0.2
16	0.23
17	0.24
18	0.26
19	0.26
20	0.26
21	0.26
22	0.23
23	0.23
24	0.19
25	0.19
26	0.19
27	0.2
28	0.2
29	0.2
30	0.22
31	0.2
32	0.19
33	0.17
34	0.18
35	0.17
36	0.18
37	0.2
38	0.2
39	0.19
40	0.19
41	0.21
42	0.2
43	0.2
44	0.24
45	0.21
46	0.25
47	0.26
48	0.25
49	0.25
50	0.27
51	0.26
52	0.24
53	0.26
54	0.21
55	0.21
56	0.22
57	0.24
58	0.25
59	0.23
60	0.24
61	0.23
62	0.25
63	0.23
64	0.21
65	0.19
66	0.17
67	0.17
68	0.14
69	0.14
70	0.11
71	0.11
72	0.12
73	0.09
74	0.08
75	0.09
76	0.09
77	0.14
78	0.2
79	0.22
80	0.26
81	0.3
82	0.33
83	0.33
84	0.35
85	0.35
86	0.39
87	0.44
88	0.46
89	0.45
90	0.45
91	0.44
92	0.42
93	0.43
94	0.37
95	0.32
96	0.28
97	0.28
98	0.26
99	0.27
100	0.29
101	0.22
102	0.18
103	0.15
104	0.13
105	0.13
106	0.17
107	0.17
108	0.19
109	0.28
110	0.36
111	0.46
112	0.55
113	0.62
114	0.68
115	0.77
116	0.83
117	0.85
118	0.88
119	0.88
120	0.89
121	0.9
122	0.88
123	0.82
124	0.72
125	0.63
126	0.6
127	0.57
128	0.57
129	0.51
130	0.47
131	0.5
132	0.5
133	0.5
134	0.51
135	0.47
136	0.39
137	0.37
138	0.34
139	0.29
140	0.3
141	0.29
142	0.23
143	0.21
144	0.22
145	0.21
146	0.2
147	0.19
148	0.21
149	0.23
150	0.29
151	0.3
152	0.32
153	0.39
154	0.42
155	0.52
156	0.6
157	0.64
158	0.66
159	0.73
160	0.77
161	0.77
162	0.81
163	0.79
164	0.75
165	0.74
166	0.7
167	0.66
168	0.68
169	0.64
170	0.6
171	0.52
172	0.46
173	0.44
174	0.42
175	0.35
176	0.27
177	0.24
178	0.22
179	0.23
180	0.24
181	0.22
182	0.18
183	0.17
184	0.17
185	0.16
186	0.14
187	0.12
188	0.12
189	0.11
190	0.1
191	0.12
192	0.13
193	0.12
194	0.12
195	0.14
196	0.14
197	0.14
198	0.14
199	0.12
200	0.11
201	0.13
202	0.15
203	0.15
204	0.21
205	0.23
206	0.23
207	0.27
208	0.27
209	0.28
210	0.29
211	0.31
212	0.27
213	0.27
214	0.26
215	0.24
216	0.23
217	0.2
218	0.18
219	0.13
220	0.1
221	0.08
222	0.07
223	0.08
224	0.09
225	0.09
226	0.1
227	0.1
228	0.11
229	0.11
230	0.12
231	0.11
232	0.11
233	0.13
234	0.12
235	0.18
236	0.21
237	0.23
238	0.22
239	0.22
240	0.22
241	0.2
242	0.2
243	0.15
244	0.12
245	0.13
246	0.14
247	0.16
248	0.15
249	0.14
250	0.12
251	0.12
252	0.11
253	0.09
254	0.11
255	0.09
256	0.08
257	0.09
258	0.1
259	0.1
260	0.1
261	0.11
262	0.1
263	0.11
264	0.12
265	0.12
266	0.13
267	0.13
268	0.13
269	0.15
270	0.15
271	0.15
272	0.14
273	0.13
274	0.12
275	0.12
276	0.13
277	0.09
278	0.08
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.08
283	0.07
284	0.05
285	0.06
286	0.06
287	0.06
288	0.07
289	0.08
290	0.08
291	0.1
292	0.1
293	0.1
294	0.1
295	0.14
296	0.16
297	0.17
298	0.18
299	0.16
300	0.18
301	0.18
302	0.2
303	0.22
304	0.2
305	0.22
306	0.22
307	0.28
308	0.31
309	0.36
310	0.38
311	0.4
312	0.47
313	0.45
314	0.53
315	0.56
316	0.56
317	0.6
318	0.64
319	0.65
320	0.61
321	0.65
322	0.65
323	0.67
324	0.66
325	0.64
326	0.64
327	0.55
328	0.52
329	0.46
330	0.38
331	0.3
332	0.28
333	0.29
334	0.21
335	0.21
336	0.23
337	0.24
338	0.23
339	0.24
340	0.22
341	0.16
342	0.16
343	0.17
344	0.15
345	0.14
346	0.11
347	0.1
348	0.1
349	0.08
350	0.07
351	0.07
352	0.06
353	0.06
354	0.07
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.08
359	0.1
360	0.12
361	0.12
362	0.12
363	0.12
364	0.12
365	0.11
366	0.11
367	0.09
368	0.1
369	0.11
370	0.11
371	0.1
372	0.1
373	0.11
374	0.11
375	0.12
376	0.1
377	0.09
378	0.11
379	0.14
380	0.14
381	0.16
382	0.16
383	0.17
384	0.19
385	0.2
386	0.2
387	0.18
388	0.17
389	0.18
390	0.22
391	0.22
392	0.22
393	0.21
394	0.23
395	0.25
396	0.27
397	0.25
398	0.21
399	0.24
400	0.24
401	0.24
402	0.2
403	0.18
404	0.16
405	0.15
406	0.13
407	0.09
408	0.07
409	0.05
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.07
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.07
418	0.07
419	0.08
420	0.08
421	0.08
422	0.09
423	0.09
424	0.1
425	0.1
426	0.11
427	0.11
428	0.11
429	0.14
430	0.21
431	0.21
432	0.21
433	0.22
434	0.23
435	0.3
436	0.35
437	0.32
438	0.26
439	0.26
440	0.26
441	0.29
442	0.32
443	0.27
444	0.26
445	0.31
446	0.36
447	0.37
448	0.39
449	0.39
450	0.38
451	0.37
452	0.33
453	0.27
454	0.23
455	0.22
456	0.22
457	0.2
458	0.18
459	0.19
460	0.17
461	0.17
462	0.15
463	0.14
464	0.12
465	0.11
466	0.08
467	0.07
468	0.07
469	0.06
470	0.06
471	0.05
472	0.04
473	0.05
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.06
479	0.06
480	0.06
481	0.06
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.06
487	0.06
488	0.06
489	0.06
490	0.08
491	0.09
492	0.1
493	0.1
494	0.12
495	0.16
496	0.2
497	0.2
498	0.18
499	0.17
500	0.17
501	0.19
502	0.17
503	0.12
504	0.09
505	0.09
506	0.09
507	0.09
508	0.07
509	0.06
510	0.05
511	0.05
512	0.06
513	0.06
514	0.06
515	0.07
516	0.07
517	0.06
518	0.08
519	0.08
520	0.09
521	0.1
522	0.12
523	0.12
524	0.13
525	0.13
526	0.12
527	0.13
528	0.1
529	0.09
530	0.07
531	0.06
532	0.05
533	0.05
534	0.05
535	0.05
536	0.06
537	0.07
538	0.11
539	0.13
540	0.14
541	0.18
542	0.22
543	0.24
544	0.26
545	0.3
546	0.36
547	0.36
548	0.38
549	0.34
550	0.33
551	0.34
552	0.34
553	0.29
554	0.21
555	0.26
556	0.23
557	0.23
558	0.2
559	0.16
560	0.14
561	0.14
562	0.12
563	0.07
564	0.07
565	0.06
566	0.06
567	0.05
568	0.06
569	0.06
570	0.07
571	0.06
572	0.07
573	0.09
574	0.1
575	0.12
576	0.15
577	0.17
578	0.17
579	0.19
580	0.19
581	0.2
582	0.2
583	0.2
584	0.17
585	0.14
586	0.14
587	0.12
588	0.13
589	0.12
590	0.1
591	0.1
592	0.1
593	0.1
594	0.1
595	0.1
596	0.08
597	0.07
598	0.09
599	0.09
600	0.09
601	0.1
602	0.09
603	0.09
604	0.09
605	0.08
606	0.07
607	0.05
608	0.05
609	0.04
610	0.05
611	0.06
612	0.06
613	0.07
614	0.07
615	0.07
616	0.07
617	0.07
618	0.06
619	0.07
620	0.08
621	0.08
622	0.07
623	0.08
624	0.07
625	0.08
626	0.08
627	0.07
628	0.05
629	0.04
630	0.05
631	0.04
632	0.05
633	0.05
634	0.06
635	0.06
636	0.07
637	0.06
638	0.07
639	0.07
640	0.1
641	0.12
642	0.11
643	0.12
644	0.12
645	0.13
646	0.13
647	0.12
648	0.1
649	0.08
650	0.07
651	0.06
652	0.06
653	0.05
654	0.05
655	0.05
656	0.04
657	0.04
658	0.05
659	0.04
660	0.05
661	0.04
662	0.04
663	0.04
664	0.04
665	0.05
666	0.05
667	0.05
668	0.05
669	0.05
670	0.05
671	0.05
672	0.05
673	0.05
674	0.1
675	0.1
676	0.11
677	0.12
678	0.12
679	0.12
680	0.12
681	0.12
682	0.08
683	0.08
684	0.08
685	0.1
686	0.13
687	0.13
688	0.14
689	0.14
690	0.14
691	0.14
692	0.13
693	0.1
694	0.09
695	0.09
696	0.08
697	0.08
698	0.09
699	0.08
700	0.1
701	0.13
702	0.16
703	0.17
704	0.19
705	0.19
706	0.18
707	0.19
708	0.23
709	0.2
710	0.16
711	0.15
712	0.13
713	0.13
714	0.13
715	0.12
716	0.07
717	0.07
718	0.08
719	0.09
720	0.09
721	0.1
722	0.1
723	0.1
724	0.09
725	0.09
726	0.08
727	0.06
728	0.06
729	0.05
730	0.05
731	0.04
732	0.05
733	0.07
734	0.09
735	0.12
736	0.12
737	0.12
738	0.13
739	0.12
740	0.12
741	0.11
742	0.14
743	0.11
744	0.12
745	0.14
746	0.14
747	0.16
748	0.18
749	0.17
750	0.13
751	0.12
752	0.11
753	0.13
754	0.14
755	0.13
756	0.12
757	0.13
758	0.14
759	0.14
760	0.14
761	0.12
762	0.15
763	0.14
764	0.13
765	0.15
766	0.15
767	0.18
768	0.18
769	0.16
770	0.16
771	0.16
772	0.2
773	0.19
774	0.2
775	0.18
776	0.18
777	0.19
778	0.17
779	0.17
780	0.14
781	0.14
782	0.13
783	0.13
784	0.12
785	0.11
786	0.1
787	0.1
788	0.08
789	0.08
790	0.07
791	0.06
792	0.06
793	0.06
794	0.06
795	0.06
796	0.06
797	0.07
798	0.07
799	0.1
800	0.13
801	0.19
802	0.2
803	0.23
804	0.23
805	0.24
806	0.24
807	0.22
808	0.21
809	0.16
810	0.17
811	0.14
812	0.13
813	0.11
814	0.1
815	0.09
816	0.06
817	0.06
818	0.05
819	0.07
820	0.08
821	0.08
822	0.09
823	0.1
824	0.11
825	0.14
826	0.21
827	0.2
828	0.2
829	0.2
830	0.19
831	0.18
832	0.17
833	0.14
834	0.07
835	0.07
836	0.06
837	0.06
838	0.05
839	0.05
840	0.06
841	0.05
842	0.04
843	0.04
844	0.04
845	0.04
846	0.05
847	0.05
848	0.04
849	0.05
850	0.05
851	0.05
852	0.05
853	0.05
854	0.05
855	0.04
856	0.04
857	0.04
858	0.04
859	0.04
860	0.04
861	0.04
862	0.04
863	0.04
864	0.05
865	0.05
866	0.05
867	0.05
868	0.05
869	0.06
870	0.07
871	0.08
872	0.08
873	0.08
874	0.08
875	0.08
876	0.08
877	0.08
878	0.07
879	0.08
880	0.1
881	0.1
882	0.1
883	0.13
884	0.13
885	0.14
886	0.14
887	0.13
888	0.11
889	0.11
890	0.14
891	0.12
892	0.12
893	0.13
894	0.13
895	0.13
896	0.13
897	0.18
898	0.15
899	0.15
900	0.21
901	0.21
902	0.22
903	0.23
904	0.3
905	0.27
906	0.29
907	0.34
908	0.3
909	0.31
910	0.31
911	0.31
912	0.27
913	0.27
914	0.24
915	0.19
916	0.16
917	0.14
918	0.15
919	0.14
920	0.13
921	0.11
922	0.11
923	0.12
924	0.13
925	0.14
926	0.14
927	0.2
928	0.22
929	0.23
930	0.26
931	0.25
932	0.24
933	0.23
934	0.23
935	0.18
936	0.16
937	0.16
938	0.14
939	0.15
940	0.15
941	0.15
942	0.15
943	0.14
944	0.19
945	0.21
946	0.22
947	0.22
948	0.24
949	0.28
950	0.27
951	0.27
952	0.23
953	0.2
954	0.2
955	0.19
956	0.18
957	0.12
958	0.1
959	0.09
960	0.08
961	0.08
962	0.05
963	0.04
964	0.03
965	0.03
966	0.03
967	0.03
968	0.04
969	0.03
970	0.04
971	0.04
972	0.06
973	0.07
974	0.07
975	0.08
976	0.11
977	0.11
978	0.13
979	0.13
980	0.12
981	0.12
982	0.13
983	0.12
984	0.13
985	0.13
986	0.11
987	0.11
988	0.1
989	0.1
990	0.1
991	0.11
992	0.1
993	0.12
994	0.13
995	0.14
996	0.16
997	0.16
998	0.17
999	0.16
1000	0.21
1001	0.2
1002	0.2
1003	0.19
1004	0.17
1005	0.17
1006	0.17
1007	0.15
1008	0.09
1009	0.07
1010	0.07
1011	0.08
1012	0.07
1013	0.08
1014	0.09
1015	0.11
1016	0.13
1017	0.14
1018	0.14
1019	0.14
1020	0.14
1021	0.14
1022	0.13
1023	0.1
1024	0.08
1025	0.09
1026	0.1
1027	0.09
1028	0.08
1029	0.09
1030	0.12
1031	0.12
1032	0.12
1033	0.1
1034	0.1
1035	0.1
1036	0.1
1037	0.09
1038	0.05
1039	0.05
1040	0.04
1041	0.04
1042	0.04
1043	0.04
1044	0.05
1045	0.05
1046	0.05
1047	0.05
1048	0.05
1049	0.06
1050	0.06
1051	0.07
1052	0.08
1053	0.09
1054	0.13
1055	0.19
1056	0.19
1057	0.22
1058	0.26
1059	0.28
1060	0.28
1061	0.3
1062	0.32
1063	0.29
1064	0.28
1065	0.28
1066	0.26
1067	0.24
1068	0.26
1069	0.25
1070	0.2
1071	0.19
1072	0.2
1073	0.17
1074	0.19
1075	0.2
1076	0.18
1077	0.19
1078	0.2
1079	0.21
1080	0.22
1081	0.23
1082	0.2
1083	0.2
1084	0.19
1085	0.17
1086	0.15
1087	0.17
1088	0.18
1089	0.18
1090	0.24
1091	0.25
1092	0.26
1093	0.3
1094	0.34
1095	0.33
1096	0.38
1097	0.39
1098	0.37
1099	0.35
1100	0.39
1101	0.4
1102	0.38
1103	0.4
1104	0.32
1105	0.29
1106	0.27
1107	0.29
1108	0.25
1109	0.19
1110	0.17
1111	0.17
1112	0.17
1113	0.16
1114	0.16
1115	0.13
1116	0.11
1117	0.11
1118	0.11
1119	0.07
1120	0.06
1121	0.06
1122	0.07
1123	0.07
1124	0.07
1125	0.05
1126	0.05
1127	0.05
1128	0.05
1129	0.05
1130	0.05
1131	0.05
1132	0.07
1133	0.09
1134	0.1
1135	0.12
1136	0.14
1137	0.16
1138	0.19
1139	0.21
1140	0.21
1141	0.18
1142	0.2
1143	0.22
1144	0.24
1145	0.22
1146	0.18
1147	0.19
1148	0.17
1149	0.18
1150	0.17
1151	0.14
1152	0.1
1153	0.1
1154	0.11
1155	0.1
1156	0.12
1157	0.12
1158	0.13
1159	0.14
1160	0.15
1161	0.21
1162	0.24
1163	0.25
1164	0.28
1165	0.27
1166	0.27
1167	0.28
1168	0.31
1169	0.33
1170	0.36
1171	0.38
1172	0.35
1173	0.35
1174	0.34
1175	0.31
1176	0.26
1177	0.2
1178	0.2
1179	0.14
1180	0.13
1181	0.13
1182	0.12
1183	0.11
1184	0.11
1185	0.1
1186	0.05
1187	0.05
1188	0.05
1189	0.06
1190	0.06
1191	0.07
1192	0.08
1193	0.12
1194	0.13
1195	0.15
1196	0.19
1197	0.19
1198	0.21
1199	0.23
1200	0.26
1201	0.22
1202	0.21
1203	0.19
1204	0.16
1205	0.16
1206	0.13
1207	0.11
1208	0.08
1209	0.1
1210	0.09
1211	0.09
1212	0.09
1213	0.09
1214	0.11
1215	0.12
1216	0.11
1217	0.1
1218	0.1
1219	0.1
1220	0.12
1221	0.12
1222	0.1
1223	0.09
1224	0.09
1225	0.09
1226	0.09
1227	0.09
1228	0.07
1229	0.07
1230	0.07
1231	0.07
1232	0.07
1233	0.07
1234	0.07
1235	0.06
1236	0.07
1237	0.07
1238	0.09
1239	0.1
1240	0.13
1241	0.15
1242	0.16
1243	0.17
1244	0.18
1245	0.2
1246	0.21
1247	0.22
1248	0.23
1249	0.22
1250	0.23
1251	0.24
1252	0.23
1253	0.21
1254	0.23
1255	0.28

A0A177EEP5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer