Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177ECC0

Protein Details
Accession A0A177ECC0    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-45VAILHEKERRRPRRAISKKKISLYKTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-39KERRRPRRAISKKK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045877  ZFP36-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003729  F:mRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MDGGQEMFEIKVSSKDFQGVAILHEKERRRPRRAISKKKISLYKTEICKSFETSNFCAYGDKCQFAHSLEELRDVERHPRYKTELCKTYTTQGSCSYGKRCCFIHAGPKGDKDTDLQDARNLPGDWKTPGVADTESDSLEMNEISVEETIKTLNILTEEESEKLQLLSKFKVKTSFQKQRHSFMHPRPSEQKEFVTTKHSSSLMWIKAHMCFIFVDTGSKIIAIKPLGKAPGSVTLGKALGWC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.22
3 0.21
4 0.21
5 0.24
6 0.19
7 0.19
8 0.24
9 0.25
10 0.24
11 0.31
12 0.33
13 0.39
14 0.5
15 0.56
16 0.56
17 0.63
18 0.7
19 0.76
20 0.84
21 0.86
22 0.86
23 0.87
24 0.88
25 0.88
26 0.86
27 0.78
28 0.76
29 0.72
30 0.69
31 0.66
32 0.64
33 0.59
34 0.54
35 0.53
36 0.48
37 0.46
38 0.43
39 0.42
40 0.39
41 0.38
42 0.36
43 0.34
44 0.32
45 0.27
46 0.31
47 0.27
48 0.27
49 0.24
50 0.25
51 0.26
52 0.24
53 0.27
54 0.19
55 0.2
56 0.18
57 0.22
58 0.21
59 0.21
60 0.21
61 0.19
62 0.25
63 0.28
64 0.32
65 0.3
66 0.33
67 0.38
68 0.44
69 0.51
70 0.53
71 0.53
72 0.52
73 0.54
74 0.53
75 0.52
76 0.51
77 0.44
78 0.36
79 0.32
80 0.33
81 0.3
82 0.31
83 0.3
84 0.29
85 0.3
86 0.3
87 0.27
88 0.26
89 0.28
90 0.27
91 0.32
92 0.32
93 0.36
94 0.36
95 0.38
96 0.37
97 0.33
98 0.32
99 0.24
100 0.2
101 0.2
102 0.2
103 0.17
104 0.17
105 0.18
106 0.18
107 0.2
108 0.18
109 0.13
110 0.14
111 0.15
112 0.14
113 0.14
114 0.13
115 0.1
116 0.11
117 0.12
118 0.09
119 0.08
120 0.09
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.04
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.07
144 0.1
145 0.11
146 0.12
147 0.12
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.13
152 0.13
153 0.15
154 0.18
155 0.24
156 0.26
157 0.27
158 0.34
159 0.34
160 0.41
161 0.49
162 0.56
163 0.58
164 0.67
165 0.69
166 0.71
167 0.72
168 0.7
169 0.68
170 0.67
171 0.7
172 0.61
173 0.64
174 0.64
175 0.66
176 0.64
177 0.58
178 0.52
179 0.48
180 0.49
181 0.43
182 0.42
183 0.36
184 0.32
185 0.33
186 0.3
187 0.23
188 0.26
189 0.32
190 0.31
191 0.3
192 0.3
193 0.28
194 0.3
195 0.33
196 0.27
197 0.21
198 0.16
199 0.17
200 0.18
201 0.16
202 0.17
203 0.14
204 0.15
205 0.14
206 0.14
207 0.13
208 0.1
209 0.15
210 0.15
211 0.18
212 0.2
213 0.24
214 0.27
215 0.27
216 0.27
217 0.25
218 0.31
219 0.32
220 0.3
221 0.27
222 0.27
223 0.27