Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177EA79

Protein Details
Accession A0A177EA79    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
204-223ISTRRKKKDADEKKRVPEKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
207-218RRKKKDADEKKR
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 7, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038635  CCR4-NOT_su2/3/5_C_sf  
IPR040168  Not2/3/5  
IPR007282  NOT2/3/5_C  
IPR007207  Not_N  
Gene Ontology GO:0030015  C:CCR4-NOT core complex  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF04153  NOT2_3_5  
PF04065  Not3  
Amino Acid Sequences MSGKKLAEIERTGRKIQEGGKIVFSLVKKLGYTQSGGEIKPIPKPVPLIFTERSKTEKELRKEVKKLSALKEMFKSGAKEDKIKEEVEVYKKGVDLMVELEESISLCLREEAQKFYSADLKDKTLITIKNIDLEAKIRKYPQIDTHPLKVLLSQDGADKAVLGPALDDYYDGKIQTMELLNHLANKKTEEAPPKEEAWKGDVSISTRRKKKDADEKKRVPEKEETLFPQLQKKINTLTIPFNIQIINSLRHPLHYNDTCASLRLRPEFSECPSFFPKKPIALLSSPEFYQKLDMDTLFFIFYFHQNTACQYYAAKELKNYSWRLHTKYMAWFQRLEEPVVLTEEYEQGIYIFFDYEVTWTSRKKENFRFDYKYLEDIDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.45
3 0.45
4 0.47
5 0.44
6 0.41
7 0.41
8 0.4
9 0.38
10 0.37
11 0.33
12 0.29
13 0.24
14 0.24
15 0.21
16 0.24
17 0.28
18 0.26
19 0.27
20 0.24
21 0.3
22 0.31
23 0.31
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.35
28 0.38
29 0.31
30 0.3
31 0.34
32 0.33
33 0.33
34 0.34
35 0.36
36 0.35
37 0.4
38 0.41
39 0.39
40 0.4
41 0.38
42 0.4
43 0.43
44 0.48
45 0.48
46 0.56
47 0.63
48 0.69
49 0.73
50 0.74
51 0.73
52 0.71
53 0.72
54 0.67
55 0.67
56 0.6
57 0.58
58 0.55
59 0.48
60 0.43
61 0.39
62 0.35
63 0.29
64 0.35
65 0.32
66 0.35
67 0.35
68 0.4
69 0.4
70 0.38
71 0.35
72 0.32
73 0.37
74 0.36
75 0.37
76 0.3
77 0.29
78 0.28
79 0.28
80 0.23
81 0.17
82 0.12
83 0.11
84 0.11
85 0.09
86 0.09
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.07
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.07
96 0.13
97 0.15
98 0.19
99 0.2
100 0.25
101 0.25
102 0.26
103 0.31
104 0.25
105 0.29
106 0.26
107 0.27
108 0.24
109 0.24
110 0.24
111 0.23
112 0.24
113 0.22
114 0.25
115 0.23
116 0.25
117 0.25
118 0.24
119 0.19
120 0.21
121 0.24
122 0.21
123 0.23
124 0.2
125 0.23
126 0.25
127 0.28
128 0.33
129 0.36
130 0.42
131 0.44
132 0.47
133 0.48
134 0.45
135 0.41
136 0.35
137 0.27
138 0.2
139 0.17
140 0.13
141 0.11
142 0.11
143 0.12
144 0.1
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.07
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.09
163 0.1
164 0.08
165 0.08
166 0.1
167 0.1
168 0.14
169 0.14
170 0.14
171 0.13
172 0.14
173 0.15
174 0.16
175 0.2
176 0.24
177 0.27
178 0.3
179 0.33
180 0.33
181 0.33
182 0.32
183 0.29
184 0.24
185 0.21
186 0.17
187 0.16
188 0.15
189 0.15
190 0.23
191 0.3
192 0.34
193 0.39
194 0.41
195 0.44
196 0.46
197 0.53
198 0.55
199 0.59
200 0.63
201 0.68
202 0.74
203 0.79
204 0.83
205 0.75
206 0.68
207 0.63
208 0.57
209 0.5
210 0.47
211 0.41
212 0.38
213 0.4
214 0.36
215 0.37
216 0.36
217 0.36
218 0.34
219 0.32
220 0.3
221 0.31
222 0.32
223 0.28
224 0.28
225 0.25
226 0.26
227 0.24
228 0.22
229 0.18
230 0.16
231 0.17
232 0.16
233 0.16
234 0.15
235 0.18
236 0.17
237 0.18
238 0.21
239 0.19
240 0.25
241 0.25
242 0.28
243 0.26
244 0.3
245 0.29
246 0.28
247 0.27
248 0.21
249 0.23
250 0.23
251 0.24
252 0.21
253 0.27
254 0.29
255 0.31
256 0.38
257 0.34
258 0.36
259 0.41
260 0.44
261 0.39
262 0.42
263 0.42
264 0.36
265 0.38
266 0.35
267 0.34
268 0.32
269 0.34
270 0.32
271 0.3
272 0.27
273 0.27
274 0.24
275 0.2
276 0.21
277 0.18
278 0.16
279 0.16
280 0.16
281 0.16
282 0.16
283 0.16
284 0.13
285 0.12
286 0.11
287 0.1
288 0.12
289 0.14
290 0.13
291 0.15
292 0.15
293 0.18
294 0.22
295 0.21
296 0.19
297 0.17
298 0.18
299 0.25
300 0.28
301 0.26
302 0.25
303 0.29
304 0.35
305 0.41
306 0.42
307 0.37
308 0.44
309 0.49
310 0.52
311 0.54
312 0.51
313 0.49
314 0.54
315 0.6
316 0.58
317 0.54
318 0.5
319 0.46
320 0.51
321 0.48
322 0.42
323 0.33
324 0.28
325 0.26
326 0.27
327 0.25
328 0.16
329 0.15
330 0.14
331 0.13
332 0.12
333 0.1
334 0.08
335 0.09
336 0.09
337 0.08
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.09
343 0.11
344 0.14
345 0.17
346 0.19
347 0.24
348 0.32
349 0.39
350 0.48
351 0.55
352 0.63
353 0.69
354 0.75
355 0.79
356 0.73
357 0.74
358 0.68
359 0.62