Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8YSD1

Protein Details
Accession G8YSD1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-36YYPPDWDPSKIPKKKKTGNEIIKVRLMHydrophilic
133-157KENKEYQTLKKKRKQNPFWQKDRSLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007590  Saf4/Yju2  
IPR043701  Yju2  
Gene Ontology GO:0071006  C:U2-type catalytic step 1 spliceosome  
GO:0071007  C:U2-type catalytic step 2 spliceosome  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000349  P:generation of catalytic spliceosome for first transesterification step  
GO:0000350  P:generation of catalytic spliceosome for second transesterification step  
Pfam View protein in Pfam  
PF04502  Saf4_Yju2  
Amino Acid Sequences MSERKGINKYYPPDWDPSKIPKKKKTGNEIIKVRLMTPFSMRCGKCNEYIGERRKFNARKEVTGEKYMNVKIIRFYLSCPRCTNTINLKTNPQTAGYIIESGAVKNFEPTATNDVPVQETEEQILERLEREEKENKEYQTLKKKRKQNPFWQKDRSLKDDQGDVLENLEKKMIEQQRQQEITSQIENLQKKYTDISAKGGSDALLDAAQKRLQEEAAAHQELSAKSIEKQDEEEAAKAFSNRRHPNIGPSSSPKDEGNTDEKVPESKDFLTDSLTVPKITVKKRKVTESSNNKLPINELTSKKQTNTITSLFNYSSDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.53
3 0.5
4 0.56
5 0.61
6 0.62
7 0.69
8 0.71
9 0.77
10 0.81
11 0.85
12 0.85
13 0.85
14 0.87
15 0.87
16 0.85
17 0.8
18 0.76
19 0.66
20 0.56
21 0.49
22 0.41
23 0.33
24 0.32
25 0.3
26 0.29
27 0.38
28 0.37
29 0.36
30 0.42
31 0.43
32 0.42
33 0.44
34 0.42
35 0.42
36 0.51
37 0.56
38 0.57
39 0.55
40 0.53
41 0.58
42 0.61
43 0.59
44 0.6
45 0.56
46 0.54
47 0.58
48 0.65
49 0.6
50 0.61
51 0.55
52 0.47
53 0.48
54 0.42
55 0.41
56 0.33
57 0.29
58 0.23
59 0.25
60 0.26
61 0.21
62 0.23
63 0.29
64 0.31
65 0.34
66 0.35
67 0.35
68 0.34
69 0.35
70 0.4
71 0.4
72 0.47
73 0.49
74 0.48
75 0.53
76 0.53
77 0.55
78 0.48
79 0.39
80 0.3
81 0.23
82 0.24
83 0.19
84 0.16
85 0.12
86 0.13
87 0.12
88 0.11
89 0.12
90 0.1
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.08
95 0.09
96 0.11
97 0.17
98 0.17
99 0.18
100 0.18
101 0.18
102 0.19
103 0.17
104 0.18
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.1
116 0.1
117 0.14
118 0.21
119 0.23
120 0.28
121 0.32
122 0.31
123 0.35
124 0.39
125 0.42
126 0.46
127 0.53
128 0.57
129 0.6
130 0.7
131 0.73
132 0.8
133 0.82
134 0.82
135 0.85
136 0.84
137 0.85
138 0.83
139 0.8
140 0.77
141 0.72
142 0.67
143 0.6
144 0.54
145 0.46
146 0.41
147 0.34
148 0.27
149 0.24
150 0.17
151 0.13
152 0.13
153 0.12
154 0.1
155 0.11
156 0.09
157 0.08
158 0.16
159 0.2
160 0.23
161 0.28
162 0.34
163 0.42
164 0.43
165 0.43
166 0.4
167 0.37
168 0.35
169 0.3
170 0.24
171 0.2
172 0.24
173 0.26
174 0.22
175 0.22
176 0.2
177 0.2
178 0.21
179 0.21
180 0.2
181 0.2
182 0.22
183 0.23
184 0.23
185 0.23
186 0.22
187 0.17
188 0.13
189 0.12
190 0.08
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.1
201 0.11
202 0.15
203 0.19
204 0.2
205 0.19
206 0.19
207 0.23
208 0.21
209 0.22
210 0.17
211 0.12
212 0.13
213 0.19
214 0.2
215 0.17
216 0.2
217 0.2
218 0.24
219 0.25
220 0.24
221 0.2
222 0.19
223 0.19
224 0.18
225 0.2
226 0.2
227 0.29
228 0.34
229 0.37
230 0.43
231 0.44
232 0.52
233 0.56
234 0.55
235 0.49
236 0.5
237 0.53
238 0.48
239 0.49
240 0.4
241 0.35
242 0.33
243 0.33
244 0.3
245 0.27
246 0.26
247 0.25
248 0.26
249 0.25
250 0.25
251 0.22
252 0.22
253 0.19
254 0.21
255 0.21
256 0.2
257 0.22
258 0.21
259 0.21
260 0.23
261 0.24
262 0.21
263 0.2
264 0.25
265 0.29
266 0.37
267 0.45
268 0.45
269 0.54
270 0.6
271 0.69
272 0.72
273 0.73
274 0.76
275 0.76
276 0.78
277 0.77
278 0.75
279 0.67
280 0.6
281 0.53
282 0.47
283 0.43
284 0.42
285 0.38
286 0.41
287 0.49
288 0.52
289 0.51
290 0.53
291 0.5
292 0.48
293 0.5
294 0.46
295 0.43
296 0.41
297 0.44
298 0.38
299 0.35