Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1M2VSN4

Protein Details
Accession A0A1M2VSN4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
145-168SAMLHFSKKSRKHKKDPSKEPMMLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
152-161KKSRKHKKDP
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006565  BTP  
IPR009072  Histone-fold  
IPR037818  TAF8  
IPR019473  TFIID_su8_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF07524  Bromo_TP  
PF10406  TAF8_C  
Amino Acid Sequences MAHHYPAHAQNQAYQSYPAPAAYGYSAPAYYPGYQPRPGGGYAFDGAVGATSAQPQVGPHSAPELPGVTPQLASHVMERLVSSELRDAGFESAEAGALRRLEREVAEFVQELYERAHDYANLAHRANPIATDVFAAANDYGLESSAMLHFSKKSRKHKKDPSKEPMMLLPPPSRSPSPELLSSDDENAPPAIPMTLRPLPHYVPPLPPKHTYLRTPISPPKKAALPSLEKKLKNAALVQDSLKNLLLATEDNTQEDAELLGATVNWEATTHPRKRWKLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.27
3 0.26
4 0.27
5 0.2
6 0.17
7 0.15
8 0.14
9 0.14
10 0.14
11 0.12
12 0.12
13 0.12
14 0.11
15 0.13
16 0.15
17 0.15
18 0.19
19 0.25
20 0.29
21 0.32
22 0.33
23 0.33
24 0.33
25 0.32
26 0.28
27 0.22
28 0.21
29 0.18
30 0.17
31 0.15
32 0.12
33 0.11
34 0.1
35 0.08
36 0.05
37 0.05
38 0.05
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.11
44 0.12
45 0.13
46 0.12
47 0.16
48 0.16
49 0.17
50 0.18
51 0.15
52 0.13
53 0.14
54 0.16
55 0.12
56 0.12
57 0.11
58 0.13
59 0.12
60 0.13
61 0.12
62 0.13
63 0.13
64 0.13
65 0.13
66 0.11
67 0.12
68 0.11
69 0.11
70 0.11
71 0.12
72 0.12
73 0.12
74 0.11
75 0.1
76 0.1
77 0.09
78 0.08
79 0.06
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.07
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.11
91 0.13
92 0.12
93 0.14
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.11
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.11
107 0.15
108 0.17
109 0.16
110 0.17
111 0.18
112 0.19
113 0.18
114 0.15
115 0.12
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.03
128 0.03
129 0.04
130 0.03
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.07
137 0.12
138 0.2
139 0.28
140 0.39
141 0.5
142 0.59
143 0.69
144 0.79
145 0.86
146 0.89
147 0.91
148 0.89
149 0.86
150 0.78
151 0.69
152 0.61
153 0.53
154 0.44
155 0.36
156 0.3
157 0.23
158 0.23
159 0.25
160 0.23
161 0.22
162 0.25
163 0.27
164 0.27
165 0.28
166 0.29
167 0.29
168 0.31
169 0.3
170 0.28
171 0.23
172 0.2
173 0.18
174 0.16
175 0.13
176 0.09
177 0.09
178 0.07
179 0.06
180 0.07
181 0.13
182 0.17
183 0.17
184 0.2
185 0.23
186 0.24
187 0.27
188 0.32
189 0.27
190 0.31
191 0.38
192 0.41
193 0.42
194 0.44
195 0.45
196 0.47
197 0.5
198 0.46
199 0.47
200 0.48
201 0.47
202 0.51
203 0.56
204 0.57
205 0.56
206 0.55
207 0.51
208 0.49
209 0.48
210 0.46
211 0.45
212 0.45
213 0.47
214 0.55
215 0.59
216 0.54
217 0.54
218 0.57
219 0.51
220 0.46
221 0.44
222 0.4
223 0.36
224 0.38
225 0.38
226 0.35
227 0.32
228 0.31
229 0.28
230 0.21
231 0.17
232 0.15
233 0.14
234 0.1
235 0.13
236 0.16
237 0.16
238 0.17
239 0.18
240 0.17
241 0.16
242 0.15
243 0.12
244 0.08
245 0.07
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.05
253 0.06
254 0.07
255 0.16
256 0.26
257 0.31
258 0.4
259 0.5