Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1M2VAP2

Protein Details
Accession A0A1M2VAP2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
241-269VLKSKQDKADGKRKKKKKRTDAHKVVEHSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
246-259QDKADGKRKKKKKR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025724  GAG-pre-integrase_dom  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13976  gag_pre-integrs  
PF14223  Retrotran_gag_2  
Amino Acid Sequences MGDDTTLVLTGIDNYQMWKIRILAKLRAVGAGRIVTGQETRPLPTTTVYPPVNGTTIEAWDLRAEKAHGILVEHVSDAIALKFTDCTSAQELYQAITKEYEQTNTTVLAFYTWISLANTHWDGTSSIVDHIGCLLADHHRLTSLKKPMDDEFLAYTLLNSLPSDSRWDTFRTTILSAIPLGQSLTFSDVDARIHAEVARNASSSISESALKASGSTPKQSGKKHCSQHGFNDSHTTDECRVLKSKQDKADGKRKKKKKRTDAHKVVEHSDSDSDMASHLCTRGLNVLFSEHGGRVHLRDRTHIMAATVKRGLYHLEVDPLPRKDQAMLAVDINLLHRRFAHISVDRLRCMVSKGQLKGINTLTGEPKFCEPCAMGKMHKLPFKSRTGNRATRPLQFIHSDVGGMVNPSRQGFRYWITFLDEHNRFLWVLFMKHKSEAQDTYNRWKADVQAYFQEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.16
3 0.21
4 0.22
5 0.23
6 0.25
7 0.31
8 0.37
9 0.41
10 0.43
11 0.44
12 0.48
13 0.47
14 0.48
15 0.42
16 0.36
17 0.35
18 0.28
19 0.23
20 0.18
21 0.18
22 0.15
23 0.16
24 0.16
25 0.19
26 0.19
27 0.21
28 0.24
29 0.25
30 0.25
31 0.24
32 0.27
33 0.25
34 0.32
35 0.3
36 0.28
37 0.28
38 0.29
39 0.29
40 0.25
41 0.23
42 0.16
43 0.17
44 0.18
45 0.16
46 0.15
47 0.16
48 0.17
49 0.15
50 0.16
51 0.16
52 0.15
53 0.16
54 0.17
55 0.15
56 0.15
57 0.17
58 0.16
59 0.16
60 0.15
61 0.13
62 0.11
63 0.11
64 0.1
65 0.08
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.07
70 0.08
71 0.11
72 0.11
73 0.14
74 0.17
75 0.18
76 0.18
77 0.2
78 0.2
79 0.17
80 0.21
81 0.18
82 0.15
83 0.15
84 0.15
85 0.17
86 0.19
87 0.2
88 0.18
89 0.18
90 0.19
91 0.19
92 0.19
93 0.14
94 0.13
95 0.11
96 0.1
97 0.09
98 0.09
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.14
105 0.15
106 0.14
107 0.14
108 0.14
109 0.14
110 0.15
111 0.16
112 0.11
113 0.1
114 0.12
115 0.11
116 0.1
117 0.1
118 0.08
119 0.07
120 0.06
121 0.07
122 0.08
123 0.1
124 0.11
125 0.1
126 0.13
127 0.14
128 0.16
129 0.23
130 0.3
131 0.31
132 0.32
133 0.35
134 0.34
135 0.39
136 0.37
137 0.31
138 0.24
139 0.21
140 0.2
141 0.17
142 0.15
143 0.1
144 0.1
145 0.08
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.13
151 0.13
152 0.14
153 0.16
154 0.18
155 0.19
156 0.2
157 0.21
158 0.19
159 0.18
160 0.18
161 0.16
162 0.15
163 0.13
164 0.13
165 0.11
166 0.08
167 0.08
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.1
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.12
185 0.13
186 0.12
187 0.12
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.09
196 0.1
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.13
201 0.14
202 0.16
203 0.17
204 0.22
205 0.28
206 0.33
207 0.41
208 0.42
209 0.49
210 0.53
211 0.58
212 0.59
213 0.56
214 0.58
215 0.58
216 0.52
217 0.44
218 0.45
219 0.38
220 0.33
221 0.31
222 0.25
223 0.18
224 0.21
225 0.21
226 0.17
227 0.19
228 0.19
229 0.25
230 0.3
231 0.35
232 0.36
233 0.44
234 0.49
235 0.53
236 0.63
237 0.67
238 0.71
239 0.74
240 0.79
241 0.81
242 0.85
243 0.89
244 0.89
245 0.9
246 0.9
247 0.91
248 0.92
249 0.89
250 0.84
251 0.76
252 0.68
253 0.59
254 0.49
255 0.39
256 0.28
257 0.2
258 0.15
259 0.12
260 0.09
261 0.08
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.06
268 0.07
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.13
274 0.12
275 0.13
276 0.14
277 0.09
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.11
282 0.16
283 0.19
284 0.18
285 0.21
286 0.25
287 0.26
288 0.27
289 0.26
290 0.22
291 0.24
292 0.25
293 0.25
294 0.22
295 0.19
296 0.18
297 0.18
298 0.19
299 0.15
300 0.17
301 0.14
302 0.16
303 0.17
304 0.2
305 0.26
306 0.26
307 0.26
308 0.24
309 0.24
310 0.21
311 0.22
312 0.24
313 0.21
314 0.2
315 0.19
316 0.19
317 0.18
318 0.17
319 0.17
320 0.17
321 0.13
322 0.12
323 0.12
324 0.16
325 0.18
326 0.2
327 0.26
328 0.25
329 0.31
330 0.4
331 0.43
332 0.4
333 0.38
334 0.37
335 0.3
336 0.29
337 0.28
338 0.26
339 0.3
340 0.32
341 0.38
342 0.41
343 0.41
344 0.43
345 0.4
346 0.36
347 0.29
348 0.3
349 0.28
350 0.27
351 0.27
352 0.24
353 0.27
354 0.25
355 0.25
356 0.25
357 0.21
358 0.23
359 0.27
360 0.29
361 0.26
362 0.31
363 0.39
364 0.42
365 0.45
366 0.43
367 0.46
368 0.49
369 0.56
370 0.59
371 0.57
372 0.6
373 0.66
374 0.71
375 0.7
376 0.73
377 0.68
378 0.66
379 0.64
380 0.57
381 0.52
382 0.46
383 0.42
384 0.35
385 0.31
386 0.24
387 0.19
388 0.18
389 0.14
390 0.13
391 0.12
392 0.11
393 0.13
394 0.14
395 0.16
396 0.16
397 0.18
398 0.21
399 0.24
400 0.28
401 0.28
402 0.29
403 0.32
404 0.32
405 0.32
406 0.38
407 0.37
408 0.33
409 0.32
410 0.31
411 0.26
412 0.24
413 0.27
414 0.2
415 0.23
416 0.27
417 0.32
418 0.34
419 0.37
420 0.4
421 0.39
422 0.42
423 0.42
424 0.41
425 0.46
426 0.48
427 0.55
428 0.6
429 0.55
430 0.51
431 0.48
432 0.48
433 0.48
434 0.48
435 0.43